Heatmap: Cluster_212 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro105_g053100.1 (Contig544.g6999)
5.29 74.58 128.38 41.65 44.56 159.93 54.09 64.65 36.8 40.14 69.83 36.25 21.88 19.86 72.95 2.39 60.14 86.96 16.49 19.38 31.18 10.34 48.4 53.94 35.91 38.7 36.58
Sro1079_g238950.1 (Contig298.g3932)
0.56 42.03 61.7 58.9 81.89 19.0 33.4 15.57 5.49 35.11 22.84 30.06 40.24 28.19 40.48 44.88 11.47 22.15 31.89 32.47 44.12 15.21 2.53 28.09 15.42 40.21 25.4
Sro1105_g241910.1 (Contig2574.g20910)
3.35 103.96 73.55 74.69 52.6 5.49 12.74 16.97 14.44 23.89 25.89 18.69 11.48 6.86 23.57 56.07 24.16 27.72 33.9 18.24 24.12 13.77 11.38 16.03 13.97 18.09 31.25
Sro1105_g241920.1 (Contig2574.g20911)
0.22 98.05 73.1 36.95 29.73 8.18 14.08 23.74 28.05 16.93 26.08 11.02 22.4 11.6 21.81 39.13 34.69 29.22 26.63 19.23 15.52 29.93 26.07 14.85 23.19 16.96 23.52
Sro112_g055620.1 (Contig1575.g14287)
0.14 4.84 8.71 5.67 4.62 2.63 2.03 2.75 2.34 3.57 6.27 3.28 3.91 2.54 4.25 4.11 6.27 2.67 2.25 4.15 3.45 1.61 1.71 2.49 2.89 2.85 3.53
Sro1199_g251700.1 (Contig642.g7722)
1.16 52.93 78.88 44.87 34.87 1.1 34.95 19.23 17.29 25.89 55.73 12.85 3.58 11.68 21.23 70.34 16.98 6.19 20.88 11.73 30.73 12.85 12.55 82.45 99.83 30.63 53.73
Sro1234_g254920.1 (Contig2459.g20127)
8.15 40.92 26.29 33.75 23.49 77.81 2.88 7.02 8.96 18.92 53.94 10.5 23.18 1.9 40.75 1.86 46.37 93.39 9.2 6.7 27.41 5.14 20.8 14.62 15.39 79.06 27.12
Sro1265_g257490.1 (Contig3808.g29177)
0.34 19.68 28.44 24.69 23.11 6.33 15.87 8.3 10.65 12.13 32.7 12.77 11.5 13.4 18.39 22.01 15.56 12.94 8.38 11.57 7.25 3.11 6.37 14.42 7.86 8.59 11.44
Sro128_g061140.1 (Contig1654.g14890)
4.12 21.88 25.05 34.84 41.83 31.58 24.36 14.57 12.79 21.76 46.98 24.25 61.12 25.58 41.08 28.8 34.23 22.94 19.88 30.62 18.46 11.63 12.63 51.56 33.08 21.56 17.9
Sro1295_g260290.1 (Contig1102.g10678)
17.15 54.56 98.11 51.26 52.85 4.63 26.38 20.84 15.32 21.27 24.61 19.2 18.0 1.74 23.35 60.95 10.3 23.57 37.79 34.23 25.06 8.68 12.25 59.66 74.86 26.69 41.51
Sro1324_g262740.1 (Contig3409.g26603)
43.93 30.42 44.5 32.12 37.45 19.19 15.96 18.27 1.06 19.19 50.6 7.8 30.39 5.33 45.66 51.21 27.56 39.2 12.74 26.88 7.11 0.23 3.87 145.15 164.09 74.92 38.95
1.38 15.21 28.11 17.45 14.58 4.52 8.13 6.49 8.06 8.87 14.01 7.69 11.01 4.58 12.34 16.28 9.35 7.51 10.55 9.62 7.24 5.05 6.22 14.19 7.77 7.63 11.26
Sro1373_g267220.1 (Contig3001.g23870)
1.85 13.54 12.71 30.6 29.16 18.5 25.67 19.21 15.76 24.44 34.66 16.28 16.44 9.58 25.29 37.17 29.26 32.41 24.33 23.93 31.2 14.79 8.61 45.52 78.84 35.3 32.0
Sro1431_g272040.1 (Contig2472.g20224)
5.29 141.75 128.3 112.73 132.96 23.35 45.52 69.36 53.83 46.86 77.94 37.52 12.49 30.38 52.69 56.27 54.49 51.11 48.36 28.2 34.28 48.01 53.25 13.71 12.11 26.91 46.71
Sro1449_g273660.1 (Contig2836.g22756)
0.4 8.64 4.22 1.61 2.49 0.02 4.22 2.47 1.09 2.51 3.51 0.62 2.48 0.08 2.99 8.37 3.55 4.15 6.89 3.81 3.23 0.65 0.35 5.62 8.63 4.18 4.91
Sro149_g068530.1 (Contig259.g3221)
0.48 42.33 56.12 57.62 65.11 31.54 43.9 33.9 42.7 64.93 87.91 56.86 102.11 43.95 62.13 91.24 54.38 72.6 93.38 98.87 63.08 26.31 37.02 42.64 92.17 70.93 75.75
Sro1618_g286440.1 (Contig4550.g34011)
1.67 28.18 56.45 39.53 32.83 25.19 36.89 33.92 24.45 35.45 65.39 36.62 39.17 22.82 45.07 85.51 62.3 34.5 48.75 48.62 46.83 14.31 13.18 64.52 66.3 37.53 40.95
Sro1655_g288950.1 (Contig2908.g23141)
3.61 15.73 19.6 22.13 15.54 3.74 8.5 16.01 4.53 8.8 17.6 9.42 18.14 5.4 13.49 13.11 11.45 9.43 9.59 18.59 10.8 4.12 4.02 14.22 23.13 9.56 8.84
Sro1707_g292600.1 (Contig3781.g29026)
0.36 5.85 3.39 5.3 5.23 6.99 11.15 9.17 8.38 11.87 24.17 12.44 7.73 10.94 21.49 25.59 13.68 15.1 12.89 7.87 9.98 2.47 6.5 13.13 7.93 8.81 14.11
Sro1747_g295010.1 (Contig3590.g27743)
0.05 69.11 94.62 51.83 55.51 14.0 33.41 28.73 19.61 27.91 17.29 18.75 22.47 10.01 18.7 20.24 15.24 28.07 31.84 44.05 27.51 39.92 21.6 42.35 49.58 31.22 37.71
Sro1809_g299030.1 (Contig3159.g25022)
0.03 0.24 0.22 0.1 0.28 0.03 0.51 0.38 0.25 0.25 0.08 0.06 0.05 0.01 0.61 0.39 0.12 0.57 0.1 0.14 0.26 0.07 0.12 0.16 0.02 0.12 0.48
Sro1952_g307450.1 (Contig4337.g32709)
0.05 5.64 5.18 2.71 3.81 0.83 0.99 1.22 0.75 2.15 2.39 0.69 1.09 0.18 2.26 3.33 2.66 3.65 3.41 1.73 2.08 1.81 0.27 0.24 1.65 2.33 2.99
Sro2094_g314180.1 (Contig1203.g11332)
0.08 4.54 3.44 2.76 3.48 0.07 2.1 0.76 0.15 1.61 1.23 0.99 0.59 0.09 2.58 3.31 1.86 1.18 0.56 0.5 1.95 0.05 0.08 2.61 2.85 2.38 1.79
Sro217_g089600.1 (Contig1718.g15334)
13.78 75.05 73.92 153.44 116.84 70.77 99.95 61.05 62.59 95.07 143.06 81.75 97.92 49.02 117.64 136.7 115.8 147.91 171.0 127.67 86.15 33.01 43.01 93.66 133.97 78.76 117.2
Sro227_g092150.1 (Contig327.g4327)
0.05 4.64 5.84 6.69 9.58 0.58 2.5 2.68 2.18 3.44 3.25 2.56 5.75 2.76 4.61 4.54 2.35 4.97 4.03 6.94 4.81 1.15 2.79 1.72 3.18 2.61 3.7
Sro231_g093700.1 (Contig3051.g24283)
110.82 57.71 88.93 106.44 73.12 97.63 98.82 80.75 23.66 44.51 117.76 32.5 65.82 19.57 125.26 40.71 62.0 68.44 21.2 63.34 21.45 2.96 16.13 90.39 64.97 21.45 48.38
Sro233_g094120.1 (Contig310.g4073)
0.12 61.21 46.57 50.3 38.12 4.67 19.22 12.89 6.74 24.55 54.62 23.34 43.7 4.75 35.83 93.18 18.58 32.24 34.78 31.39 18.27 1.49 6.83 39.88 39.18 21.16 76.07
Sro23_g015730.1 (Contig2259.g18723)
38.0 73.02 83.44 169.06 129.35 151.73 38.14 42.28 13.51 56.86 116.41 42.16 63.43 22.09 109.93 28.16 106.22 173.17 45.76 49.05 30.48 7.03 22.47 129.3 130.02 103.74 57.32
Sro244_g097260.1 (Contig2788.g22442)
0.66 53.58 32.9 29.68 37.62 4.6 10.97 8.96 4.5 10.76 10.14 9.77 5.1 9.54 12.42 20.3 7.87 20.02 8.68 10.57 12.78 1.65 5.9 12.84 6.77 6.67 13.39
Sro249_g098540.1 (Contig4691.g34858)
0.0 2.17 1.31 1.96 0.79 0.0 0.64 1.77 1.41 0.89 6.15 0.16 0.0 0.09 3.08 5.95 0.12 0.91 3.73 0.26 0.41 0.53 1.1 1.69 1.8 1.59 4.52
Sro249_g098550.1 (Contig4691.g34859)
0.03 19.88 26.31 35.49 30.39 3.51 3.43 2.31 2.94 11.63 26.26 8.89 6.89 6.02 17.96 38.49 10.37 9.56 30.75 9.49 10.19 4.07 5.2 11.46 6.37 8.02 21.33
Sro252_g099660.1 (Contig311.g4108)
2.24 99.66 81.29 80.33 113.74 127.44 95.8 133.27 70.0 79.02 269.57 64.83 151.42 131.42 194.76 147.85 129.86 72.31 36.92 46.71 32.69 57.59 73.97 88.66 29.67 29.14 108.39
Sro2535_g330500.1 (Contig2442.g20005)
0.0 1.26 0.47 1.23 1.15 0.03 0.87 1.17 0.39 1.24 3.16 0.08 0.0 0.04 3.24 6.02 1.29 0.63 1.52 0.26 0.31 0.16 0.25 2.58 1.28 1.89 4.89
Sro2657_g333850.1 (Contig583.g7350)
5.94 155.43 127.58 159.31 160.97 44.18 90.73 81.28 57.19 74.42 73.01 61.42 55.16 41.73 72.97 83.15 52.98 99.09 117.4 78.48 81.35 49.17 50.31 110.4 137.97 77.41 59.02
Sro266_g103080.1 (Contig1823.g16039)
0.07 13.57 5.83 2.65 1.93 0.05 1.92 4.26 1.03 2.47 10.57 0.54 0.05 0.08 1.76 5.47 1.0 1.18 2.42 0.19 2.9 0.12 0.29 7.05 2.39 0.05 8.3
Sro27_g018340.1 (Contig3926.g30095)
0.0 10.53 8.54 9.14 9.01 1.59 3.62 6.14 4.32 5.36 10.66 5.37 9.83 5.06 5.63 6.12 5.27 5.97 6.61 8.46 5.61 3.38 2.05 2.79 3.32 3.58 5.69
Sro286_g108280.1 (Contig956.g9864)
0.1 11.47 13.06 4.71 7.66 0.23 3.87 1.64 4.13 4.16 10.38 1.5 2.99 1.76 7.5 19.12 8.62 2.37 3.64 4.19 7.08 4.34 3.94 3.42 4.72 1.99 8.15
Sro2889_g339500.1 (Contig4534.g33915)
77.53 51.99 82.85 73.7 69.47 38.57 21.51 28.71 1.99 41.72 105.64 17.32 84.07 13.0 104.0 121.99 60.99 115.9 35.78 69.35 11.7 1.72 7.63 221.3 206.36 126.3 92.02
Sro28_g018760.1 (Contig404.g5485)
2.81 50.37 27.6 29.58 36.19 13.23 9.64 14.81 7.6 16.65 35.82 19.74 4.87 4.84 29.37 26.97 30.01 20.63 13.01 8.75 12.49 6.83 6.02 23.4 12.21 15.99 22.28
Sro28_g018890.1 (Contig404.g5498)
0.09 97.22 73.19 67.5 47.74 1.46 9.31 3.41 2.24 14.67 39.64 11.92 0.66 0.42 12.78 36.31 8.62 4.04 28.89 12.22 6.62 0.76 2.44 18.64 9.12 15.41 43.34
Sro2_g001950.1 (Contig467.g6353)
0.03 3.6 18.52 2.97 1.54 0.98 4.27 4.72 2.76 4.42 5.26 3.61 3.92 2.52 6.32 5.94 4.3 5.53 5.1 8.2 5.51 5.44 2.5 2.94 3.12 2.67 5.38
Sro305_g112770.1 (Contig560.g7118)
0.65 65.9 57.28 46.91 47.29 3.94 19.82 20.06 26.9 23.88 48.92 18.05 22.74 13.52 29.0 40.61 27.06 28.17 25.47 32.25 23.05 8.24 17.76 23.25 31.32 23.31 29.34
Sro311_g114370.1 (Contig909.g9552)
0.21 11.57 11.28 10.54 13.02 1.15 7.83 6.76 4.75 6.38 5.86 4.56 11.4 2.66 7.06 5.09 4.0 7.29 5.54 8.76 7.27 2.54 5.66 11.97 16.19 11.71 3.27
Sro336_g120360.1 (Contig4022.g30925)
0.03 7.73 5.07 5.03 4.52 2.01 5.05 2.3 0.56 3.9 4.71 4.36 0.67 3.92 6.28 6.18 2.76 0.7 0.66 0.83 4.96 1.27 0.52 7.0 8.76 8.27 3.88
Sro3541_g349070.1 (Contig4420.g33210)
0.0 6.4 3.45 3.21 2.97 6.38 0.8 6.63 3.37 3.16 5.88 1.81 4.92 0.91 7.7 7.6 7.52 1.8 2.48 3.64 1.93 0.16 0.0 2.47 1.38 2.28 5.4
Sro35_g022300.1 (Contig3323.g26107)
0.0 5.74 4.04 1.92 1.35 1.49 1.25 0.1 0.31 1.56 1.52 1.3 2.09 0.47 3.82 1.9 1.1 1.56 1.75 1.7 2.07 0.04 0.12 3.93 2.32 2.14 1.43
Sro40_g024450.1 (Contig335.g4452)
0.0 10.48 7.03 11.27 10.08 1.71 2.3 1.85 0.18 3.81 4.84 1.73 5.21 0.81 6.48 10.99 4.45 3.79 2.15 5.3 2.04 0.02 0.32 10.48 18.47 8.65 6.17
Sro432_g141580.1 (Contig1545.g14013)
0.19 6.77 5.23 3.41 3.87 0.0 0.26 0.43 0.35 1.17 2.84 0.63 1.05 0.19 1.51 5.67 0.58 0.51 1.65 0.82 0.97 0.03 0.12 0.33 0.46 0.21 2.69
Sro458_g147010.1 (Contig3230.g25533)
1.18 8.07 12.92 7.96 4.34 4.95 4.82 3.07 2.1 4.99 7.72 3.48 5.44 2.9 6.93 10.34 5.8 3.27 4.63 6.45 4.5 3.22 1.51 7.45 5.04 5.02 6.09
Sro45_g026860.1 (Contig2311.g19068)
0.13 1.83 3.61 2.92 5.04 2.14 2.77 1.05 1.63 2.33 1.52 1.3 4.98 0.84 2.86 3.81 0.88 3.68 2.03 5.12 2.88 1.49 1.38 1.6 3.64 2.2 2.06
Sro460_g147570.1 (Contig3843.g29582)
2.43 19.21 8.63 10.75 10.93 16.75 17.0 19.07 8.15 12.0 34.16 10.74 5.78 7.31 25.39 19.3 22.98 16.55 11.73 11.24 8.52 2.7 6.15 25.63 11.95 12.94 16.41
Sro471_g149720.1 (Contig458.g6185)
0.02 45.59 21.24 29.39 16.51 0.08 3.46 1.07 0.25 6.89 8.75 4.54 0.19 1.09 3.62 13.25 1.11 0.4 4.11 4.35 4.4 0.14 0.47 6.51 7.28 6.02 10.53
Sro478_g150940.1 (Contig272.g3492)
0.34 34.24 30.88 13.59 15.73 18.15 16.73 10.42 5.24 13.32 16.49 9.69 9.97 5.21 18.33 20.48 8.67 12.88 13.08 10.5 10.84 3.31 4.74 27.26 24.47 22.08 16.7
Sro478_g150950.1 (Contig272.g3493)
1.4 62.35 53.7 24.42 29.47 8.3 18.75 13.56 5.95 18.49 26.22 13.75 13.32 5.5 22.75 31.31 11.69 18.95 19.46 16.76 15.02 7.28 6.47 29.63 31.57 23.16 20.85
Sro4_g003780.1 (Contig3815.g29296)
2.88 25.37 34.61 25.73 22.69 10.3 11.91 12.95 9.85 16.92 27.22 14.82 21.84 13.52 21.29 27.73 20.89 16.16 21.4 25.55 17.22 15.51 10.87 17.29 15.34 14.33 24.55
Sro539_g162880.1 (Contig837.g9233)
0.51 13.64 13.21 7.7 5.96 1.99 4.64 4.74 3.44 5.71 6.75 2.93 7.36 0.69 10.26 12.49 3.96 5.7 4.49 6.14 4.61 0.69 0.52 4.99 6.94 4.3 7.63
Sro570_g168460.1 (Contig131.g1469)
1.14 5.31 7.16 5.48 5.49 0.5 1.22 1.19 0.7 2.78 4.14 1.35 4.19 0.49 3.36 3.04 1.37 4.64 5.46 6.57 2.73 1.21 0.46 3.72 4.57 4.37 3.65
Sro5_g004180.1 (Contig4001.g30733)
0.35 3.27 4.48 1.53 1.55 1.21 2.33 1.95 1.23 2.1 4.13 2.04 1.4 2.12 3.51 4.5 2.7 1.59 1.15 1.8 2.46 2.04 0.86 3.41 2.77 2.47 3.35
Sro60_g034770.1 (Contig797.g8954)
0.05 4.91 1.41 0.09 0.58 0.13 0.82 0.6 0.02 1.72 1.84 0.92 0.14 0.41 0.99 2.03 2.72 0.41 1.76 0.92 1.84 0.25 0.05 0.47 0.52 2.14 2.87
Sro623_g177200.1 (Contig3858.g29699)
0.04 3.95 2.65 1.84 1.14 0.15 0.87 0.48 0.13 1.0 1.91 0.69 0.65 0.12 1.0 1.97 0.76 1.04 2.2 1.13 0.72 0.11 0.28 1.5 1.14 0.71 1.57
Sro640_g179900.1 (Contig454.g6124)
1.24 22.44 20.77 16.64 20.51 1.29 5.85 8.35 7.57 7.08 8.27 9.47 5.93 5.37 6.83 13.33 4.89 9.47 4.45 4.07 8.17 3.3 5.8 7.89 5.73 6.4 6.21
Sro641_g180080.1 (Contig1098.g10652)
0.03 31.96 20.44 18.65 16.04 3.32 7.32 4.44 8.55 7.43 7.75 6.58 8.4 2.64 6.49 10.64 6.03 9.88 8.72 9.07 8.1 2.74 7.17 6.25 6.55 6.81 8.45
Sro753_g197290.1 (Contig4403.g33072)
1.61 4.62 5.29 2.35 2.46 0.95 2.78 1.25 1.4 3.79 1.56 3.74 3.83 2.46 3.01 2.8 1.27 1.75 1.66 5.28 5.13 1.93 0.79 3.85 6.4 4.15 1.34
Sro769_g199740.1 (Contig2367.g19476)
0.17 12.52 10.68 8.93 7.72 1.99 6.23 5.48 2.98 6.11 6.81 7.82 8.73 4.32 7.98 4.38 2.86 3.64 7.48 7.5 5.08 1.91 0.97 17.41 6.77 5.46 4.6
Sro780_g201470.1 (Contig2838.g22781)
0.13 15.99 11.54 7.88 13.08 1.01 5.19 2.71 1.3 6.6 5.57 8.03 9.81 5.7 5.46 4.31 4.07 5.5 7.46 10.12 7.98 2.05 1.06 9.09 14.82 8.2 3.53
Sro781_g201660.1 (Contig678.g7949)
0.27 149.75 150.92 169.46 147.08 4.1 35.25 30.11 19.14 37.85 64.47 51.75 14.0 0.77 40.72 110.17 17.31 26.9 67.64 27.46 34.28 6.11 21.32 128.72 120.37 51.33 66.22
Sro871_g213760.1 (Contig1188.g11246)
0.03 6.08 2.65 0.0 0.0 0.45 0.62 0.25 0.05 1.28 0.27 0.24 0.47 0.0 4.1 1.87 0.0 0.37 0.1 0.38 0.4 0.0 0.03 0.39 0.34 0.0 5.76
Sro875_g214310.1 (Contig1071.g10430)
0.13 55.03 36.35 59.05 49.87 2.14 11.65 13.02 9.01 11.33 22.22 8.93 13.64 5.04 13.08 22.64 13.15 16.69 17.26 12.72 8.39 6.38 20.71 10.27 9.5 9.22 16.42
Sro880_g215040.1 (Contig3977.g30542)
8.69 6.19 13.69 36.45 28.03 17.55 13.51 16.27 6.92 14.05 26.58 13.7 11.16 3.79 21.12 20.4 22.69 17.04 7.78 16.4 16.84 1.51 4.93 49.87 51.29 31.67 22.83
Sro977_g227010.1 (Contig4536.g33918)
0.32 16.57 8.44 7.87 8.15 2.1 10.04 10.81 7.71 6.15 15.8 4.5 4.72 2.14 9.65 8.92 6.95 8.03 8.83 4.44 6.47 2.22 3.68 13.26 14.84 11.15 8.19
Sro984_g227890.1 (Contig3577.g27649)
0.81 30.66 13.87 4.43 5.2 0.54 1.08 7.81 2.48 4.09 11.2 0.9 4.3 0.04 2.19 0.76 3.01 1.3 2.0 8.2 2.24 0.27 1.19 5.07 1.94 0.33 9.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)