1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_268 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro103_g052350.1 (Contig308.g4032)
 0.05 0.24 0.17 0.16 0.1 0.06 0.34 0.29 0.32 0.52 0.41 0.65 0.6 0.29 0.36 0.64 0.29 0.28 0.44 0.74 0.63 0.2 0.25 0.34 1.0 0.5 0.27
Sro1109_g242270.1 (Contig4618.g34447)
 0.18 0.06 0.08 0.04 0.03 0.41 0.17 0.13 0.25 0.59 0.22 1.0 0.14 0.12 0.13 0.18 0.12 0.04 0.14 0.35 0.5 0.11 0.11 0.18 0.34 0.11 0.14
Sro1209_g252630.1 (Contig2883.g23015)
 0.01 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03 0.23 0.15 0.13 0.58 0.19 1.0 0.57 0.24 0.22 0.2 0.18 0.39 0.28 0.92 0.8 0.01 0.03 0.27 0.55 0.19 0.13
Sro120_g058550.1 (Contig2411.g19733)
 0.21 0.09 0.09 0.06 0.05 0.14 0.35 0.22 0.19 0.65 0.3 1.0 0.58 0.56 0.36 0.46 0.38 0.3 0.4 0.79 0.77 0.35 0.15 0.22 0.49 0.26 0.26
Sro129_g061480.1 (Contig1945.g16722)
 0.7 0.26 0.26 0.32 0.26 0.26 0.47 0.32 0.27 0.85 0.84 1.0 0.24 0.25 0.57 0.75 0.65 0.24 0.46 0.41 0.83 0.1 0.22 0.72 0.63 0.37 0.54
Sro130_g061860.1 (Contig2611.g21109)
 0.29 0.13 0.1 0.06 0.06 0.21 0.63 0.3 0.32 0.61 0.4 0.78 0.67 0.27 0.38 0.3 0.15 0.23 0.24 1.0 0.77 0.2 0.33 0.49 0.34 0.23 0.26
Sro1329_g263340.1 (Contig1121.g10735)
 0.09 0.24 0.25 0.36 0.3 0.11 0.34 0.28 0.31 0.49 0.24 0.82 0.24 0.18 0.26 0.53 0.16 0.3 0.22 0.54 1.0 0.18 0.13 0.36 0.85 0.3 0.19
Sro1337_g264120.1 (Contig951.g9834)
 0.02 0.11 0.12 0.28 0.18 0.36 0.55 0.14 0.08 0.82 0.39 1.0 0.05 0.24 0.47 0.51 0.36 0.38 0.3 0.07 0.57 0.02 0.04 0.24 0.28 0.11 0.47
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.02 0.04 0.36 0.16 1.0 0.25 0.13 0.18 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.28 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro136_g064110.1 (Contig2000.g17122)
 0.05 0.24 0.24 0.18 0.15 0.14 0.36 0.18 0.2 0.71 0.22 1.0 0.52 0.49 0.36 0.55 0.28 0.31 0.71 0.57 0.83 0.17 0.19 0.29 0.47 0.29 0.28
Sro1743_g294830.1 (Contig4739.g35140)
 0.43 0.22 0.14 0.25 0.2 0.17 0.15 0.1 0.0 0.56 0.8 0.94 0.11 0.27 0.54 0.56 0.5 0.07 0.07 0.14 0.33 0.0 0.0 0.83 1.0 0.38 0.58
Sro1845_g301320.1 (Contig2688.g21720)
 0.08 0.05 0.06 0.04 0.04 0.1 0.36 0.39 0.23 0.71 0.25 1.0 0.52 0.26 0.32 0.31 0.19 0.26 0.17 0.85 0.81 0.16 0.14 0.28 0.27 0.15 0.24
Sro1953_g307570.1 (Contig437.g5892)
 0.16 0.07 0.08 0.07 0.09 0.24 0.4 0.34 0.37 0.64 0.32 1.0 0.65 0.42 0.34 0.4 0.18 0.29 0.33 0.81 0.7 0.17 0.25 0.28 0.5 0.26 0.35
Sro20_g013860.1 (Contig2954.g23416)
 0.1 0.12 0.04 0.19 0.16 0.11 0.34 0.34 0.4 0.75 0.35 1.0 0.23 0.39 0.36 0.49 0.3 0.2 0.41 0.69 0.58 0.37 0.29 0.27 0.22 0.27 0.27
Sro217_g089930.1 (Contig1718.g15367)
 0.2 0.09 0.04 0.05 0.07 0.13 0.64 0.33 0.29 0.82 0.29 1.0 0.7 0.66 0.46 0.44 0.23 0.26 0.33 0.86 0.83 0.19 0.25 0.33 0.59 0.36 0.26
Sro238_g095690.1 (Contig99.g1215)
 0.89 0.02 0.03 0.02 0.01 0.12 0.25 0.12 0.2 0.63 0.27 1.0 0.29 0.15 0.18 0.16 0.21 0.1 0.16 0.62 0.86 0.06 0.08 0.39 0.64 0.22 0.16
Sro239_g095900.1 (Contig3063.g24386)
 0.35 0.07 0.1 0.21 0.09 0.11 0.27 0.35 0.29 0.59 0.12 1.0 0.35 0.11 0.12 0.31 0.06 0.12 0.09 0.39 0.73 0.06 0.21 0.21 0.39 0.21 0.1
Sro2493_g329210.1 (Contig3559.g27472)
 0.02 0.05 0.08 0.04 0.04 0.33 0.4 0.17 0.15 0.51 0.14 1.0 0.43 0.11 0.17 0.15 0.11 0.28 0.21 0.67 0.78 0.18 0.09 0.23 0.35 0.08 0.2
Sro307_g113260.1 (Contig2839.g22796)
 0.21 0.06 0.09 0.07 0.06 0.15 0.46 0.31 0.31 0.76 0.32 0.97 0.48 0.54 0.36 0.45 0.31 0.24 0.29 0.69 1.0 0.22 0.2 0.28 0.43 0.3 0.23
0.12 0.03 0.01 0.0 0.0 0.05 0.3 0.22 0.07 0.71 0.12 1.0 0.44 0.31 0.24 0.46 0.1 0.18 0.1 0.73 0.82 0.21 0.1 0.42 0.41 0.16 0.26
0.16 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.5 0.63 0.04 0.92 0.45 0.91 0.71 0.23 0.25 0.44 0.02 0.13 0.11 0.95 1.0 0.27 0.06 0.38 0.75 0.32 0.27
Sro351_g124040.1 (Contig4381.g32958)
 0.09 0.06 0.02 0.07 0.05 0.05 0.25 0.27 0.17 0.61 0.21 1.0 0.32 0.43 0.26 0.38 0.2 0.1 0.12 0.49 0.91 0.11 0.15 0.21 0.36 0.2 0.18
Sro3584_g349370.1 (Contig4703.g34979)
 0.01 0.06 0.09 0.16 0.09 0.38 0.56 0.33 0.27 0.7 0.45 1.0 0.53 0.7 0.44 0.42 0.37 0.26 0.25 0.58 0.96 0.21 0.2 0.35 0.67 0.43 0.33
Sro376_g129740.1 (Contig3640.g28124)
 0.4 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.35 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.01
Sro383_g131340.1 (Contig132.g1499)
 0.76 0.3 0.24 0.16 0.2 0.28 0.27 0.49 0.29 0.73 0.75 1.0 0.08 0.5 0.58 0.72 0.49 0.16 0.06 0.08 0.64 0.06 0.23 0.41 0.13 0.23 0.48
Sro3911_g351860.1 (Contig3333.g26172)
 1.0 0.13 0.14 0.08 0.16 0.22 0.21 0.21 0.27 0.56 0.29 0.63 0.59 0.32 0.25 0.31 0.35 0.27 0.37 0.66 0.38 0.2 0.19 0.2 0.22 0.18 0.19
Sro392_g133350.1 (Contig4514.g33841)
 0.36 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.22 0.17 0.23 0.47 0.09 1.0 0.16 0.3 0.24 0.0 0.02 0.03 0.03 0.15 0.51 0.19 0.2 0.36 0.26 0.29 0.02
Sro396_g134210.1 (Contig2592.g21032)
 0.03 0.23 0.24 0.21 0.21 0.15 0.43 0.28 0.3 0.66 0.49 0.78 0.61 0.41 0.48 0.5 0.4 0.28 0.39 0.74 1.0 0.16 0.23 0.42 0.97 0.45 0.4
Sro406_g136350.1 (Contig2793.g22476)
 0.11 0.06 0.06 0.06 0.06 0.15 0.47 0.38 0.21 0.68 0.33 1.0 0.37 0.23 0.37 0.46 0.23 0.24 0.14 0.5 0.72 0.14 0.18 0.37 0.52 0.32 0.27
Sro442_g143810.1 (Contig509.g6752)
 0.05 0.22 0.33 0.31 0.26 0.13 0.42 0.24 0.24 0.35 0.58 0.55 0.19 0.24 0.38 0.62 0.42 0.25 0.32 0.26 0.36 0.13 0.21 0.63 1.0 0.43 0.29
Sro47_g027950.1 (Contig1172.g11188)
 0.56 0.03 0.02 0.03 0.02 0.07 0.1 0.13 0.16 0.57 0.08 1.0 0.13 0.14 0.06 0.07 0.06 0.12 0.1 0.34 0.42 0.09 0.12 0.02 0.04 0.03 0.06
Sro492_g153850.1 (Contig2481.g20311)
 0.77 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.12 0.25 0.25 0.8 0.05 1.0 0.04 0.23 0.08 0.05 0.04 0.05 0.04 0.13 0.57 0.29 0.11 0.04 0.02 0.02 0.06
Sro59_g034280.1 (Contig571.g7274)
 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.43 0.22 0.22 0.51 0.15 1.0 0.35 0.21 0.2 0.33 0.17 0.17 0.19 0.4 0.59 0.08 0.16 0.27 0.42 0.27 0.13
Sro609_g174980.1 (Contig285.g3730)
 0.13 0.05 0.06 0.06 0.08 0.12 0.15 0.11 0.16 0.73 0.26 0.88 0.72 0.53 0.29 0.36 0.13 0.22 0.37 1.0 0.85 0.1 0.16 0.15 0.33 0.14 0.17
Sro624_g177240.1 (Contig2249.g18629)
 0.07 0.1 0.05 0.05 0.08 0.08 0.48 0.43 0.27 0.74 0.31 0.85 0.34 0.49 0.32 0.18 0.28 0.14 0.12 0.61 1.0 0.28 0.13 0.34 0.41 0.28 0.37
Sro624_g177250.1 (Contig2249.g18630)
 0.03 0.16 0.04 0.05 0.05 0.04 0.42 0.48 0.16 0.6 0.42 0.63 0.53 0.61 0.25 0.19 0.24 0.2 0.18 0.59 1.0 0.12 0.1 0.34 0.35 0.3 0.38
Sro652_g181720.1 (Contig2024.g17325)
 0.38 0.05 0.06 0.04 0.06 0.44 0.58 0.36 0.31 0.73 0.44 0.74 0.86 0.83 0.51 0.55 0.28 0.31 0.27 1.0 0.96 0.3 0.36 0.25 0.5 0.33 0.38
Sro691_g187960.1 (Contig1133.g10891)
 0.15 0.12 0.08 0.07 0.09 0.15 0.51 0.28 0.32 0.64 0.37 1.0 0.5 0.36 0.34 0.43 0.21 0.22 0.28 0.62 0.76 0.23 0.28 0.32 0.58 0.22 0.34
Sro695_g188740.1 (Contig4098.g31321)
 0.18 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.14 0.36 0.18 0.72 0.12 1.0 0.35 0.27 0.18 0.24 0.04 0.37 0.2 0.43 0.43 0.03 0.1 0.05 0.01 0.04 0.15
Sro72_g039660.1 (Contig1459.g13365)
 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.26 0.14 0.16 0.62 0.17 1.0 0.43 0.41 0.27 0.26 0.16 0.2 0.18 0.72 0.77 0.07 0.06 0.11 0.32 0.13 0.18
Sro811_g205890.1 (Contig4366.g32886)
 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.1 0.41 0.15 0.14 0.61 0.45 1.0 0.2 0.29 0.25 0.33 0.31 0.13 0.26 0.35 0.65 0.06 0.12 0.29 0.28 0.22 0.26
Sro881_g215260.1 (Contig4286.g32379)
 0.13 0.01 0.03 0.02 0.02 0.07 0.28 0.23 0.24 0.48 0.14 1.0 0.39 0.16 0.14 0.12 0.07 0.07 0.1 0.63 0.38 0.13 0.12 0.15 0.12 0.1 0.09
Sro934_g221830.1 (Contig2403.g19670)
 0.32 0.01 0.03 0.02 0.01 0.13 0.16 0.27 0.28 0.55 0.16 1.0 0.34 0.12 0.14 0.14 0.17 0.13 0.15 0.87 0.37 0.14 0.22 0.13 0.16 0.09 0.11
Sro93_g048240.1 (Contig3841.g29512)
 0.02 0.01 0.07 0.05 0.07 0.03 0.33 0.13 0.11 0.59 0.32 1.0 0.36 0.06 0.29 0.53 0.21 0.49 0.27 0.83 0.77 0.05 0.11 0.15 0.45 0.16 0.17
Sro960_g224900.1 (Contig143.g1586)
 0.31 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.16 0.13 0.08 0.34 0.07 1.0 0.08 0.17 0.08 0.05 0.07 0.03 0.1 0.15 0.24 0.07 0.05 0.14 0.22 0.1 0.06
Sro9_g007450.1 (Contig4120.g31513)
 0.21 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.09 0.07 0.12 0.36 0.06 1.0 0.15 0.21 0.07 0.04 0.02 0.02 0.04 0.18 0.29 0.05 0.07 0.3 0.54 0.59 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)