Heatmap: Cluster_228 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1033_g233680.1 (Contig1396.g12842)	0.01	1.0	0.84	0.73	0.58	0.13	0.09	0.11	0.02	0.38	0.25	0.17	0.1	0.1	0.12	0.39	0.89	0.19	0.43	0.17	0.23	0.08	0.02	0.14	0.07	0.65	0.62
Sro1134_g244990.1 (Contig4360.g32857)	0.0	0.77	0.59	0.58	0.47	0.04	0.09	0.02	0.01	0.43	0.72	0.36	0.1	0.06	0.14	0.36	0.19	0.03	1.0	0.25	0.5	0.02	0.0	0.11	0.14	0.05	0.6
Sro113_g055990.1 (Contig4126.g31564)	0.02	0.44	0.32	0.45	0.43	0.71	0.63	0.37	0.16	0.78	0.7	0.94	0.11	0.36	0.55	0.58	0.69	0.35	0.45	0.39	0.7	0.18	0.17	1.0	0.98	0.81	0.9
Sro1143_g245970.1 (Contig934.g9723)	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.06	0.02	0.0	0.43	0.3	0.29	0.01	0.0	0.15	0.3	1.0	0.01	0.73	0.5	0.68	0.02	0.01	0.02	0.17	0.06	0.56
Sro1163_g247980.1 (Contig264.g3284)	0.0	0.12	0.08	0.06	0.11	0.17	0.47	0.23	0.21	0.52	1.0	0.36	0.55	0.27	0.82	0.86	0.77	0.31	0.34	0.76	0.43	0.1	0.03	0.58	0.75	0.69	0.94
Sro1189_g250700.1 (Contig972.g9927)	0.01	0.65	0.75	0.79	0.56	0.21	0.04	0.04	0.08	0.57	0.97	0.79	0.3	0.26	0.34	0.7	0.28	0.26	1.0	0.41	0.5	0.13	0.18	0.09	0.23	0.13	0.79
Sro1200_g251910.1 (Contig430.g5835)	0.0	1.0	0.73	0.52	0.52	0.32	0.39	0.34	0.16	0.35	0.61	0.2	0.03	0.07	0.32	0.34	0.75	0.35	0.84	0.25	0.2	0.17	0.12	0.82	0.7	0.65	0.6
Sro1390_g268620.1 (Contig2158.g18118)	0.04	0.27	0.25	0.28	0.25	0.3	0.61	0.25	0.24	0.51	0.86	0.61	0.14	0.26	0.69	1.0	0.56	0.2	0.27	0.42	0.35	0.09	0.12	0.59	0.82	0.46	0.55
Sro1413_g270600.1 (Contig3287.g25836)	0.0	0.22	0.13	0.33	0.22	0.05	0.13	0.06	0.0	0.31	0.69	0.22	0.01	0.09	0.28	0.43	1.0	0.03	0.35	0.14	0.19	0.06	0.02	0.35	0.58	0.37	0.52
Sro149_g068540.1 (Contig259.g3222)	0.01	0.26	0.14	0.22	0.2	0.42	0.11	0.07	0.02	0.5	0.41	0.35	0.39	0.23	0.19	0.33	1.0	0.41	0.87	0.74	0.43	0.09	0.06	0.22	0.25	0.29	0.66
Sro15_g011320.1 (Contig791.g8858)	0.03	0.49	0.35	0.34	0.46	0.92	0.4	0.23	0.07	0.73	0.59	0.7	0.08	0.6	0.56	0.57	0.74	0.35	0.67	0.2	0.49	0.14	0.13	0.51	0.19	0.39	1.0
Sro1842_g301080.1 (Contig2247.g18623)	0.02	0.87	0.6	0.51	0.57	0.66	0.5	0.38	0.19	0.75	0.57	0.95	0.06	0.25	0.43	0.47	0.76	0.52	0.69	0.31	0.92	0.21	0.19	0.59	0.7	0.84	1.0
Sro1943_g306800.1 (Contig3086.g24592)	0.01	0.43	0.34	0.42	0.46	0.29	0.27	0.21	0.06	0.52	0.65	0.46	0.11	0.33	0.31	0.43	1.0	0.35	0.72	0.4	0.34	0.1	0.07	0.51	0.34	0.4	0.69
Sro2019_g311330.1 (Contig3048.g24250)	0.04	0.7	0.55	0.78	0.65	0.23	0.34	0.43	0.19	0.65	0.46	0.67	0.07	0.63	0.47	1.0	0.62	0.62	0.83	0.35	0.54	0.14	0.2	0.32	0.37	0.56	0.81
Sro207_g086730.1 (Contig755.g8576)	0.08	0.43	0.19	0.17	0.14	0.6	0.21	0.13	0.04	0.65	0.69	0.85	0.02	0.22	0.3	0.09	1.0	0.05	0.69	0.29	0.49	0.02	0.04	0.12	0.2	0.26	0.95
Sro2121_g315440.1 (Contig4568.g34121)	0.03	0.27	0.21	0.33	0.26	0.17	0.31	0.22	0.12	0.56	0.77	0.62	0.14	0.33	0.38	0.48	0.73	0.13	0.39	0.49	0.44	0.07	0.09	0.67	1.0	0.51	0.6
Sro2197_g318660.1 (Contig1089.g10537)	0.01	0.79	0.86	1.0	0.95	0.46	0.26	0.2	0.11	0.48	0.59	0.37	0.05	0.1	0.25	0.29	0.74	0.31	0.61	0.15	0.32	0.09	0.09	0.28	0.15	0.38	0.82
Sro2197_g318660.2	0.0	1.0	0.55	0.77	0.78	0.14	0.29	0.13	0.11	0.19	0.28	0.18	0.0	0.07	0.12	0.15	0.26	0.11	0.14	0.08	0.11	0.22	0.06	0.36	0.12	0.13	0.29
Sro251_g099210.1 (Contig687.g8001)	0.0	0.17	0.12	0.13	0.11	0.27	0.29	0.2	0.22	0.45	0.3	0.36	0.06	0.14	0.22	0.4	0.44	0.4	0.63	0.32	0.66	0.14	0.09	0.58	1.0	0.55	0.51
Sro260_g101520.1 (Contig1663.g15004)	0.0	0.17	0.17	0.07	0.17	0.0	0.01	0.03	0.03	0.41	0.64	0.25	0.01	0.03	0.12	0.52	1.0	0.09	0.65	0.25	0.13	0.03	0.02	0.01	0.01	0.16	0.71
Sro260_g101650.1 (Contig1663.g15017)	0.0	0.06	0.13	0.14	0.16	0.21	0.35	0.16	0.12	0.38	0.92	0.45	0.26	0.45	0.46	0.47	0.62	0.19	0.31	0.26	0.39	0.03	0.04	0.76	1.0	0.52	0.64
Sro2678_g334430.1 (Contig3626.g28037)	0.0	0.19	0.09	0.35	0.29	0.15	0.46	0.26	0.32	0.52	0.79	0.49	0.62	0.62	0.56	0.49	1.0	0.43	0.52	0.68	0.36	0.08	0.09	0.91	0.64	0.49	0.68
Sro26_g017870.1 (Contig2432.g19958)	0.02	0.28	0.42	0.27	0.2	0.14	0.57	0.32	0.06	0.55	1.0	0.43	0.27	0.04	0.46	0.65	0.79	0.77	0.51	0.61	0.68	0.02	0.05	0.73	0.41	0.26	0.75
Sro3104_g343830.1 (Contig2425.g19839)	0.0	0.59	0.48	0.85	0.71	0.61	0.24	0.2	0.04	0.64	0.58	0.68	0.03	0.28	0.36	0.37	0.67	0.15	0.28	0.17	0.4	0.01	0.03	0.54	0.48	0.76	1.0
Sro3104_g343840.1 (Contig2425.g19840)	0.02	1.0	0.57	0.63	0.63	0.71	0.57	0.32	0.11	0.74	0.48	0.83	0.05	0.3	0.39	0.19	0.63	0.18	0.48	0.2	0.68	0.3	0.2	0.75	0.81	0.86	0.91
Sro3112_g343970.1 (Contig1992.g17055)	0.01	0.18	0.12	0.08	0.09	0.18	0.5	0.34	0.14	0.46	0.92	0.41	0.25	0.38	0.64	0.65	0.56	0.64	0.37	0.36	0.49	0.01	0.12	0.85	1.0	0.61	0.72
Sro315_g115240.1 (Contig447.g6047)	0.04	0.44	0.41	0.38	0.49	0.05	0.19	0.17	0.05	0.66	0.38	0.73	0.2	0.66	0.19	0.5	0.64	0.49	0.87	0.59	0.64	0.03	0.06	0.41	0.57	1.0	0.62
Sro323_g117180.1 (Contig364.g4899)	0.02	0.52	0.45	0.34	0.39	0.38	0.58	0.28	0.14	0.43	0.46	0.69	0.06	0.24	0.22	0.23	0.17	0.14	0.33	0.12	0.45	0.32	0.25	0.56	1.0	0.74	0.46
Sro323_g117190.1 (Contig364.g4900)	0.01	1.0	0.59	0.77	0.78	0.58	0.48	0.32	0.15	0.6	0.58	0.62	0.04	0.24	0.4	0.35	0.6	0.3	0.56	0.24	0.44	0.2	0.15	0.72	0.6	0.92	0.95
Sro353_g124670.1 (Contig1923.g16601)	0.0	0.04	0.08	0.07	0.05	0.21	0.12	0.24	0.04	0.59	0.83	0.64	0.03	0.26	0.26	0.53	1.0	0.17	0.6	0.34	0.53	0.04	0.0	0.31	0.27	0.36	0.74
Sro357_g125510.1 (Contig708.g8179)	0.02	0.18	0.05	0.16	0.32	0.07	0.07	0.1	0.03	0.57	0.33	0.61	0.02	1.0	0.33	0.85	0.49	0.27	0.63	0.26	0.53	0.21	0.07	0.1	0.05	0.55	0.54
Sro361_g126530.1 (Contig1094.g10578)	0.02	0.67	0.45	0.5	0.49	0.03	0.13	0.1	0.04	0.56	0.66	0.56	0.01	0.3	0.25	0.77	0.85	0.13	1.0	0.26	0.4	0.13	0.08	0.24	0.24	0.36	0.72
Sro366_g127670.1 (Contig1993.g17076)	0.03	0.24	0.02	0.08	0.23	0.07	0.27	0.15	0.08	0.71	0.8	0.83	0.3	0.49	0.34	0.53	0.51	0.42	0.71	0.88	1.0	0.11	0.09	0.4	0.82	0.34	0.97
Sro402_g135490.1 (Contig305.g4010)	0.4	0.36	0.23	0.43	0.45	0.02	0.04	0.09	0.01	0.64	0.62	0.89	0.02	0.23	0.24	0.57	0.55	0.02	0.64	0.49	0.76	0.03	0.04	0.44	1.0	0.22	0.82
Sro453_g146000.1 (Contig1693.g15157)	0.03	0.55	0.38	0.44	0.51	0.32	0.13	0.07	0.02	0.66	0.9	1.0	0.01	0.25	0.36	0.27	0.71	0.1	0.74	0.19	0.75	0.05	0.04	0.16	0.12	0.17	1.0
Sro48_g028160.1 (Contig1255.g11711)	0.01	0.26	0.16	0.28	0.36	0.33	0.36	0.32	0.26	0.65	0.76	0.76	0.18	0.51	0.58	1.0	0.89	0.44	0.54	0.36	0.93	0.42	0.21	0.5	0.71	0.63	0.78
Sro62_g035460.1 (Contig2718.g21927)	0.0	1.0	0.74	0.56	0.5	0.05	0.13	0.19	0.06	0.5	0.43	0.46	0.05	0.3	0.32	0.57	0.25	0.16	0.51	0.3	0.48	0.08	0.09	0.17	0.22	0.21	0.42
Sro641_g180040.1 (Contig1098.g10648)	0.01	0.16	0.09	0.12	0.1	0.39	0.4	0.37	0.13	0.75	0.61	0.77	0.11	0.37	0.59	0.59	0.92	0.26	0.35	0.38	0.78	0.21	0.06	0.77	1.0	0.8	0.76
Sro654_g182030.1 (Contig1277.g11893)	0.03	0.23	0.08	0.19	0.32	0.29	0.2	0.1	0.04	0.59	0.45	0.64	0.03	1.0	0.4	0.53	0.75	0.27	0.79	0.22	0.6	0.15	0.14	0.25	0.09	0.77	0.7
Sro661_g183130.1 (Contig401.g5413)	0.06	0.18	0.06	0.17	0.28	0.76	0.34	0.22	0.05	0.72	0.39	0.78	0.25	1.0	0.45	0.44	0.72	0.34	0.92	0.33	0.56	0.32	0.14	0.39	0.07	0.51	0.91
Sro661_g183210.1 (Contig401.g5421)	0.02	0.38	0.34	0.29	0.18	0.31	0.37	0.29	0.06	0.39	0.53	0.41	0.05	0.04	0.18	0.29	1.0	0.32	0.2	0.07	0.44	0.02	0.06	0.56	0.5	0.31	0.51
Sro675_g185490.1 (Contig1040.g10287)	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.0	0.43	0.44	0.29	0.01	0.12	0.06	0.07	1.0	0.02	0.95	0.39	0.46	0.11	0.02	0.03	0.12	0.18	0.59
Sro678_g185990.1 (Contig2726.g21984)	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.09	0.05	0.03	0.03	0.47	0.83	0.36	0.16	0.09	0.17	0.24	1.0	0.21	0.83	0.29	0.37	0.16	0.05	0.05	0.05	0.37	0.83
Sro714_g191690.1 (Contig596.g7422)	0.02	0.94	0.6	0.42	0.31	0.32	0.25	0.22	0.05	0.42	0.57	0.2	0.04	0.16	0.21	0.68	1.0	0.24	0.78	0.22	0.22	0.04	0.04	0.62	0.24	0.22	0.7
Sro726_g193420.1 (Contig3737.g28646)	0.0	0.11	0.06	0.08	0.11	0.02	0.01	0.03	0.02	0.39	0.93	0.39	0.02	0.06	0.12	0.23	1.0	0.04	0.73	0.3	0.23	0.11	0.02	0.01	0.02	0.11	0.65
Sro73_g040210.1 (Contig3929.g30122)	0.02	0.42	0.19	0.21	0.25	0.51	0.17	0.13	0.02	0.49	0.4	0.5	0.05	0.51	0.37	0.21	1.0	0.3	0.82	0.27	0.25	0.27	0.07	0.32	0.2	0.31	0.52
Sro750_g197010.1 (Contig993.g10036)	0.01	0.77	0.57	0.66	0.56	0.66	0.49	0.42	0.17	0.62	0.79	0.53	0.09	0.38	0.46	0.54	1.0	0.34	0.77	0.32	0.51	0.24	0.24	0.58	0.51	0.59	0.96
Sro847_g210360.1 (Contig4605.g34381)	0.14	1.0	0.68	0.56	0.71	0.45	0.48	0.24	0.08	0.66	0.45	0.81	0.1	0.33	0.34	0.39	0.66	0.18	0.36	0.2	0.55	0.41	0.14	0.69	0.41	0.42	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)