Heatmap: Cluster_307 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1044_g234880.1 (Contig685.g7974)
0.0 0.15 0.16 0.15 0.11 0.26 0.1 1.0 0.4 0.26 0.53 0.32 0.25 0.17 0.38 0.27 0.78 0.53 0.56 0.22 0.18 0.59 0.32 0.15 0.04 0.27 0.36
Sro1058_g236360.1 (Contig518.g6826)
0.01 0.01 0.06 0.03 0.05 0.01 0.09 0.3 0.37 0.09 0.05 0.03 0.22 0.0 0.08 0.09 0.0 1.0 0.98 0.15 0.04 0.55 0.2 0.0 0.0 0.02 0.09
Sro1060_g236650.1 (Contig1660.g14958)
0.29 0.05 0.07 0.0 0.0 0.07 0.09 0.92 0.35 0.03 0.0 0.0 0.07 0.01 0.03 0.11 0.05 0.02 0.03 0.04 0.05 1.0 0.26 0.02 0.03 0.09 0.04
Sro1070_g237740.1 (Contig4107.g31347)
0.03 0.06 0.39 0.19 0.1 0.01 0.21 0.72 0.44 0.18 0.21 0.09 0.22 0.05 0.2 0.37 0.07 0.46 0.67 0.42 0.31 1.0 0.26 0.27 0.33 0.31 0.12
Sro1117_g243030.1 (Contig1027.g10249)
0.0 0.25 1.0 0.31 0.21 0.03 0.06 0.56 0.37 0.15 0.09 0.08 0.95 0.03 0.18 0.13 0.13 0.39 0.51 0.78 0.08 0.75 0.14 0.04 0.07 0.03 0.09
Sro1118_g243110.1 (Contig728.g8389)
0.69 0.25 0.39 0.33 0.27 0.22 0.36 0.66 1.0 0.4 0.56 0.35 0.31 0.2 0.51 0.62 0.47 0.38 0.36 0.39 0.71 0.95 0.36 0.62 0.85 0.36 0.45
Sro113_g055900.1 (Contig4126.g31555)
0.0 0.22 0.19 0.12 0.14 0.12 0.08 1.0 0.52 0.23 0.45 0.32 0.22 0.28 0.37 0.22 0.65 0.39 0.4 0.23 0.19 1.0 0.33 0.14 0.03 0.18 0.25
Sro1155_g247220.1 (Contig3100.g24666)
0.03 0.37 0.41 0.55 0.45 0.09 0.04 0.65 0.71 0.2 0.08 0.19 0.1 0.03 0.14 0.04 0.18 0.33 0.32 0.09 0.51 1.0 0.29 0.04 0.03 0.06 0.09
Sro1169_g248630.1 (Contig2988.g23735)
0.02 0.06 0.16 0.11 0.14 0.26 0.18 0.5 0.48 0.22 0.26 0.23 0.04 0.29 0.24 0.16 0.14 0.19 0.38 0.13 0.36 1.0 0.52 0.08 0.13 0.2 0.3
0.0 0.4 0.47 0.3 0.39 0.02 0.22 0.88 0.61 0.12 0.32 0.03 0.05 0.06 0.19 0.2 0.25 0.22 0.15 0.04 0.13 1.0 0.4 0.28 0.32 0.24 0.21
Sro1202_g252020.1 (Contig4304.g32483)
0.0 0.01 0.06 0.03 0.04 0.11 0.23 0.8 0.3 0.06 0.18 0.01 0.07 0.09 0.15 0.04 0.25 0.06 0.06 0.05 0.04 1.0 0.23 0.03 0.08 0.12 0.15
0.02 0.41 1.0 0.23 0.24 0.04 0.2 0.31 0.25 0.16 0.19 0.18 0.14 0.08 0.21 0.24 0.17 0.18 0.17 0.16 0.17 0.26 0.19 0.24 0.24 0.14 0.17
Sro1248_g255950.1 (Contig1404.g12874)
0.14 0.05 0.26 0.2 0.05 0.13 0.02 0.3 0.53 0.13 0.05 0.16 0.11 0.01 0.15 0.06 0.18 0.17 0.33 0.11 0.18 1.0 0.23 0.04 0.03 0.06 0.07
0.08 0.39 0.43 0.54 0.42 0.05 0.04 0.51 0.99 0.25 0.08 0.24 0.13 0.04 0.16 0.05 0.2 0.27 0.44 0.13 0.57 1.0 0.33 0.04 0.03 0.05 0.09
Sro1295_g260260.1 (Contig1102.g10675)
0.03 0.09 0.1 0.14 0.02 0.04 0.12 0.68 0.21 0.13 0.06 0.07 0.04 0.03 0.12 0.16 0.33 0.32 0.13 0.08 0.21 1.0 0.06 0.19 0.14 0.11 0.13
Sro1321_g262450.1 (Contig4512.g33821)
0.03 0.28 0.36 0.37 0.32 0.02 0.06 0.53 0.53 0.12 0.05 0.08 0.07 0.02 0.06 0.07 0.04 0.18 0.12 0.07 0.3 1.0 0.41 0.01 0.02 0.0 0.02
Sro1321_g262460.1 (Contig4512.g33822)
0.65 0.22 0.25 0.19 0.19 0.03 0.08 0.51 0.46 0.17 0.06 0.19 0.29 0.09 0.13 0.1 0.1 0.69 0.35 0.25 0.25 1.0 0.4 0.03 0.08 0.08 0.1
Sro1530_g280050.1 (Contig886.g9454)
0.02 0.28 0.23 0.28 0.33 0.07 0.54 1.0 0.43 0.15 0.13 0.07 0.17 0.03 0.13 0.09 0.12 0.37 0.15 0.15 0.18 0.79 0.41 0.46 0.33 0.19 0.1
0.0 0.77 1.0 0.34 0.28 0.03 0.23 0.66 0.6 0.1 0.11 0.04 0.07 0.07 0.12 0.13 0.3 0.08 0.11 0.08 0.04 0.99 0.44 0.11 0.1 0.09 0.1
Sro1609_g285730.1 (Contig342.g4644)
0.07 0.31 0.45 0.49 0.41 0.05 0.03 0.5 1.0 0.1 0.1 0.13 0.04 0.01 0.15 0.09 0.09 0.15 0.19 0.05 0.23 0.51 0.28 0.05 0.03 0.05 0.1
Sro170_g075330.1 (Contig2525.g20606)
0.0 0.39 1.0 0.36 0.26 0.22 0.52 0.85 0.59 0.21 0.33 0.11 0.11 0.12 0.35 0.46 0.45 0.83 0.46 0.12 0.28 0.99 0.58 0.11 0.12 0.27 0.47
Sro1777_g296940.1 (Contig3318.g26035)
0.0 0.2 0.66 0.21 0.2 0.17 0.17 0.63 0.6 0.13 0.52 0.1 0.05 0.06 0.26 0.23 0.63 0.09 0.12 0.04 0.11 1.0 0.29 0.05 0.04 0.14 0.28
Sro178_g078320.1 (Contig275.g3557)
0.02 0.15 0.14 0.13 0.19 0.02 0.08 0.79 0.28 0.18 0.24 0.2 0.16 0.08 0.25 0.08 0.37 0.32 0.33 0.23 0.2 1.0 0.39 0.02 0.0 0.1 0.16
Sro1888_g303650.1 (Contig4582.g34238)
0.01 0.83 0.86 0.61 0.48 0.04 0.14 0.34 0.48 0.34 0.42 0.21 0.22 0.14 0.31 1.0 0.47 0.82 0.62 0.22 0.52 0.44 0.58 0.1 0.14 0.24 0.44
Sro1927_g305940.1 (Contig136.g1513)
0.02 0.62 0.22 0.15 0.16 0.09 0.16 0.19 0.37 0.27 0.23 0.32 0.29 0.19 0.2 0.17 0.16 0.35 0.47 0.35 0.34 1.0 0.46 0.11 0.11 0.18 0.21
Sro1986_g309510.1 (Contig933.g9715)
0.04 0.2 0.25 0.37 0.33 0.07 0.02 0.6 0.5 0.16 0.06 0.17 0.14 0.02 0.13 0.06 0.17 0.3 0.33 0.13 0.5 1.0 0.23 0.01 0.01 0.04 0.08
Sro1991_g309770.1 (Contig4515.g33854)
0.02 0.07 0.04 0.25 0.12 0.0 0.05 0.39 0.6 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 1.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.02
Sro2209_g319170.1 (Contig3038.g24223)
0.02 0.06 0.14 0.19 0.29 0.03 0.22 0.28 0.37 0.13 0.01 0.06 0.06 0.01 0.08 0.03 0.02 0.06 0.06 0.3 0.1 1.0 0.54 0.02 0.0 0.0 0.04
Sro2210_g319210.1 (Contig710.g8221)
0.0 0.02 0.05 0.05 0.03 0.12 0.19 0.71 0.6 0.11 0.23 0.11 0.06 0.05 0.15 0.3 0.47 0.19 0.1 0.06 0.2 1.0 0.3 0.01 0.01 0.11 0.17
Sro222_g091200.1 (Contig3134.g24883)
0.0 0.05 0.12 0.09 0.07 0.1 0.03 0.32 0.32 0.07 0.09 0.0 0.68 0.01 0.11 0.02 0.03 0.74 0.75 0.12 0.0 1.0 0.27 0.02 0.0 0.01 0.03
Sro223_g091320.1 (Contig370.g5001)
0.01 0.47 1.0 0.77 0.59 0.25 0.44 0.69 0.51 0.36 0.53 0.41 0.32 0.45 0.51 0.6 0.41 0.65 0.43 0.31 0.39 0.52 0.68 0.22 0.18 0.19 0.55
Sro250_g099110.1 (Contig1989.g17027)
0.0 0.21 0.2 0.15 0.14 0.14 0.3 1.0 0.67 0.13 0.34 0.06 0.1 0.02 0.2 0.39 0.35 0.49 0.19 0.07 0.17 0.81 0.31 0.13 0.16 0.23 0.34
Sro2573_g331670.1 (Contig912.g9562)
0.02 0.11 0.14 0.07 0.03 0.06 0.13 0.14 0.07 0.27 0.0 0.14 0.42 0.37 0.08 0.31 0.14 0.61 0.58 0.5 0.88 1.0 0.09 0.2 0.06 0.26 0.14
Sro2573_g331680.1 (Contig912.g9563)
0.0 0.15 0.06 0.09 0.11 0.05 0.13 0.55 0.0 0.09 0.03 0.04 0.09 0.17 0.01 0.08 0.32 0.22 0.11 0.14 0.22 1.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.04
Sro273_g105210.1 (Contig4205.g32002)
0.0 0.05 1.0 0.1 0.07 0.0 0.02 0.31 0.14 0.05 0.0 0.11 0.13 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.19 0.02 0.3 0.02 0.01 0.04 0.02 0.0
Sro276_g106010.1 (Contig2556.g20781)
0.0 1.0 0.88 0.56 0.63 0.1 0.17 0.27 0.31 0.27 0.2 0.23 0.17 0.27 0.18 0.29 0.14 0.17 0.3 0.25 0.3 0.82 0.33 0.11 0.19 0.27 0.2
Sro283_g107840.1 (Contig4255.g32215)
0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.15 0.27 0.04 0.13 0.07 0.4 0.08 0.04 0.08 0.03 0.02 0.07 0.14 0.3 0.18 1.0 0.13 0.07 0.13 0.14 0.04
Sro286_g108430.1 (Contig956.g9879)
0.0 0.14 0.38 0.07 0.09 0.17 0.09 0.43 0.47 0.22 0.21 0.26 0.06 0.19 0.25 0.28 0.42 0.05 0.09 0.06 0.33 1.0 0.3 0.1 0.09 0.16 0.19
Sro2920_g340270.1 (Contig2919.g23237)
0.01 0.58 1.0 0.59 0.33 0.2 0.32 0.52 0.45 0.19 0.39 0.11 0.07 0.1 0.32 0.44 0.41 0.12 0.07 0.06 0.31 0.68 0.49 0.16 0.37 0.38 0.32
Sro314_g115070.1 (Contig2448.g20033)
0.04 0.35 0.32 0.25 0.23 0.13 0.19 0.63 0.52 0.17 0.73 0.19 0.37 0.3 0.28 0.12 1.0 0.47 0.31 0.25 0.08 0.36 0.31 0.06 0.0 0.13 0.26
Sro314_g115170.1 (Contig2448.g20043)
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.25 1.0 0.49 0.14 0.42 0.17 0.25 0.23 0.27 0.12 1.0 0.07 0.08 0.21 0.14 0.49 0.35 0.07 0.01 0.14 0.2
Sro316_g115560.1 (Contig2414.g19762)
0.06 1.0 0.82 0.23 0.21 0.06 0.22 0.28 0.5 0.1 0.04 0.06 0.1 0.07 0.1 0.04 0.06 0.07 0.07 0.08 0.06 0.84 0.45 0.01 0.01 0.04 0.05
Sro3212_g345350.1 (Contig2773.g22311)
0.0 0.6 1.0 0.92 0.29 0.0 0.01 0.49 0.24 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.25 0.02 0.02 0.0 0.01 0.99 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro362_g126730.1 (Contig50.g355)
0.02 0.06 0.07 0.03 0.03 0.1 0.18 0.51 0.28 0.07 0.11 0.06 0.02 0.01 0.16 0.14 0.08 0.1 0.03 0.02 0.1 1.0 0.11 0.35 0.3 0.22 0.11
0.03 0.5 0.78 0.73 0.45 0.14 0.27 0.46 0.57 0.28 0.27 0.27 0.03 0.16 0.24 0.24 0.38 0.03 0.02 0.04 0.32 1.0 0.53 0.3 0.33 0.25 0.21
Sro386_g131890.1 (Contig4061.g31130)
0.0 0.01 1.0 0.37 0.2 0.1 0.05 0.16 0.11 0.1 0.0 0.09 0.14 0.05 0.06 0.05 0.15 0.12 0.16 0.24 0.14 0.31 0.21 0.03 0.16 0.09 0.07
Sro4018_g352550.1 (Contig529.g6904)
0.0 0.39 1.0 0.35 0.26 0.0 0.02 0.12 0.16 0.1 0.07 0.09 0.07 0.12 0.05 0.08 0.03 0.06 0.09 0.05 0.05 0.89 0.3 0.05 0.03 0.08 0.07
Sro40_g024830.1 (Contig335.g4490)
0.01 0.49 0.37 0.12 0.28 0.03 0.03 0.28 0.14 0.08 0.05 0.08 0.15 0.05 0.05 0.06 0.08 0.05 0.16 0.17 0.05 1.0 0.09 0.02 0.04 0.02 0.04
Sro43_g026240.1 (Contig2453.g20090)
0.0 0.71 1.0 0.73 0.42 0.16 0.2 0.52 0.47 0.19 0.5 0.08 0.02 0.04 0.3 0.65 0.49 0.05 0.03 0.02 0.36 0.64 0.32 0.09 0.18 0.17 0.46
Sro440_g143390.1 (Contig2528.g20651)
0.11 0.45 0.86 0.72 0.49 0.11 0.56 1.0 0.65 0.24 0.44 0.18 0.18 0.12 0.4 0.63 0.41 0.97 0.34 0.24 0.3 0.99 0.3 0.3 0.27 0.17 0.45
Sro44_g026660.1 (Contig358.g4835)
0.02 0.51 0.6 1.0 0.71 0.12 0.04 0.48 0.92 0.25 0.07 0.29 0.22 0.03 0.19 0.08 0.3 0.65 0.66 0.24 0.85 0.93 0.41 0.02 0.03 0.09 0.13
Sro501_g155390.1 (Contig1458.g13352)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.46 0.42 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.23 0.38 0.12 0.19 0.14 0.16 0.16 0.15 0.12 0.18 0.09 0.05 0.12 0.18 1.0 0.26 0.13 0.17 0.1 0.12
Sro53_g031250.1 (Contig1592.g14465)
0.02 0.39 0.33 0.14 0.12 0.08 0.15 0.13 0.56 0.19 0.2 0.21 0.13 0.11 0.3 0.09 0.17 0.13 0.18 0.07 0.25 1.0 0.43 0.18 0.11 0.13 0.13
Sro53_g031380.1 (Contig1592.g14478)
0.01 0.5 0.67 0.16 0.16 0.17 0.15 0.12 0.54 0.22 0.26 0.26 0.38 0.26 0.27 0.19 0.3 0.21 0.3 0.31 0.17 1.0 0.47 0.1 0.08 0.11 0.18
Sro579_g169950.1 (Contig368.g4979)
0.0 0.33 0.24 0.13 0.07 0.0 0.02 0.12 0.36 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 1.0 0.06 0.0 0.01 0.02 0.0
Sro594_g172440.1 (Contig3536.g27338)
0.0 0.3 0.81 0.4 0.36 0.13 0.01 0.6 0.46 0.06 0.13 0.0 0.08 0.0 0.12 0.02 0.27 0.59 0.14 0.02 0.02 1.0 0.17 0.01 0.02 0.21 0.05
Sro5_g004080.1 (Contig4001.g30723)
0.0 0.61 0.67 0.65 0.74 0.29 0.41 1.0 0.61 0.33 0.41 0.24 0.19 0.24 0.38 0.48 0.6 0.6 0.23 0.19 0.45 0.62 0.59 0.28 0.15 0.21 0.43
Sro655_g182350.1 (Contig3913.g29993)
0.0 0.3 1.0 0.38 0.25 0.01 0.05 0.44 0.39 0.06 0.12 0.01 0.03 0.0 0.15 0.16 0.05 0.15 0.06 0.02 0.03 0.75 0.06 0.07 0.18 0.14 0.08
Sro663_g183560.1 (Contig119.g1354)
0.0 0.55 1.0 0.36 0.35 0.02 0.12 0.31 0.38 0.09 0.01 0.02 0.05 0.02 0.06 0.0 0.01 0.16 0.06 0.02 0.0 0.73 0.31 0.04 0.07 0.07 0.05
Sro689_g187530.1 (Contig4685.g34838)
0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01 0.04 0.16 0.41 0.09 0.08 0.14 0.03 0.03 0.08 0.06 0.15 0.02 0.02 0.05 0.09 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.58 0.45 0.02 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.04 0.01 1.0 0.07 0.04 0.0 0.03 0.0
Sro745_g196300.1 (Contig210.g2500)
0.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.1 0.09 0.63 0.35 0.08 0.36 0.1 0.21 0.19 0.16 0.09 1.0 0.15 0.29 0.16 0.03 0.27 0.19 0.05 0.01 0.15 0.22
Sro77_g042160.1 (Contig338.g4611)
0.01 0.03 0.12 0.08 0.07 0.15 0.15 0.51 0.65 0.21 0.26 0.14 0.17 0.01 0.31 0.29 0.26 0.38 0.25 0.21 0.21 1.0 0.23 0.2 0.35 0.45 0.39
Sro790_g202800.1 (Contig4757.g451)
0.03 0.85 1.0 0.21 0.16 0.1 0.08 0.16 0.39 0.12 0.13 0.09 0.29 0.2 0.19 0.03 0.21 0.12 0.17 0.21 0.14 0.94 0.27 0.01 0.0 0.02 0.07
Sro851_g210890.1 (Contig461.g6215)
0.02 0.57 0.67 0.6 0.72 0.21 0.19 0.21 0.23 0.25 0.12 0.19 1.0 0.24 0.15 0.19 0.25 0.32 0.22 0.27 0.16 0.99 0.19 0.16 0.11 0.3 0.21
0.01 0.32 0.96 0.51 0.43 0.06 0.47 1.0 0.63 0.19 0.35 0.09 0.12 0.04 0.25 0.27 0.35 0.27 0.16 0.21 0.23 0.71 0.52 0.18 0.26 0.32 0.32
0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.05 0.01 0.33 0.11 0.15 0.05 0.06 0.24 0.03 0.13 0.2 0.04 0.94 1.0 0.34 0.04 0.54 0.18 0.02 0.0 0.01 0.16
Sro949_g223700.1 (Contig3294.g25870)
0.01 0.53 0.77 0.44 0.35 0.35 0.32 0.93 0.74 0.31 0.52 0.3 0.32 0.29 0.42 0.65 1.0 0.42 0.31 0.22 0.4 0.99 0.38 0.11 0.1 0.2 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)