Heatmap: Cluster_303 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1038_g234310.1 (Contig4312.g32525)
0.23 4.53 4.81 3.27 2.23 10.56 10.75 5.95 5.96 12.08 14.39 11.77 9.36 13.31 12.32 8.56 9.84 9.48 12.71 12.26 17.2 9.32 5.02 14.99 17.86 17.65 14.19
Sro103_g052570.1 (Contig308.g4054)
1.63 7.12 4.56 5.96 5.82 4.19 7.56 4.83 6.63 11.06 9.4 15.09 16.42 9.09 8.99 8.74 7.85 6.66 9.54 13.53 11.86 3.64 4.93 7.4 7.44 6.12 7.74
Sro108_g054060.1 (Contig2294.g18986)
7.32 5.78 7.63 6.47 7.97 24.85 26.8 18.39 15.85 41.74 36.57 61.66 19.4 25.64 40.25 48.24 23.2 16.86 15.38 16.14 51.89 16.96 12.16 38.18 58.37 18.91 34.78
Sro1188_g250560.1 (Contig3566.g27548)
0.58 1.56 3.28 3.19 2.13 1.42 4.59 5.02 3.9 6.67 6.75 9.84 4.07 1.53 5.48 8.17 4.44 2.73 3.78 5.02 5.53 1.85 1.41 5.04 2.97 2.54 5.07
Sro120_g058680.1 (Contig2411.g19746)
1.12 2.33 1.58 1.86 2.3 5.43 7.08 4.32 2.61 11.17 12.51 16.45 3.37 7.68 9.77 13.18 7.77 4.4 6.37 6.42 11.08 4.14 2.29 9.69 7.64 5.86 11.19
Sro1221_g253690.1 (Contig1854.g16193)
1.07 1.79 2.18 1.7 2.1 1.89 3.07 3.38 2.02 6.42 5.98 9.99 7.41 4.69 3.99 4.87 3.24 2.9 6.47 9.23 8.7 1.83 1.55 5.62 6.72 3.96 4.75
Sro1254_g256410.1 (Contig4319.g32590)
6.07 6.97 5.97 7.37 8.07 8.26 18.27 9.37 10.73 30.85 34.2 42.93 14.1 18.84 18.85 29.9 21.74 9.99 27.0 25.68 46.56 10.14 10.31 18.26 31.21 19.26 29.47
Sro1261_g257050.1 (Contig24.g175)
1.37 1.41 1.31 1.62 1.15 2.81 3.23 1.8 1.29 4.94 7.15 6.36 3.48 2.87 6.21 7.96 4.38 2.04 2.36 4.79 5.36 1.31 0.92 5.03 2.61 3.54 4.73
Sro130_g061770.1 (Contig2611.g21100)
0.12 1.29 0.91 0.61 0.76 2.04 2.29 1.82 1.01 3.72 4.91 5.06 2.75 2.44 3.71 3.8 2.47 3.31 3.47 4.52 3.97 0.6 0.8 2.8 2.94 2.53 3.98
Sro1337_g264190.1 (Contig951.g9841)
20.86 76.64 28.47 33.73 26.83 6.41 58.55 37.66 32.3 44.22 37.38 65.53 16.43 20.28 41.88 39.96 42.89 41.52 24.93 28.98 42.05 12.09 30.48 44.62 32.15 14.28 23.99
Sro1337_g264200.1 (Contig951.g9842)
10.83 8.25 7.78 8.08 8.08 4.86 17.63 12.63 12.4 19.51 14.49 33.88 10.23 9.36 17.8 20.2 18.9 21.51 11.64 13.37 19.26 2.51 8.89 12.89 8.33 4.35 9.95
Sro142_g066420.1 (Contig226.g2691)
0.33 10.83 8.1 7.8 5.98 9.11 9.47 9.84 8.22 13.77 9.95 14.86 25.14 10.02 14.14 12.1 12.08 12.36 18.43 25.36 22.08 3.36 4.66 10.47 15.72 8.61 8.55
Sro144_g066840.1 (Contig3873.g29783)
5.91 4.11 4.23 4.96 3.44 5.05 5.48 3.97 4.25 9.67 8.5 14.18 6.15 6.5 8.52 11.43 7.71 4.98 7.41 10.83 7.85 2.27 3.07 5.58 5.03 4.04 6.47
Sro1501_g277880.1 (Contig2462.g20151)
1.11 4.76 4.61 4.74 3.45 2.7 9.89 6.91 3.73 13.37 24.02 13.52 3.9 2.62 18.98 24.81 12.42 5.62 5.7 6.8 18.82 2.15 3.74 14.64 13.86 7.51 16.65
Sro154_g070070.1 (Contig2716.g21885)
27.75 35.52 36.53 33.6 27.57 22.54 41.39 33.75 29.57 60.43 82.79 72.98 41.26 37.56 60.18 89.85 49.53 39.06 55.65 44.52 69.18 20.14 27.13 52.17 33.13 33.14 55.1
Sro1589_g284370.1 (Contig942.g9763)
1.0 5.24 6.46 4.83 3.21 14.2 14.58 10.73 7.3 25.85 27.86 49.69 15.73 7.07 23.67 24.93 14.48 27.77 26.38 24.95 24.8 4.66 4.5 26.38 12.25 14.92 24.56
Sro1603_g285300.1 (Contig1925.g16607)
0.3 8.14 6.33 5.02 5.59 13.22 14.36 9.27 4.55 23.54 29.46 29.83 13.48 17.16 21.06 25.48 19.73 12.09 14.42 19.62 15.43 4.12 2.87 19.59 20.73 11.99 21.55
Sro161_g072540.1 (Contig3982.g30595)
0.73 2.65 2.63 3.41 1.99 9.2 8.7 2.31 2.52 16.76 22.02 18.42 13.13 12.82 15.51 19.2 12.17 11.14 17.9 17.26 17.62 2.44 1.19 9.48 12.45 12.27 17.84
Sro162_g072960.1 (Contig2670.g21632)
0.0 0.28 0.2 0.23 0.18 1.87 1.74 1.24 0.46 3.32 5.01 3.6 1.9 2.63 3.4 2.43 4.99 3.48 3.73 2.99 3.47 0.69 0.26 3.75 2.92 4.04 3.24
Sro1634_g287480.1 (Contig879.g9440)
1.46 2.71 1.54 1.78 2.25 1.63 3.64 4.19 1.75 6.15 5.58 8.32 6.39 3.56 5.47 6.42 3.8 3.72 6.91 9.26 6.96 2.28 1.88 4.62 5.36 3.46 4.95
Sro1642_g288060.1 (Contig4503.g33764)
4.13 7.77 14.92 11.34 13.23 30.99 60.46 30.76 17.56 90.19 86.52 138.36 101.72 45.27 87.91 220.76 60.15 43.01 66.82 110.94 85.09 10.92 17.55 64.8 87.29 53.16 82.21
Sro169_g075180.1 (Contig4412.g33138)
0.27 3.31 2.47 2.18 2.32 1.42 3.88 2.94 2.2 5.38 4.96 6.61 4.97 3.68 3.63 4.52 1.91 1.73 3.01 5.59 5.96 1.37 1.2 4.57 4.88 3.12 2.96
Sro1743_g294820.1 (Contig4739.g35139)
0.08 0.57 0.48 0.56 0.84 0.89 1.05 0.13 0.0 1.91 2.91 2.52 1.91 1.37 2.56 1.75 2.74 0.63 1.29 1.87 3.06 0.02 0.1 1.76 1.44 1.84 1.98
Sro179_g078380.1 (Contig4117.g31430)
5.93 11.61 8.54 13.88 15.23 4.81 44.1 40.97 18.19 32.78 14.85 52.89 7.84 8.61 20.82 28.29 7.36 19.4 7.16 8.01 49.66 1.52 20.26 31.24 29.02 11.97 13.11
Sro1834_g300510.1 (Contig890.g9470)
0.49 3.58 2.57 2.1 3.08 1.88 4.19 2.79 2.14 3.99 4.77 3.45 4.77 2.35 4.51 6.26 4.92 3.53 3.45 6.18 4.3 2.84 1.68 3.16 3.16 2.82 3.83
Sro1842_g301060.1 (Contig2247.g18621)
0.0 1.11 1.95 1.37 0.82 0.62 2.76 2.09 1.77 2.71 2.57 2.21 6.79 1.55 3.87 3.78 2.75 2.36 3.96 5.73 2.57 0.63 0.54 3.15 2.02 1.72 2.19
Sro1861_g302180.1 (Contig35.g218)
0.02 1.22 1.26 2.07 2.13 0.78 2.05 1.87 1.42 2.55 2.58 4.36 4.25 1.27 2.35 2.22 1.49 1.14 2.24 4.67 2.68 0.42 0.46 2.48 2.62 1.28 2.06
0.09 0.68 0.89 0.69 0.59 2.56 3.75 1.93 1.56 4.33 5.07 6.15 3.18 3.73 5.06 5.85 6.15 2.68 3.43 4.13 4.77 0.95 1.37 3.6 4.49 3.56 3.43
Sro2001_g310310.1 (Contig2691.g21732)
0.47 16.05 9.41 14.49 7.91 20.97 20.93 14.54 4.89 26.52 22.05 29.28 22.57 30.99 23.89 27.32 18.12 22.4 16.88 28.06 29.17 4.81 6.13 21.91 31.57 19.76 22.16
Sro2139_g316140.1 (Contig4181.g31888)
239.75 25.62 49.83 41.86 30.89 40.26 89.21 68.44 40.18 161.75 153.99 234.23 136.26 47.72 131.49 189.25 93.45 108.61 67.13 183.48 161.92 8.41 33.95 116.4 161.54 91.82 83.63
Sro2172_g317520.1 (Contig4373.g32909)
10.85 17.93 9.83 10.51 9.37 4.02 19.4 13.78 11.49 20.23 20.04 36.2 13.97 10.41 18.17 19.04 19.57 28.9 15.74 18.58 21.38 3.48 9.31 15.71 10.35 4.91 9.92
Sro21_g014950.1 (Contig813.g9085)
0.44 0.53 1.3 1.03 1.15 1.83 5.83 7.76 2.27 6.39 7.2 9.48 5.46 2.01 4.91 6.85 10.32 1.93 1.52 7.17 5.08 0.78 0.88 6.31 9.22 2.83 6.2
Sro2200_g318850.1 (Contig2408.g19702)
1.14 0.7 0.72 1.98 0.7 3.64 4.33 3.07 4.36 4.92 7.43 5.92 3.83 2.99 7.29 9.68 5.71 1.53 2.75 5.17 4.86 1.12 1.74 5.69 3.11 3.26 6.36
Sro2248_g320710.1 (Contig3132.g24857)
0.32 6.23 6.32 5.79 4.9 8.14 13.18 10.09 8.98 19.83 15.9 23.58 19.38 14.77 15.08 20.9 11.39 12.07 13.25 19.37 24.09 8.02 8.1 13.62 20.16 13.47 14.46
Sro2383_g325620.1 (Contig4229.g32072)
1.31 1.71 1.99 1.12 0.92 2.39 3.2 1.3 1.26 5.82 5.15 11.12 4.58 6.33 4.29 5.33 4.07 3.65 4.55 7.72 4.46 0.45 0.79 5.17 4.09 3.22 4.17
Sro244_g097290.1 (Contig2788.g22445)
0.2 3.23 4.04 3.18 3.0 2.8 5.89 3.57 4.27 12.05 9.94 21.34 7.17 10.83 7.38 11.18 7.63 6.11 12.33 11.16 14.19 2.63 3.12 7.68 11.99 12.09 9.25
Sro274_g105480.1 (Contig1557.g14172)
0.26 3.68 2.33 2.93 2.75 7.04 6.11 4.55 3.19 9.63 10.21 11.88 7.85 8.6 9.05 11.11 7.25 5.47 6.83 10.97 12.15 3.21 2.64 7.94 5.93 5.36 7.84
0.13 2.19 2.33 2.95 2.66 1.97 3.83 3.26 3.13 7.04 7.41 10.15 14.8 7.78 5.47 5.07 3.78 4.69 7.23 12.73 6.28 1.0 1.72 4.95 6.02 5.7 4.94
Sro326_g117990.1 (Contig1080.g10487)
0.18 3.48 2.91 1.8 1.55 2.05 6.14 4.34 2.15 8.22 6.22 13.31 5.46 5.14 7.29 15.18 3.49 6.36 8.65 7.87 8.92 1.76 1.89 6.6 8.53 5.94 6.54
Sro337_g120500.1 (Contig2800.g22508)
0.08 2.77 3.93 2.63 1.85 2.65 3.7 2.86 2.34 4.15 3.99 5.06 3.91 3.05 4.09 3.77 3.91 1.61 2.8 5.43 6.78 3.36 1.96 4.23 4.62 4.51 4.76
Sro3406_g347660.1 (Contig617.g7582)
0.04 1.94 1.67 1.95 2.36 1.08 2.63 2.02 1.57 3.88 2.74 3.99 8.38 2.58 4.42 3.78 2.52 3.74 4.57 7.24 4.23 1.19 0.71 1.88 5.24 2.84 3.37
Sro352_g124250.1 (Contig2645.g21401)
0.12 9.99 7.64 10.48 7.72 1.8 6.93 4.93 2.48 8.36 9.51 11.34 4.16 1.06 5.78 9.9 7.95 5.41 8.37 5.52 8.28 1.28 1.24 8.88 7.56 3.73 10.26
Sro354_g124730.1 (Contig4485.g33696)
0.32 5.41 7.62 6.49 5.61 4.78 6.8 5.99 6.1 13.99 14.32 20.91 16.15 13.55 13.11 22.16 14.51 7.3 14.93 17.08 14.8 8.73 5.85 6.59 7.88 7.35 10.19
Sro359_g126080.1 (Contig295.g3869)
2.82 6.84 4.86 2.23 1.8 4.74 23.65 23.51 10.64 27.47 27.23 34.58 6.18 9.64 18.13 19.02 16.15 19.14 27.69 30.3 31.6 6.59 6.87 22.21 30.7 18.55 30.53
Sro35_g022600.1 (Contig3323.g26137)
0.01 4.05 4.26 2.51 1.7 1.06 2.73 1.93 1.22 3.04 4.0 3.07 3.33 1.71 3.35 4.39 3.0 3.07 2.85 4.29 4.79 3.48 0.91 2.94 3.29 2.84 3.19
Sro385_g131730.1 (Contig3292.g25855)
0.03 1.95 2.97 2.14 1.47 3.54 3.76 2.33 2.76 4.48 6.17 4.73 5.1 2.94 5.56 4.13 4.16 2.74 3.68 6.88 6.14 3.2 2.45 4.43 5.54 4.73 3.93
Sro389_g132550.1 (Contig669.g7872)
0.58 1.7 2.0 1.99 1.8 1.95 5.19 3.67 1.64 5.75 8.41 7.42 3.33 2.25 6.9 9.94 4.63 3.1 3.25 6.22 5.45 0.65 1.19 6.94 5.35 3.78 5.55
Sro40_g024720.1 (Contig335.g4479)
1.06 4.16 4.25 4.69 4.12 17.05 27.51 21.88 12.34 31.31 41.79 37.37 10.48 24.43 37.04 53.46 24.69 24.6 23.6 13.81 20.89 3.54 6.72 22.7 23.97 12.46 33.98
Sro419_g138980.1 (Contig4415.g33159)
0.89 1.06 0.34 1.14 1.04 0.98 2.6 0.46 0.92 4.26 4.51 7.33 3.86 3.48 3.46 3.86 3.24 1.87 3.46 6.33 4.26 1.18 1.58 3.2 2.51 2.25 2.87
Sro455_g146530.1 (Contig189.g2196)
0.12 1.24 1.76 0.73 0.45 0.25 0.88 0.55 0.17 2.29 2.76 3.43 0.71 1.27 1.89 2.61 1.32 2.51 2.45 1.67 2.38 0.03 0.08 2.81 0.92 0.86 1.67
Sro456_g146700.1 (Contig1868.g16334)
0.15 2.59 2.09 3.95 2.33 3.15 2.49 2.4 2.27 6.32 5.72 10.28 6.71 4.95 5.72 6.54 4.71 3.7 5.61 7.27 6.44 3.41 2.69 3.61 3.85 3.85 5.56
Sro473_g150130.1 (Contig2918.g23233)
0.62 7.95 8.19 5.78 7.18 12.62 18.05 18.51 15.75 19.05 19.57 21.52 12.56 10.04 17.36 29.71 10.15 11.79 11.55 13.41 23.52 10.94 7.52 16.66 14.17 15.23 16.74
Sro490_g153600.1 (Contig328.g4380)
0.0 0.59 0.0 0.29 0.21 0.4 3.71 1.51 0.25 2.66 2.81 2.37 1.19 1.72 3.09 2.59 1.98 2.73 2.5 2.63 3.8 2.45 0.68 1.85 3.86 3.34 2.56
Sro506_g156390.1 (Contig3494.g27116)
3.66 5.94 3.93 9.4 6.36 10.73 21.53 16.4 17.65 26.55 28.65 45.21 10.1 9.44 19.03 17.24 15.92 6.73 11.86 21.51 27.82 3.85 6.8 25.82 28.77 15.47 21.33
Sro584_g170880.1 (Contig2089.g17813)
0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.46 0.84 0.28 0.11 0.89 1.05 1.07 0.6 1.09 0.71 0.77 0.67 0.21 0.34 0.93 0.86 0.14 0.14 0.73 0.86 0.54 1.21
Sro60_g034670.1 (Contig797.g8944)
3.46 17.37 14.72 13.34 11.77 12.27 20.85 18.17 10.3 36.02 35.68 51.4 9.62 25.63 22.99 28.2 16.4 22.18 34.8 19.23 45.6 7.25 10.7 31.84 38.15 25.62 31.05
Sro639_g179680.1 (Contig197.g2289)
0.07 1.91 0.37 1.41 1.29 0.62 2.0 0.65 0.83 3.97 1.92 7.38 2.04 0.2 2.97 5.91 3.15 2.89 1.08 1.74 3.67 0.11 0.56 1.37 0.64 0.74 1.8
Sro671_g184800.1 (Contig562.g7137)
0.08 1.11 1.5 0.87 0.33 1.39 2.93 1.07 3.1 5.03 7.43 10.24 3.47 0.92 4.64 5.93 4.11 1.45 4.0 5.7 5.09 0.49 0.63 4.94 3.77 1.2 6.51
Sro719_g192410.1 (Contig661.g7827)
0.89 0.9 0.69 2.43 2.41 7.2 9.27 6.65 3.49 22.3 15.37 29.33 9.3 14.55 13.26 21.3 11.65 7.69 16.06 19.78 28.02 1.36 2.16 14.25 17.94 13.16 17.89
Sro72_g039960.1 (Contig1459.g13395)
0.2 0.12 0.07 0.0 0.0 0.15 2.12 1.15 0.13 3.26 5.04 4.5 0.45 1.38 3.29 3.07 4.89 0.81 1.49 2.77 6.85 0.01 0.16 2.8 4.26 2.02 2.78
Sro740_g195530.1 (Contig168.g1892)
0.03 0.58 0.55 0.83 0.35 3.24 4.15 3.26 1.67 4.5 5.66 4.73 2.48 2.71 4.64 3.95 4.57 3.09 2.15 2.15 7.45 2.55 1.65 4.11 5.27 4.67 4.81
Sro751_g197050.1 (Contig4217.g32050)
140.36 32.1 42.17 29.65 24.12 45.25 120.69 111.43 73.67 148.29 142.01 233.37 101.2 71.62 126.07 139.61 113.02 187.5 96.92 153.66 163.93 18.28 60.29 162.86 189.28 118.29 92.42
Sro811_g205910.1 (Contig4366.g32888)
0.06 1.5 0.54 0.61 0.59 1.63 2.14 1.37 0.44 2.67 2.03 2.9 3.36 2.04 2.21 2.26 1.22 2.25 1.23 3.78 1.82 0.74 0.38 1.52 1.6 1.82 2.72
Sro86_g045790.1 (Contig2999.g23857)
0.22 1.01 0.42 0.31 0.28 2.36 3.6 5.04 0.94 9.42 6.88 10.82 1.54 4.7 6.17 11.79 4.31 6.26 8.82 7.89 11.34 3.65 0.86 7.61 11.95 11.01 10.73
Sro873_g214020.1 (Contig3883.g29840)
0.99 2.99 3.64 4.01 4.03 4.25 5.46 3.41 3.78 8.3 6.22 12.1 12.17 6.64 7.01 7.9 5.56 6.56 10.6 14.73 7.58 2.36 3.87 5.7 5.84 3.79 5.23
Sro877_g214600.1 (Contig139.g1541)
0.14 1.09 1.68 1.44 1.61 2.55 9.35 11.26 4.74 7.74 7.71 8.95 1.23 6.01 9.0 10.62 4.56 2.02 0.73 1.99 9.78 0.53 3.62 4.22 5.1 3.37 5.61

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)