Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1005_g230220.1 (Contig3320.g26060)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1007_g230400.1 (Contig188.g2178)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1018_g231820.1 (Contig4480.g33664)
1.46 - - - - - 0.79 -0.18 0.9 0.16 - 0.83 - - 1.04 - 0.7 1.84 - 2.07 - - 1.27 - - 1.29 -0.85
Sro1040_g234440.1 (Contig3118.g24782)
0.03 - - - - - -0.72 - -1.49 0.63 - 0.34 2.86 - - - - 1.66 - 3.25 -0.54 -0.49 - - - -0.14 -
Sro1058_g236420.1 (Contig518.g6832)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1079_g238930.1 (Contig298.g3930)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro10_g007980.1 (Contig1.g22)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1138_g245370.1 (Contig1400.g12870)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1142_g245890.1 (Contig2104.g17878)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro114_g056220.1 (Contig1482.g13522)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1175_g249140.1 (Contig1328.g12261)
- - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - -
Sro1186_g250250.1 (Contig3178.g25111)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1219_g253450.1 (Contig468.g6360)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1242_g255470.1 (Contig1008.g10127)
- - - - - - - - - 0.22 - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - -
Sro1287_g259520.1 (Contig248.g3038)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro1299_g260690.1 (Contig488.g6586)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1331_g263560.1 (Contig1733.g15462)
- - - - - - 2.92 - - 1.57 - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - 2.62
Sro1336_g263990.1 (Contig2079.g17759)
-3.06 0.98 0.52 1.68 1.09 -1.17 -1.42 0.46 -1.83 -1.69 - -2.92 2.84 -3.08 -3.31 -6.35 - 0.3 0.85 2.05 -3.72 -1.89 -2.14 -3.54 - - -
Sro1354_g265410.1 (Contig2087.g17794)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro13_g010380.1 (Contig337.g4579)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1449_g273720.1 (Contig2836.g22762)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro149_g068630.1 (Contig259.g3231)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1505_g278240.1 (Contig474.g6446)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro150_g068730.1 (Contig1519.g13836)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1517_g279160.1 (Contig3255.g25682)
- - - - - - - - - 1.51 - - - - - - - - - 4.59 - - - - - - -
Sro1526_g279750.1 (Contig1576.g14316)
- - - - - - 2.02 - - 0.16 - - - - - - - - - 4.29 - - - - - - 1.2
Sro154_g069850.1 (Contig2716.g21863)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1556_g282220.1 (Contig457.g6173)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1587_g284230.1 (Contig878.g9433)
- - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - - - - -0.27 - - - - - 4.21
Sro160_g072320.1 (Contig2985.g23728)
- - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1623_g286650.1 (Contig4019.g30908)
3.98 - - - - - - - 0.16 0.72 - - - - -0.86 - - - 1.01 1.13 - 0.35 - - - 1.3 -
Sro1634_g287510.1 (Contig879.g9443)
- - - - - - - - - 2.05 - 4.51 - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1656_g289040.1 (Contig3268.g25734)
- - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1736_g294380.1 (Contig3231.g25553)
- - - - - - - - - 1.73 - - - - 4.57 - - - - - - - - - - - -
Sro1742_g294740.1 (Contig636.g7703)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1768_g296350.1 (Contig3421.g26665)
- - 4.35 - - - - - - -0.85 - - - - - - - - - 2.58 - - - - - - -
Sro176_g077330.1 (Contig203.g2420)
0.59 -1.17 -1.69 -1.48 -2.6 -4.04 -0.45 -3.09 0.97 0.26 -3.06 0.08 2.08 -0.28 -4.61 - - -2.03 -2.11 1.03 1.3 1.64 2.4 -3.27 -2.07 -3.36 -4.65
Sro1851_g301640.1 (Contig3358.g26291)
-2.6 1.49 2.0 1.59 0.84 -3.82 -1.54 -0.07 -1.1 -0.66 0.36 -3.8 -2.29 0.56 0.42 -1.51 -1.93 -5.43 -4.64 -4.18 -0.78 -3.78 -1.05 1.69 0.65 -0.31 -0.12
Sro1855_g301960.1 (Contig61.g491)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1884_g303490.1 (Contig4687.g34851)
- - - - - - - -0.59 - 1.88 - 1.97 - 1.31 1.62 0.65 - - - - 3.25 - -0.78 - - - 0.57
Sro189_g081520.1 (Contig744.g8516)
- - - - - - - - - 2.02 - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - -
Sro1931_g306130.1 (Contig349.g4738)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1935_g306360.1 (Contig2530.g20673)
- - - - - - 1.33 - - 0.46 - - - - - - - 3.49 - 3.57 - - - - - - -
Sro1940_g306610.1 (Contig1706.g15273)
- - - - - - - 0.28 - 1.38 2.54 -0.07 - - 0.98 0.06 - - - - 2.74 - - - 1.76 0.4 1.0
1.02 - - - -2.21 - 1.4 3.09 1.52 1.77 - - - - -0.43 - - - 0.38 - - 1.21 -0.67 - - 0.88 -1.07
Sro1984_g309360.1 (Contig3609.g27884)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2001_g310270.1 (Contig2691.g21728)
- - - - - - 2.89 - - -0.4 - - - - - - - - 4.23 - - - - - - - -
Sro2025_g311660.1 (Contig2866.g22968)
- - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
Sro2052_g312610.1 (Contig416.g5576)
- - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro206_g086540.1 (Contig4750.g35191)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2087_g313890.1 (Contig3974.g30521)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro2136_g315980.1 (Contig2570.g20870)
- - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - -
Sro2136_g315990.1 (Contig2570.g20871)
- - - - - - 3.75 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2203_g318950.1 (Contig3463.g26861)
- - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - 4.55 - - - - - - -
Sro2206_g319000.1 (Contig1918.g16550)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2222_g319660.1 (Contig2106.g17888)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2235_g320200.1 (Contig1457.g13351)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2326_g323470.1 (Contig1600.g14531)
- - 3.86 - - - - - - -0.49 - - - - - - - - - - - 3.3 0.8 - - - -2.62
Sro2350_g324400.1 (Contig4477.g33636)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2361_g324830.1 (Contig1740.g15508)
- - - - - - - - 4.62 1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.04 0.02 0.08 - -0.08 -29.37 -0.03 -0.3 -2.35 0.25 2.92 -0.95 -11.07 1.41 -0.32 -4.9 1.16 -22.82 -4.89 0.55 -19.18 -1.29 -0.83 -23.67 1.3 -2.85 -0.06
Sro2417_g326960.1 (Contig3438.g26762)
- - - - - - - - - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58
Sro2462_g328340.1 (Contig2329.g19198)
- - - - - - - - - 0.79 - - - - - - - - - - 4.66 - - - - - -
Sro2517_g329990.1 (Contig1515.g13821)
- - - - - - 3.39 - - -1.46 - - - - - - - - - - - - 4.02 - - - -
Sro2555_g331100.1 (Contig261.g3240)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2623_g332930.1 (Contig2538.g20706)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro262_g102080.1 (Contig809.g9028)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2648_g333650.1 (Contig1598.g14507)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2710_g335240.1 (Contig3750.g28728)
4.33 - - - - - - - - 0.59 - - - - 0.2 - - - - - 2.06 - - - - - -
Sro2710_g335260.1 (Contig3750.g28730)
3.5 - - - - - - 0.2 - 0.76 - 2.85 - - - - - - - 1.37 - 1.59 - - - - -
Sro275_g105700.1 (Contig3464.g26872)
- - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - - - 3.65 - - - - - - -
Sro278_g106580.1 (Contig1952.g16773)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2800_g337360.1 (Contig1802.g15882)
- - - - - - 4.15 - - 1.86 - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - -
Sro2856_g338760.1 (Contig4122.g31550)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2953_g340950.1 (Contig2733.g22014)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro296_g110720.1 (Contig440.g5911)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2988_g341720.1 (Contig1825.g16063)
- - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - 4.62 - - - - - -
Sro2988_g341730.1 (Contig1825.g16064)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - -
Sro3060_g342960.1 (Contig602.g7495)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3138_g344350.1 (Contig2789.g22446)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3138_g344360.1 (Contig2789.g22447)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3168_g344700.1 (Contig973.g9934)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3201_g345110.1 (Contig2683.g21687)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3234_g345700.1 (Contig1702.g15240)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3286_g346190.1 (Contig1078.g10477)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro3312_g346610.1 (Contig3273.g25765)
- - - - - - - - - - - 3.7 - - - - - - - 3.81 - - - - - - -
Sro3407_g347670.1 (Contig1187.g11243)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro342_g121740.1 (Contig3070.g24474)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3464_g348310.1 (Contig2532.g20679)
- - - - - - 3.6 - 3.77 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3509_g348720.1 (Contig3794.g29125)
- - - - - - - - - 2.05 - - - - - - - - - 4.51 - - - - - - -
Sro3596_g349460.1 (Contig1443.g13261)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3598_g349500.1 (Contig2955.g23480)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3688_g350310.1 (Contig1821.g16027)
- - - - - - - 4.27 - - - - - - - - - - - - - 2.94 - - - - -
Sro3690_g350330.1 (Contig158.g1796)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3690_g350340.1 (Contig158.g1797)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3693_g350390.1 (Contig1630.g14681)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3703_g350500.1 (Contig2435.g19970)
- - - - - - - 3.49 - - - - - - 2.68 - - - - - - - 3.22 - - - -
0.23 - 1.83 2.65 - - -1.04 - - 1.38 - -0.56 - -0.91 0.05 1.06 - - 0.06 - 1.9 -0.39 -1.82 - - 0.23 0.63
Sro3721_g350630.1 (Contig3925.g30057)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro376_g129600.1 (Contig3640.g28110)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro39_g024350.1 (Contig234.g2855)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro404_g135890.1 (Contig4176.g31849)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.33 1.18 - - 1.44 - - - - -0.73 - 3.94 - - 0.03 - - - -
Sro4202_g353370.1 (Contig1199.g11318)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro465_g148600.1 (Contig3955.g30305)
- - - - - - - - - 2.11 - - - - - - - - 3.92 2.92 - - - - - - -
Sro482_g151810.1 (Contig232.g2791)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro4_g003300.1 (Contig3815.g29248)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.96 4.26 - - - - - - - - - - - - - -
Sro576_g169540.1 (Contig2441.g19998)
- - - - - - - - - 0.45 - 2.7 - - - - - - - 3.92 - - 0.38 - - - 1.41
Sro588_g171430.1 (Contig4679.g34785)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro588_g171580.1 (Contig4679.g34800)
- - - - - - - - - 1.93 - 2.31 - - 0.55 - - - - 4.07 - - - - - - -
Sro608_g174850.1 (Contig3978.g30568)
- - - - - - - - - 0.3 - - - - - - - 3.74 - - 3.63 - - - - - -
Sro613_g175590.1 (Contig1327.g12249)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro655_g182280.1 (Contig3913.g29986)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro66_g037110.1 (Contig399.g5381)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - -
Sro677_g185780.1 (Contig3197.g25274)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro703_g190160.1 (Contig314.g4184)
- - - - - - - - 4.48 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro713_g191630.1 (Contig2997.g23830)
- - - - - - - - - 4.29 - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - -
Sro729_g193840.1 (Contig1259.g11779)
- - - - - - - - - 0.37 - - - - - - - - - - 4.68 - - - - - -
Sro749_g196870.1 (Contig2460.g20144)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro763_g198980.1 (Contig4662.g34702)
- - - - - - - - - 0.22 4.69 - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro775_g200750.1 (Contig59.g471)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro778_g201160.1 (Contig2552.g20761)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro784_g202030.1 (Contig2479.g20277)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro841_g209460.1 (Contig2025.g17344)
- - - - - - - - - -0.46 - - 4.12 - - - - - 3.15 - - - - - - - -
Sro866_g212930.1 (Contig709.g8203)
3.85 - - - - - - - - -0.22 - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - -
Sro882_g215390.1 (Contig1771.g15682)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro891_g216810.1 (Contig564.g7157)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro95_g049290.1 (Contig45.g314)
- - - - - - 1.85 -0.89 1.5 1.31 1.72 0.13 - - -1.7 0.34 1.29 0.22 - - 2.49 0.73 -0.52 - - - -
Sro996_g229360.1 (Contig2630.g21350)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.