1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_188 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1011_g230980.1 (Contig997.g10071)
 0.07 0.45 0.55 0.58 0.41 0.22 0.29 0.33 0.22 0.29 0.4 0.23 0.47 0.23 0.49 0.24 0.34 0.9 0.82 0.54 0.27 0.43 0.16 0.6 1.0 0.63 0.25
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.54 1.0 0.44 0.09 0.02 0.2 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.07 0.05 0.04 0.15 0.62 0.22 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro1074_g238260.1 (Contig4290.g32410)
 0.08 0.39 0.12 0.0 0.11 0.11 0.07 0.39 0.94 0.15 0.32 0.05 0.16 0.0 0.67 0.23 0.28 0.11 0.21 0.11 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.24 0.19
Sro1196_g251470.1 (Contig1221.g11482)
 0.01 0.04 0.05 0.03 0.03 0.06 0.15 0.08 0.13 0.17 0.08 0.16 1.0 0.16 0.12 0.2 0.07 0.13 0.23 0.48 0.28 0.55 0.22 0.23 0.17 0.15 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.33 0.4 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.0 0.0
Sro134_g063480.1 (Contig145.g1610)
 0.02 0.0 0.0 0.13 0.08 0.18 0.61 0.35 0.42 0.56 0.6 1.0 0.56 0.7 0.68 0.73 0.63 0.0 0.29 0.64 0.58 0.53 0.26 0.97 0.9 0.65 0.45
Sro134_g063490.1 (Contig145.g1611)
 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.27 0.64 0.1 0.12 0.45 0.1 0.68 0.03 0.23 0.72 0.53 0.34 0.0 0.0 0.0 0.47 0.38 0.16 1.0 0.88 0.97 0.37
Sro1426_g271660.1 (Contig2394.g19618)
 0.04 0.1 0.41 0.15 0.17 0.04 0.31 0.13 0.37 0.2 0.16 0.13 0.23 0.01 0.07 0.02 0.02 0.36 0.72 0.36 0.06 0.28 0.05 0.45 1.0 0.8 0.03
Sro142_g066330.1 (Contig226.g2682)
 0.01 0.33 0.4 0.32 0.34 0.16 0.47 0.63 0.41 0.44 0.44 0.48 0.35 0.36 0.39 0.39 0.53 0.42 0.34 0.4 0.57 0.62 0.28 0.48 1.0 0.59 0.34
Sro1485_g276560.1 (Contig4245.g32137)
 0.01 0.11 0.04 0.06 0.09 0.4 0.51 0.35 0.07 0.35 0.43 0.35 0.13 0.07 0.61 0.51 0.27 0.08 0.07 0.17 1.0 0.47 0.12 0.42 0.59 0.52 0.65
Sro148_g068030.1 (Contig3597.g27795)
 0.02 0.17 0.08 0.12 0.07 0.61 0.67 0.46 0.33 0.3 0.41 0.12 0.35 0.23 0.29 0.33 0.27 0.85 0.59 0.43 0.35 0.76 0.35 0.72 1.0 0.59 0.46
Sro150_g068920.1 (Contig1519.g13855)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.54 0.25 0.17 0.19 0.02 0.29 0.06 0.15 0.19 0.09 0.02 0.08 0.07 0.12 0.28 1.0 0.23 0.27 0.33 0.33 0.06
Sro1531_g280150.1 (Contig2576.g20921)
 0.54 0.21 0.1 0.25 0.02 0.03 0.09 0.71 0.36 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.15 0.04 0.01 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro1594_g284590.1 (Contig2316.g19109)
 0.0 0.33 0.23 0.19 0.43 0.04 0.39 0.16 0.19 0.1 0.05 0.04 1.0 0.22 0.1 0.11 0.07 0.19 0.48 0.21 0.03 0.44 0.22 0.02 0.01 0.07 0.13
Sro162_g072930.1 (Contig2670.g21629)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.19 0.0 0.12 0.02 0.19 0.21 1.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.17 0.31 0.04 0.01 0.0 0.02 0.03
Sro163_g073420.1 (Contig1793.g15875)
 0.03 0.11 0.1 0.16 0.12 0.0 0.54 0.56 0.28 0.26 0.17 0.11 0.31 0.17 0.22 0.09 0.18 0.43 0.61 0.6 0.26 0.39 0.22 0.41 1.0 0.5 0.24
Sro1644_g288150.1 (Contig3810.g29184)
 0.0 0.0 0.61 0.0 0.63 0.0 0.09 0.0 0.93 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro16_g011580.1 (Contig916.g9595)
 0.02 0.08 0.01 0.03 0.05 0.04 0.24 0.22 0.23 0.17 0.02 0.07 0.04 0.02 0.12 0.01 0.06 0.04 0.13 0.03 0.2 0.65 0.39 0.38 0.62 1.0 0.04
0.04 0.18 0.28 0.27 0.25 0.06 0.59 1.0 0.47 0.23 0.06 0.27 0.31 0.11 0.11 0.08 0.06 0.4 0.24 0.34 0.23 0.6 0.3 0.03 0.08 0.16 0.08
Sro177_g077840.1 (Contig795.g8910)
 0.28 0.28 0.28 0.08 0.11 0.1 0.36 0.24 0.23 0.54 0.64 0.62 0.23 0.4 0.53 0.72 0.3 0.47 0.65 0.24 1.0 0.89 0.43 0.97 0.35 0.25 0.4
Sro1888_g303610.1 (Contig4582.g34234)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.52 0.11 0.07 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.01 0.05 0.01 0.05 0.02 1.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03
Sro2009_g310700.1 (Contig340.g4630)
 0.34 0.11 0.08 0.09 0.09 0.25 0.41 0.43 0.25 0.26 0.29 0.15 0.08 0.08 0.37 0.51 0.29 0.33 0.37 0.16 0.24 0.45 0.2 0.73 1.0 0.51 0.32
Sro2042_g312290.1 (Contig3880.g29833)
 0.02 0.09 0.01 0.06 0.03 0.21 0.07 0.5 0.48 0.19 0.1 0.06 0.5 0.06 0.66 0.38 0.33 0.05 0.2 0.12 0.1 1.0 0.5 0.11 0.0 0.01 0.31
Sro205_g086130.1 (Contig2217.g18426)
 0.0 0.25 0.2 0.38 0.24 0.09 0.51 0.51 0.45 0.23 0.32 0.24 0.36 0.08 0.19 0.29 0.26 0.24 0.17 0.41 0.51 0.37 0.41 0.28 1.0 0.47 0.17
Sro210_g087760.1 (Contig2488.g20393)
 0.01 0.09 0.25 0.05 0.07 0.06 0.46 0.49 0.38 0.23 0.21 0.44 1.0 0.11 0.17 0.57 0.4 0.57 0.38 0.24 0.4 0.56 0.24 0.13 0.21 0.11 0.06
Sro2461_g328310.1 (Contig2671.g21639)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro25_g016840.1 (Contig1417.g13023)
 0.0 0.17 0.12 0.13 0.09 0.09 0.38 0.43 0.4 0.28 0.48 0.19 0.34 0.18 0.36 0.38 0.48 0.28 0.31 0.45 0.26 0.55 0.24 0.46 1.0 0.74 0.35
Sro312_g114470.1 (Contig2832.g22692)
 0.0 0.29 0.16 0.35 0.27 0.04 0.52 0.02 0.35 0.26 0.06 0.02 0.14 0.12 0.1 0.05 0.04 0.21 0.08 0.06 0.42 0.64 0.2 0.41 1.0 0.92 0.03
Sro3157_g344570.1 (Contig789.g8804)
 0.02 0.07 0.08 0.12 0.1 0.07 0.73 1.0 0.38 0.28 0.07 0.37 0.43 0.18 0.1 0.09 0.03 0.6 0.27 0.45 0.31 0.29 0.34 0.02 0.11 0.24 0.09
Sro375_g129480.1 (Contig4478.g33649)
 0.01 0.04 0.01 0.0 0.04 0.16 0.19 0.14 0.05 0.09 0.06 0.0 0.03 0.0 0.24 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.07 0.37 0.19 0.72 1.0 0.47 0.03
Sro386_g131950.1 (Contig4061.g31136)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro43_g026360.1 (Contig2453.g20102)
 0.0 0.24 0.08 0.09 0.19 0.55 0.43 0.28 0.05 0.4 0.47 0.33 0.22 0.33 0.65 0.38 0.39 0.29 0.3 0.36 0.5 0.57 0.17 0.39 1.0 0.68 0.5
Sro450_g145430.1 (Contig271.g3468)
 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.22 0.33 0.35 0.2 0.5 0.23 0.75 0.02 0.66 0.37 0.39 0.24 0.24 0.22 0.27 1.0 0.73 0.27 0.3 0.6 0.49 0.22
Sro457_g146950.1 (Contig1832.g16124)
 0.01 0.13 0.17 0.26 0.2 0.47 0.49 0.53 0.24 0.38 0.39 0.42 0.44 0.35 0.5 0.33 0.22 0.39 0.48 0.28 0.52 0.59 0.29 0.72 1.0 0.63 0.43
Sro509_g157010.1 (Contig4289.g32394)
 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.01 0.17 0.08 0.04 0.17 0.12 0.13 0.69 0.23 0.14 0.19 0.15 0.23 0.37 0.77 0.23 1.0 0.17 0.29 0.75 0.13 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro522_g159520.1 (Contig3319.g26038)
 0.71 0.74 0.55 0.39 0.37 0.27 0.3 0.2 0.2 0.36 0.14 0.3 0.43 0.15 0.23 0.17 0.3 0.93 1.0 0.59 0.34 0.49 0.3 0.29 0.44 0.38 0.15
Sro558_g166270.1 (Contig3624.g28025)
 0.0 0.09 0.04 0.0 0.04 0.11 0.02 1.0 0.43 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.13 0.0 0.79 0.03 0.06 0.05 0.0 0.03
Sro572_g168900.1 (Contig1817.g16019)
 0.0 0.23 0.0 0.09 0.21 0.0 0.11 0.02 0.1 0.06 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.92 0.81 0.0 0.42 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro576_g169560.1 (Contig2441.g20000)
 0.0 1.0 0.59 0.0 0.0 0.27 0.11 0.0 0.0 0.21 0.0 0.08 0.09 0.31 0.02 0.96 0.27 0.17 0.61 0.0 0.58 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.3
Sro598_g173000.1 (Contig1655.g14926)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.28 0.11 0.08 0.0 0.14 0.35 0.0 0.02 0.0 0.0 0.68 0.08 0.17 0.14 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro632_g178620.1 (Contig512.g6770)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.22 0.0 1.0 0.03 0.0 0.26 0.0 0.2
Sro666_g184010.1 (Contig1358.g12520)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.61 0.33 0.17 0.27 0.0 0.28 0.14 0.1 0.03 0.03 0.01 0.63 0.48 0.24 0.21 1.0 0.27 0.0 0.0 0.14 0.02
Sro688_g187360.1 (Contig1782.g15782)
 0.01 0.04 0.05 0.03 0.02 0.0 0.26 0.51 0.24 0.05 0.02 0.04 0.11 0.06 0.04 0.02 0.0 0.1 0.05 0.1 0.08 1.0 0.21 0.01 0.1 0.08 0.03
Sro713_g191490.1 (Contig2997.g23816)
 0.0 0.11 0.21 1.0 0.48 0.02 0.58 0.32 0.33 0.1 0.13 0.02 0.08 0.06 0.04 0.03 0.1 0.18 0.11 0.05 0.03 0.89 0.62 0.0 0.02 0.01 0.03
Sro74_g040920.1 (Contig4700.g34954)
 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.29 0.28 0.12 0.31 0.15 0.26 1.0 0.21 0.12 0.16 0.08 0.96 0.84 0.65 0.3 0.26 0.08 0.11 0.38 0.33 0.11
0.0 0.06 0.07 0.05 0.06 0.54 0.56 0.25 0.11 0.26 0.57 0.18 0.06 0.28 0.62 0.73 0.34 0.13 0.13 0.02 0.07 0.41 0.2 1.0 0.59 0.53 0.69
Sro839_g209280.1 (Contig1990.g17035)
 0.02 0.2 0.07 0.13 0.13 0.05 0.43 0.54 0.34 0.34 0.27 0.48 0.48 0.19 0.33 0.47 0.3 0.39 0.54 0.6 0.51 0.56 0.31 0.42 1.0 0.45 0.25
Sro850_g210750.1 (Contig2035.g17497)
 0.08 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.36 1.0 0.13 0.08 0.02 0.14 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.71 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01
Sro871_g213870.1 (Contig1188.g11257)
 0.01 0.04 0.04 0.05 0.03 0.02 0.36 0.17 0.08 0.33 0.19 0.33 0.54 0.26 0.12 0.11 0.05 0.78 1.0 0.73 0.44 0.39 0.09 0.24 0.4 0.55 0.08
Sro887_g216350.1 (Contig1780.g15775)
 0.01 0.77 0.34 1.0 0.7 0.0 0.08 0.2 0.36 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.82 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro89_g047140.1 (Contig3846.g29635)
 0.05 0.19 0.23 0.19 0.24 0.29 0.13 0.07 0.1 0.45 0.11 0.47 0.28 1.0 0.28 0.32 0.19 0.09 0.36 0.45 0.59 0.62 0.13 0.08 0.15 0.17 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)