Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1031_g233500.1 (Contig1465.g13459)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro1065_g237300.1 (Contig1468.g13474)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro1074_g238270.1 (Contig4290.g32411)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro1084_g239510.1 (Contig3162.g25058)
- - - - - - - - - -1.72 - - 4.35 - - - - - - 2.66 - - - - - - -
Sro1142_g245870.1 (Contig2104.g17876)
- - - - - - - - - -0.86 - - 3.73 0.55 - - - -0.86 - 3.44 -1.87 - - - - - -
Sro1197_g251510.1 (Contig496.g6699)
- - - - - - - - - 0.96 - - 4.65 - - - - - - - - - - - - - -
Sro1197_g251520.1 (Contig496.g6700)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro119_g058120.1 (Contig2194.g18285)
1.94 -1.37 -1.93 -2.76 -2.24 -3.26 -0.95 -1.15 -2.13 0.24 -0.89 0.21 1.33 -2.09 -0.79 -1.52 -1.58 -0.13 0.93 2.58 -0.2 -3.26 -2.45 0.29 -0.3 -1.31 0.64
Sro1210_g252730.1 (Contig2015.g17239)
-0.09 - - - - - -0.83 -0.73 -0.58 -0.85 - 0.22 3.08 -0.76 -1.44 - - 0.97 2.58 1.53 -0.68 - 0.7 - - - -
Sro1211_g252850.1 (Contig766.g8684)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro1232_g254690.1 (Contig645.g7738)
- - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - -
Sro1246_g255790.1 (Contig800.g8976)
-4.21 -1.27 -0.97 -1.06 -2.32 -1.26 0.26 -0.5 -2.18 -0.9 -1.71 -1.35 2.67 -3.21 -0.84 -1.8 -2.75 1.75 2.4 0.58 -2.95 -4.04 -2.02 0.53 -0.97 -0.37 -0.32
Sro1344_g264710.1 (Contig723.g8311)
- - - - - - - - - -2.4 - - 1.87 - - - - - - 4.53 - - - - - - -
Sro134_g063520.1 (Contig145.g1614)
- - - - - - - - - 0.52 - - 3.64 - - - - - - 3.71 - - - - - - -
Sro1360_g266030.1 (Contig2203.g18324)
- -0.24 - - - - -1.02 - - -0.84 2.45 - 3.22 - -2.47 - - - 2.39 1.73 - - 0.02 -0.76 - - -
Sro1380_g267730.1 (Contig4344.g32782)
- - - - - - - - - -0.07 - - 4.05 - - - - - - - 3.24 - - - - - -
Sro1486_g276690.1 (Contig1746.g15555)
- - - - - - 2.36 - - 0.3 - 2.65 - - 1.92 - - - - 2.87 - - 1.71 - - - -
Sro1499_g277710.1 (Contig1461.g13417)
- - - - - - - - - -1.49 - - 3.48 - - - - - - 3.95 - - - - - - -
Sro149_g068620.1 (Contig259.g3230)
- - - - - - 4.08 - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1520_g279410.1 (Contig2548.g20744)
- - - - - - - - - -0.77 - - 2.54 - - - - - -0.85 4.15 - 1.22 - - - - -
Sro160_g072100.1 (Contig2985.g23706)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1621_g286550.1 (Contig359.g4848)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro1621_g286580.1 (Contig359.g4851)
- - - - - - - - - -1.02 - - 2.72 - - - - - - 4.19 - 0.75 - - - - -
- - - - - - - - - 1.45 1.78 - 1.24 - - - - - - 4.05 - - - - - - 0.9
- -1.33 - - - - - - - -0.56 -2.44 -1.08 2.42 -1.57 -1.28 -2.92 1.73 1.2 2.15 2.56 -0.03 -0.54 -4.15 - - 0.22 -2.42
Sro1648_g288520.1 (Contig4608.g34394)
- - - - - - - - 2.67 0.94 - - - 2.13 - - - - - - 3.47 - - - - - 1.69
Sro1656_g289030.1 (Contig3268.g25733)
-5.59 0.46 -0.03 -1.89 -0.63 -3.61 -1.31 -2.24 -1.36 -1.37 -1.69 -2.91 1.86 -2.02 -1.9 -1.01 -1.42 2.37 2.42 0.92 -1.8 -2.68 0.65 -0.69 -0.1 -1.38 -1.25
Sro1674_g290320.1 (Contig3489.g27079)
- - - - - - - - - -2.03 - - 2.76 - - - - 2.15 2.85 3.06 - - - - - - -
Sro1897_g304090.1 (Contig2567.g20851)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.56 - -0.9 - - - - 0.24 -2.17 0.53 -1.47 - 2.42 - -1.02 - 1.71 -0.18 - 3.37 - 0.94 -2.25 -1.23 - - -
Sro1919_g305460.1 (Contig1207.g11350)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro193_g082560.1 (Contig826.g9155)
- - 1.02 1.79 2.08 - - -1.97 - 0.42 - - 2.09 - - - - 0.22 -0.81 3.23 - - -2.79 - - - -2.79
Sro198_g083950.1 (Contig2317.g19115)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2030_g311820.1 (Contig2022.g17316)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro2087_g313910.1 (Contig3974.g30523)
3.37 - - - - - - - - -0.46 - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - -
Sro210_g087500.1 (Contig2488.g20367)
- - - - - - - - - 0.27 - - 3.61 - 0.01 - 0.74 - - 3.45 - - - - - - -
Sro2114_g315100.1 (Contig1314.g12140)
- - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - 4.25 - - - - - -
Sro21_g014510.1 (Contig813.g9041)
-4.2 -3.24 - - -3.29 -3.18 -0.59 -1.11 -0.73 -1.08 -2.62 -0.59 3.72 -4.07 -1.47 -2.06 -1.2 -3.86 1.71 2.19 -1.77 -3.05 -0.43 - - - -1.91
Sro223_g091470.1 (Contig370.g5016)
- - 0.83 - - - - - - -0.01 - - 3.44 -1.13 -1.2 - 1.7 - - 3.12 -0.99 - - - - - -
Sro2309_g322780.1 (Contig1964.g16823)
- - - - - - - - - 0.49 - - - 1.31 - - - 1.44 1.62 4.12 - - - - - - -
Sro2405_g326520.1 (Contig3497.g27143)
- - - - - - - - - -0.67 - - 3.44 - - - - - 2.01 3.52 - - - - - - -
Sro2425_g327270.1 (Contig290.g3802)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.45 - 2.36 - 2.31 2.59 - - - - - 2.44 - - - - - -
- 1.74 - - - - - - -0.83 0.71 - - 2.63 - -0.66 - - - - 3.47 1.68 - - - - - -1.39
Sro255_g100430.1 (Contig2336.g19220)
- - 1.54 0.59 0.56 - -0.72 0.8 -0.69 0.27 0.23 -1.14 2.76 - -1.35 -1.89 - - - 2.13 0.49 -0.9 0.44 - - - -2.27
Sro260_g101600.1 (Contig1663.g15012)
- - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
Sro2634_g333270.1 (Contig4043.g31051)
- - - - - - - - 0.83 -1.5 - - 3.5 - - - - 1.82 1.83 2.01 - - - - - - 1.29
Sro2683_g334540.1 (Contig4215.g32046)
- - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - 2.15 2.25 - - - - - - -
Sro269_g104030.1 (Contig1337.g12324)
-5.22 -5.76 -3.27 -4.46 -5.02 1.59 -8.65 -2.4 -2.56 0.05 -1.68 -0.18 2.39 0.19 -1.83 -2.18 0.98 0.43 2.01 1.88 -0.3 -0.61 -2.8 -2.82 -2.48 -0.25 -1.02
- - - - - - - - - 0.65 - - 2.29 - - - - - 2.01 4.05 - - - - - - -
- - - - - - - - - 0.16 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
Sro2817_g337790.1 (Contig2451.g20052)
- - - - - - - - - 1.04 - - 4.12 - - - - 2.92 - - - - - - - - -
Sro28_g018730.1 (Contig404.g5482)
- - - - - - 1.39 - - 1.34 - 3.15 - - - - - - - - 2.6 - - - - - 2.78
Sro2911_g340120.1 (Contig2663.g21546)
- 2.24 - - 1.46 - - - - -0.84 - - 2.72 - - - - 2.51 - 2.75 - - - - - - -16.03
Sro2918_g340230.1 (Contig218.g2589)
3.31 - - - - - - - - -0.49 - - - - - - - - - 1.79 3.69 - - - - - -
Sro2953_g340940.1 (Contig2733.g22013)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro295_g110570.1 (Contig4342.g32780)
- - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - - 3.16 - - - - - - -
Sro3036_g342570.1 (Contig4285.g32370)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro3042_g342680.1 (Contig2141.g18004)
- - - - - - - - - 0.17 - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - -
Sro3168_g344690.1 (Contig973.g9933)
- - - - - - - - - 0.8 - - - - - - - - - - 4.32 - - - - - 2.42
Sro3170_g344730.1 (Contig1272.g11868)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro3187_g344890.1 (Contig3096.g24658)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro320_g116420.1 (Contig3665.g28303)
- 3.2 - - - - - - - 1.98 - - - 3.73 - - - - - - - - -0.73 - - - -
Sro332_g119410.1 (Contig1165.g11128)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro3381_g347460.1 (Contig1231.g11558)
- - - - - - - - - 2.09 - - - 4.0 - - - - - - - - - - - - 2.76
Sro3422_g347810.1 (Contig4595.g34337)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro344_g122270.1 (Contig3448.g26815)
- 0.05 - - -0.45 - - -3.67 - 0.3 - - 3.53 - -0.6 - - 0.95 0.74 2.47 1.13 - -3.91 - - - -1.54
Sro3493_g348600.1 (Contig4417.g33193)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro350_g123780.1 (Contig1556.g14148)
2.9 - - - - - - - -21.61 -0.63 - - 3.61 - - - - - - - 2.64 - -1.23 - - - -
-3.36 - - - - 1.35 0.25 0.65 -1.07 -1.13 -28.89 - 3.34 -1.38 -1.85 -0.63 - -4.87 0.72 1.7 -0.01 -1.49 -0.87 -1.36 0.2 - -0.19
Sro376_g129610.1 (Contig3640.g28111)
- - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
Sro3782_g351030.1 (Contig2741.g22028)
- - - - - - - - - 1.91 - -15.57 - 3.23 2.58 - - - - - 2.97 - - - - -16.89 -
Sro3803_g351200.1 (Contig980.g9959)
- - - - - - - - - 1.05 - - - - - - - - - 4.64 - - - - - - -
Sro387_g132090.1 (Contig424.g5694)
- - - -0.18 - - -0.84 - - -0.56 - - 4.37 - - - - -1.87 1.2 - - - - -0.53 -1.06 - -1.1
- - - - - - 0.32 -2.05 - -4.26 - - 3.44 - - - - - - -0.28 3.4 - -1.61 - - - 1.51
Sro409_g137280.1 (Contig1790.g15832)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro4117_g352990.1 (Contig1432.g13205)
0.21 0.53 -1.72 0.67 1.03 -0.25 -0.06 -3.66 -4.49 0.9 -0.0 0.97 -1.4 -2.13 -0.38 0.81 -1.84 - -0.76 0.25 -1.56 -0.79 -1.37 2.0 - 0.91 0.44
Sro4143_g353170.1 (Contig1243.g11622)
- - - - - - - - - -1.38 - - - - - - - - - 4.73 - - - - - - -
Sro4242_g353500.1 (Contig4182.g31890)
- - - - - - - - 1.0 -1.48 - - 3.03 0.78 - - - - 0.85 3.69 - - - - - - -
Sro4721_g354540.1 (Contig619.g7590)
1.28 - - - - 1.42 - -1.1 - 0.97 - -0.97 0.82 1.42 - 2.62 0.53 - 1.62 1.02 -22.85 - - - - - 0.88
Sro482_g151800.1 (Contig232.g2790)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro605_g174200.1 (Contig514.g6786)
- - - 2.06 - - - - - -1.16 - - 3.33 - - - - - 0.47 3.45 - - - - - - -
Sro657_g182580.1 (Contig301.g3978)
- - - - - - - - - 0.13 - - 2.03 - - - - - - 1.97 2.83 - - 2.7 - 2.1 -
Sro65_g036650.1 (Contig155.g1735)
0.26 -0.97 - - -1.17 - -0.72 -3.39 -0.71 -0.66 - - 3.03 - - - - 0.0 -0.31 3.49 -0.76 -1.33 -0.48 - - - -
- - - - - - - - - 0.91 - - 3.92 - - - - - - 2.71 1.77 - - - - - -
Sro74_g040590.1 (Contig4700.g34921)
- - - - - - - - - 1.47 - - 3.56 - - - - - - 3.64 - - - - - - -
- - - - - - - - - -1.4 - - 4.13 - - - - - - 3.19 - - - - - - -
Sro756_g197690.1 (Contig3619.g27985)
- - - - - - - - - 0.73 - - 4.66 - - - - - - - - - - - - - -
Sro775_g200810.1 (Contig59.g477)
- - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - -
Sro804_g204910.1 (Contig3806.g29164)
- - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sro856_g211510.1 (Contig4173.g31822)
- - - - - - - - - 1.72 - - 4.57 - - - - - - - - - - - - - -
Sro919_g220120.1 (Contig2964.g23549)
- - - - - - - - - 2.92 - - - - 2.03 - - - 2.98 2.9 - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.