Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1035_g233890.1 (Contig58.g461)	0.0	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.1	0.03	0.04	0.15	0.2	0.13	1.0	0.13	0.15	0.26	0.18	0.19	0.27	0.77	0.22	0.04	0.04	0.12	0.06	0.07	0.09
Sro104_g053050.1 (Contig1278.g11948)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.12	0.05	0.08	0.22	0.07	0.24	1.0	0.41	0.18	0.68	0.08	0.3	0.31	0.58	0.29	0.11	0.08	0.03	0.04	0.06	0.08
Sro1100_g241220.1 (Contig937.g9734)	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.1	0.04	0.08	0.23	0.09	0.23	1.0	0.38	0.21	0.81	0.16	0.21	0.22	0.6	0.31	0.09	0.05	0.07	0.19	0.14	0.09
Sro1141_g245690.1 (Contig1502.g13746)	0.03	0.08	0.07	0.05	0.07	0.06	0.12	0.09	0.12	0.19	0.12	0.25	1.0	0.13	0.13	0.17	0.12	0.15	0.15	0.4	0.26	0.05	0.07	0.1	0.15	0.08	0.08
Sro1165_g248060.1 (Contig3103.g24677)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.01	0.03	0.15	0.1	0.2	1.0	0.25	0.13	0.37	0.14	0.14	0.18	0.49	0.24	0.06	0.03	0.03	0.02	0.06	0.06
Sro1165_g248060.2	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.12	0.05	0.12	0.21	0.13	0.14	1.0	0.24	0.2	0.65	0.21	0.17	0.23	0.72	0.23	0.34	0.1	0.02	0.07	0.1	0.14
Sro1180_g249770.1 (Contig2637.g21369)	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.11	0.05	0.12	0.08	0.01	0.12	1.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.26	0.21	0.01	0.05	0.0	0.01	0.0	0.01
Sro125_g060200.1 (Contig2833.g22731)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.13	0.06	0.08	0.21	0.09	0.19	1.0	0.36	0.21	0.6	0.08	0.26	0.25	0.72	0.31	0.12	0.09	0.06	0.05	0.06	0.09
Sro12_g009060.1 (Contig2293.g18926)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.11	0.07	0.05	0.14	0.16	0.15	1.0	0.09	0.15	0.19	0.08	0.15	0.14	0.52	0.21	0.06	0.03	0.16	0.28	0.13	0.12
Sro1386_g268260.1 (Contig1512.g13809)	0.01	0.09	0.07	0.05	0.09	0.08	0.06	0.04	0.03	0.18	0.13	0.23	1.0	0.15	0.12	0.14	0.05	0.05	0.17	0.42	0.15	0.03	0.02	0.09	0.05	0.05	0.15
Sro1496_g277540.1 (Contig2419.g19804)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.09	0.02	0.12	0.12	0.04	0.23	1.0	0.18	0.11	0.32	0.05	0.06	0.07	0.65	0.21	0.1	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06
Sro157_g071170.1 (Contig2362.g19407)	0.15	0.03	0.07	0.05	0.06	0.11	0.14	0.08	0.15	0.26	0.18	0.33	1.0	0.2	0.14	0.12	0.13	0.17	0.18	0.54	0.36	0.11	0.07	0.13	0.15	0.09	0.12
Sro1638_g287700.1 (Contig4204.g31970)	0.0	0.03	0.03	0.04	0.02	0.07	0.09	0.03	0.19	0.26	0.27	0.39	1.0	0.41	0.28	0.43	0.15	0.26	0.27	0.75	0.29	0.06	0.09	0.06	0.08	0.08	0.17
Sro1805_g298840.1 (Contig1266.g11828)	0.02	0.13	0.11	0.21	0.17	0.17	0.27	0.23	0.23	0.36	0.32	0.46	1.0	0.4	0.28	0.27	0.31	0.26	0.28	0.67	0.35	0.44	0.31	0.17	0.26	0.2	0.24
Sro1860_g302100.1 (Contig183.g2118)	0.1	0.03	0.05	0.05	0.03	0.06	0.16	0.07	0.13	0.19	0.13	0.2	1.0	0.12	0.15	0.14	0.11	0.13	0.2	0.68	0.24	0.21	0.09	0.12	0.2	0.13	0.11
Sro194_g082980.1 (Contig237.g2893)	0.14	0.08	0.12	0.13	0.13	0.07	0.2	0.15	0.22	0.28	0.22	0.31	1.0	0.33	0.22	0.27	0.2	0.23	0.26	0.57	0.31	0.38	0.26	0.15	0.25	0.18	0.12
Sro197_g083730.1 (Contig3509.g27178)	0.0	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.18	0.1	0.11	0.25	0.2	0.37	1.0	0.24	0.21	0.22	0.09	0.15	0.25	0.63	0.41	0.08	0.06	0.22	0.37	0.25	0.23
Sro208_g087220.1 (Contig351.g4793)	0.0	0.02	0.03	0.02	0.02	0.12	0.11	0.07	0.09	0.17	0.11	0.19	1.0	0.12	0.15	0.13	0.15	0.11	0.19	0.35	0.2	0.04	0.03	0.12	0.06	0.04	0.17
Sro2127_g315750.1 (Contig3789.g29086)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.12	0.01	0.13	1.0	0.2	0.12	0.42	0.04	0.16	0.14	0.53	0.18	0.26	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04
Sro219_g090420.1 (Contig3313.g25982)	0.11	0.12	0.16	0.21	0.22	0.11	0.21	0.15	0.27	0.33	0.28	0.43	1.0	0.41	0.27	0.33	0.34	0.32	0.3	0.67	0.38	0.24	0.32	0.15	0.19	0.22	0.2
Sro229_g092990.1 (Contig429.g5803)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.01	0.04	0.14	0.03	0.12	1.0	0.31	0.13	0.42	0.06	0.18	0.15	0.5	0.25	0.09	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03
Sro248_g098270.1 (Contig288.g3761)	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.13	0.1	0.07	0.19	0.23	0.15	1.0	0.18	0.18	0.27	0.15	0.2	0.3	0.52	0.23	0.11	0.04	0.14	0.25	0.18	0.16
Sro2503_g329570.1 (Contig517.g6818)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04	0.09	0.02	0.01	0.12	0.16	0.1	1.0	0.17	0.14	0.14	0.11	0.11	0.14	0.72	0.13	0.04	0.01	0.07	0.09	0.07	0.06
Sro256_g100620.3	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.05	0.01	0.09	0.16	0.12	0.16	1.0	0.29	0.13	0.27	0.1	0.16	0.27	0.53	0.25	0.02	0.04	0.06	0.04	0.09	0.07
Sro256_g100750.1 (Contig3587.g27720)	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.1	0.14	0.07	0.13	0.27	0.19	0.3	1.0	0.47	0.26	0.58	0.16	0.29	0.31	0.74	0.37	0.28	0.13	0.11	0.14	0.14	0.12
Sro295_g110360.1 (Contig4342.g32759)	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.02	0.03	0.05	0.11	0.07	0.12	1.0	0.04	0.03	0.02	0.0	0.07	0.05	0.48	0.19	0.04	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro29_g019150.1 (Contig1384.g12758)	0.02	0.06	0.05	0.03	0.03	0.08	0.25	0.18	0.21	0.26	0.21	0.26	1.0	0.35	0.26	0.53	0.2	0.35	0.35	0.58	0.36	0.26	0.25	0.11	0.06	0.1	0.16
Sro2_g001790.1 (Contig467.g6337)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.08	0.03	0.15	0.16	0.08	0.15	1.0	0.3	0.2	0.58	0.1	0.25	0.23	0.67	0.22	0.16	0.1	0.03	0.05	0.07	0.05
Sro3059_g342920.1 (Contig2601.g21071)	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.06	0.09	0.03	0.1	0.1	0.15	1.0	0.05	0.11	0.16	0.12	0.08	0.22	0.69	0.18	0.07	0.02	0.08	0.29	0.23	0.07
Sro306_g113080.1 (Contig3593.g27782)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.15	0.07	0.02	0.13	0.21	0.15	1.0	0.07	0.17	0.15	0.18	0.08	0.15	0.3	0.14	0.02	0.04	0.17	0.14	0.1	0.21
Sro30_g019410.1 (Contig3962.g30341)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.12	0.1	0.09	0.06	0.22	0.16	0.27	1.0	0.39	0.2	0.35	0.14	0.19	0.18	0.48	0.25	0.03	0.03	0.08	0.04	0.05	0.16
Sro30_g019480.1 (Contig3962.g30348)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.06	0.25	0.27	0.19	0.26	1.0	0.38	0.22	0.51	0.16	0.16	0.21	0.61	0.37	0.13	0.14	0.08	0.13	0.15	0.12
Sro3141_g344380.2	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.07	0.11	0.21	0.13	0.25	1.0	0.25	0.18	0.28	0.11	0.15	0.17	0.57	0.23	0.29	0.07	0.08	0.13	0.12	0.09
Sro345_g122450.1 (Contig2266.g18804)	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.05	0.15	0.08	0.14	0.25	0.14	0.29	1.0	0.35	0.22	0.53	0.14	0.25	0.31	0.63	0.33	0.14	0.11	0.04	0.05	0.1	0.13
Sro37_g023330.1 (Contig1425.g13149)	0.0	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.15	0.03	0.17	0.25	0.36	0.37	1.0	0.45	0.23	0.31	0.43	0.14	0.24	0.65	0.31	0.04	0.09	0.14	0.1	0.17	0.19
Sro411_g137680.1 (Contig243.g2974)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.04	0.17	0.17	0.13	0.14	1.0	0.32	0.18	0.29	0.11	0.17	0.2	0.72	0.23	0.26	0.15	0.06	0.07	0.08	0.09
Sro495_g154420.1 (Contig3243.g25622)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.24	0.1	0.02	0.07	1.0	0.41	0.06	0.1	0.02	0.03	0.06	0.75	0.16	0.2	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01
Sro49_g028790.1 (Contig2054.g17629)	0.02	0.06	0.07	0.05	0.06	0.03	0.08	0.05	0.13	0.17	0.11	0.18	1.0	0.29	0.12	0.26	0.08	0.08	0.11	0.7	0.23	0.26	0.09	0.04	0.06	0.05	0.09
Sro4_g003330.1 (Contig3815.g29251)	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.09	0.05	0.07	0.17	0.13	0.15	1.0	0.31	0.11	0.13	0.11	0.12	0.17	0.53	0.21	0.08	0.05	0.11	0.14	0.1	0.13
Sro507_g156560.1 (Contig4452.g33458)	0.21	0.11	0.17	0.2	0.16	0.08	0.16	0.15	0.1	0.25	0.26	0.26	1.0	0.25	0.24	0.36	0.23	0.32	0.35	0.61	0.25	0.12	0.1	0.21	0.21	0.12	0.26
Sro528_g160880.1	0.0	0.04	0.04	0.04	0.02	0.16	0.08	0.02	0.04	0.11	0.09	0.16	1.0	0.18	0.13	0.05	0.08	0.02	0.08	0.6	0.08	0.04	0.04	0.06	0.06	0.06	0.05
Sro549_g164520.1 (Contig1749.g15557)	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.03	0.11	0.16	0.1	0.14	1.0	0.25	0.21	0.46	0.11	0.11	0.17	0.51	0.22	0.13	0.04	0.06	0.13	0.11	0.07
Sro54_g032020.1 (Contig2430.g19890)	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.12	0.06	0.09	0.18	0.14	0.22	1.0	0.27	0.17	0.25	0.1	0.12	0.12	0.53	0.23	0.27	0.1	0.08	0.15	0.08	0.07
Sro569_g168310.1 (Contig1581.g14357)	0.02	0.08	0.09	0.11	0.13	0.09	0.26	0.29	0.27	0.3	0.27	0.36	1.0	0.31	0.32	0.55	0.27	0.32	0.3	0.69	0.39	0.51	0.23	0.24	0.48	0.23	0.17
Sro623_g177080.1 (Contig3858.g29687)	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.13	0.1	0.07	0.04	0.16	0.17	0.18	1.0	0.13	0.18	0.29	0.15	0.36	0.17	0.45	0.17	0.04	0.04	0.09	0.16	0.07	0.1
Sro665_g183900.1 (Contig1678.g15083)	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.18	0.07	0.2	0.28	0.19	0.29	1.0	0.57	0.29	0.76	0.23	0.33	0.29	0.78	0.43	0.28	0.19	0.1	0.08	0.16	0.11
Sro71_g039550.1 (Contig2582.g20978)	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.1	0.05	0.15	0.17	0.05	0.18	1.0	0.36	0.09	0.11	0.08	0.05	0.08	0.76	0.2	0.33	0.11	0.03	0.06	0.02	0.04
Sro80_g043010.1 (Contig92.g1045)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.1	0.05	0.08	0.19	0.15	0.2	1.0	0.38	0.18	0.4	0.14	0.17	0.21	0.59	0.26	0.23	0.08	0.09	0.13	0.14	0.08
Sro810_g205690.1 (Contig3420.g26647)	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.06	0.14	0.07	0.08	0.17	0.13	0.17	1.0	0.19	0.15	0.23	0.1	0.13	0.17	0.49	0.2	0.15	0.06	0.08	0.09	0.08	0.09
Sro88_g046500.1 (Contig265.g3308)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.06	0.01	0.07	0.19	0.11	0.26	1.0	0.31	0.15	0.35	0.09	0.06	0.08	0.94	0.25	0.25	0.04	0.05	0.08	0.03	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)