1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_326 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
0.17 1.53 0.96 0.13 1.27 0.38 0.7 0.33 1.65 9.35 9.23 9.25 0.58 6.07 3.66 9.48 3.49 1.83 9.23 4.2 10.53 2.57 2.66 1.9 4.6 7.65 8.38
Sro1074_g238330.1 (Contig4290.g32417)
 1.17 11.07 8.78 8.73 10.28 1.1 5.4 5.09 8.37 12.2 12.56 13.92 1.92 4.31 7.75 19.18 6.99 4.7 17.74 13.88 13.33 11.12 9.55 4.0 6.14 7.02 13.13
Sro1133_g244820.1 (Contig2145.g18044)
 0.13 4.57 4.9 7.7 5.53 3.62 2.81 2.69 7.47 8.38 9.54 11.25 9.08 7.2 6.21 6.83 14.94 5.7 7.35 10.8 7.1 4.67 6.33 3.21 5.26 7.1 8.15
Sro1133_g244850.1 (Contig2145.g18047)
 0.02 1.02 2.06 0.66 0.34 2.41 2.3 0.92 5.81 3.51 1.07 3.03 3.3 1.34 1.51 0.56 1.9 2.39 6.05 8.79 5.5 2.81 3.08 3.41 4.34 7.48 2.62
Sro1153_g247070.1 (Contig4473.g33622)
 0.06 1.53 9.1 2.27 1.62 0.75 0.73 0.95 3.27 4.68 2.62 5.56 11.15 5.26 2.92 6.33 3.49 3.07 6.33 11.39 8.78 2.86 4.04 1.17 1.09 3.01 2.84
Sro1195_g251420.1 (Contig4057.g31108)
 0.66 3.36 3.24 2.94 2.42 2.13 3.72 2.3 2.83 6.03 5.27 8.25 4.69 5.77 3.24 3.44 3.32 1.76 6.5 8.23 6.99 4.88 4.63 6.15 2.78 4.15 5.16
Sro128_g061170.1 (Contig1654.g14893)
 0.1 2.82 2.39 2.69 1.7 1.85 2.22 1.29 2.57 5.4 5.02 6.4 7.3 5.26 3.4 3.25 4.86 2.99 5.05 8.79 6.4 3.08 2.84 1.57 1.95 1.54 5.05
Sro1308_g261490.1 (Contig2858.g22925)
 4.48 6.38 5.79 8.83 4.46 13.88 8.12 6.38 5.77 20.04 15.2 26.11 14.23 21.52 15.02 13.78 15.3 13.37 15.59 20.02 26.55 9.66 7.44 21.23 22.34 23.7 15.87
Sro1406_g269900.1 (Contig4418.g33198)
 0.05 1.26 1.65 2.49 1.84 1.47 1.44 0.95 5.56 5.51 2.42 5.81 1.31 4.4 1.74 1.69 1.31 1.57 6.8 7.45 7.69 6.25 5.27 1.81 3.32 5.67 3.14
Sro157_g071300.1 (Contig2362.g19420)
 0.58 1.03 1.47 1.18 0.74 1.76 1.58 2.45 2.37 5.98 5.64 7.74 5.93 2.97 4.0 4.58 4.62 3.55 7.81 12.0 7.02 2.67 3.21 2.31 3.49 4.58 4.12
Sro162_g072830.1 (Contig2670.g21619)
 0.11 1.39 2.36 2.49 0.96 0.75 1.98 2.91 1.95 4.01 3.36 5.18 4.71 3.27 3.1 3.6 2.92 1.69 4.11 5.99 5.46 1.97 0.95 2.84 3.77 3.47 4.55
Sro165_g073890.1 (Contig381.g5130)
 0.22 1.35 1.63 3.23 2.56 8.31 8.1 5.77 5.34 19.87 22.78 30.49 18.76 19.09 16.25 26.27 19.84 20.21 31.85 26.82 28.99 6.6 7.44 12.03 14.7 18.04 15.27
Sro1669_g289940.1 (Contig3699.g28498)
 1.92 13.43 13.2 11.12 10.35 6.79 4.65 6.37 10.01 14.62 14.15 15.31 11.97 11.74 8.31 6.41 11.01 11.5 19.4 16.81 17.16 8.56 10.77 7.15 9.83 14.89 14.67
Sro167_g074420.1 (Contig2973.g23623)
 0.33 10.43 12.78 13.98 8.54 9.79 7.51 3.48 8.58 14.97 17.95 14.58 14.15 19.53 13.71 6.7 13.58 11.53 16.34 20.26 21.73 8.34 10.32 9.34 8.03 10.47 12.77
Sro174_g076660.1 (Contig4298.g32450)
 0.31 3.41 4.66 4.64 3.77 6.02 6.41 9.12 10.92 10.27 13.7 10.85 6.36 5.52 7.02 9.12 7.22 4.03 9.73 11.55 11.27 6.47 8.16 7.74 5.07 9.02 11.91
Sro1934_g306290.1 (Contig3443.g26781)
 0.18 2.28 10.96 2.42 0.89 0.67 0.93 1.61 3.84 5.29 3.75 5.4 14.53 2.53 3.55 6.79 5.42 2.64 5.68 13.67 11.76 3.52 5.35 1.89 4.9 2.46 3.8
Sro1943_g306810.1 (Contig3086.g24593)
 0.07 4.93 3.68 5.45 4.35 3.79 2.08 0.67 6.03 8.31 8.05 13.9 4.07 5.34 5.35 4.36 6.42 5.27 11.44 11.31 8.91 5.84 6.18 1.81 2.07 4.78 6.44
Sro19_g013640.1 (Contig446.g6028)
 7.44 5.19 3.88 7.76 6.79 6.54 7.07 5.72 6.79 13.12 12.65 16.39 8.52 9.02 10.7 11.36 8.1 7.38 10.64 14.24 15.83 4.68 5.87 9.83 12.24 9.37 10.62
0.24 3.24 4.74 5.03 4.01 2.3 2.53 1.34 1.78 11.84 10.52 14.46 5.68 12.88 7.56 10.41 9.43 7.59 14.05 15.78 14.66 2.05 3.18 4.27 2.68 8.38 10.04
Sro2032_g311880.1 (Contig3520.g27237)
 1.0 8.66 10.49 1.46 2.38 0.78 0.58 0.62 10.9 6.02 0.99 3.98 2.3 1.66 1.69 0.98 3.28 3.77 11.96 20.95 12.33 8.05 5.97 1.37 1.3 1.66 1.17
Sro2375_g325360.1 (Contig4596.g34340)
 0.76 12.49 13.3 6.2 5.84 5.6 9.21 12.33 17.37 14.2 17.22 17.33 6.99 14.13 12.23 14.53 12.78 7.48 14.17 16.33 17.19 19.11 16.49 12.06 6.7 14.22 19.12
Sro2446_g327970.1 (Contig1070.g10428)
 0.05 3.02 3.18 3.62 2.92 3.98 3.45 2.11 4.0 8.02 6.66 10.51 5.89 8.49 5.13 6.12 4.5 4.49 8.15 11.34 7.52 3.55 5.71 2.24 2.87 4.08 7.7
Sro2715_g335350.1 (Contig1935.g16654)
 1.02 17.14 21.76 25.79 18.35 9.98 6.45 5.73 13.99 19.87 26.35 21.5 19.97 11.48 13.89 5.81 23.77 23.32 38.2 43.41 25.17 10.54 16.29 8.83 9.6 13.94 14.29
Sro2848_g338500.1 (Contig3603.g27857)
 0.05 1.97 2.69 3.52 2.34 4.1 3.29 2.39 3.65 7.62 12.87 8.16 7.91 5.39 7.33 6.43 8.42 5.42 8.29 13.5 7.83 2.21 5.02 4.65 2.87 4.72 9.24
Sro2876_g339150.1 (Contig4123.g31551)
 1.23 28.24 31.17 28.5 29.28 23.56 22.07 26.48 35.57 36.31 35.07 42.77 29.98 25.52 33.32 44.24 36.48 46.03 50.8 38.79 41.16 33.03 37.04 19.26 31.42 27.25 32.01
Sro28_g018920.1 (Contig404.g5501)
 0.93 3.8 9.7 4.76 2.69 1.25 4.18 3.76 8.54 13.61 18.46 15.41 6.47 7.38 5.64 10.5 18.53 4.74 12.56 15.76 29.58 11.42 7.27 7.16 5.65 10.35 14.71
Sro3084_g343380.1 (Contig4306.g32491)
 0.12 0.69 0.55 0.3 0.55 1.46 0.0 0.08 3.65 2.34 0.17 2.82 0.64 0.87 0.25 0.17 0.17 0.4 3.26 4.22 3.56 1.45 3.17 0.47 0.66 2.28 1.25
Sro311_g114280.1 (Contig909.g9543)
 6.13 17.08 14.02 15.0 12.97 22.11 20.34 14.78 21.41 46.38 50.26 55.38 50.12 52.24 41.22 44.0 34.83 42.99 53.74 69.9 49.85 25.66 19.79 28.88 23.78 37.49 46.5
Sro31_g020530.1 (Contig420.g5648)
 0.06 1.25 2.24 1.01 0.82 1.08 1.16 1.14 1.84 3.09 3.42 4.49 1.5 3.1 2.66 2.73 3.9 1.59 2.93 3.97 4.36 1.64 1.71 1.94 1.0 2.12 2.74
Sro336_g120390.1 (Contig4022.g30928)
 13.02 53.26 58.9 40.68 36.32 43.22 65.93 51.14 58.9 107.14 88.0 129.04 134.5 114.69 88.58 108.36 90.75 88.23 129.22 146.9 107.89 63.32 62.19 46.08 55.53 76.28 92.02
Sro337_g120720.1 (Contig2800.g22530)
 3.01 12.01 9.55 7.33 8.25 10.12 9.93 9.31 13.16 20.19 17.8 23.19 20.4 13.88 17.15 24.92 11.08 15.78 30.15 33.89 22.62 10.53 13.08 11.1 14.88 13.21 20.37
Sro355_g125110.1 (Contig2977.g23669)
 0.08 1.92 11.25 2.38 0.83 0.84 2.35 1.65 6.72 7.0 4.19 6.04 22.89 2.42 2.97 3.96 5.54 4.7 7.24 29.48 8.9 4.09 7.55 3.17 3.68 5.67 5.13
Sro399_g134960.1 (Contig279.g3623)
 3.6 22.2 22.52 17.59 16.56 14.13 8.8 8.64 17.14 18.32 21.41 20.42 11.87 9.08 15.21 13.59 18.48 22.52 20.31 21.76 17.86 13.3 15.92 11.46 8.64 16.32 16.45
Sro42_g025610.1 (Contig312.g4138)
 0.3 10.42 6.94 10.16 7.76 8.56 8.22 6.5 6.88 13.66 14.56 18.44 12.44 6.75 11.28 13.78 8.54 9.0 14.28 15.75 17.41 6.81 5.96 9.63 11.85 11.17 14.18
Sro450_g145590.1 (Contig271.g3484)
 0.94 3.07 2.52 2.97 2.79 5.97 7.1 6.28 4.38 15.5 15.8 21.33 24.4 13.88 13.93 16.17 14.8 16.03 13.37 24.92 22.02 5.2 4.38 11.11 9.78 14.24 11.99
Sro452_g145930.1 (Contig1249.g11672)
 0.08 4.03 3.05 3.16 4.07 4.52 2.31 1.19 7.72 7.31 5.99 8.77 3.89 2.27 4.17 5.11 3.9 1.49 7.78 11.59 6.42 3.75 5.22 2.18 3.34 4.7 6.55
Sro4581_g354270.1 (Contig3121.g24803)
 0.56 0.77 0.58 0.44 0.7 5.81 3.51 1.66 1.81 10.23 3.98 16.03 2.1 13.28 5.25 7.02 5.79 2.92 12.29 15.23 12.12 2.21 2.54 4.3 4.36 8.36 8.62
Sro463_g148160.1 (Contig3968.g30425)
 1.94 17.02 23.62 35.16 28.7 15.68 6.84 11.23 18.34 27.28 34.82 41.75 4.97 6.39 14.67 12.03 26.92 13.81 21.13 13.72 17.41 11.45 22.01 14.86 17.05 28.88 31.47
Sro472_g149850.1 (Contig4323.g32600)
 0.02 0.73 1.37 1.65 1.51 0.4 0.55 0.34 1.71 1.42 0.19 1.29 0.34 0.35 0.3 0.1 0.12 0.22 2.42 1.84 2.57 1.06 1.48 1.54 2.24 2.37 1.02
Sro518_g158840.1 (Contig3565.g27539)
 5.03 3.19 3.05 9.58 3.68 1.66 2.72 2.56 2.06 8.85 6.98 10.76 5.43 4.85 4.93 6.81 4.31 6.26 6.52 9.51 9.86 2.36 1.65 3.95 6.15 4.14 6.3
Sro557_g166170.1 (Contig1427.g13187)
 2.11 3.89 4.36 3.9 3.25 6.62 5.58 5.13 6.98 13.44 14.27 16.23 11.21 8.09 8.52 8.88 7.18 10.96 18.66 19.64 19.15 7.96 5.99 7.05 5.35 8.62 13.81
Sro61_g035080.1 (Contig3112.g24761)
 0.07 1.7 1.58 1.27 1.44 0.49 0.3 1.05 0.64 2.26 2.64 2.84 0.74 0.82 0.84 1.06 0.62 0.73 4.08 3.1 2.52 1.09 1.98 0.64 0.36 2.14 2.31
Sro61_g035090.1 (Contig3112.g24762)
 0.09 0.98 0.84 1.38 1.17 0.15 0.14 0.5 3.61 2.73 2.92 2.79 2.96 0.57 0.49 0.06 0.28 0.01 7.44 5.2 3.44 1.68 4.4 0.35 1.27 2.34 1.77
Sro642_g180200.1 (Contig442.g5938)
 0.0 1.3 1.69 0.78 0.87 0.13 0.51 0.3 2.42 1.58 0.99 1.8 1.95 1.76 0.98 1.29 0.85 1.27 3.57 5.08 1.74 1.37 1.81 0.99 1.69 1.37 1.05
Sro669_g184500.1 (Contig2091.g17822)
 0.08 4.33 9.44 7.24 6.25 4.94 3.84 2.3 7.84 8.41 6.12 11.59 4.76 5.52 5.99 7.31 6.97 5.03 6.21 9.31 8.56 3.84 7.88 4.45 5.76 6.98 6.09
Sro691_g187950.1 (Contig1133.g10890)
 0.23 11.73 14.46 12.76 9.74 1.95 2.37 2.16 12.72 11.77 8.6 14.98 9.17 8.07 6.6 10.86 9.35 5.04 9.16 21.8 13.68 6.89 9.03 2.99 6.05 6.59 8.3
Sro731_g194350.1 (Contig3971.g30495)
 0.1 0.07 0.14 0.03 0.03 1.86 1.48 0.91 1.8 4.25 4.51 5.19 2.71 1.91 2.97 3.91 2.54 1.28 3.32 5.39 4.3 0.94 1.08 1.53 1.3 1.46 3.71
Sro744_g196290.1 (Contig393.g5328)
 0.0 0.06 1.25 0.34 0.0 0.1 0.58 0.07 0.03 1.58 1.63 2.27 0.67 2.0 1.53 1.98 2.81 0.47 0.41 1.26 3.07 0.05 0.03 1.28 1.94 0.88 1.36
Sro757_g197880.1 (Contig322.g4277)
 0.03 4.49 4.11 2.87 2.75 1.66 2.4 1.84 3.08 4.04 4.44 3.72 3.18 2.51 2.31 1.74 1.31 1.47 5.59 5.53 4.12 1.45 2.9 3.52 3.03 3.69 4.3
Sro793_g203240.1 (Contig534.g6932)
 0.29 2.14 1.84 3.09 3.62 6.86 2.86 2.21 2.89 10.91 14.34 12.91 6.61 9.55 8.43 9.03 10.68 10.83 20.03 13.71 15.64 5.83 5.97 4.71 5.9 9.74 11.38
Sro84_g045050.1 (Contig220.g2638)
 0.16 2.72 4.16 3.15 4.38 1.59 3.32 1.65 3.06 8.47 5.41 12.08 1.58 9.41 6.24 10.63 4.49 1.67 8.16 8.0 11.0 1.8 2.64 5.64 7.9 3.63 7.71
Sro859_g211970.1 (Contig1286.g12004)
 1.81 3.31 5.44 2.31 2.37 0.93 2.65 2.73 4.91 4.84 5.18 6.7 6.73 3.77 3.83 3.05 3.87 2.67 5.03 8.55 6.02 2.73 4.99 3.66 4.97 3.04 3.23
Sro865_g212840.1 (Contig3005.g23907)
 2.33 4.79 5.16 10.63 4.25 3.38 4.53 2.62 3.96 9.36 9.1 10.9 7.29 7.1 6.47 8.28 5.97 6.71 9.39 12.94 9.37 5.4 5.29 7.21 4.15 9.51 7.35
Sro91_g047750.1 (Contig190.g2226)
 0.12 0.1 0.1 0.09 0.13 0.29 0.89 0.22 0.8 5.53 6.81 5.76 2.11 2.21 2.88 1.65 3.85 2.4 6.52 13.71 5.7 0.91 0.68 1.05 2.49 1.55 6.05
Sro933_g221750.1 (Contig254.g3129)
 0.26 4.76 7.81 6.77 6.6 5.57 4.14 3.3 4.57 8.57 10.53 10.61 5.24 3.0 6.71 7.21 5.99 4.51 9.41 12.12 8.39 5.29 7.13 5.73 8.18 8.06 9.45
Sro93_g048420.1 (Contig3841.g29530)
 0.08 0.0 0.06 0.11 0.14 1.14 0.71 1.14 3.29 2.13 0.92 1.9 9.1 0.35 1.38 4.82 0.4 2.33 4.35 7.64 2.59 0.88 1.6 0.65 1.03 1.19 1.74
Sro983_g227840.1 (Contig79.g823)
 0.3 0.68 0.94 0.72 0.61 1.2 1.1 2.33 2.37 3.69 3.44 4.43 2.06 3.39 2.12 2.88 2.63 3.91 6.73 4.79 7.37 2.91 2.1 2.18 2.64 2.78 2.68
Sro992_g228770.1 (Contig4505.g33780)
 0.14 0.64 1.23 0.47 0.43 0.14 0.79 0.09 0.31 3.58 2.67 4.22 0.67 5.25 1.32 2.77 0.87 0.59 2.89 4.56 5.14 2.19 1.4 1.35 0.21 1.45 2.4
Sro992_g228780.1 (Contig4505.g33781)
 0.12 2.15 5.55 0.89 1.02 1.42 0.78 0.96 5.69 5.37 3.23 5.92 1.79 7.52 2.44 4.24 3.85 1.11 4.51 7.63 6.83 5.52 4.23 1.46 2.07 2.55 4.36
Sro9_g007650.1 (Contig4120.g31533)
 0.03 0.17 0.38 0.1 0.23 0.76 1.03 0.73 1.54 2.92 3.98 3.3 5.9 2.93 2.6 4.74 3.61 2.21 5.41 4.03 4.08 0.67 1.89 0.7 3.71 3.0 3.71

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)