Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1043_g234810.1 (Contig3084.g24572)
0.03 0.25 0.2 0.19 0.17 0.6 0.25 0.21 0.12 0.62 0.32 0.62 0.27 0.59 0.58 1.0 0.24 0.58 0.63 0.27 0.46 0.03 0.09 0.1 0.04 0.08 0.78
Sro104_g052850.1 (Contig1278.g11928)
0.02 0.06 0.03 0.04 0.04 0.5 0.22 0.23 0.09 0.54 0.33 0.43 0.08 0.38 0.54 1.0 0.23 0.58 0.44 0.08 0.19 0.01 0.05 0.09 0.03 0.04 0.91
Sro113_g056130.1 (Contig4126.g31578)
0.03 0.55 0.33 0.26 0.16 0.83 0.25 0.27 0.15 0.82 0.36 1.0 0.03 0.65 0.54 0.48 0.16 0.21 0.3 0.03 0.45 0.01 0.13 0.05 0.01 0.03 1.0
0.09 0.3 0.18 0.1 0.12 0.86 0.2 0.19 0.11 0.8 0.28 0.69 0.05 0.76 0.55 0.57 0.12 0.27 0.45 0.06 0.53 0.0 0.09 0.05 0.0 0.02 1.0
Sro1222_g253770.1 (Contig1750.g15569)
0.06 0.18 0.14 0.07 0.06 0.46 0.25 0.19 0.09 0.62 0.46 0.61 0.16 0.49 0.59 1.0 0.29 0.67 0.63 0.11 0.32 0.02 0.08 0.08 0.02 0.04 0.94
Sro12_g009480.1 (Contig2293.g18968)
0.17 0.25 0.13 0.16 0.29 0.54 0.3 0.31 0.16 0.56 0.37 0.4 0.11 0.23 0.55 1.0 0.24 0.71 0.58 0.12 0.21 0.02 0.09 0.09 0.1 0.1 0.9
Sro1387_g268380.1 (Contig2235.g18584)
0.05 0.35 0.12 0.18 0.24 0.36 0.26 0.31 0.13 0.5 0.3 0.58 0.13 0.45 0.47 1.0 0.4 0.64 0.42 0.16 0.29 0.03 0.17 0.06 0.0 0.05 0.67
Sro140_g065630.1 (Contig1537.g13979)
0.03 0.2 0.1 0.15 0.25 0.47 0.25 0.23 0.16 0.53 0.27 0.48 0.07 0.43 0.6 1.0 0.2 0.46 0.41 0.1 0.23 0.02 0.11 0.09 0.06 0.03 0.77
Sro15_g010970.1 (Contig791.g8823)
0.16 0.1 0.05 0.05 0.1 0.38 0.23 0.24 0.12 0.54 0.26 0.56 0.04 0.49 0.57 1.0 0.19 0.76 0.52 0.07 0.25 0.02 0.09 0.04 0.02 0.05 0.72
Sro16_g011450.1 (Contig916.g9582)
0.03 0.81 0.31 0.3 0.45 0.84 0.59 0.4 0.21 0.87 0.57 0.88 0.31 0.76 0.64 0.85 0.34 0.52 0.6 0.35 0.48 0.09 0.17 0.28 0.28 0.23 1.0
Sro16_g011520.1 (Contig916.g9589)
0.1 0.2 0.14 0.14 0.13 0.45 0.57 0.36 0.11 0.74 0.44 0.61 0.17 0.51 0.66 1.0 0.39 0.51 0.63 0.26 0.8 0.03 0.14 0.23 0.43 0.2 0.83
Sro1712_g292920.1 (Contig3889.g29867)
0.19 0.2 0.15 0.11 0.18 0.43 0.26 0.3 0.14 0.49 0.21 0.48 0.05 0.44 0.53 1.0 0.16 0.81 0.7 0.04 0.22 0.01 0.12 0.03 0.01 0.02 0.62
Sro1807_g298970.1 (Contig4747.g35175)
0.24 0.37 0.26 0.17 0.14 0.61 0.4 0.38 0.2 0.76 0.45 0.87 0.2 0.61 0.65 0.82 0.27 0.65 0.66 0.29 0.42 0.04 0.15 0.16 0.03 0.06 1.0
Sro185_g080270.1 (Contig1228.g11502)
0.1 0.33 0.26 0.12 0.17 0.54 0.57 0.41 0.25 0.83 0.27 0.81 0.13 0.67 0.68 0.95 0.13 0.84 0.87 0.14 0.81 0.08 0.18 0.12 0.28 0.07 1.0
Sro1_g000430.1 (Contig3007.g23958)
0.11 0.38 0.17 0.27 0.36 0.68 0.28 0.33 0.19 0.73 0.49 0.6 0.5 0.83 0.66 0.82 0.37 0.52 0.44 0.22 0.27 0.03 0.14 0.11 0.07 0.12 1.0
Sro2013_g310980.1 (Contig2748.g22128)
0.16 0.24 0.17 0.1 0.15 0.54 0.31 0.34 0.2 0.63 0.32 0.66 0.09 0.54 0.7 1.0 0.23 0.87 0.83 0.15 0.27 0.03 0.15 0.1 0.11 0.11 0.82
Sro212_g088210.1 (Contig3756.g28804)
0.05 0.19 0.14 0.21 0.28 0.68 0.36 0.35 0.22 0.71 0.44 0.6 0.22 0.54 0.6 0.77 0.29 0.78 0.74 0.28 0.38 0.06 0.15 0.13 0.08 0.09 1.0
0.16 0.61 0.37 0.16 0.31 0.2 0.34 0.24 0.17 0.46 0.29 0.43 0.05 0.33 0.48 1.0 0.31 0.78 0.49 0.08 0.25 0.02 0.1 0.06 0.01 0.03 0.49
Sro259_g101330.1 (Contig240.g2923)
0.08 0.24 0.1 0.19 0.3 0.55 0.35 0.4 0.21 0.56 0.29 0.52 0.04 0.47 0.61 1.0 0.22 0.71 0.52 0.04 0.21 0.01 0.17 0.05 0.01 0.02 0.82
Sro314_g115050.1 (Contig2448.g20031)
0.12 0.22 0.17 0.17 0.18 0.51 0.21 0.24 0.13 0.66 0.48 0.62 0.19 0.78 0.61 0.78 0.28 0.53 0.51 0.3 0.34 0.01 0.1 0.1 0.03 0.06 1.0
Sro316_g115580.1 (Contig2414.g19764)
0.01 0.37 0.34 0.23 0.19 0.53 0.31 0.28 0.12 0.74 0.4 0.84 0.12 0.58 0.63 1.0 0.2 0.48 0.71 0.23 0.4 0.01 0.14 0.13 0.04 0.07 0.91
Sro345_g122420.1 (Contig2266.g18801)
0.03 0.52 0.51 0.29 0.4 0.51 0.38 0.3 0.16 0.62 0.32 0.71 0.14 0.41 0.65 1.0 0.29 0.86 0.85 0.15 0.28 0.03 0.1 0.17 0.06 0.04 0.79
Sro345_g122430.1 (Contig2266.g18802)
0.05 0.41 0.41 0.32 0.34 0.73 0.4 0.28 0.17 0.79 0.37 0.92 0.15 0.59 0.69 0.89 0.21 0.68 0.74 0.18 0.62 0.03 0.12 0.23 0.11 0.05 1.0
Sro345_g122460.1 (Contig2266.g18805)
0.04 0.37 0.21 0.22 0.22 0.47 0.29 0.27 0.11 0.57 0.26 0.49 0.17 0.56 0.58 1.0 0.21 0.43 0.42 0.18 0.52 0.08 0.12 0.1 0.06 0.1 0.66
0.02 0.44 0.29 0.48 0.52 0.47 0.38 0.31 0.13 0.54 0.38 0.4 0.05 0.25 0.66 0.96 0.25 0.71 0.48 0.07 0.16 0.02 0.12 0.1 0.0 0.02 1.0
Sro388_g132390.1 (Contig4393.g33013)
0.01 0.38 0.4 0.29 0.23 0.53 0.22 0.25 0.1 0.58 0.33 0.62 0.07 0.34 0.58 1.0 0.19 0.57 0.76 0.09 0.23 0.01 0.11 0.02 0.0 0.03 0.84
Sro437_g142910.1 (Contig994.g10057)
0.06 0.59 0.51 0.39 0.44 0.51 0.29 0.27 0.14 0.61 0.33 0.57 0.19 0.53 0.64 1.0 0.27 0.63 0.7 0.12 0.27 0.03 0.13 0.13 0.1 0.07 0.85
Sro465_g148660.1 (Contig3955.g30311)
0.07 0.25 0.15 0.21 0.36 0.52 0.27 0.28 0.13 0.47 0.23 0.38 0.03 0.29 0.54 1.0 0.25 0.53 0.34 0.04 0.23 0.01 0.12 0.06 0.0 0.02 0.78
Sro502_g155560.1 (Contig2629.g21322)
0.03 0.37 0.18 0.19 0.12 0.7 0.32 0.26 0.13 0.82 0.41 0.81 0.1 0.81 0.69 0.93 0.3 0.54 0.53 0.11 0.5 0.01 0.1 0.1 0.03 0.07 1.0
Sro506_g156310.1 (Contig3494.g27108)
0.0 0.67 0.36 0.41 0.41 0.62 0.33 0.34 0.18 0.74 0.28 0.7 0.1 0.44 0.64 0.89 0.07 0.61 0.7 0.16 0.1 0.01 0.16 0.05 0.0 0.03 1.0
Sro52_g031000.1 (Contig3190.g25183)
0.03 0.32 0.12 0.23 0.23 0.43 0.37 0.29 0.15 0.6 0.39 0.58 0.2 0.74 0.53 1.0 0.34 0.54 0.48 0.25 0.39 0.11 0.13 0.18 0.21 0.21 0.62
Sro52_g031010.1 (Contig3190.g25184)
0.03 0.16 0.11 0.1 0.11 0.4 0.2 0.17 0.11 0.53 0.29 0.52 0.13 0.48 0.49 1.0 0.24 0.49 0.42 0.12 0.36 0.04 0.07 0.07 0.06 0.09 0.64
Sro539_g162840.1 (Contig837.g9229)
0.04 0.29 0.17 0.2 0.25 0.62 0.29 0.31 0.16 0.66 0.38 0.54 0.09 0.43 0.61 0.94 0.27 0.63 0.48 0.11 0.23 0.01 0.1 0.07 0.01 0.03 1.0
Sro542_g163330.1 (Contig390.g5302)
0.05 0.37 0.13 0.2 0.25 0.41 0.25 0.25 0.12 0.53 0.34 0.47 0.35 0.59 0.54 1.0 0.29 0.39 0.31 0.18 0.38 0.04 0.11 0.09 0.07 0.1 0.66
Sro613_g175600.1 (Contig1327.g12250)
0.09 0.51 0.36 0.25 0.38 0.82 0.26 0.28 0.2 0.71 0.36 0.56 0.09 0.47 0.68 0.95 0.41 0.68 0.76 0.13 0.28 0.04 0.11 0.08 0.03 0.04 1.0
Sro637_g179360.1 (Contig2599.g21057)
0.12 0.83 0.47 0.52 0.55 0.53 0.46 0.39 0.19 0.64 0.31 0.55 0.16 0.41 0.62 1.0 0.3 0.69 0.74 0.16 0.32 0.03 0.13 0.19 0.04 0.08 0.84
Sro680_g186240.1 (Contig3657.g28238)
0.02 0.82 0.38 0.37 0.3 0.73 0.53 0.5 0.2 0.88 0.47 0.93 0.13 0.58 0.51 0.49 0.2 0.37 0.5 0.14 0.39 0.03 0.14 0.06 0.0 0.03 1.0
Sro720_g192670.1 (Contig2421.g19828)
0.29 0.2 0.11 0.13 0.22 0.53 0.43 0.37 0.17 0.61 0.33 0.49 0.06 0.5 0.62 1.0 0.24 0.8 0.55 0.09 0.28 0.05 0.15 0.05 0.03 0.04 0.82
Sro781_g201630.1 (Contig678.g7946)
0.02 0.18 0.09 0.19 0.16 0.51 0.26 0.24 0.1 0.59 0.2 0.48 0.05 0.43 0.69 1.0 0.23 0.3 0.33 0.13 0.55 0.06 0.14 0.13 0.23 0.07 0.74
Sro834_g208690.1 (Contig2061.g17671)
0.09 0.32 0.21 0.19 0.25 0.53 0.3 0.3 0.14 0.56 0.31 0.47 0.08 0.42 0.61 1.0 0.25 0.82 0.85 0.08 0.33 0.01 0.11 0.11 0.04 0.03 0.8
Sro834_g208700.1 (Contig2061.g17672)
0.08 0.43 0.25 0.25 0.37 0.56 0.37 0.42 0.22 0.6 0.37 0.48 0.07 0.42 0.65 1.0 0.25 0.72 0.71 0.07 0.33 0.02 0.15 0.1 0.04 0.03 0.87
Sro840_g209390.1 (Contig1129.g10837)
0.05 0.1 0.07 0.13 0.21 0.54 0.37 0.35 0.17 0.62 0.31 0.49 0.13 0.4 0.68 1.0 0.35 0.51 0.36 0.18 0.35 0.02 0.11 0.14 0.07 0.05 0.8
Sro89_g047060.1 (Contig3846.g29627)
0.12 0.44 0.17 0.27 0.35 0.64 0.3 0.31 0.19 0.74 0.48 0.67 0.87 0.9 0.73 0.9 0.35 0.6 0.55 0.39 0.34 0.08 0.15 0.13 0.06 0.13 1.0
Sro906_g218660.1 (Contig1704.g15265)
0.01 0.32 0.25 0.25 0.27 0.5 0.18 0.24 0.13 0.49 0.28 0.42 0.17 0.31 0.52 1.0 0.24 0.57 0.59 0.38 0.28 0.02 0.08 0.05 0.0 0.02 0.75
Sro91_g047810.1 (Contig190.g2232)
0.02 0.28 0.19 0.25 0.23 0.52 0.39 0.29 0.11 0.65 0.38 0.59 0.09 0.47 0.64 1.0 0.27 0.5 0.51 0.12 0.43 0.02 0.12 0.14 0.05 0.04 0.9
Sro936_g222140.1 (Contig2485.g20361)
0.02 0.57 0.27 0.26 0.27 0.61 0.38 0.3 0.11 0.79 0.44 0.86 0.05 0.92 0.62 0.67 0.41 0.17 0.27 0.09 0.45 0.0 0.14 0.16 0.05 0.11 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)