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Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
1.16 -0.16 0.75 -0.19 -1.47 0.61 -2.27 -0.6 -0.66 -1.37 -0.67 0.92
0.41 0.12 -0.07 0.29 0.19 -0.24 -1.12 -0.15 -0.49 -0.11 -0.22 0.65
0.61 -0.5 0.52 0.06 -0.33 0.02 -0.7 0.37 -0.32 -0.67 -0.52 0.53
0.92 0.26 0.33 0.39 -0.26 0.16 -1.77 -0.01 -0.45 -1.12 -0.7 0.37
0.95 0.37 -0.35 0.47 -0.41 -0.25 -0.8 -0.26 -0.37 -0.67 -0.08 0.32
0.61 0.38 0.23 0.53 -0.59 -0.27 -0.59 -0.02 -0.69 -0.77 -0.58 0.63
0.37 0.3 -0.11 0.37 -0.33 -0.44 -0.93 -0.57 -0.08 0.06 -0.9 1.01
0.76 0.33 0.44 0.39 -0.1 -0.1 -0.71 -0.49 -0.79 -0.45 -1.1 0.51
0.36 0.18 -0.09 0.23 0.08 -0.11 -0.13 -0.23 -0.21 -0.29 -0.28 0.29
0.78 0.07 0.55 0.04 -0.66 -0.42 -0.55 -0.62 -0.32 -0.29 -0.43 0.73
0.93 -0.47 0.66 0.26 -0.04 0.18 -1.19 -0.11 -0.44 -0.98 -1.81 0.67
0.43 0.06 0.46 0.1 -0.01 -0.0 -0.41 -0.06 -0.16 -0.61 -0.22 0.07
0.52 -0.57 0.66 0.06 0.28 0.19 -1.22 0.27 0.02 -0.88 -0.5 0.02
0.47 0.26 0.19 0.13 -0.02 -0.38 -0.61 0.05 -0.33 -0.17 -0.01 0.08
0.67 -0.09 0.2 0.29 -0.3 0.06 -0.93 -0.13 -0.12 -0.63 -0.84 0.75
0.14 0.18 0.01 0.34 0.31 -0.25 -1.12 -0.16 -1.19 0.44 -2.23 1.04
0.63 0.15 0.33 0.33 -0.46 -0.21 -0.56 -0.36 -0.24 0.02 -0.76 0.41
0.69 0.16 -0.05 0.47 -0.18 -0.46 -0.43 -0.19 -0.18 -0.82 -0.52 0.63
0.09 0.29 0.46 0.86 -0.25 -0.32 -0.34 0.07 -0.22 -0.1 -1.14 -0.35
0.06 -0.05 -0.38 0.34 0.12 0.4 -0.12 -0.24 0.23 -0.83 -0.74 0.53
0.1 -0.53 -0.24 -0.04 -1.28 -1.13 -1.51 -0.21 0.23 -0.83 -1.06 2.04
0.47 -0.16 0.18 0.28 -0.37 -0.43 -1.11 0.26 -0.13 -0.46 -0.56 0.91
0.31 -0.3 -0.09 0.44 -0.11 -0.28 -1.52 -0.36 0.21 -0.72 -0.92 1.31
0.41 -0.02 0.09 0.26 -0.19 -0.3 -1.23 -0.08 -0.06 -0.39 0.01 0.71
0.75 -0.89 0.6 -0.12 -0.25 -0.06 -1.45 0.27 0.13 -0.77 -0.14 0.47
0.47 -0.01 0.25 0.23 -0.85 -0.26 -1.19 -0.66 -0.42 -0.36 -0.23 1.28
0.52 0.42 0.24 0.08 -0.14 -0.3 -0.62 -0.15 -0.23 -1.05 -0.33 0.67
0.97 0.31 0.5 0.15 -0.31 0.17 -1.31 -0.07 -0.47 -0.58 -1.2 0.22
-0.04 0.13 -0.6 0.21 -0.08 -0.63 -0.85 0.03 -0.41 0.08 0.37 0.89
0.47 0.73 0.32 0.29 0.05 -0.78 -1.22 0.1 -0.71 -0.61 -0.04 0.16
0.46 0.39 0.05 -0.05 -0.06 -0.72 -0.95 0.04 -0.2 0.21 -1.12 0.77
0.52 0.07 0.07 0.16 -0.29 -0.09 -1.38 -0.24 -0.27 -0.43 -1.77 1.33
0.3 0.37 0.08 0.4 0.12 -0.54 -0.93 -0.25 -0.48 -0.2 0.07 0.4
-0.17 0.23 -0.44 0.44 0.42 -0.33 -1.12 -0.09 -0.68 -0.01 -1.59 1.24
0.6 0.44 -0.14 0.27 -0.31 -0.26 -1.24 -0.24 -0.38 -0.07 -0.17 0.57
0.69 0.25 0.39 0.1 -0.46 -0.26 -1.15 0.18 -0.31 -0.02 -0.97 0.44
0.16 -0.47 -0.41 0.11 0.02 -0.43 -0.54 0.27 0.23 -0.98 -0.71 1.25
0.44 0.16 -0.13 0.18 -0.03 0.11 -0.42 -0.25 -0.3 -0.15 -0.37 0.43
0.52 -0.08 0.16 0.23 -0.2 -0.37 -0.56 0.13 -0.02 -0.79 -0.71 0.79
0.48 0.19 -0.04 0.09 -0.22 -0.48 -1.17 -0.13 -0.58 -0.61 -1.02 1.42
0.43 -0.33 0.39 0.2 -0.4 0.11 -0.69 0.07 0.17 -0.34 -0.33 0.25
0.52 0.18 0.23 0.29 -0.16 -0.15 -1.48 -0.11 -0.58 -0.31 -0.44 0.81
0.66 -0.17 0.23 0.23 -0.94 0.02 -0.12 -0.21 0.18 0.16 -1.37 0.29
0.45 -0.04 0.19 0.17 0.01 0.12 -0.87 -0.29 -0.31 -0.1 -0.71 0.66
0.31 0.32 0.13 0.33 0.02 -0.27 -1.1 0.12 -0.33 -0.2 -0.31 0.37
0.1 0.33 -0.31 0.33 0.11 -0.86 -0.74 -0.22 -0.36 0.54 -0.9 0.81
0.68 0.53 0.29 0.18 -0.96 -0.2 -1.92 -0.45 -0.41 -0.33 -0.49 0.97
0.44 0.26 0.31 0.21 0.08 0.08 -0.64 -0.43 -0.22 -0.37 -1.36 0.62
0.44 0.05 -0.2 0.22 -0.64 -0.43 -0.45 -0.12 -0.11 -0.44 0.06 0.86
0.92 -0.32 0.38 0.36 -0.36 0.26 -0.89 0.04 -0.43 -0.72 -0.63 0.23
-0.6 -0.2 -0.3 0.54 0.27 -0.98 -1.03 0.14 -0.29 -0.09 -1.47 1.47
0.68 -0.2 0.27 0.01 -0.3 0.15 -1.01 -0.24 -0.42 -1.1 0.15 0.78
0.26 0.23 0.54 0.16 -0.03 -0.15 -0.42 -0.59 -0.81 -0.58 -0.29 0.78
0.93 -0.51 0.83 0.22 -0.42 -0.32 -1.93 0.34 -0.43 -0.06 -1.12 0.29
-0.12 -0.07 -0.12 0.42 -0.25 -0.45 -0.29 -0.23 -0.39 0.14 -0.86 1.14
0.37 0.11 -0.0 0.31 -0.02 0.11 -0.69 -0.13 -0.18 -0.86 -0.09 0.5
0.39 0.13 0.15 0.21 -0.11 -0.14 -0.89 -0.04 -0.26 -0.65 -0.15 0.67
0.71 0.05 0.3 0.35 -0.41 -0.08 -0.94 0.02 -0.28 -0.08 -0.96 0.39
0.66 -0.32 -0.15 0.05 0.3 -0.62 -0.71 -0.78 -0.57 -0.88 -0.1 1.3
0.27 0.2 0.06 0.26 0.08 -0.62 -0.39 -0.0 -0.18 -0.56 -0.35 0.67
-0.05 -0.09 0.11 -0.09 -0.79 -0.27 -1.12 -0.71 -0.49 -0.2 0.07 1.56
0.39 -0.16 0.16 0.47 -0.87 -0.28 -0.71 -0.64 -0.29 -1.32 -0.13 1.34
0.5 0.24 -0.09 0.32 -0.17 0.04 -0.7 -0.34 -0.25 -0.43 -1.06 0.87
0.32 0.15 0.3 0.17 0.16 -0.21 -0.71 -0.15 -0.25 -0.35 -0.6 0.6
0.26 0.15 0.03 0.29 -0.04 -0.04 -0.86 -0.35 -0.75 0.1 -0.52 0.85
0.49 -0.09 0.38 0.56 0.11 -0.44 -1.25 -0.08 -0.39 -0.26 -0.75 0.58
0.27 0.18 0.2 0.96 -0.57 0.38 -1.16 0.3 0.18 -0.41 -1.09 -0.85
0.97 0.22 0.67 0.49 -0.87 0.13 -1.4 -0.36 -0.51 -28.24 -1.61 1.03
-0.18 -0.26 -0.17 0.31 0.02 0.26 -0.16 -0.52 0.01 -0.99 -0.26 1.0
0.44 0.23 -0.08 0.4 0.07 -0.14 -0.41 0.02 -0.23 -0.57 -0.79 0.46
1.11 -0.89 0.62 0.08 -0.4 0.41 -2.14 -0.17 -0.49 -0.87 -2.08 1.01
0.4 0.11 0.05 0.17 -0.21 -0.15 -0.86 -0.06 -0.2 -0.02 -0.99 0.84
0.4 -0.01 0.31 0.29 -0.13 0.12 -0.78 0.2 -0.22 -0.18 -1.63 0.52
0.24 -0.02 0.21 0.28 -0.23 0.05 -0.42 0.08 -0.1 -0.46 -0.44 0.45
0.1 -0.07 -0.38 0.3 -0.3 -0.74 -1.35 -0.23 -0.43 0.25 -0.24 1.34
0.52 -0.07 0.17 0.4 -0.35 -0.24 -0.25 0.24 -0.04 -0.44 -1.0 0.4
0.64 0.02 -0.02 0.22 -0.23 0.1 -1.25 -0.41 -0.27 0.01 -0.88 0.85
-0.01 0.32 0.34 0.23 0.11 -0.29 -0.21 -0.16 0.01 -0.55 -1.08 0.59
0.44 0.04 -0.04 0.44 -0.78 -0.69 -1.5 0.03 -0.24 -0.06 -1.0 1.27
0.62 0.56 0.73 0.09 -1.28 -0.76 -0.61 -0.56 -0.53 -0.5 -0.51 0.87
0.98 -0.14 0.36 0.16 -0.16 0.24 -0.63 0.25 -0.11 -1.03 -1.24 -0.04
0.25 0.44 0.77 0.45 -0.71 -0.22 -1.02 -1.17 -1.35 -0.88 -0.7 1.28
-0.24 0.47 -0.27 0.15 -0.24 -0.36 -0.89 -0.29 -0.42 -0.15 -0.26 1.24
0.37 0.19 -0.01 0.25 -0.57 -0.12 -1.09 -0.62 -0.97 -1.29 0.07 1.43
0.75 -0.29 0.49 -0.03 -0.59 0.16 -0.28 0.02 -0.31 -0.72 0.17 -0.07
-0.07 -0.7 0.03 0.13 0.03 -0.2 -0.3 0.08 0.09 -0.34 -0.04 0.79
0.37 -0.29 0.04 0.48 -0.08 -0.44 -0.46 -0.11 -0.48 -0.82 -0.83 1.19
-1.13 -0.36 -3.04 0.87 -0.31 -1.09 -1.41 -0.56 -1.48 -0.23 -1.2 2.27
0.59 0.22 -0.14 0.25 -0.56 -0.58 -1.56 -0.8 -1.66 -0.86 -1.08 1.86
0.37 -0.21 -0.02 -0.3 -0.66 -0.72 -0.81 -0.32 -0.12 0.05 -1.72 1.66
0.13 -0.37 0.1 0.37 -0.84 -0.29 -0.58 -0.16 -0.92 -0.78 -0.73 1.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.