Heatmap: Cluster_303 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1038_g234310.1 (Contig4312.g32525)
0.01 0.25 0.27 0.18 0.13 0.59 0.6 0.33 0.33 0.68 0.81 0.66 0.52 0.75 0.69 0.48 0.55 0.53 0.71 0.69 0.96 0.52 0.28 0.84 1.0 0.99 0.79
Sro103_g052570.1 (Contig308.g4054)
0.1 0.43 0.28 0.36 0.35 0.26 0.46 0.29 0.4 0.67 0.57 0.92 1.0 0.55 0.55 0.53 0.48 0.41 0.58 0.82 0.72 0.22 0.3 0.45 0.45 0.37 0.47
Sro108_g054060.1 (Contig2294.g18986)
0.12 0.09 0.12 0.1 0.13 0.4 0.43 0.3 0.26 0.68 0.59 1.0 0.31 0.42 0.65 0.78 0.38 0.27 0.25 0.26 0.84 0.28 0.2 0.62 0.95 0.31 0.56
Sro1188_g250560.1 (Contig3566.g27548)
0.06 0.16 0.33 0.32 0.22 0.14 0.47 0.51 0.4 0.68 0.69 1.0 0.41 0.16 0.56 0.83 0.45 0.28 0.38 0.51 0.56 0.19 0.14 0.51 0.3 0.26 0.52
Sro120_g058680.1 (Contig2411.g19746)
0.07 0.14 0.1 0.11 0.14 0.33 0.43 0.26 0.16 0.68 0.76 1.0 0.2 0.47 0.59 0.8 0.47 0.27 0.39 0.39 0.67 0.25 0.14 0.59 0.46 0.36 0.68
Sro1221_g253690.1 (Contig1854.g16193)
0.11 0.18 0.22 0.17 0.21 0.19 0.31 0.34 0.2 0.64 0.6 1.0 0.74 0.47 0.4 0.49 0.32 0.29 0.65 0.92 0.87 0.18 0.16 0.56 0.67 0.4 0.48
Sro1254_g256410.1 (Contig4319.g32590)
0.13 0.15 0.13 0.16 0.17 0.18 0.39 0.2 0.23 0.66 0.73 0.92 0.3 0.4 0.4 0.64 0.47 0.21 0.58 0.55 1.0 0.22 0.22 0.39 0.67 0.41 0.63
Sro1261_g257050.1 (Contig24.g175)
0.17 0.18 0.16 0.2 0.14 0.35 0.41 0.23 0.16 0.62 0.9 0.8 0.44 0.36 0.78 1.0 0.55 0.26 0.3 0.6 0.67 0.16 0.12 0.63 0.33 0.45 0.59
Sro130_g061770.1 (Contig2611.g21100)
0.02 0.25 0.18 0.12 0.15 0.4 0.45 0.36 0.2 0.74 0.97 1.0 0.54 0.48 0.73 0.75 0.49 0.65 0.68 0.89 0.79 0.12 0.16 0.55 0.58 0.5 0.79
Sro1337_g264190.1 (Contig951.g9841)
0.27 1.0 0.37 0.44 0.35 0.08 0.76 0.49 0.42 0.58 0.49 0.85 0.21 0.26 0.55 0.52 0.56 0.54 0.33 0.38 0.55 0.16 0.4 0.58 0.42 0.19 0.31
Sro1337_g264200.1 (Contig951.g9842)
0.32 0.24 0.23 0.24 0.24 0.14 0.52 0.37 0.37 0.58 0.43 1.0 0.3 0.28 0.53 0.6 0.56 0.63 0.34 0.39 0.57 0.07 0.26 0.38 0.25 0.13 0.29
Sro142_g066420.1 (Contig226.g2691)
0.01 0.43 0.32 0.31 0.24 0.36 0.37 0.39 0.32 0.54 0.39 0.59 0.99 0.4 0.56 0.48 0.48 0.49 0.73 1.0 0.87 0.13 0.18 0.41 0.62 0.34 0.34
Sro144_g066840.1 (Contig3873.g29783)
0.42 0.29 0.3 0.35 0.24 0.36 0.39 0.28 0.3 0.68 0.6 1.0 0.43 0.46 0.6 0.81 0.54 0.35 0.52 0.76 0.55 0.16 0.22 0.39 0.35 0.28 0.46
Sro1501_g277880.1 (Contig2462.g20151)
0.04 0.19 0.19 0.19 0.14 0.11 0.4 0.28 0.15 0.54 0.97 0.54 0.16 0.11 0.76 1.0 0.5 0.23 0.23 0.27 0.76 0.09 0.15 0.59 0.56 0.3 0.67
Sro154_g070070.1 (Contig2716.g21885)
0.31 0.4 0.41 0.37 0.31 0.25 0.46 0.38 0.33 0.67 0.92 0.81 0.46 0.42 0.67 1.0 0.55 0.43 0.62 0.5 0.77 0.22 0.3 0.58 0.37 0.37 0.61
Sro1589_g284370.1 (Contig942.g9763)
0.02 0.11 0.13 0.1 0.06 0.29 0.29 0.22 0.15 0.52 0.56 1.0 0.32 0.14 0.48 0.5 0.29 0.56 0.53 0.5 0.5 0.09 0.09 0.53 0.25 0.3 0.49
Sro1603_g285300.1 (Contig1925.g16607)
0.01 0.27 0.21 0.17 0.19 0.44 0.48 0.31 0.15 0.79 0.99 1.0 0.45 0.58 0.71 0.85 0.66 0.41 0.48 0.66 0.52 0.14 0.1 0.66 0.69 0.4 0.72
Sro161_g072540.1 (Contig3982.g30595)
0.03 0.12 0.12 0.15 0.09 0.42 0.39 0.1 0.11 0.76 1.0 0.84 0.6 0.58 0.7 0.87 0.55 0.51 0.81 0.78 0.8 0.11 0.05 0.43 0.57 0.56 0.81
Sro162_g072960.1 (Contig2670.g21632)
0.0 0.06 0.04 0.05 0.04 0.37 0.35 0.25 0.09 0.66 1.0 0.72 0.38 0.53 0.68 0.49 0.99 0.69 0.75 0.6 0.69 0.14 0.05 0.75 0.58 0.81 0.65
Sro1634_g287480.1 (Contig879.g9440)
0.16 0.29 0.17 0.19 0.24 0.18 0.39 0.45 0.19 0.66 0.6 0.9 0.69 0.38 0.59 0.69 0.41 0.4 0.75 1.0 0.75 0.25 0.2 0.5 0.58 0.37 0.53
Sro1642_g288060.1 (Contig4503.g33764)
0.02 0.04 0.07 0.05 0.06 0.14 0.27 0.14 0.08 0.41 0.39 0.63 0.46 0.21 0.4 1.0 0.27 0.19 0.3 0.5 0.39 0.05 0.08 0.29 0.4 0.24 0.37
Sro169_g075180.1 (Contig4412.g33138)
0.04 0.5 0.37 0.33 0.35 0.21 0.59 0.44 0.33 0.81 0.75 1.0 0.75 0.56 0.55 0.68 0.29 0.26 0.45 0.85 0.9 0.21 0.18 0.69 0.74 0.47 0.45
Sro1743_g294820.1 (Contig4739.g35139)
0.03 0.19 0.16 0.18 0.28 0.29 0.34 0.04 0.0 0.62 0.95 0.83 0.63 0.45 0.84 0.57 0.9 0.21 0.42 0.61 1.0 0.01 0.03 0.58 0.47 0.6 0.65
Sro179_g078380.1 (Contig4117.g31430)
0.11 0.22 0.16 0.26 0.29 0.09 0.83 0.77 0.34 0.62 0.28 1.0 0.15 0.16 0.39 0.53 0.14 0.37 0.14 0.15 0.94 0.03 0.38 0.59 0.55 0.23 0.25
Sro1834_g300510.1 (Contig890.g9470)
0.08 0.57 0.41 0.34 0.49 0.3 0.67 0.45 0.34 0.64 0.76 0.55 0.76 0.37 0.72 1.0 0.79 0.56 0.55 0.99 0.69 0.45 0.27 0.51 0.5 0.45 0.61
Sro1842_g301060.1 (Contig2247.g18621)
0.0 0.16 0.29 0.2 0.12 0.09 0.41 0.31 0.26 0.4 0.38 0.33 1.0 0.23 0.57 0.56 0.41 0.35 0.58 0.84 0.38 0.09 0.08 0.46 0.3 0.25 0.32
Sro1861_g302180.1 (Contig35.g218)
0.0 0.26 0.27 0.44 0.46 0.17 0.44 0.4 0.31 0.55 0.55 0.93 0.91 0.27 0.5 0.48 0.32 0.24 0.48 1.0 0.57 0.09 0.1 0.53 0.56 0.27 0.44
0.01 0.11 0.14 0.11 0.1 0.42 0.61 0.31 0.25 0.7 0.83 1.0 0.52 0.61 0.82 0.95 1.0 0.44 0.56 0.67 0.78 0.15 0.22 0.59 0.73 0.58 0.56
Sro2001_g310310.1 (Contig2691.g21732)
0.01 0.51 0.3 0.46 0.25 0.66 0.66 0.46 0.16 0.84 0.7 0.93 0.71 0.98 0.76 0.87 0.57 0.71 0.53 0.89 0.92 0.15 0.19 0.69 1.0 0.63 0.7
Sro2139_g316140.1 (Contig4181.g31888)
1.0 0.11 0.21 0.17 0.13 0.17 0.37 0.29 0.17 0.67 0.64 0.98 0.57 0.2 0.55 0.79 0.39 0.45 0.28 0.77 0.68 0.04 0.14 0.49 0.67 0.38 0.35
Sro2172_g317520.1 (Contig4373.g32909)
0.3 0.5 0.27 0.29 0.26 0.11 0.54 0.38 0.32 0.56 0.55 1.0 0.39 0.29 0.5 0.53 0.54 0.8 0.43 0.51 0.59 0.1 0.26 0.43 0.29 0.14 0.27
Sro21_g014950.1 (Contig813.g9085)
0.04 0.05 0.13 0.1 0.11 0.18 0.57 0.75 0.22 0.62 0.7 0.92 0.53 0.19 0.48 0.66 1.0 0.19 0.15 0.69 0.49 0.08 0.09 0.61 0.89 0.27 0.6
Sro2200_g318850.1 (Contig2408.g19702)
0.12 0.07 0.07 0.2 0.07 0.38 0.45 0.32 0.45 0.51 0.77 0.61 0.4 0.31 0.75 1.0 0.59 0.16 0.28 0.53 0.5 0.12 0.18 0.59 0.32 0.34 0.66
Sro2248_g320710.1 (Contig3132.g24857)
0.01 0.26 0.26 0.24 0.2 0.34 0.55 0.42 0.37 0.82 0.66 0.98 0.8 0.61 0.63 0.87 0.47 0.5 0.55 0.8 1.0 0.33 0.34 0.57 0.84 0.56 0.6
Sro2383_g325620.1 (Contig4229.g32072)
0.12 0.15 0.18 0.1 0.08 0.22 0.29 0.12 0.11 0.52 0.46 1.0 0.41 0.57 0.39 0.48 0.37 0.33 0.41 0.69 0.4 0.04 0.07 0.46 0.37 0.29 0.37
Sro244_g097290.1 (Contig2788.g22445)
0.01 0.15 0.19 0.15 0.14 0.13 0.28 0.17 0.2 0.56 0.47 1.0 0.34 0.51 0.35 0.52 0.36 0.29 0.58 0.52 0.67 0.12 0.15 0.36 0.56 0.57 0.43
Sro274_g105480.1 (Contig1557.g14172)
0.02 0.3 0.19 0.24 0.23 0.58 0.5 0.37 0.26 0.79 0.84 0.98 0.65 0.71 0.74 0.91 0.6 0.45 0.56 0.9 1.0 0.26 0.22 0.65 0.49 0.44 0.65
0.01 0.15 0.16 0.2 0.18 0.13 0.26 0.22 0.21 0.48 0.5 0.69 1.0 0.53 0.37 0.34 0.26 0.32 0.49 0.86 0.42 0.07 0.12 0.33 0.41 0.39 0.33
Sro326_g117990.1 (Contig1080.g10487)
0.01 0.23 0.19 0.12 0.1 0.14 0.4 0.29 0.14 0.54 0.41 0.88 0.36 0.34 0.48 1.0 0.23 0.42 0.57 0.52 0.59 0.12 0.12 0.44 0.56 0.39 0.43
Sro337_g120500.1 (Contig2800.g22508)
0.01 0.41 0.58 0.39 0.27 0.39 0.55 0.42 0.34 0.61 0.59 0.75 0.58 0.45 0.6 0.56 0.58 0.24 0.41 0.8 1.0 0.49 0.29 0.62 0.68 0.66 0.7
Sro3406_g347660.1 (Contig617.g7582)
0.0 0.23 0.2 0.23 0.28 0.13 0.31 0.24 0.19 0.46 0.33 0.48 1.0 0.31 0.53 0.45 0.3 0.45 0.55 0.86 0.5 0.14 0.08 0.22 0.62 0.34 0.4
Sro352_g124250.1 (Contig2645.g21401)
0.01 0.88 0.67 0.92 0.68 0.16 0.61 0.43 0.22 0.74 0.84 1.0 0.37 0.09 0.51 0.87 0.7 0.48 0.74 0.49 0.73 0.11 0.11 0.78 0.67 0.33 0.9
Sro354_g124730.1 (Contig4485.g33696)
0.01 0.24 0.34 0.29 0.25 0.22 0.31 0.27 0.28 0.63 0.65 0.94 0.73 0.61 0.59 1.0 0.65 0.33 0.67 0.77 0.67 0.39 0.26 0.3 0.36 0.33 0.46
Sro359_g126080.1 (Contig295.g3869)
0.08 0.2 0.14 0.06 0.05 0.14 0.68 0.68 0.31 0.79 0.79 1.0 0.18 0.28 0.52 0.55 0.47 0.55 0.8 0.88 0.91 0.19 0.2 0.64 0.89 0.54 0.88
Sro35_g022600.1 (Contig3323.g26137)
0.0 0.85 0.89 0.52 0.35 0.22 0.57 0.4 0.26 0.63 0.83 0.64 0.69 0.36 0.7 0.92 0.63 0.64 0.6 0.9 1.0 0.73 0.19 0.61 0.69 0.59 0.67
Sro385_g131730.1 (Contig3292.g25855)
0.0 0.28 0.43 0.31 0.21 0.51 0.55 0.34 0.4 0.65 0.9 0.69 0.74 0.43 0.81 0.6 0.6 0.4 0.53 1.0 0.89 0.46 0.36 0.64 0.8 0.69 0.57
Sro389_g132550.1 (Contig669.g7872)
0.06 0.17 0.2 0.2 0.18 0.2 0.52 0.37 0.16 0.58 0.85 0.75 0.34 0.23 0.69 1.0 0.47 0.31 0.33 0.63 0.55 0.07 0.12 0.7 0.54 0.38 0.56
Sro40_g024720.1 (Contig335.g4479)
0.02 0.08 0.08 0.09 0.08 0.32 0.51 0.41 0.23 0.59 0.78 0.7 0.2 0.46 0.69 1.0 0.46 0.46 0.44 0.26 0.39 0.07 0.13 0.42 0.45 0.23 0.64
Sro419_g138980.1 (Contig4415.g33159)
0.12 0.14 0.05 0.16 0.14 0.13 0.36 0.06 0.12 0.58 0.62 1.0 0.53 0.48 0.47 0.53 0.44 0.26 0.47 0.86 0.58 0.16 0.22 0.44 0.34 0.31 0.39
Sro455_g146530.1 (Contig189.g2196)
0.03 0.36 0.51 0.21 0.13 0.07 0.26 0.16 0.05 0.67 0.81 1.0 0.21 0.37 0.55 0.76 0.38 0.73 0.71 0.49 0.7 0.01 0.02 0.82 0.27 0.25 0.49
Sro456_g146700.1 (Contig1868.g16334)
0.01 0.25 0.2 0.38 0.23 0.31 0.24 0.23 0.22 0.61 0.56 1.0 0.65 0.48 0.56 0.64 0.46 0.36 0.55 0.71 0.63 0.33 0.26 0.35 0.37 0.37 0.54
Sro473_g150130.1 (Contig2918.g23233)
0.02 0.27 0.28 0.19 0.24 0.42 0.61 0.62 0.53 0.64 0.66 0.72 0.42 0.34 0.58 1.0 0.34 0.4 0.39 0.45 0.79 0.37 0.25 0.56 0.48 0.51 0.56
Sro490_g153600.1 (Contig328.g4380)
0.0 0.15 0.0 0.07 0.05 0.1 0.96 0.39 0.06 0.69 0.73 0.61 0.31 0.44 0.8 0.67 0.51 0.71 0.65 0.68 0.98 0.63 0.18 0.48 1.0 0.86 0.66
Sro506_g156390.1 (Contig3494.g27116)
0.08 0.13 0.09 0.21 0.14 0.24 0.48 0.36 0.39 0.59 0.63 1.0 0.22 0.21 0.42 0.38 0.35 0.15 0.26 0.48 0.62 0.09 0.15 0.57 0.64 0.34 0.47
Sro584_g170880.1 (Contig2089.g17813)
0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.38 0.7 0.23 0.09 0.74 0.87 0.88 0.49 0.9 0.59 0.64 0.56 0.17 0.28 0.77 0.71 0.11 0.12 0.61 0.72 0.45 1.0
Sro60_g034670.1 (Contig797.g8944)
0.07 0.34 0.29 0.26 0.23 0.24 0.41 0.35 0.2 0.7 0.69 1.0 0.19 0.5 0.45 0.55 0.32 0.43 0.68 0.37 0.89 0.14 0.21 0.62 0.74 0.5 0.6
Sro639_g179680.1 (Contig197.g2289)
0.01 0.26 0.05 0.19 0.18 0.08 0.27 0.09 0.11 0.54 0.26 1.0 0.28 0.03 0.4 0.8 0.43 0.39 0.15 0.24 0.5 0.01 0.08 0.19 0.09 0.1 0.24
Sro671_g184800.1 (Contig562.g7137)
0.01 0.11 0.15 0.08 0.03 0.14 0.29 0.1 0.3 0.49 0.73 1.0 0.34 0.09 0.45 0.58 0.4 0.14 0.39 0.56 0.5 0.05 0.06 0.48 0.37 0.12 0.64
Sro719_g192410.1 (Contig661.g7827)
0.03 0.03 0.02 0.08 0.08 0.25 0.32 0.23 0.12 0.76 0.52 1.0 0.32 0.5 0.45 0.73 0.4 0.26 0.55 0.67 0.96 0.05 0.07 0.49 0.61 0.45 0.61
Sro72_g039960.1 (Contig1459.g13395)
0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.31 0.17 0.02 0.48 0.74 0.66 0.07 0.2 0.48 0.45 0.71 0.12 0.22 0.4 1.0 0.0 0.02 0.41 0.62 0.29 0.41
Sro740_g195530.1 (Contig168.g1892)
0.0 0.08 0.07 0.11 0.05 0.44 0.56 0.44 0.22 0.6 0.76 0.64 0.33 0.36 0.62 0.53 0.61 0.42 0.29 0.29 1.0 0.34 0.22 0.55 0.71 0.63 0.65
Sro751_g197050.1 (Contig4217.g32050)
0.6 0.14 0.18 0.13 0.1 0.19 0.52 0.48 0.32 0.64 0.61 1.0 0.43 0.31 0.54 0.6 0.48 0.8 0.42 0.66 0.7 0.08 0.26 0.7 0.81 0.51 0.4
Sro811_g205910.1 (Contig4366.g32888)
0.02 0.4 0.14 0.16 0.16 0.43 0.57 0.36 0.12 0.71 0.54 0.77 0.89 0.54 0.59 0.6 0.32 0.59 0.33 1.0 0.48 0.19 0.1 0.4 0.42 0.48 0.72
Sro86_g045790.1 (Contig2999.g23857)
0.02 0.08 0.04 0.03 0.02 0.2 0.3 0.42 0.08 0.79 0.58 0.91 0.13 0.39 0.52 0.99 0.36 0.52 0.74 0.66 0.95 0.31 0.07 0.64 1.0 0.92 0.9
Sro873_g214020.1 (Contig3883.g29840)
0.07 0.2 0.25 0.27 0.27 0.29 0.37 0.23 0.26 0.56 0.42 0.82 0.83 0.45 0.48 0.54 0.38 0.45 0.72 1.0 0.51 0.16 0.26 0.39 0.4 0.26 0.36
Sro877_g214600.1 (Contig139.g1541)
0.01 0.1 0.15 0.13 0.14 0.23 0.83 1.0 0.42 0.69 0.68 0.8 0.11 0.53 0.8 0.94 0.41 0.18 0.06 0.18 0.87 0.05 0.32 0.37 0.45 0.3 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)