Heatmap: Cluster_241 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1018_g231880.1 (Contig4480.g33670)	0.58	0.12	0.16	0.18	0.15	0.3	0.33	0.4	0.49	0.78	0.48	0.92	0.48	0.27	0.28	0.37	0.23	0.22	0.26	0.61	1.0	0.23	0.27	0.41	0.32	0.2	0.29
Sro1029_g233280.1 (Contig460.g6201)	0.85	0.03	0.02	0.02	0.03	0.11	0.51	0.38	0.3	0.62	0.18	1.0	0.15	0.21	0.19	0.13	0.11	0.15	0.14	0.43	0.75	0.22	0.14	0.21	0.32	0.21	0.14
Sro1056_g236200.1 (Contig4431.g33261)	0.19	0.04	0.05	0.07	0.05	0.17	0.51	0.44	0.33	0.7	0.3	1.0	0.37	0.47	0.4	0.29	0.28	0.3	0.41	0.54	0.47	0.25	0.24	0.23	0.29	0.17	0.21
Sro1059_g236460.1 (Contig822.g9122)	0.25	0.0	0.01	0.01	0.01	0.06	0.35	0.12	0.21	0.61	0.2	1.0	0.29	0.18	0.16	0.13	0.14	0.13	0.13	0.48	0.56	0.01	0.13	0.19	0.27	0.09	0.13
Sro1151_g246710.1 (Contig4710.g35022)	0.32	0.13	0.19	0.25	0.3	0.12	0.28	0.38	0.33	0.56	0.41	1.0	0.11	0.23	0.31	0.31	0.29	0.12	0.26	0.37	0.63	0.29	0.23	0.32	0.42	0.29	0.25
Sro1258_g256770.1 (Contig3284.g25814)	0.36	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.44	0.28	0.64	0.09	1.0	0.29	0.23	0.11	0.07	0.05	0.37	0.37	0.75	0.36	0.28	0.12	0.09	0.1	0.1	0.09
Sro1285_g259320.1 (Contig851.g9360)	0.12	0.05	0.12	0.09	0.1	0.18	0.25	0.3	0.36	0.62	0.32	1.0	0.29	0.36	0.34	0.31	0.3	0.17	0.15	0.32	0.51	0.37	0.25	0.25	0.33	0.35	0.28
Sro1398_g269220.1 (Contig4711.g35034)	0.49	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.41	0.35	0.25	0.7	0.17	1.0	0.22	0.32	0.2	0.15	0.07	0.09	0.13	0.46	0.69	0.13	0.12	0.26	0.18	0.1	0.15
Sro1468_g275180.1 (Contig3834.g29484)	0.22	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.18	0.27	0.21	0.81	0.15	1.0	0.19	0.23	0.12	0.13	0.07	0.21	0.12	0.39	0.86	0.28	0.11	0.01	0.0	0.03	0.1
Sro148_g068120.1 (Contig3597.g27804)	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.07	0.29	0.23	0.11	0.56	0.12	1.0	0.08	0.28	0.14	0.08	0.05	0.08	0.1	0.22	0.41	0.09	0.05	0.07	0.03	0.04	0.08
Sro1583_g283980.1 (Contig2117.g17917)	0.08	0.01	0.0	0.01	0.01	0.19	0.58	0.3	0.17	0.72	0.26	1.0	0.18	0.33	0.39	0.28	0.14	0.23	0.32	0.36	0.78	0.05	0.11	0.29	0.43	0.25	0.21
Sro1638_g287730.1 (Contig4204.g31973)	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.19	0.32	0.33	0.19	0.7	0.32	0.84	0.58	0.41	0.37	0.36	0.28	0.37	0.49	1.0	0.71	0.27	0.11	0.3	0.4	0.26	0.28
Sro172_g075890.1 (Contig1453.g13298)	0.2	0.1	0.32	0.1	0.08	0.05	0.5	0.45	0.51	0.76	0.29	1.0	0.26	0.27	0.18	0.15	0.16	0.16	0.2	0.38	0.78	0.18	0.28	0.37	0.33	0.24	0.13
Sro1799_g298410.1 (Contig3588.g27732)	0.38	0.13	0.13	0.18	0.09	0.21	0.45	0.46	0.35	0.82	0.45	1.0	0.5	0.52	0.49	0.38	0.24	0.36	0.6	0.69	0.86	0.34	0.2	0.43	0.4	0.25	0.34
Sro190_g082000.1 (Contig3488.g27075)	0.14	0.02	0.02	0.05	0.05	0.1	0.26	0.12	0.1	0.7	0.15	1.0	0.31	0.21	0.21	0.17	0.08	0.13	0.14	0.8	0.73	0.4	0.14	0.08	0.04	0.04	0.17
Sro1959_g307980.1 (Contig1986.g16999)	0.09	0.01	0.0	0.0	0.01	0.08	0.22	0.22	0.15	0.52	0.1	1.0	0.08	0.17	0.09	0.09	0.06	0.05	0.06	0.2	0.55	0.09	0.07	0.11	0.16	0.07	0.1
Sro2005_g310530.1 (Contig1905.g16501)	0.33	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.53	0.3	0.23	0.61	0.17	1.0	0.16	0.25	0.18	0.13	0.11	0.15	0.15	0.45	0.55	0.12	0.19	0.12	0.1	0.06	0.12
Sro2018_g311210.1 (Contig4652.g34628)	0.76	0.02	0.02	0.05	0.06	0.12	0.36	0.29	0.25	0.64	0.43	1.0	0.2	0.19	0.39	0.4	0.27	0.21	0.27	0.49	0.54	0.19	0.17	0.21	0.1	0.12	0.33
Sro2078_g313650.1 (Contig3499.g27146)	0.12	0.06	0.05	0.15	0.12	0.23	0.38	0.34	0.2	0.65	0.44	1.0	0.59	0.22	0.43	0.41	0.27	0.31	0.39	1.0	0.71	0.18	0.11	0.37	0.38	0.23	0.29
Sro219_g090490.1 (Contig3313.g25989)	0.48	0.04	0.07	0.11	0.16	0.05	0.58	0.76	0.65	0.71	0.22	0.99	0.45	0.23	0.29	0.23	0.16	0.11	0.25	0.84	1.0	0.42	0.38	0.28	0.36	0.12	0.21
Sro21_g014630.1 (Contig813.g9053)	0.11	0.07	0.08	0.15	0.1	0.08	0.3	0.24	0.24	0.66	0.31	1.0	0.53	0.3	0.24	0.25	0.2	0.29	0.41	0.9	0.53	0.2	0.13	0.18	0.18	0.23	0.24
Sro241_g096240.1 (Contig4317.g32542)	0.16	0.0	0.01	0.01	0.01	0.13	0.51	0.67	0.28	0.92	0.19	1.0	0.4	0.36	0.27	0.16	0.04	0.33	0.23	0.82	0.87	0.22	0.11	0.13	0.15	0.08	0.22
Sro2691_g334760.1 (Contig4382.g32963)	0.15	0.02	0.04	0.04	0.04	0.08	0.32	0.08	0.14	0.68	0.1	1.0	0.05	0.28	0.14	0.16	0.05	0.09	0.06	0.11	0.53	0.0	0.09	0.07	0.01	0.03	0.11
Sro2940_g340680.1 (Contig1872.g16362)	0.44	0.1	0.08	0.1	0.1	0.17	0.42	0.35	0.3	0.78	0.38	0.95	0.52	0.42	0.39	0.4	0.41	0.18	0.3	1.0	0.88	0.19	0.22	0.43	0.62	0.3	0.31
Sro298_g111230.1 (Contig4399.g33054)	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.13	0.41	0.46	0.38	0.8	0.28	0.93	0.49	0.4	0.39	0.29	0.15	0.37	0.57	0.83	1.0	0.23	0.09	0.41	0.5	0.4	0.24
Sro3309_g346540.1 (Contig1835.g16131)	0.09	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.15	0.12	0.02	0.75	0.14	1.0	0.19	0.27	0.13	0.1	0.12	0.09	0.17	0.57	0.84	0.07	0.06	0.02	0.0	0.05	0.12
Sro3409_g347720.1 (Contig3155.g25014)	0.79	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.25	0.35	0.23	0.61	0.42	1.0	0.23	0.2	0.38	0.39	0.2	0.21	0.26	0.48	0.57	0.09	0.12	0.17	0.06	0.09	0.34
Sro3488_g348531.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.04	0.02	0.64	0.0	0.67	0.0	0.2	0.02	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.18	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0
Sro3488_g348540.1 (Contig1580.g14348)	0.16	0.0	0.09	0.0	0.03	0.01	0.19	0.45	0.29	0.76	0.08	1.0	0.0	0.25	0.12	0.13	0.0	0.0	0.0	0.09	0.75	0.2	0.14	0.1	0.06	0.06	0.05
Sro360_g126300.1 (Contig4561.g34074)	0.04	0.03	0.04	0.13	0.16	0.16	1.0	0.84	0.8	0.69	0.38	0.97	0.55	0.23	0.32	0.3	0.24	0.24	0.29	0.93	0.74	0.76	0.63	0.19	0.08	0.1	0.28
Sro454_g146270.1 (Contig682.g7953)	0.71	0.01	0.01	0.01	0.0	0.07	0.17	0.31	0.09	0.58	0.16	1.0	0.14	0.29	0.18	0.14	0.08	0.1	0.12	0.27	0.52	0.07	0.12	0.63	0.63	0.26	0.11
Sro477_g150710.1 (Contig553.g7050)	0.23	0.04	0.05	0.06	0.04	0.1	0.47	0.33	0.26	0.66	0.14	1.0	0.15	0.41	0.27	0.13	0.14	0.15	0.26	0.27	0.42	0.32	0.19	0.25	0.33	0.15	0.11
Sro521_g159500.1 (Contig1979.g16940)	0.6	0.03	0.04	0.1	0.09	0.11	0.58	0.31	0.28	0.71	0.28	1.0	0.51	0.2	0.39	0.34	0.23	0.27	0.28	0.83	0.71	0.27	0.21	0.34	0.43	0.19	0.28
Sro538_g162480.1 (Contig95.g1089)	0.21	0.01	0.06	0.03	0.03	0.08	0.31	0.94	0.58	0.67	0.25	1.0	0.39	0.24	0.23	0.23	0.12	0.44	0.41	0.87	0.7	0.28	0.19	0.23	0.33	0.15	0.2
Sro553_g165370.1 (Contig1023.g10213)	0.16	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.35	0.26	0.15	0.57	0.23	1.0	0.3	0.46	0.4	0.17	0.19	0.21	0.24	0.54	0.44	0.13	0.11	0.23	0.1	0.09	0.14
Sro625_g177630.1 (Contig691.g8101)	0.09	0.15	0.12	0.06	0.07	0.07	0.31	0.38	0.15	0.6	0.18	1.0	0.31	0.43	0.25	0.13	0.14	0.43	0.5	0.64	0.59	0.22	0.09	0.24	0.22	0.18	0.17
Sro71_g039470.2	0.11	0.0	0.02	0.02	0.02	0.09	0.24	0.14	0.08	0.65	0.22	1.0	0.49	0.35	0.41	0.27	0.15	0.32	0.2	0.92	0.64	0.06	0.04	0.06	0.02	0.06	0.15
Sro75_g041330.1 (Contig2656.g21505)	0.21	0.05	0.06	0.15	0.2	0.11	0.51	0.47	0.45	0.68	0.31	1.0	0.38	0.26	0.39	0.27	0.2	0.22	0.22	0.64	0.61	0.39	0.32	0.24	0.23	0.14	0.23
Sro793_g203280.1 (Contig534.g6936)	0.04	0.13	0.14	0.0	0.08	0.05	0.05	0.03	0.05	0.57	0.04	1.0	0.17	0.4	0.11	0.01	0.02	0.0	0.01	0.21	0.56	0.0	0.04	0.08	0.08	0.12	0.04
Sro809_g205660.1 (Contig3027.g24129)	0.26	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.45	0.23	0.21	0.64	0.23	1.0	0.4	0.17	0.19	0.14	0.14	0.22	0.19	0.76	0.57	0.12	0.19	0.29	0.29	0.1	0.14
Sro853_g211180.1 (Contig4547.g33985)	0.61	0.21	0.21	0.26	0.22	0.15	0.31	0.34	0.25	0.76	0.55	1.0	0.55	0.48	0.45	0.48	0.41	0.35	0.64	0.9	0.7	0.22	0.19	0.39	0.23	0.22	0.32
Sro865_g212910.1 (Contig3005.g23914)	0.15	0.1	0.12	0.04	0.04	0.08	0.35	0.26	0.27	0.58	0.19	1.0	0.18	0.24	0.17	0.24	0.16	0.19	0.16	0.35	0.5	0.19	0.27	0.15	0.14	0.1	0.19
Sro917_g219840.1 (Contig3222.g25462)	0.34	0.06	0.11	0.04	0.02	0.03	0.51	1.0	0.49	0.64	0.14	0.9	0.34	0.14	0.11	0.08	0.09	0.52	0.4	0.83	0.35	0.48	0.3	0.13	0.21	0.08	0.07
Sro948_g223580.1 (Contig1921.g16565)	0.72	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.28	0.24	0.17	0.59	0.26	1.0	0.39	0.23	0.28	0.26	0.13	0.11	0.11	0.48	0.66	0.14	0.09	0.16	0.05	0.05	0.2
Sro962_g225150.1 (Contig891.g9483)	0.92	0.03	0.04	0.08	0.08	0.16	0.57	0.5	0.62	0.73	0.27	0.93	0.37	0.2	0.3	0.21	0.16	0.18	0.25	0.61	1.0	0.28	0.39	0.28	0.41	0.2	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)