1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230870.1 (Contig4560.g34052)
 0.27 0.47 0.92 0.0 0.07 0.16 9.64 1.45 11.67 12.55 0.43 1.83 324.86 40.4 1.0 0.53 2.93 2.5 3.11 303.52 0.47 3.25 12.93 0.06 0.3 0.14 0.23
Sro1034_g233820.1 (Contig2522.g20583)
 0.11 0.0 0.0 0.08 0.08 2.18 1.66 0.0 1.79 16.3 4.47 0.17 311.14 93.34 20.95 1.56 5.23 1.38 0.29 287.28 0.03 1.98 2.49 0.0 0.0 0.12 1.35
Sro1044_g234950.1 (Contig685.g7981)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1103_g241700.1 (Contig4430.g33247)
 1.22 0.29 0.22 0.0 0.03 0.2 0.26 0.53 0.02 4.28 0.6 2.13 45.73 1.61 1.11 0.24 0.67 8.4 4.16 52.68 1.52 0.46 0.17 0.15 0.16 0.1 0.31
Sro1139_g245390.1 (Contig125.g1415)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1189_g250670.1 (Contig972.g9924)
 0.0 0.22 0.07 0.0 0.22 0.06 0.15 0.88 0.6 0.72 0.13 0.15 10.55 0.33 0.19 0.06 0.13 0.18 0.35 7.64 1.46 0.43 0.74 0.0 0.0 0.02 0.12
Sro11_g008710.1 (Contig724.g8345)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.0 0.01 0.69 0.11 0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 1.0 0.07 0.0 0.03 0.06 0.1 0.17 0.01
Sro1344_g264690.1 (Contig723.g8309)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1344_g264700.1 (Contig723.g8310)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1537_g280720.1 (Contig3053.g24296)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.09 0.0 0.1 0.06 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.24 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1547_g281520.1 (Contig3266.g25724)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro154_g069970.1 (Contig2716.g21875)
 0.0 0.0 0.0 0.2 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.48 0.28 0.06 7.83 2.22 1.04 0.53 0.0 0.26 0.14 7.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro1573_g283410.1 (Contig1464.g13438)
 0.03 0.2 0.0 0.07 0.05 0.0 0.13 0.02 0.19 0.43 0.28 0.1 10.35 0.45 0.34 0.0 0.05 0.17 0.11 10.91 0.06 0.17 0.06 0.04 0.04 0.03 0.03
Sro1674_g290330.1 (Contig3489.g27080)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1682_g290870.1 (Contig3596.g27793)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1695_g291760.1 (Contig3081.g24559)
 0.05 0.12 0.07 0.1 0.07 0.01 0.99 0.22 1.56 3.21 0.2 0.54 53.64 9.01 0.17 0.13 0.37 0.14 0.22 68.85 1.23 0.13 0.92 0.03 0.11 0.12 0.13
Sro1756_g295590.1 (Contig4362.g32862)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.05 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.22 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1790_g297760.1 (Contig4724.g35074)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.38 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1803_g298590.1 (Contig1067.g10408)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2025_g311630.1 (Contig2866.g22965)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2241_g320370.1 (Contig1724.g15420)
 0.0 0.43 1.81 0.0 1.78 0.0 0.0 0.0 0.18 0.59 0.0 0.0 5.85 0.0 0.0 0.0 0.0 3.05 1.28 10.6 0.17 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2435_g327530.1 (Contig3908.g29952)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro249_g098860.1 (Contig4691.g34890)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.16 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2537_g330540.1 (Contig2457.g20113)
 0.02 0.3 0.11 0.06 0.03 0.0 0.07 0.24 0.03 2.75 0.0 0.17 80.4 0.01 0.02 0.0 0.01 1.86 8.72 79.28 0.01 0.48 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro2634_g333260.1 (Contig4043.g31050)
 2.86 0.15 0.0 0.0 0.0 0.26 0.27 14.64 5.88 6.09 1.9 2.34 19.7 0.27 0.53 2.03 0.26 21.36 19.36 78.17 7.95 0.2 22.34 0.0 0.05 0.14 0.83
Sro2693_g334810.1 (Contig1365.g12556)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 1.41 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2720_g335480.1 (Contig4604.g34370)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.26 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2926_g340400.1 (Contig4636.g34569)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.51 0.0 0.03 0.0 0.0 0.31 0.14 0.53 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Sro3072_g343190.1 (Contig2349.g19312)
 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.23 0.0 0.24 0.33 0.23 0.6 1.24 0.14 0.23 0.0 0.0 0.82 0.0 2.71 0.15 0.0 0.47 0.29 0.27 0.42 0.27
Sro319_g116370.1 (Contig204.g2477)
 0.03 0.06 0.0 0.04 0.0 0.36 8.39 0.0 20.98 17.54 0.43 0.12 306.84 88.53 6.05 0.58 2.18 2.3 3.79 351.28 2.01 32.4 7.97 0.0 0.0 0.02 0.37
Sro31_g020210.1 (Contig420.g5616)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.48 14.94 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 16.2 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro321_g116630.1 (Contig56.g419)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.51 0.09 0.11 56.3 11.53 0.39 0.1 0.53 0.38 0.06 63.96 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
Sro322_g117030.1 (Contig1229.g11541)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 2.09 2.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.95 0.0 0.18 20.58 1.57 0.26 0.09 0.06 3.57 1.85 27.41 0.08 1.25 1.11 0.12 0.0 0.0 0.01
Sro3824_g351290.1 (Contig2495.g20438)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.26 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3923_g351900.1 (Contig1900.g16492)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro40_g024960.1 (Contig335.g4503)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 1.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.12 1.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4331_g353730.1 (Contig4035.g31007)
 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.14 0.25 0.0 0.0 0.03 0.06 0.02 0.23 0.02
Sro4498_g354140.1 (Contig2401.g19665)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 24.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.72 21.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro47_g027610.1 (Contig1172.g11154)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro491_g153720.1 (Contig4139.g31627)
 0.0 0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro513_g157820.1 (Contig214.g2544)
 0.12 0.14 0.07 0.11 0.11 0.06 11.25 0.01 15.63 4.31 0.42 0.16 123.56 2.47 0.59 0.36 2.42 0.04 0.12 128.05 0.04 0.74 5.22 0.02 0.0 0.01 0.13
0.0 0.0 0.97 0.64 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.22 0.0 0.0 2.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.3 0.56 3.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro528_g160850.1 (Contig1695.g15199)
 0.0 0.0 0.0 1.46 0.61 0.0 0.16 0.06 0.11 0.38 0.11 0.32 4.5 0.36 0.19 0.0 0.0 0.41 0.62 4.73 0.33 0.0 0.1 0.0 0.45 0.0 0.02
Sro577_g169610.1 (Contig448.g6068)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro600_g173350.1 (Contig1881.g16394)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro698_g189210.1 (Contig480.g6491)
 0.15 0.07 0.03 0.03 0.03 0.08 0.35 0.33 0.61 0.91 0.75 0.81 6.57 1.04 0.96 0.98 0.88 0.55 0.27 7.15 0.35 0.68 0.54 0.67 1.02 0.27 0.39
Sro854_g211230.1 (Contig1879.g16385)
 0.32 16.99 13.16 7.37 5.93 0.65 2.12 3.42 3.73 6.57 6.17 3.95 17.09 5.06 5.35 4.28 5.14 15.65 9.34 59.03 2.3 4.64 0.83 7.39 6.33 5.63 2.64
Sro89_g046990.1 (Contig3846.g29620)
 0.03 0.65 0.89 0.23 0.27 0.04 0.16 0.06 0.39 0.34 0.13 0.13 3.41 0.91 0.18 0.11 0.1 0.12 0.14 4.17 0.21 0.23 0.13 0.07 0.06 0.08 0.11
Sro997_g229440.1 (Contig4588.g34266)
 0.47 0.02 0.07 0.02 0.0 0.1 2.91 0.93 6.17 2.99 0.3 1.22 40.86 2.32 0.42 0.28 0.6 0.89 1.11 56.4 0.92 1.14 2.16 0.03 0.03 0.07 0.3

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)