Heatmap: Cluster_115 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000158.116 (tig00000158_g10218.t1)	0.69	0.68	0.61	0.65	0.54	0.54	0.97	0.93	0.77	0.8	0.74	0.74	0.65	0.67	0.53	0.66	0.9	0.68	1.0	0.63	0.67	0.8	0.8	0.55	0.84	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000158.117 (tig00000158_g10218.t1)	0.53	0.53	0.45	0.49	0.43	0.27	0.78	0.73	0.52	0.7	0.6	0.53	0.44	0.61	0.47	0.55	0.84	0.8	0.94	0.54	0.89	1.0	0.93	0.65	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000158.118 (tig00000158_g10218.t1)	0.43	0.34	0.3	0.29	0.24	0.2	0.43	0.52	0.3	0.38	0.39	0.34	0.3	0.43	0.29	0.37	0.56	0.49	0.57	0.34	0.62	1.0	0.56	0.52	0.76	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000158.119 (tig00000158_g10218.t1)	0.12	0.09	0.11	0.03	0.14	0.08	0.09	0.18	0.08	0.06	0.19	0.09	0.16	0.18	0.09	0.07	0.16	0.17	0.11	0.15	0.31	1.0	0.13	0.04	0.51	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000158.120 (tig00000158_g10218.t1)	0.23	0.25	0.28	0.21	0.19	0.15	0.23	0.32	0.18	0.31	0.24	0.24	0.17	0.3	0.33	0.29	0.45	0.36	0.45	0.31	0.5	1.0	0.66	0.3	0.81	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000158.121 (tig00000158_g10218.t1)	0.31	0.31	0.34	0.19	0.17	0.16	0.4	0.38	0.24	0.27	0.32	0.23	0.17	0.38	0.31	0.4	0.42	0.38	0.43	0.24	0.82	0.79	0.92	0.21	1.0	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000158.123 (tig00000158_g10218.t1)	0.2	0.27	0.27	0.14	0.1	0.08	0.24	0.22	0.18	0.13	0.29	0.26	0.23	0.26	0.38	0.35	0.46	0.42	0.25	0.22	0.33	1.0	0.41	0.15	0.73	0.17
Cpa\|evm.model.tig00000158.130 (tig00000158_g10218.t1)	0.22	0.16	0.15	0.14	0.12	0.12	0.17	0.19	0.12	0.16	0.18	0.23	0.12	0.31	0.27	0.32	0.33	0.19	0.22	0.21	0.47	0.79	0.36	0.26	1.0	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000189.35 (tig00000189_g14335.t1)	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000190.48 (tig00000190_g13867.t1)	0.24	0.46	0.59	0.55	0.38	0.15	0.36	0.45	0.43	0.51	0.59	0.43	0.35	0.71	0.55	0.92	0.52	0.92	0.69	0.58	0.08	0.46	1.0	0.33	0.42	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000203.21 (tig00000203_g17126.t1)	0.1	0.0	0.12	0.11	0.13	0.2	0.06	0.03	0.06	0.22	0.08	0.09	0.0	0.23	0.05	0.06	0.06	0.52	0.37	0.12	1.0	0.31	0.43	0.26	0.6	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000219.54 (tig00000219_g19493.t1)	0.52	0.71	0.47	0.53	0.57	0.36	0.65	0.7	0.48	0.81	0.73	0.59	0.46	0.63	0.5	0.62	0.37	0.62	0.52	0.39	0.29	0.79	1.0	0.8	0.73	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000219.55 (tig00000219_g19493.t1)	0.61	0.85	0.59	0.62	0.62	0.38	0.69	0.77	0.5	0.82	0.81	0.65	0.51	0.94	0.64	0.89	0.58	0.92	0.73	0.51	0.31	0.73	1.0	0.68	0.72	0.74
Cpa\|evm.model.tig00000219.56	0.32	0.38	0.46	0.45	0.3	0.29	0.35	0.51	0.33	0.52	0.72	0.35	0.36	0.68	0.58	0.67	0.42	0.82	0.56	0.47	0.3	0.77	1.0	0.39	0.67	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000431.12 (tig00000431_g675.t1)	0.14	0.08	0.08	0.08	0.12	0.08	0.07	0.11	0.07	0.13	0.11	0.08	0.06	0.27	0.17	0.28	0.13	0.28	0.17	0.07	0.44	1.0	0.56	0.23	0.39	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000431.13 (tig00000431_g676.t1)	0.15	0.06	0.15	0.13	0.12	0.1	0.05	0.1	0.09	0.15	0.17	0.09	0.06	0.29	0.14	0.43	0.06	0.23	0.19	0.09	0.38	1.0	0.46	0.23	0.36	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000431.14 (tig00000431_g676.t1)	0.24	0.14	0.09	0.08	0.13	0.17	0.23	0.13	0.06	0.3	0.23	0.08	0.04	0.33	0.31	0.34	0.15	0.44	0.32	0.1	0.79	1.0	0.77	0.21	0.41	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000431.15 (tig00000431_g677.t1)	0.49	0.39	0.42	0.55	0.53	0.36	0.53	0.53	0.39	0.52	0.49	0.43	0.4	0.75	0.46	0.71	0.35	0.45	0.43	0.3	0.49	1.0	0.64	0.33	0.52	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000431.25 (tig00000431_g689.t1)	0.16	0.26	0.2	0.22	0.2	0.19	0.28	0.24	0.12	0.21	0.17	0.13	0.11	0.23	0.13	0.3	0.24	0.25	0.22	0.12	0.07	1.0	0.31	0.09	0.4	0.16
Cpa\|evm.model.tig00000431.26 (tig00000431_g689.t1)	0.36	0.28	0.25	0.25	0.3	0.26	0.32	0.3	0.2	0.24	0.2	0.21	0.16	0.43	0.27	0.45	0.28	0.3	0.37	0.21	0.16	1.0	0.45	0.16	0.41	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000431.27 (tig00000431_g689.t1)	0.15	0.1	0.15	0.1	0.1	0.09	0.09	0.14	0.06	0.08	0.07	0.06	0.05	0.22	0.07	0.21	0.15	0.15	0.11	0.06	0.07	1.0	0.25	0.09	0.44	0.18
Cpa\|evm.model.tig00000431.28 (tig00000431_g690.t1)	0.16	0.12	0.14	0.07	0.11	0.09	0.15	0.12	0.09	0.12	0.09	0.13	0.04	0.23	0.18	0.33	0.2	0.26	0.29	0.08	0.19	1.0	0.25	0.17	0.27	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000431.29 (tig00000431_g694.t1)	0.3	0.27	0.25	0.21	0.32	0.21	0.23	0.22	0.18	0.22	0.19	0.19	0.12	0.5	0.37	0.56	0.42	0.49	0.46	0.26	0.17	1.0	0.45	0.18	0.61	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000470.4 (tig00000431_g689.t1)	0.17	0.0	0.06	0.2	0.28	0.06	0.2	0.06	0.13	0.06	0.0	0.14	0.0	0.23	0.22	0.37	0.14	0.33	0.18	0.16	0.08	1.0	0.41	0.1	0.55	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000480.16 (tig00000480_g1300.t1)	0.3	0.29	0.36	0.33	0.34	0.31	0.44	0.42	0.24	0.33	0.31	0.31	0.21	0.82	0.58	0.75	0.59	0.63	0.47	0.58	0.82	0.85	1.0	0.31	0.61	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000480.17 (tig00000480_g1301.t1)	0.29	0.32	0.35	0.34	0.32	0.32	0.43	0.37	0.26	0.37	0.25	0.27	0.17	0.76	0.57	0.65	0.51	0.51	0.46	0.51	0.79	0.96	1.0	0.37	0.71	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000480.18 (tig00000480_g1301.t1)	0.37	0.36	0.43	0.38	0.43	0.42	0.54	0.42	0.32	0.41	0.32	0.35	0.22	0.79	0.64	0.67	0.58	0.55	0.55	0.56	0.83	0.96	1.0	0.31	0.77	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000480.19 (tig00000480_g1300.t1)	0.3	0.33	0.4	0.36	0.36	0.31	0.47	0.37	0.25	0.39	0.26	0.26	0.2	0.79	0.67	0.7	0.61	0.54	0.5	0.59	0.87	1.0	0.94	0.3	0.91	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000480.20 (tig00000480_g1301.t1)	0.29	0.3	0.33	0.31	0.31	0.3	0.46	0.32	0.25	0.32	0.28	0.26	0.18	0.7	0.53	0.57	0.54	0.38	0.43	0.51	0.69	0.79	1.0	0.42	0.72	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000480.21 (tig00000480_g1301.t1)	0.22	0.23	0.26	0.26	0.28	0.29	0.38	0.28	0.25	0.27	0.2	0.23	0.16	0.52	0.41	0.43	0.35	0.37	0.33	0.37	0.72	1.0	0.82	0.27	0.68	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000480.22 (tig00000480_g1301.t1)	0.29	0.25	0.34	0.36	0.34	0.29	0.46	0.34	0.27	0.36	0.29	0.3	0.18	0.76	0.54	0.62	0.55	0.43	0.47	0.57	0.8	0.65	1.0	0.38	0.74	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000480.23 (tig00000480_g1300.t1)	0.28	0.32	0.34	0.35	0.41	0.32	0.49	0.4	0.27	0.37	0.32	0.28	0.17	0.8	0.62	0.69	0.62	0.58	0.53	0.57	0.73	0.79	1.0	0.31	0.67	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000480.24 (tig00000480_g1301.t1)	0.22	0.21	0.27	0.26	0.27	0.24	0.34	0.27	0.2	0.26	0.2	0.19	0.14	0.51	0.41	0.48	0.37	0.37	0.34	0.36	0.78	0.98	1.0	0.52	0.69	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000480.26 (tig00000480_g1301.t1)	0.21	0.24	0.28	0.28	0.28	0.26	0.36	0.27	0.22	0.31	0.21	0.23	0.15	0.55	0.41	0.48	0.46	0.36	0.41	0.42	0.72	0.83	1.0	0.47	0.55	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000480.28 (tig00000480_g1301.t1)	0.28	0.31	0.33	0.35	0.34	0.28	0.46	0.37	0.27	0.36	0.31	0.27	0.2	0.59	0.45	0.53	0.42	0.44	0.42	0.43	0.73	0.83	1.0	0.41	0.67	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000480.29 (tig00000480_g1301.t1)	0.31	0.34	0.39	0.4	0.42	0.3	0.56	0.43	0.32	0.46	0.37	0.33	0.22	0.7	0.55	0.66	0.53	0.51	0.57	0.53	0.73	0.85	1.0	0.43	0.66	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000480.30 (tig00000480_g1301.t1)	0.3	0.33	0.38	0.41	0.39	0.29	0.59	0.4	0.33	0.48	0.4	0.34	0.22	0.61	0.48	0.61	0.48	0.52	0.55	0.5	0.75	0.83	1.0	0.48	0.66	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000498.22 (tig00000498_g1599.t1)	0.33	0.21	0.13	0.1	0.08	0.04	0.1	0.1	0.09	0.06	0.1	0.12	0.36	0.15	0.13	0.29	0.1	0.25	0.13	0.11	0.06	1.0	0.2	0.1	0.26	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000691.22 (tig00000691_g3174.t1)	0.22	0.19	0.17	0.18	0.2	0.14	0.25	0.25	0.23	0.19	0.3	0.31	0.15	0.3	0.25	0.36	0.32	0.4	0.31	0.24	0.06	0.7	1.0	0.31	0.54	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000691.23 (tig00000691_g3174.t1)	0.41	0.29	0.22	0.15	0.18	0.1	0.15	0.25	0.17	0.34	0.43	0.47	0.19	0.53	0.32	0.55	0.53	0.48	0.45	0.25	0.06	0.84	1.0	0.35	0.51	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001030.34 (tig00001030_g6473.t1)	0.39	0.21	0.37	0.46	0.61	0.5	0.6	0.61	0.54	0.58	0.85	0.54	0.35	0.74	0.3	0.74	0.44	0.64	0.47	0.28	0.23	1.0	0.78	0.37	0.36	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001095.28 (tig00001095_g7045.t1)	0.79	0.7	0.05	0.19	0.45	0.48	0.4	0.45	0.52	0.49	1.0	0.75	0.39	0.04	0.13	0.05	0.05	0.59	0.21	0.11	0.63	0.04	0.0	0.2	0.55	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001333.1 (tig00001333_g8180.t1)	0.47	0.36	0.28	0.23	0.22	0.15	0.27	0.32	0.24	0.33	0.31	0.31	0.23	0.49	0.43	0.54	0.7	0.65	0.6	0.42	1.0	0.63	0.79	0.34	0.71	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001333.10 (tig00001333_g8184.t1)	0.39	0.37	0.27	0.28	0.23	0.21	0.27	0.4	0.35	0.34	0.44	0.38	0.23	0.31	0.23	0.37	0.44	0.39	0.5	0.27	1.0	0.42	0.43	0.25	0.45	0.29
Cpa\|evm.model.tig00001333.11 (tig00001333_g8187.t1)	0.48	0.43	0.35	0.32	0.24	0.2	0.41	0.38	0.35	0.38	0.36	0.37	0.3	0.38	0.35	0.44	0.53	0.39	0.48	0.36	0.89	0.68	1.0	0.49	0.77	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001333.12 (tig00001333_g8185.t1)	0.5	0.5	0.42	0.4	0.26	0.19	0.41	0.4	0.41	0.49	0.44	0.46	0.34	0.41	0.34	0.41	0.45	0.52	0.6	0.32	1.0	0.82	0.72	0.31	0.91	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001333.13 (tig00001333_g8187.t1)	1.0	0.94	0.85	0.67	0.45	0.2	0.63	0.82	0.9	0.81	0.94	0.87	0.49	0.35	0.49	0.79	0.73	0.81	0.52	0.55	0.84	0.34	0.34	0.2	0.58	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001333.17 (tig00001333_g8187.t1)	1.0	0.98	0.82	0.77	0.68	0.57	0.97	0.9	0.85	0.95	0.83	0.9	0.78	0.67	0.64	0.76	0.89	0.67	0.95	0.72	0.78	0.54	0.76	0.41	0.65	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001333.2 (tig00001333_g8185.t1)	0.54	0.42	0.32	0.29	0.19	0.18	0.31	0.35	0.28	0.37	0.31	0.36	0.24	0.47	0.49	0.62	0.72	0.63	0.68	0.47	1.0	0.58	0.82	0.33	0.73	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001333.3 (tig00001333_g8183.t1)	0.81	0.56	0.42	0.25	0.34	0.17	0.54	0.53	0.31	0.51	0.48	0.4	0.29	0.54	0.25	0.59	0.65	0.79	0.77	0.48	1.0	0.43	0.61	0.17	0.61	0.27
Cpa\|evm.model.tig00001333.7 (tig00001333_g8185.t1)	0.31	0.34	0.29	0.21	0.16	0.13	0.29	0.29	0.26	0.33	0.3	0.26	0.15	0.32	0.24	0.36	0.39	0.41	0.41	0.29	1.0	0.47	0.79	0.54	0.73	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001333.9 (tig00001333_g8187.t1)	0.57	0.41	0.43	0.37	0.22	0.19	0.45	0.46	0.4	0.4	0.38	0.36	0.33	0.45	0.46	0.6	0.67	0.63	0.57	0.44	1.0	0.79	0.93	0.6	0.81	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020553.241 (tig00020796_g13714.t1)	0.85	0.82	0.72	0.65	0.87	0.66	1.0	0.75	0.73	1.0	0.77	0.79	0.57	0.97	0.78	0.97	0.71	0.61	0.69	0.67	0.56	0.58	0.55	0.61	0.46	0.84
Cpa\|evm.model.tig00020801.32 (tig00020801_g13915.t1)	0.12	0.14	0.17	0.23	0.3	0.23	0.37	0.4	0.37	0.34	0.3	0.23	0.13	0.49	0.31	0.6	0.33	0.48	0.37	0.33	0.09	1.0	0.32	0.26	0.62	0.21
Cpa\|evm.model.tig00020816.108 (tig00020816_g14194.t1)	0.57	0.35	0.37	0.33	0.43	0.28	0.39	0.51	0.27	0.55	0.62	0.52	0.49	0.78	0.44	0.87	0.64	0.6	0.43	0.41	0.35	1.0	0.96	0.48	0.65	0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)