Heatmap: Cluster_341 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1012_g231170.1 (Contig304.g3987)	0.07	0.49	0.48	0.62	0.62	0.45	0.85	0.73	0.79	0.65	0.83	0.69	0.63	0.54	0.86	1.0	0.86	0.73	0.55	0.55	0.7	0.59	0.76	0.59	0.81	0.46	0.65
Sro1032_g233510.1 (Contig2177.g18179)	0.06	0.99	1.0	0.65	0.7	0.35	0.52	0.6	0.59	0.64	0.59	0.76	0.36	0.54	0.66	0.93	0.73	0.41	0.37	0.58	0.62	0.5	0.53	0.35	0.37	0.3	0.48
Sro1206_g252390.2	0.24	0.76	0.83	0.75	0.85	0.47	0.57	0.7	0.72	0.46	0.78	0.57	1.0	0.54	0.67	0.51	0.89	0.46	0.62	0.68	0.34	0.25	0.72	0.41	0.27	0.4	0.58
Sro1207_g252420.1 (Contig242.g2945)	0.02	0.99	0.7	0.53	0.33	0.15	0.45	0.24	0.26	0.47	0.68	0.53	0.28	0.3	0.43	0.53	1.0	0.33	0.3	0.12	0.46	0.16	0.45	0.15	0.03	0.25	0.62
Sro1207_g252430.1 (Contig242.g2946)	0.04	0.97	1.0	0.85	0.71	0.33	0.49	0.23	0.27	0.55	0.75	0.59	0.31	0.34	0.67	0.93	0.8	0.35	0.31	0.41	0.68	0.03	0.41	0.26	0.21	0.38	0.72
Sro1222_g253840.1 (Contig1750.g15576)	0.01	0.89	1.0	0.82	0.68	0.23	0.2	0.14	0.26	0.45	0.89	0.49	0.26	0.3	0.54	0.73	0.84	0.24	0.43	0.25	0.45	0.1	0.16	0.27	0.14	0.22	0.5
Sro122_g059200.1 (Contig71.g739)	0.05	0.81	0.41	0.89	0.69	0.37	0.57	0.75	0.64	0.7	0.87	0.99	0.43	0.33	0.64	0.55	1.0	0.85	0.5	0.52	0.75	0.05	0.56	0.42	0.17	0.28	0.84
Sro1264_g257340.1 (Contig827.g9169)	0.0	0.67	1.0	0.4	0.29	0.14	0.16	0.13	0.13	0.3	0.4	0.37	0.29	0.21	0.27	0.28	0.46	0.17	0.3	0.28	0.35	0.07	0.07	0.18	0.25	0.18	0.26
Sro1306_g261250.1 (Contig1290.g12020)	0.07	0.36	0.3	0.42	0.44	0.21	0.46	0.47	0.6	0.52	0.92	0.9	0.63	0.6	0.63	0.52	1.0	0.73	0.44	0.6	0.42	0.1	0.65	0.22	0.06	0.27	0.63
Sro1310_g261680.1 (Contig1983.g16982)	0.34	0.3	0.4	0.51	0.47	0.43	0.56	0.44	0.61	0.53	0.62	0.63	0.67	0.34	0.54	0.67	0.57	0.47	0.43	0.52	0.49	0.25	0.47	0.53	1.0	0.51	0.49
Sro1361_g266170.1 (Contig3089.g24632)	0.03	0.65	0.87	0.55	0.56	0.35	0.37	0.26	0.28	0.54	1.0	0.6	0.3	0.37	0.73	0.83	0.77	0.33	0.48	0.31	0.5	0.14	0.29	0.5	0.5	0.47	0.58
Sro1363_g266330.1 (Contig2704.g21787)	0.03	0.91	1.0	0.78	0.79	0.29	0.54	0.8	0.76	0.62	0.81	0.72	0.45	0.53	0.67	0.95	0.79	0.58	0.59	0.48	0.71	0.43	0.6	0.42	0.23	0.41	0.63
Sro1380_g267810.1 (Contig4344.g32790)	0.02	0.95	1.0	1.0	0.87	0.48	0.48	0.39	0.62	0.56	0.99	0.72	0.88	0.56	0.76	0.89	0.88	0.32	0.54	0.54	0.57	0.48	0.54	0.63	0.48	0.43	0.69
Sro1718_g293330.1 (Contig3856.g29681)	0.06	0.78	0.45	0.47	0.54	0.17	0.88	0.44	0.85	0.64	0.57	0.97	0.81	0.23	0.52	0.67	0.55	0.31	0.27	1.0	0.74	0.11	0.7	0.22	0.33	0.17	0.41
Sro1762_g295961.1	0.02	1.0	0.82	0.4	0.32	0.17	0.27	0.28	0.33	0.39	0.7	0.28	0.09	0.32	0.32	0.2	0.57	0.13	0.17	0.11	0.29	0.56	0.44	0.19	0.1	0.08	0.28
Sro17_g012200.3	0.03	0.41	0.76	1.0	0.99	0.26	0.41	0.41	0.45	0.54	0.37	0.63	0.35	0.46	0.47	0.6	0.44	0.44	0.48	0.51	0.5	0.22	0.37	0.43	0.56	0.57	0.37
Sro1_g000240.1 (Contig3007.g23939)	0.03	0.18	0.26	0.36	0.36	0.48	0.53	0.45	0.41	0.6	0.89	0.77	0.55	0.5	0.73	0.88	0.85	0.54	0.51	0.54	0.67	0.43	0.42	0.56	1.0	0.69	0.61
Sro2045_g312450.1 (Contig2859.g22930)	0.01	0.6	0.62	0.8	0.75	0.38	0.46	0.65	0.66	0.46	0.99	0.44	0.74	0.46	0.63	0.73	1.0	0.65	0.62	0.58	0.4	0.31	0.64	0.29	0.2	0.44	0.7
Sro231_g093540.1 (Contig3051.g24267)	0.01	0.43	0.35	0.38	0.4	0.29	0.32	0.33	0.36	0.49	1.0	0.5	0.26	0.74	0.67	0.66	0.58	0.42	0.58	0.31	0.32	0.15	0.29	0.28	0.08	0.25	0.68
Sro2341_g324070.1 (Contig2901.g23127)	0.31	0.58	0.64	0.96	0.9	0.34	0.5	0.23	0.35	0.59	0.74	0.72	0.9	0.44	0.64	1.0	0.73	0.7	0.81	0.75	0.44	0.0	0.34	0.36	0.29	0.36	0.67
Sro2588_g331970.1 (Contig4630.g34535)	0.01	0.32	0.35	0.91	0.69	0.25	0.55	0.25	0.27	0.55	0.54	0.67	0.24	0.49	0.55	1.0	0.47	0.24	0.38	0.49	0.61	0.05	0.39	0.51	0.84	0.58	0.65
Sro264_g102680.1 (Contig921.g9694)	0.01	0.77	0.58	0.64	0.55	0.24	0.46	0.46	0.47	0.67	0.97	0.71	0.6	0.6	0.76	1.0	0.69	0.53	0.61	0.62	0.69	0.2	0.29	0.46	0.38	0.45	0.73
Sro272_g104820.1 (Contig2144.g18023)	0.02	0.95	0.9	0.79	0.7	0.45	0.6	0.58	0.49	0.61	1.0	0.7	0.45	0.58	0.72	0.96	0.75	0.26	0.31	0.35	0.58	0.31	0.45	0.71	0.46	0.41	0.66
Sro308_g113610.1 (Contig2352.g19331)	0.02	0.49	0.8	0.5	0.4	0.62	0.32	0.37	0.61	0.48	0.57	0.86	0.9	0.84	0.49	0.45	1.0	0.36	0.6	0.48	0.46	0.17	0.45	0.2	0.07	0.32	0.55
Sro312_g114490.1 (Contig2832.g22694)	0.0	0.97	0.69	0.84	0.88	0.59	0.67	0.83	0.85	0.63	0.97	0.72	0.86	0.52	0.67	0.56	1.0	0.45	0.67	0.82	0.59	0.28	0.68	0.49	0.3	0.42	0.75
Sro320_g116520.1 (Contig3665.g28313)	0.02	0.89	0.91	0.69	0.79	0.28	0.59	0.48	0.61	0.62	0.56	0.64	0.71	0.46	0.65	1.0	0.51	0.58	0.6	0.69	0.65	0.49	0.62	0.39	0.6	0.44	0.49
Sro3652_g349990.1 (Contig2844.g22834)	0.01	0.56	0.66	0.52	0.45	0.28	0.24	0.22	0.18	0.5	0.58	0.46	0.12	0.59	0.59	1.0	0.62	0.15	0.21	0.33	0.58	0.08	0.29	0.36	0.33	0.25	0.65
Sro383_g131200.1 (Contig132.g1485)	0.23	0.25	0.27	0.32	0.3	0.41	0.36	0.36	0.41	0.56	1.0	0.65	0.83	0.76	0.56	0.47	0.72	0.41	0.55	0.74	0.34	0.18	0.37	0.41	0.11	0.4	0.69
Sro409_g137190.1 (Contig1790.g15823)	0.0	0.54	1.0	0.54	0.53	0.21	0.27	0.16	0.14	0.53	0.61	0.69	0.13	0.24	0.61	0.4	0.45	0.24	0.59	0.48	0.47	0.24	0.23	0.36	0.28	0.11	0.75
Sro443_g144000.1 (Contig715.g8246)	0.01	0.59	1.0	0.33	0.29	0.11	0.34	0.19	0.25	0.44	0.46	0.46	0.18	0.51	0.39	0.4	0.55	0.2	0.19	0.3	0.59	0.16	0.28	0.17	0.09	0.23	0.39
Sro454_g146350.2	0.08	0.39	0.25	0.34	0.39	0.38	0.57	0.44	1.0	0.57	0.7	0.66	0.96	0.62	0.62	0.68	0.76	0.64	0.91	0.67	0.51	0.36	0.8	0.49	0.48	0.54	0.45
Sro463_g148260.2	0.02	0.55	0.43	0.41	0.39	0.29	0.52	0.65	0.54	0.5	1.0	0.64	0.7	0.51	0.62	0.56	0.91	0.86	0.75	0.71	0.37	0.18	0.47	0.38	0.16	0.44	0.62
Sro545_g163850.2	0.02	0.48	0.55	0.55	0.52	0.46	0.45	0.53	0.67	0.61	0.95	0.85	0.79	0.63	0.67	0.65	1.0	0.58	0.77	0.77	0.61	0.26	0.54	0.4	0.14	0.46	0.6
Sro581_g170260.1 (Contig2661.g21531)	0.11	0.37	0.4	0.38	0.35	0.29	0.95	0.53	0.85	0.47	0.44	0.96	0.44	0.28	0.41	0.31	0.44	0.59	0.4	0.36	0.57	0.27	0.61	0.78	1.0	0.54	0.26
Sro621_g176750.1 (Contig1511.g13792)	0.44	0.76	0.96	0.59	0.65	0.44	0.4	0.33	0.28	0.57	0.94	0.55	0.22	0.47	0.67	1.0	0.64	0.34	0.45	0.43	0.52	0.18	0.37	0.52	0.81	0.61	0.7
Sro695_g188620.1 (Contig4098.g31309)	0.16	0.46	0.44	0.89	0.88	0.43	0.77	0.52	0.59	0.71	1.0	0.8	0.9	0.66	0.81	0.87	0.78	0.67	0.61	0.94	0.75	0.41	0.64	0.66	0.9	0.67	0.77
Sro6_g005620.1 (Contig175.g2067)	0.01	0.75	1.0	0.86	0.8	0.26	0.57	0.34	0.47	0.62	0.66	0.73	0.53	0.57	0.67	0.76	0.56	0.74	0.91	0.66	0.74	0.28	0.44	0.54	0.56	0.67	0.55
Sro71_g039560.1 (Contig2582.g20979)	0.08	0.59	0.61	0.79	0.76	0.57	0.74	0.7	0.72	0.75	0.81	0.82	0.84	0.56	0.79	1.0	0.78	0.93	0.84	0.77	0.7	0.34	0.73	0.44	0.59	0.45	0.82
Sro726_g193450.2	0.01	0.26	0.37	0.41	0.4	0.48	0.45	0.56	0.72	0.45	0.81	0.6	0.91	0.49	0.56	0.59	1.0	0.41	0.48	0.64	0.38	0.2	0.6	0.26	0.12	0.32	0.53
Sro799_g204120.1 (Contig974.g9942)	0.04	0.44	0.45	0.56	0.55	0.44	0.87	0.62	0.91	0.65	0.77	1.0	0.78	0.52	0.68	0.76	0.68	0.88	0.81	0.72	0.69	0.38	0.84	0.35	0.5	0.45	0.59
Sro79_g042770.1 (Contig1826.g16084)	0.07	0.46	0.45	0.56	0.55	0.61	0.87	0.66	0.77	0.83	0.9	1.0	0.64	0.69	0.82	0.97	0.93	0.88	0.76	0.72	0.88	0.52	0.78	0.6	0.92	0.58	0.7
Sro7_g006130.1 (Contig389.g5266)	0.06	0.44	0.64	0.71	0.59	0.38	0.85	0.48	1.0	0.77	0.6	0.87	0.73	0.47	0.5	0.57	0.39	0.45	0.58	0.77	0.92	0.44	0.7	0.47	0.91	0.33	0.44
Sro800_g204220.1 (Contig413.g5556)	0.0	0.16	0.34	0.29	0.24	0.12	0.23	0.21	0.26	0.25	0.48	0.41	0.31	0.31	0.28	0.27	1.0	0.13	0.12	0.26	0.29	0.01	0.19	0.23	0.07	0.17	0.34
Sro82_g043800.1 (Contig4032.g30971)	0.02	0.68	0.41	0.54	0.49	0.37	0.19	0.31	0.21	0.47	0.62	0.41	0.15	0.31	0.58	1.0	0.82	0.28	0.27	0.22	0.47	0.3	0.28	0.5	0.29	0.46	0.59
Sro865_g212750.1 (Contig3005.g23898)	0.03	0.6	0.28	0.33	0.36	0.28	0.49	0.48	0.54	0.52	0.51	0.53	0.69	0.52	0.66	1.0	0.45	0.71	0.52	0.55	0.66	0.37	0.54	0.43	0.79	0.54	0.45
Sro874_g214280.1 (Contig589.g7379)	0.05	0.85	1.0	0.38	0.5	0.14	0.26	0.15	0.16	0.48	0.54	0.49	0.48	0.47	0.51	0.51	0.64	0.35	0.39	0.5	0.34	0.34	0.22	0.19	0.07	0.23	0.38
Sro887_g216270.1 (Contig1780.g15767)	0.02	0.59	0.53	0.44	0.5	0.33	0.5	0.56	0.9	0.51	0.69	0.63	1.0	0.58	0.58	0.54	0.85	0.44	0.54	0.51	0.53	0.28	0.67	0.22	0.12	0.24	0.63
Sro946_g223300.1 (Contig2147.g18090)	0.01	0.83	0.75	0.83	0.79	0.21	0.4	0.38	0.43	0.59	1.0	0.78	0.53	0.5	0.59	0.48	0.95	0.28	0.33	0.6	0.61	0.1	0.34	0.48	0.67	0.37	0.61
Sro950_g223760.1 (Contig3704.g28510)	0.01	0.85	0.92	1.0	0.75	0.38	0.43	0.41	0.4	0.47	0.83	0.47	0.55	0.29	0.59	0.71	0.95	0.38	0.36	0.37	0.42	0.12	0.33	0.4	0.35	0.25	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)