Heatmap: Cluster_261 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1003_g230020.1 (Contig3777.g28998)
0.75 6.88 5.54 10.97 16.56 9.12 7.47 7.69 34.12 59.08 51.93 86.98 19.58 64.5 33.33 52.78 69.42 37.82 54.8 51.31 87.6 41.16 30.67 15.1 24.15 47.48 60.09
Sro1033_g233660.1 (Contig1396.g12840)
0.99 9.09 7.38 6.49 5.92 2.26 1.84 2.34 8.07 14.23 16.25 14.72 1.43 8.46 3.88 5.94 10.36 2.93 22.47 12.29 23.59 18.55 11.95 3.53 5.66 7.86 16.05
Sro1081_g239040.1 (Contig4556.g34022)
1.69 6.64 2.6 3.36 3.61 1.77 4.86 8.15 12.08 30.47 25.46 40.52 2.5 25.94 9.21 22.36 20.72 5.41 37.82 31.09 39.15 39.44 20.91 7.3 11.15 25.33 30.47
Sro1082_g239160.1 (Contig1844.g16161)
0.02 0.23 0.25 0.08 0.04 0.14 0.25 0.68 1.17 3.92 7.27 3.86 0.0 2.55 2.37 4.59 4.28 0.06 2.67 1.31 4.69 1.5 2.44 0.66 1.3 1.63 7.47
Sro110_g054970.1 (Contig1501.g13720)
0.32 7.23 5.14 8.22 9.87 7.98 6.83 4.3 15.2 22.55 20.14 26.48 2.52 21.79 8.81 9.09 18.75 8.02 29.29 19.38 25.17 23.81 18.32 12.38 18.0 36.07 29.08
Sro111_g055210.1 (Contig567.g7198)
0.14 1.64 1.76 2.44 1.35 4.28 1.63 1.68 5.4 9.71 10.7 11.33 4.9 14.7 7.35 6.96 10.51 4.86 9.2 13.34 9.65 3.62 13.47 1.68 1.72 4.62 8.99
Sro1136_g245190.1 (Contig1812.g15971)
0.89 8.89 3.29 5.34 6.39 17.0 5.93 4.62 13.11 19.45 15.68 16.33 1.98 21.99 9.8 7.01 16.63 5.55 18.04 12.99 36.32 18.01 20.47 6.7 10.24 20.06 21.46
Sro1215_g253170.1 (Contig2655.g21461)
3.53 10.75 6.78 11.59 12.05 1.05 1.11 6.03 4.62 15.92 18.92 15.76 2.91 3.19 4.86 6.31 17.74 6.48 31.91 14.9 19.67 21.99 6.24 3.61 5.7 8.37 18.05
Sro1330_g263450.1 (Contig4401.g33064)
2.46 17.87 18.63 22.08 39.47 17.58 15.96 26.68 127.84 143.35 83.47 139.93 7.86 126.84 48.82 103.62 131.24 21.45 125.1 87.83 273.71 215.82 129.26 28.8 47.45 211.72 192.02
Sro144_g067120.1 (Contig3873.g29811)
1.77 7.68 4.11 7.41 6.83 6.21 10.95 7.26 18.78 33.3 29.06 35.46 0.92 20.3 18.28 24.06 42.1 2.9 31.4 24.77 40.4 22.85 17.31 19.48 37.58 27.06 42.67
Sro145_g067260.1 (Contig3646.g28172)
0.74 28.91 16.25 16.46 24.24 10.97 19.87 12.93 68.53 77.23 112.59 71.9 2.65 47.91 31.68 13.82 97.61 12.18 215.47 62.08 60.7 164.19 141.96 38.52 46.31 208.62 195.82
Sro1486_g276610.1 (Contig1746.g15547)
2.15 11.24 10.66 9.44 9.98 4.38 1.56 1.75 8.0 20.84 22.76 22.87 1.55 12.39 12.21 24.19 25.62 11.69 27.69 23.28 26.57 24.36 13.76 4.93 7.24 13.19 26.99
Sro152_g069350.1 (Contig69.g695)
4.07 60.48 29.18 42.45 54.32 34.29 35.92 23.45 67.96 127.94 204.85 140.74 20.21 70.84 54.53 42.09 181.83 22.28 242.91 102.17 104.35 188.11 101.23 88.54 83.87 197.55 233.94
Sro1797_g298160.1 (Contig3752.g28733)
1.21 3.78 1.33 1.01 2.07 0.96 1.77 1.06 4.64 5.59 3.67 4.86 0.46 2.27 1.94 0.99 2.45 0.73 8.88 5.61 4.71 6.97 6.74 1.61 2.78 5.99 5.5
Sro1832_g300420.1 (Contig1466.g13460)
0.25 2.51 1.49 2.13 2.63 3.58 6.54 10.21 20.64 29.28 36.19 32.53 11.82 21.94 22.94 43.66 26.59 15.03 41.57 36.25 37.26 24.77 20.17 15.42 31.02 27.68 42.03
Sro1890_g303730.1 (Contig981.g9967)
1.0 24.6 8.53 22.54 32.65 22.51 20.27 13.62 33.88 59.47 88.42 55.57 2.86 31.32 26.99 24.21 76.17 20.33 203.25 59.51 37.6 149.33 93.84 38.59 22.81 137.04 145.08
Sro1891_g303810.1 (Contig3442.g26778)
6.5 1.88 11.55 2.76 2.14 1.41 1.13 7.8 12.07 32.58 21.97 45.47 3.73 24.57 9.37 22.16 16.73 16.9 29.86 34.62 39.57 25.48 15.71 3.95 9.12 40.53 31.8
Sro1965_g308270.1 (Contig4051.g31081)
0.54 6.6 4.92 6.97 7.65 3.09 6.4 8.61 13.03 35.76 49.01 39.51 34.71 31.33 23.33 39.42 40.49 12.47 43.85 47.15 38.42 31.27 19.13 14.39 24.65 33.78 45.28
0.8 4.72 6.2 5.19 5.16 5.48 7.57 14.68 16.54 26.35 45.12 30.91 18.0 14.03 25.69 40.32 34.75 16.05 37.29 21.69 30.04 21.74 20.9 17.62 30.23 27.87 39.62
Sro2053_g312700.1 (Contig2326.g19189)
0.36 4.04 13.64 1.83 2.52 0.77 0.89 1.65 15.41 22.57 21.31 25.37 6.53 13.62 9.87 27.46 25.56 2.68 29.32 18.94 27.48 23.92 15.53 4.24 9.89 19.36 29.83
Sro20_g014300.1 (Contig2954.g23460)
0.26 1.25 0.41 2.19 2.85 1.13 0.49 0.54 6.49 10.49 14.77 12.37 3.98 11.19 5.02 7.61 13.91 4.91 15.84 13.31 12.9 9.86 5.19 0.77 3.63 3.82 14.43
Sro20_g014440.1 (Contig2954.g23474)
2.28 10.1 6.27 4.28 7.56 1.33 2.21 2.61 5.01 9.35 11.19 9.88 1.0 4.31 4.17 6.43 11.61 0.93 9.87 4.24 8.12 6.43 5.89 2.22 2.05 4.78 10.12
Sro2333_g323690.1 (Contig2357.g19368)
0.12 4.27 3.03 4.18 6.3 2.39 2.23 1.82 9.3 16.32 12.2 14.95 3.83 17.8 5.88 13.95 20.18 1.9 19.61 11.26 16.66 15.07 6.43 2.51 4.32 21.19 21.76
Sro243_g096950.1 (Contig3073.g24519)
0.63 49.41 37.69 24.04 38.34 24.27 31.19 13.94 37.81 57.53 43.41 53.14 2.32 38.48 23.68 19.08 66.7 26.64 163.21 36.74 35.85 207.51 95.89 66.53 66.73 197.51 140.48
Sro245_g097400.1 (Contig3087.g24611)
0.74 9.68 4.04 5.18 7.18 2.89 3.76 5.37 38.01 41.68 19.92 43.47 1.5 33.31 6.54 17.2 29.99 5.82 58.39 37.11 50.39 59.82 41.32 9.75 19.12 43.53 35.76
Sro253_g099940.1 (Contig3900.g29912)
3.33 6.83 13.86 7.38 7.2 8.77 11.97 16.04 27.46 45.3 39.01 58.6 25.55 58.51 28.1 38.42 34.34 20.38 44.25 50.55 60.21 52.2 34.52 23.99 24.88 45.93 43.47
Sro2601_g332320.1 (Contig1388.g12799)
0.28 0.47 0.36 0.38 0.35 0.07 0.07 0.91 1.75 3.12 4.97 3.05 1.66 0.37 1.11 0.51 4.58 0.31 3.58 2.91 4.64 2.87 2.35 0.89 1.92 1.19 3.46
Sro261_g101820.1 (Contig3068.g24454)
77.5 38.62 24.52 42.56 35.86 6.12 14.13 26.36 46.4 85.85 92.37 104.34 5.7 38.97 43.73 88.71 87.2 17.51 94.87 57.66 89.86 86.1 41.99 38.13 70.49 48.32 83.97
Sro265_g102740.1 (Contig1806.g15904)
0.25 2.94 1.46 1.92 3.33 2.86 1.15 0.91 4.26 6.37 3.69 6.94 3.28 4.31 1.43 2.88 3.67 0.71 7.59 7.32 8.84 6.42 6.34 1.7 1.55 6.93 6.16
Sro269_g104060.1 (Contig1337.g12327)
3.34 11.77 12.72 13.29 16.97 4.02 8.64 5.7 40.8 50.83 45.03 51.92 10.84 33.64 19.02 47.04 38.57 11.25 56.69 33.26 58.82 59.56 41.79 19.22 34.46 61.18 65.29
Sro26_g017700.1 (Contig2432.g19941)
0.08 0.97 0.57 0.3 0.52 0.65 1.58 2.36 4.73 10.55 6.49 13.97 0.52 18.62 2.18 2.87 9.17 0.88 11.62 8.75 17.83 10.51 8.46 3.34 7.19 15.5 11.82
Sro274_g105340.1 (Contig1557.g14158)
1.06 5.22 7.26 5.53 6.07 13.34 16.78 17.6 22.69 32.47 27.88 43.49 28.96 27.6 28.02 33.68 23.04 26.29 32.15 34.17 41.43 32.34 23.58 24.84 22.58 34.22 32.68
Sro28_g018910.1 (Contig404.g5500)
0.2 7.76 3.59 4.45 7.22 0.48 1.36 4.55 8.81 13.61 15.54 12.72 0.36 5.47 6.64 12.64 15.3 2.22 29.49 21.86 12.65 8.94 11.44 2.31 7.82 8.86 22.5
Sro294_g110170.1 (Contig215.g2565)
0.04 3.4 1.52 3.39 2.74 2.07 0.93 1.4 11.15 11.95 12.43 12.35 1.17 10.13 5.02 6.82 7.64 3.16 12.7 10.09 15.85 12.33 9.4 0.93 1.83 9.93 16.42
Sro305_g112810.1 (Contig560.g7122)
7.02 137.8 84.6 108.87 103.5 210.57 69.04 79.15 78.29 255.82 335.1 212.46 20.42 250.9 146.99 150.87 317.07 102.65 354.61 133.54 195.52 178.83 85.56 69.45 36.54 436.96 518.78
Sro3091_g343560.1 (Contig3985.g30616)
0.49 1.18 0.49 0.91 2.03 2.55 1.49 6.53 10.99 28.18 22.22 40.11 0.78 23.92 10.95 32.08 23.19 2.93 26.98 17.84 34.26 20.18 20.02 4.6 8.02 26.7 28.34
Sro30_g019560.1 (Contig3962.g30356)
0.82 4.02 30.11 11.57 7.76 1.96 6.97 8.38 12.68 33.54 50.01 42.14 19.56 17.94 26.98 54.57 32.6 20.97 33.24 48.44 46.53 18.9 21.28 12.99 22.75 26.17 46.05
Sro3114_g344030.1 (Contig4074.g31235)
1.92 1.38 0.97 2.37 4.89 2.76 1.58 1.19 9.75 35.35 39.43 34.82 0.27 37.53 9.44 20.39 31.34 1.07 66.52 18.92 42.51 16.9 23.31 1.28 0.79 31.42 63.79
Sro318_g115850.1 (Contig3475.g26929)
0.19 7.67 4.67 4.0 6.41 1.32 1.24 1.99 5.26 10.69 9.23 13.11 1.14 8.02 3.19 6.2 10.45 1.24 14.61 10.77 13.24 9.11 7.95 1.8 2.56 10.05 9.63
Sro323_g117350.1 (Contig364.g4916)
3.14 36.74 36.79 49.78 44.2 10.93 15.7 11.78 27.5 46.61 64.05 63.59 25.95 16.01 28.4 48.86 41.29 16.65 60.41 49.32 53.29 25.74 27.79 31.84 34.9 26.43 57.79
Sro344_g122340.1 (Contig3448.g26822)
0.61 0.96 0.47 0.67 1.63 0.55 0.56 3.15 17.6 27.12 25.89 38.45 2.05 11.99 7.03 11.4 27.01 1.11 36.48 25.82 30.59 15.3 19.57 1.46 2.61 15.93 31.43
Sro352_g124140.1 (Contig2645.g21390)
1.95 12.32 5.83 3.95 8.16 1.93 2.73 3.7 12.67 15.21 10.03 17.14 1.03 5.12 2.51 6.41 8.74 0.44 12.17 8.32 23.88 14.91 11.63 2.97 5.36 7.04 9.1
Sro399_g134810.1 (Contig279.g3608)
11.86 497.94 374.96 500.25 440.35 210.51 258.53 269.43 403.82 436.55 420.57 391.93 41.4 346.18 254.07 369.25 355.47 231.9 764.9 374.65 437.37 397.69 402.58 373.23 242.43 593.75 688.41
Sro41_g025140.1 (Contig169.g1920)
0.71 19.3 44.73 19.12 16.91 9.23 6.08 7.18 22.35 44.92 32.09 69.84 2.07 43.01 11.23 9.54 40.13 6.47 58.4 32.11 30.54 56.52 43.6 19.63 29.22 70.21 46.74
Sro42_g025440.1 (Contig312.g4121)
0.44 6.78 3.84 4.09 6.6 2.82 3.22 4.1 10.87 12.57 12.41 12.86 4.97 10.17 6.78 11.76 19.59 4.95 12.37 11.93 8.88 12.97 6.73 3.47 3.27 15.54 15.93
Sro443_g143980.1 (Contig715.g8244)
0.39 4.32 2.64 2.69 3.74 1.65 4.57 5.78 14.38 32.74 31.98 38.06 1.45 22.06 12.03 29.64 38.27 6.06 57.63 30.17 35.14 35.05 23.75 12.94 19.32 21.89 36.61
Sro44_g026590.1 (Contig358.g4828)
0.67 1.07 1.18 0.65 1.42 0.65 0.51 1.42 9.69 24.35 32.63 27.75 18.32 14.7 10.11 21.75 26.46 14.07 38.9 28.98 27.75 26.29 14.22 2.15 3.68 22.94 34.77
Sro497_g154690.1 (Contig738.g8451)
1.17 0.64 0.29 0.43 0.62 0.21 0.28 3.51 3.29 11.97 9.71 13.3 0.5 10.67 5.69 9.27 4.53 1.23 21.29 12.07 18.53 12.25 3.08 0.95 3.22 7.62 16.3
2.81 1.68 0.71 1.06 2.01 0.61 0.77 0.94 7.14 14.74 22.61 18.4 0.51 5.71 5.36 9.28 15.86 3.73 22.02 13.85 12.48 7.58 7.72 2.6 2.8 9.85 16.42
Sro49_g028680.1 (Contig2054.g17618)
4.57 11.9 23.43 9.53 9.98 5.12 5.02 9.97 83.89 63.11 35.96 74.45 5.36 20.38 8.61 15.13 41.95 8.84 47.06 56.59 54.2 91.36 111.35 8.0 18.74 33.48 39.83
Sro50_g029050.1 (Contig297.g3893)
8.89 107.12 73.79 78.02 77.7 35.75 39.63 23.14 20.17 97.35 84.96 81.49 4.77 60.72 47.49 55.92 80.17 64.49 300.51 73.31 77.76 117.5 51.79 45.02 10.95 104.14 164.64
Sro518_g158750.1 (Contig3565.g27530)
1.83 31.16 25.47 20.36 23.92 11.14 14.49 13.92 31.7 36.96 31.39 44.24 12.51 34.13 21.06 29.07 27.83 14.75 41.93 20.24 43.17 45.97 32.5 26.96 20.46 48.11 41.46
Sro520_g159080.1 (Contig2679.g21664)
3.34 213.47 115.42 171.37 237.88 154.72 266.8 146.05 81.81 328.09 357.39 325.2 19.0 198.82 147.99 182.61 397.93 156.61 583.36 204.28 304.91 221.14 179.94 482.4 390.64 686.28 527.08
Sro555_g165680.1 (Contig677.g7916)
0.11 0.11 0.13 0.09 0.05 0.08 0.17 0.27 1.85 3.53 4.75 4.5 0.32 1.29 1.54 3.29 4.84 0.49 4.28 2.52 6.23 2.15 2.68 0.42 0.92 1.22 5.5
Sro566_g167760.1 (Contig3739.g28671)
0.64 2.08 2.69 4.97 3.78 2.55 2.61 2.78 13.27 23.28 35.13 27.71 1.52 8.26 11.74 18.96 30.08 5.1 32.03 31.66 22.08 9.56 13.74 3.78 14.97 11.44 29.52
Sro581_g170300.1 (Contig2661.g21535)
6.6 50.15 58.35 52.45 97.95 20.19 47.3 45.32 124.6 242.37 220.46 281.67 11.85 271.38 123.79 308.85 226.19 41.43 288.2 158.31 255.42 207.46 145.56 54.43 72.37 279.91 340.43
Sro581_g170310.1 (Contig2661.g21536)
2.55 18.08 12.82 16.42 28.84 2.68 5.47 9.57 65.08 65.71 65.39 68.21 1.07 38.42 29.07 73.63 77.91 2.76 79.01 23.55 88.14 74.99 50.81 11.75 17.42 57.6 109.82
Sro582_g170560.1 (Contig2996.g23812)
0.48 3.29 1.52 1.34 2.41 1.07 1.25 1.78 15.69 25.21 28.73 30.21 0.42 14.15 7.87 15.57 18.51 2.05 38.91 18.47 21.99 27.6 19.97 3.96 5.85 16.25 28.08
Sro5_g004000.1 (Contig4001.g30715)
0.11 0.89 0.32 0.5 1.06 0.15 0.13 0.07 2.13 2.5 2.0 2.3 0.07 1.22 0.52 1.93 2.5 1.55 4.66 3.2 3.27 3.35 3.51 0.34 0.36 1.75 2.81
Sro656_g182500.1 (Contig256.g3161)
0.8 1.21 0.67 1.32 1.16 0.4 0.92 2.1 5.19 9.97 10.62 10.25 0.62 4.96 4.8 10.34 9.65 3.01 11.27 10.71 9.31 5.67 4.38 0.79 1.86 2.42 11.89
Sro659_g182830.1 (Contig2136.g17991)
3.32 58.38 30.14 45.26 77.72 45.92 61.96 66.36 94.52 190.11 329.15 194.39 3.75 80.01 118.73 103.16 281.72 32.01 375.91 124.36 171.07 222.82 146.74 163.45 108.77 381.74 458.69
Sro665_g183850.1 (Contig1678.g15078)
0.61 10.21 12.57 6.79 8.21 5.28 4.68 8.68 29.54 42.17 28.17 47.35 10.24 49.73 16.43 33.57 35.41 12.55 41.19 46.74 57.24 50.05 29.69 10.93 33.37 46.74 42.01
Sro673_g185320.1 (Contig1386.g12797)
3.68 9.88 13.83 9.26 9.67 23.31 14.84 18.37 24.8 55.85 41.75 69.86 24.39 58.49 33.76 55.95 29.69 14.96 39.61 33.97 79.56 36.24 33.79 24.67 22.68 52.64 50.07
Sro679_g186130.1 (Contig1031.g10262)
0.46 0.35 0.49 0.95 0.36 0.3 0.04 0.07 0.9 2.29 1.53 3.04 0.16 1.35 0.53 0.4 1.59 0.45 3.43 2.84 3.05 1.9 1.27 0.39 0.23 1.82 1.61
Sro69_g038490.1 (Contig4677.g34758)
0.33 3.73 2.3 2.7 4.14 4.67 3.7 7.44 8.54 24.08 15.76 34.91 3.77 23.53 7.8 15.42 29.39 9.02 32.82 22.31 31.97 22.8 10.49 8.51 16.09 35.42 25.21
Sro6_g004870.1 (Contig175.g1992)
13.25 52.8 22.59 22.08 30.52 8.74 10.42 10.2 47.82 63.0 42.5 103.53 5.68 28.51 15.17 34.27 41.45 13.7 102.57 43.71 74.9 82.17 52.32 21.43 55.39 58.55 48.58
Sro6_g005150.1 (Contig175.g2020)
0.21 5.79 8.9 8.48 7.1 1.9 2.74 5.58 11.23 19.27 20.77 24.21 2.65 11.67 9.1 12.83 8.88 5.31 29.84 17.95 25.65 10.23 15.99 4.79 10.7 15.14 24.84
Sro758_g198110.1 (Contig434.g5863)
207.27 15.6 19.82 12.81 12.06 12.43 9.21 15.93 92.16 128.23 79.97 133.18 10.16 154.28 87.54 121.65 95.21 67.36 122.63 87.16 170.48 98.82 114.24 55.37 61.55 114.31 93.88
Sro76_g041800.1 (Contig184.g2158)
0.11 0.49 0.75 0.36 0.72 2.2 1.83 2.47 5.01 10.74 12.04 11.99 1.92 6.95 4.45 6.07 12.93 2.56 7.14 6.62 14.87 7.59 6.84 2.79 4.4 9.5 20.82
Sro829_g208050.1 (Contig1016.g10164)
0.61 15.04 14.13 10.95 10.34 1.21 1.58 1.61 12.71 21.07 24.45 22.36 1.59 18.53 10.43 21.45 12.98 2.19 24.22 17.87 27.81 22.66 15.91 4.36 5.19 14.39 27.34
Sro831_g208320.1 (Contig2214.g18374)
0.34 2.28 1.4 1.14 1.24 1.93 4.54 4.48 3.92 8.43 4.48 9.47 1.5 7.24 5.15 4.86 4.16 0.99 6.17 7.37 10.3 7.94 6.6 4.4 6.23 10.3 5.38
Sro83_g044490.1 (Contig4450.g33423)
29.13 19.51 13.03 13.79 20.99 15.77 13.15 16.11 127.66 127.34 77.32 176.38 19.12 99.18 32.26 53.16 77.15 42.44 217.83 109.93 176.89 171.94 156.43 39.52 50.87 77.22 71.52
Sro975_g226810.1 (Contig3918.g30027)
0.02 1.24 0.67 0.89 1.06 4.08 1.48 0.91 3.42 5.14 7.04 4.84 1.86 9.21 3.35 2.37 4.31 2.01 3.52 4.57 5.17 3.22 4.02 2.25 1.66 3.68 4.77

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)