Heatmap: Cluster_199 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro100_g051430.1 (Contig63.g548)
0.05 1.93 0.37 0.43 0.35 0.86 1.55 1.37 1.05 2.75 3.4 1.85 0.71 2.14 2.08 1.02 4.13 2.2 1.94 1.89 3.58 0.38 1.02 2.19 2.97 3.83 2.74
Sro1041_g234520.1 (Contig1456.g13337)
0.34 0.21 0.11 0.66 0.11 0.04 0.1 1.01 0.65 0.24 0.02 0.48 0.09 0.0 0.18 0.0 0.28 0.04 0.02 0.0 0.13 0.24 0.92 0.12 0.14 1.19 0.36
Sro1139_g245480.1 (Contig125.g1424)
0.07 0.21 0.2 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.43 0.31 0.0 0.05 2.42 0.32 0.25 0.0 0.0 0.27 0.05 0.61 0.23 0.56 1.59 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro1184_g250110.1 (Contig2400.g19656)
0.65 4.47 2.61 2.28 3.56 0.91 0.62 1.39 0.87 0.89 1.01 0.92 0.58 0.0 0.45 0.6 0.4 2.73 0.25 0.33 0.42 0.25 3.25 0.03 0.07 1.08 0.3
Sro1197_g251590.1 (Contig496.g6707)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.26 0.08 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.18 0.0 0.15 0.06 0.11 0.02 0.07 0.28 0.02 0.0 0.06 0.02
Sro130_g062070.1 (Contig2611.g21130)
0.84 1.1 10.25 4.95 4.07 2.91 2.92 6.34 5.58 1.31 3.84 0.92 0.57 0.08 1.26 2.39 1.71 0.26 0.41 1.07 1.36 4.77 12.77 3.31 10.25 1.31 1.77
Sro136_g064080.1 (Contig2000.g17119)
59.04 5.24 12.75 18.73 11.76 24.75 8.62 8.7 10.07 15.27 19.06 10.18 7.51 7.88 24.61 67.03 11.04 17.08 14.2 9.94 7.67 3.07 8.79 8.3 16.3 17.85 21.58
Sro138_g064680.1 (Contig2021.g17290)
0.87 1.15 1.45 1.2 1.9 2.21 2.22 2.48 3.38 2.06 2.23 2.67 0.74 0.28 1.67 1.37 1.53 0.51 0.79 0.81 1.91 0.51 2.37 1.36 2.18 2.69 1.83
Sro141_g065950.1 (Contig65.g619)
0.0 0.0 0.22 0.59 0.35 0.2 0.24 1.31 1.16 1.2 1.89 4.32 3.07 0.13 0.32 1.18 0.1 1.23 1.27 3.66 0.63 0.73 4.68 0.21 1.12 0.85 0.42
Sro1427_g271790.1 (Contig1281.g11981)
4.67 36.46 21.19 43.11 27.98 21.15 7.19 16.77 24.94 24.52 48.31 23.06 37.93 23.14 29.8 53.53 33.08 12.97 15.27 27.84 12.75 30.14 41.22 9.74 8.12 17.99 25.9
Sro144_g067070.1 (Contig3873.g29806)
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.19 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro1567_g282970.1 (Contig3738.g28663)
0.14 0.27 0.27 0.53 0.86 18.98 3.11 4.24 3.96 12.5 28.86 9.46 5.79 8.29 14.35 13.0 22.59 11.65 14.43 10.63 2.73 3.91 4.58 3.55 1.77 19.16 19.73
Sro1583_g283940.1 (Contig2117.g17913)
0.01 0.29 0.23 0.07 0.19 1.26 0.62 2.8 1.47 2.75 3.52 4.91 5.86 0.72 1.75 1.24 1.58 1.0 1.47 11.09 0.31 2.94 4.41 1.49 1.67 2.17 2.57
Sro1583_g283950.1 (Contig2117.g17914)
0.18 0.69 0.5 0.14 0.09 5.42 3.46 8.12 4.91 5.32 5.94 7.61 7.53 1.23 4.27 3.83 4.49 2.32 2.01 13.86 2.88 4.69 4.85 2.83 7.54 4.79 4.37
Sro161_g072470.1 (Contig3982.g30588)
0.05 1.55 1.0 2.08 2.59 4.89 3.21 1.67 3.4 2.79 3.7 2.79 2.79 1.84 2.41 1.62 5.23 3.68 4.91 2.99 1.37 1.41 4.28 1.32 1.38 4.52 3.53
Sro167_g074630.1 (Contig2973.g23644)
52.81 81.73 88.88 81.47 68.79 77.14 71.95 92.57 91.58 105.39 152.73 85.55 116.64 55.75 119.81 182.3 181.1 94.39 140.02 122.47 88.94 53.45 67.76 83.09 65.37 71.43 128.53
Sro181_g078940.1 (Contig4257.g32221)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1854_g301890.1 (Contig961.g9896)
0.09 0.7 0.96 0.98 0.38 2.51 1.04 0.74 0.55 1.98 4.87 2.37 0.5 1.09 3.44 2.42 2.56 0.7 0.83 0.85 1.32 0.65 0.93 1.24 1.6 1.81 3.59
Sro192_g082410.1 (Contig482.g6507)
1.78 1.35 1.02 0.96 0.92 0.17 1.0 3.39 2.75 1.17 0.88 2.46 0.33 0.53 0.95 0.99 1.71 0.37 0.49 0.39 0.76 0.71 3.16 0.42 1.61 0.76 0.81
Sro195_g083120.1 (Contig4576.g34149)
0.44 2.36 5.27 8.22 8.14 5.08 3.05 2.3 4.25 5.82 15.98 2.69 19.07 2.22 8.72 12.09 24.19 6.09 9.2 14.49 5.95 1.73 1.25 3.0 2.92 5.08 9.14
Sro1978_g309050.1 (Contig4694.g34912)
0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.6 0.13 1.17 0.99 0.47 0.34 0.25 0.6 0.13 0.42 0.71 0.68 0.61 0.55 0.7 0.18 0.25 0.47 0.0 0.03 0.01 0.42
Sro2071_g313390.1 (Contig4578.g34173)
0.15 0.45 0.31 0.36 0.17 0.01 0.15 0.31 0.15 0.19 0.05 0.2 0.05 0.03 0.12 0.08 0.03 0.03 0.02 0.07 0.06 0.14 0.23 0.01 0.07 0.15 0.08
Sro2311_g322820.1 (Contig3301.g25896)
0.8 1.37 0.14 1.22 1.95 1.94 1.54 5.98 4.06 3.76 4.01 5.1 2.88 1.65 2.68 4.78 2.8 1.78 1.01 4.24 1.31 0.55 1.65 0.72 0.6 1.45 3.17
Sro2339_g323960.1 (Contig1767.g15632)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 1.9 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.2 0.0 0.42 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2550_g330930.1 (Contig634.g7678)
0.0 0.08 0.03 0.0 0.09 0.0 0.01 0.35 0.19 0.09 0.0 0.09 0.03 0.0 0.05 0.0 0.14 0.19 0.16 0.19 0.2 0.1 0.17 0.05 0.02 0.81 0.3
Sro2771_g336770.1 (Contig542.g6994)
0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.17 0.49 0.14 0.03 0.63 1.57 0.5 0.43 0.35 0.55 0.42 0.32 0.33 0.82 1.32 0.75 0.9 0.68 1.3 0.67 0.86 0.38
Sro2896_g339670.1 (Contig2802.g22535)
0.18 0.12 0.02 0.05 0.15 0.07 0.09 0.28 0.21 0.19 0.34 0.41 0.1 0.02 0.18 0.23 0.16 0.2 0.04 0.32 0.14 0.12 0.07 0.03 0.01 0.03 0.19
Sro2925_g340380.1 (Contig505.g6744)
0.01 0.2 0.0 0.13 0.16 0.0 0.05 0.91 0.43 0.18 0.45 0.09 0.19 0.27 0.18 0.0 0.83 0.27 0.0 0.08 0.73 0.77 1.52 0.08 0.81 0.0 0.84
Sro305_g112720.1 (Contig560.g7113)
1.44 15.73 17.45 16.33 13.8 7.61 13.44 25.82 28.87 15.96 32.8 6.39 32.32 4.2 13.18 12.17 14.97 32.5 35.31 29.1 10.53 37.68 42.13 10.74 17.4 11.94 15.45
Sro3076_g343320.1 (Contig3695.g28480)
0.02 0.32 0.38 0.21 0.13 0.1 0.13 0.3 0.44 0.44 0.69 0.24 1.14 0.1 0.28 0.48 0.4 0.37 0.16 0.91 0.37 0.09 0.69 0.0 0.06 0.04 0.38
Sro3134_g344330.1 (Contig1540.g13998)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro318_g116010.1 (Contig3475.g26945)
0.54 0.28 0.2 0.44 0.25 0.99 0.73 1.4 1.61 3.18 9.51 3.56 1.59 0.55 4.37 4.91 4.59 2.72 1.21 2.6 0.81 0.69 1.31 0.23 0.15 0.84 4.7
Sro335_g120220.1 (Contig3868.g29779)
4.27 3.67 3.6 9.88 4.74 8.3 11.55 16.1 8.48 16.92 29.96 15.48 4.93 3.72 17.14 27.95 29.95 7.13 9.79 9.29 8.9 5.61 10.37 5.99 13.33 16.9 31.55
Sro338_g120880.1 (Contig15.g125)
0.7 0.66 6.49 6.21 3.2 35.89 13.86 8.5 3.45 20.19 39.2 13.49 9.09 9.12 22.18 20.5 56.72 17.4 17.75 10.82 1.68 4.86 2.85 42.73 43.93 83.44 46.16
Sro33_g021360.1 (Contig2613.g21157)
3.34 1.09 2.51 3.81 4.57 2.1 2.51 1.88 2.25 3.4 2.57 4.07 1.35 0.69 3.5 1.25 2.13 3.91 2.2 2.59 1.9 1.26 4.75 3.94 9.2 6.42 2.36
Sro343_g122020.1 (Contig2616.g21253)
0.16 0.16 0.16 0.14 0.3 1.9 1.96 1.99 0.94 1.85 5.71 1.27 0.87 0.71 3.84 3.3 4.92 0.92 0.69 1.49 0.71 0.41 1.12 2.11 1.07 0.93 4.43
Sro34_g022020.1 (Contig4590.g34305)
0.18 2.58 4.02 3.38 4.01 18.99 5.22 25.32 14.06 16.46 40.01 9.74 5.96 3.57 19.46 21.76 46.58 13.66 8.95 6.76 2.8 20.08 12.27 3.28 3.8 17.4 33.39
Sro3600_g349540.1 (Contig450.g6086)
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro402_g135430.1 (Contig305.g4004)
0.05 0.56 0.42 1.48 1.61 0.25 0.35 1.64 0.56 0.95 1.89 0.79 0.23 0.77 1.0 0.88 0.76 0.56 0.74 0.71 0.71 0.28 0.32 0.12 0.08 0.74 1.71
Sro402_g135440.1 (Contig305.g4005)
0.0 2.36 0.96 5.46 5.78 0.35 0.63 0.86 0.51 1.57 4.5 0.68 0.19 1.55 1.8 1.83 0.13 1.19 1.2 1.21 0.9 0.12 0.41 0.19 0.08 1.17 2.85
Sro4207_g353380.1 (Contig3433.g26737)
0.08 0.34 0.08 0.35 0.28 0.03 0.13 0.04 0.03 0.15 0.08 0.22 0.02 0.04 0.17 0.08 0.21 0.04 0.0 0.01 0.08 0.01 0.07 0.0 0.03 0.0 0.22
Sro426_g140410.1 (Contig1720.g15386)
0.14 0.12 0.79 0.79 0.29 1.31 1.54 0.65 0.29 0.88 0.0 0.62 0.42 0.17 0.57 0.85 0.31 1.07 0.71 0.58 1.27 0.0 3.94 0.04 0.24 0.17 0.58
Sro43_g026140.1 (Contig2453.g20080)
31.98 12.09 21.85 28.96 23.53 15.72 16.8 18.77 25.31 28.45 38.38 43.2 54.83 20.9 26.67 32.79 45.33 30.9 35.05 48.59 33.9 11.87 20.81 16.6 30.51 17.99 21.43
Sro450_g145480.1 (Contig271.g3473)
0.0 3.19 8.66 16.61 8.05 0.0 1.61 1.33 1.82 0.51 0.2 0.06 2.44 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.17 1.52 0.0 1.15 9.53 0.0 0.16 0.05 0.01
Sro453_g146180.1 (Contig1693.g15175)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.14 0.25 0.06 0.07 0.06 0.0 0.01 0.07 0.05 0.03 0.18 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 0.74
Sro45_g026910.1 (Contig2311.g19073)
3.93 2.22 2.0 6.44 2.78 0.0 2.98 14.13 10.46 0.81 0.81 0.72 0.79 0.0 0.31 0.0 0.99 1.86 3.35 0.0 0.36 14.34 15.22 0.45 0.0 1.82 0.76
Sro477_g150840.1 (Contig553.g7063)
0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.2 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro491_g153630.1 (Contig4139.g31618)
0.28 7.28 8.55 7.74 7.24 4.16 2.65 2.81 3.08 4.18 12.53 1.78 4.62 0.9 5.51 3.38 6.77 5.99 5.56 5.89 2.41 1.78 3.3 3.13 2.72 2.65 5.49
Sro498_g154890.1 (Contig3753.g28743)
3.75 1.55 2.71 1.38 1.7 1.05 2.33 7.41 2.25 2.76 1.55 3.03 5.17 2.18 1.73 1.76 1.93 1.26 2.91 5.82 2.96 3.49 5.93 3.07 2.73 1.44 1.7
Sro504_g155900.1 (Contig4263.g32256)
83.79 55.35 86.96 109.48 93.22 35.75 56.24 63.29 77.79 65.89 85.12 75.87 129.91 63.23 70.77 65.81 69.65 63.45 74.77 98.88 73.58 46.93 59.44 52.25 69.06 46.8 56.62
Sro507_g156410.1 (Contig4452.g33443)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.23 0.32 0.5 0.35 0.6 0.04 0.06 0.33 0.57 0.18 0.03 0.0 0.19 0.47 0.0 0.69 0.12 0.12 0.36 0.53
Sro507_g156600.1 (Contig4452.g33462)
0.16 0.22 0.32 0.68 0.61 0.93 0.53 1.22 1.38 1.19 1.2 1.81 0.05 0.12 0.86 1.35 0.67 0.04 0.01 0.13 0.31 0.22 2.55 0.14 0.3 0.62 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39.61 16.2 0.0 0.0 0.0 0.0
1.14 2.65 2.76 3.63 2.81 3.3 4.7 3.84 5.14 3.86 6.74 2.68 7.99 0.96 5.29 6.95 4.11 3.83 4.95 9.39 3.74 4.98 7.64 4.75 4.13 2.91 4.42
Sro552_g165120.1 (Contig2064.g17692)
4.02 12.24 14.15 12.65 12.94 4.12 3.23 5.94 4.36 6.32 6.93 5.18 3.64 1.82 5.21 4.95 5.61 7.34 3.71 5.98 2.99 4.03 5.58 3.01 3.64 5.79 5.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro592_g172180.1 (Contig2562.g20820)
0.2 1.27 1.46 4.03 3.18 0.33 4.13 12.01 6.16 2.04 2.26 1.68 0.54 0.16 1.31 3.0 5.89 0.74 0.65 0.94 1.07 2.68 3.18 0.36 0.06 1.51 2.94
0.3 0.17 0.32 2.47 1.46 7.2 5.14 25.55 11.68 6.16 17.22 3.12 1.39 0.41 3.7 6.71 26.54 6.59 2.23 1.61 0.63 1.48 3.79 0.05 0.22 1.49 12.66
Sro5_g004360.1 (Contig4001.g30751)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.65 0.08 0.03 0.05 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.06 0.02 0.02 0.12 0.59 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro60_g034730.1 (Contig797.g8950)
0.57 3.46 2.29 9.08 8.91 12.17 4.39 4.16 1.62 13.37 20.31 6.62 3.51 2.03 23.07 44.54 18.84 11.21 7.57 5.78 5.28 1.13 4.83 4.23 4.93 14.63 28.54
Sro614_g175760.1 (Contig1589.g14430)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro631_g178500.1 (Contig3194.g25255)
0.0 0.38 0.67 0.37 0.55 0.0 0.4 0.37 0.36 0.29 0.13 0.17 1.39 0.12 0.32 0.1 0.0 0.61 1.43 1.32 0.38 0.45 1.01 0.28 1.73 0.91 0.24
Sro651_g181530.1 (Contig2568.g20857)
10.26 8.88 11.39 9.04 14.84 4.24 5.45 21.58 17.21 5.25 9.55 5.03 0.5 1.37 4.75 5.41 7.65 1.15 0.08 1.32 1.24 15.54 19.65 3.7 8.8 6.74 6.51
19.0 3.12 6.23 8.78 4.65 6.67 5.62 21.59 16.71 6.28 7.18 5.87 1.27 2.21 7.09 8.75 6.17 2.13 0.88 1.09 1.44 6.31 13.59 2.84 1.85 9.02 9.37
Sro666_g183980.1 (Contig1358.g12517)
0.9 5.69 13.78 21.48 13.7 11.83 16.9 32.72 45.65 12.79 24.3 23.43 12.81 8.87 15.76 15.58 28.54 7.88 13.08 16.09 3.22 24.26 65.26 8.15 13.76 17.85 18.23
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.61 0.0 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.29 0.46 0.0 0.0 0.12 0.04
Sro692_g188140.1 (Contig950.g9822)
1.15 0.75 3.55 1.86 2.04 2.26 1.3 2.05 2.47 1.71 5.64 1.23 8.9 0.62 3.15 2.87 4.21 2.37 2.78 4.03 1.67 0.54 3.7 0.77 1.84 1.31 2.45
Sro77_g042010.1 (Contig338.g4596)
1.18 1.79 3.47 3.15 3.26 9.05 4.93 7.45 7.16 4.42 3.64 3.42 0.16 2.37 2.07 2.11 11.42 1.2 0.44 0.87 2.19 2.61 5.01 0.77 2.38 5.13 7.3
Sro811_g205940.1 (Contig4366.g32891)
0.05 6.75 1.48 3.7 2.82 0.4 0.19 0.32 1.61 3.32 3.74 2.69 2.7 1.93 1.64 3.15 3.48 0.73 2.29 4.83 2.39 2.07 4.85 0.2 0.27 2.07 2.75
Sro853_g211130.1 (Contig4547.g33980)
0.03 0.04 0.0 0.08 0.05 0.0 0.06 0.16 0.01 0.21 0.0 0.28 0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.11 0.07 0.06 0.11 0.08 0.15 0.0 0.09 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 643.44 913.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1101.11 716.8 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro905_g218470.1 (Contig2792.g22459)
1.19 11.42 11.85 18.63 17.62 22.19 14.25 13.19 9.49 29.7 42.8 31.41 31.31 18.82 38.63 46.2 24.67 33.23 43.48 27.79 28.88 11.18 10.92 17.8 28.76 26.73 33.93

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)