Heatmap: Cluster_134 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1119_g243230.1 (Contig1053.g10361)
0.03 0.35 0.93 0.91 0.6 0.08 0.4 0.62 1.0 0.04 0.08 0.01 0.05 0.0 0.07 0.1 0.08 0.2 0.08 0.07 0.0 0.71 0.29 0.03 0.01 0.06 0.05
Sro1120_g243320.1 (Contig896.g9502)
0.01 0.35 0.58 0.4 0.46 0.06 0.55 0.78 1.0 0.05 0.04 0.01 0.01 0.01 0.12 0.13 0.16 0.32 0.05 0.02 0.06 0.75 0.55 0.0 0.01 0.06 0.06
Sro1249_g255970.1 (Contig2393.g19610)
0.0 0.59 1.0 0.09 0.27 0.01 0.23 0.16 0.59 0.08 0.17 0.0 0.02 0.01 0.21 0.31 0.05 0.01 0.06 0.0 0.05 0.83 0.4 0.01 0.0 0.02 0.04
Sro1249_g255980.1 (Contig2393.g19611)
0.0 0.58 0.89 0.34 0.27 0.1 0.49 0.2 1.0 0.13 0.26 0.02 0.15 0.19 0.62 0.33 0.12 0.17 0.11 0.03 0.04 0.95 0.74 0.02 0.02 0.04 0.21
Sro132_g062440.1 (Contig2745.g22087)
0.06 0.53 1.0 0.71 0.59 0.35 0.69 0.69 0.97 0.24 0.54 0.12 0.25 0.16 0.35 0.47 0.85 0.8 0.49 0.21 0.18 0.62 0.56 0.27 0.32 0.38 0.39
0.0 0.28 0.35 0.72 0.63 0.06 0.69 0.73 1.0 0.07 0.09 0.05 0.06 0.07 0.11 0.07 0.16 0.25 0.15 0.04 0.04 0.45 0.44 0.03 0.07 0.15 0.11
Sro1644_g288170.1 (Contig3810.g29186)
0.55 0.35 0.82 1.0 0.67 0.24 0.69 0.57 0.67 0.43 0.57 0.48 0.61 0.27 0.44 0.51 0.48 0.59 0.32 0.49 0.51 0.28 0.52 0.55 0.81 0.45 0.39
Sro1698_g291980.1 (Contig1874.g16370)
0.1 0.17 0.45 0.66 0.41 0.6 0.61 0.99 0.79 0.38 0.93 0.3 0.72 0.19 0.68 0.95 1.0 0.76 0.34 0.53 0.36 0.26 0.36 0.51 0.72 0.45 0.57
Sro183_g079550.1 (Contig3056.g24300)
0.53 0.05 0.13 0.21 0.21 0.05 0.37 0.6 0.47 0.11 0.43 0.03 0.17 0.04 0.24 0.25 0.31 1.0 0.14 0.15 0.1 0.2 0.19 0.38 0.42 0.33 0.38
Sro183_g079560.1 (Contig3056.g24301)
0.0 0.09 0.24 0.16 0.07 0.08 0.08 0.42 0.21 0.13 0.38 0.01 0.15 0.0 0.24 0.49 0.6 1.0 0.3 0.19 0.12 0.53 0.08 0.05 0.08 0.23 0.37
Sro1841_g300970.1 (Contig764.g8669)
0.4 0.12 0.23 0.31 0.33 0.23 0.21 0.45 0.41 0.21 0.3 0.14 0.26 0.11 0.24 0.29 0.32 1.0 0.29 0.36 0.13 0.68 0.19 0.09 0.13 0.29 0.23
Sro192_g082530.1 (Contig482.g6519)
0.02 0.3 0.41 0.29 0.7 0.09 0.55 0.13 1.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.01 0.13 0.77 0.03 0.03 0.0 0.01
Sro197_g083930.1 (Contig3509.g27198)
0.0 0.14 0.13 0.08 0.08 0.01 0.36 0.17 1.0 0.08 0.01 0.01 0.54 0.19 0.06 0.06 0.05 0.58 0.55 0.31 0.01 0.16 0.66 0.01 0.01 0.0 0.03
Sro19_g013470.1 (Contig446.g6011)
0.21 0.52 0.89 0.81 0.83 0.36 0.77 0.63 0.97 0.43 0.67 0.31 0.3 0.18 0.55 1.0 1.0 0.7 0.46 0.44 0.31 0.55 0.31 0.23 0.24 0.48 0.54
0.0 0.41 1.0 0.43 0.37 0.42 0.4 0.38 0.49 0.21 0.31 0.15 0.26 0.3 0.39 0.08 0.31 0.93 0.35 0.21 0.29 0.89 0.53 0.47 0.25 0.32 0.16
Sro2059_g312900.1 (Contig3244.g25639)
0.39 0.37 0.63 0.59 0.57 0.12 0.61 0.64 1.0 0.22 0.24 0.18 0.25 0.14 0.32 0.34 0.27 0.13 0.17 0.25 0.19 0.74 0.57 0.23 0.29 0.28 0.21
Sro206_g086550.1 (Contig4750.g35192)
0.0 0.1 0.16 0.07 0.09 0.21 0.42 0.3 0.46 0.19 0.15 0.12 0.58 0.42 0.36 0.11 0.27 1.0 0.79 0.49 0.14 0.62 0.58 0.13 0.03 0.12 0.23
Sro2095_g314230.1 (Contig4570.g34135)
0.03 0.33 0.36 0.31 0.15 0.08 0.25 0.59 0.61 0.45 0.5 0.44 1.0 0.16 0.32 0.34 0.31 0.87 0.77 0.95 0.59 0.76 0.21 0.73 0.42 0.25 0.31
Sro2105_g314750.1 (Contig855.g9385)
0.0 0.04 0.05 0.07 0.08 0.02 0.29 0.28 1.0 0.07 0.01 0.07 0.1 0.03 0.02 0.03 0.0 0.18 0.01 0.1 0.04 0.2 0.46 0.0 0.0 0.01 0.02
Sro2284_g321890.1 (Contig2109.g17901)
0.13 0.22 0.48 0.82 0.45 0.35 0.55 1.0 0.89 0.26 0.72 0.26 0.18 0.06 0.4 0.52 0.48 0.99 0.65 0.21 0.19 0.33 0.62 0.77 0.9 0.67 0.42
Sro2348_g324340.1 (Contig4585.g34258)
0.07 0.58 0.74 0.82 1.0 0.01 0.51 0.2 0.17 0.54 0.32 0.59 0.0 0.18 0.27 0.09 0.21 0.0 0.0 0.01 0.28 0.07 0.13 0.27 0.77 0.19 0.56
Sro23_g015620.1 (Contig2259.g18712)
0.0 0.33 0.81 0.28 0.32 0.04 0.31 0.39 1.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.03 0.05 0.02 0.01 0.24 0.15 0.02 0.03 0.77 0.61 0.01 0.02 0.06 0.03
Sro2419_g327090.1 (Contig1625.g14667)
0.0 0.26 0.19 0.26 0.2 0.0 0.31 0.38 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.89 0.5 0.08 0.07 0.08 0.02
Sro2419_g327100.1 (Contig1625.g14668)
0.0 0.13 0.3 0.09 0.09 0.0 0.26 0.56 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.91 0.48 0.05 0.18 0.14 0.01
Sro2441_g327760.1 (Contig4619.g34461)
0.0 0.14 0.26 0.2 0.14 0.15 0.29 0.39 0.33 0.23 0.3 0.06 0.15 0.13 0.4 0.54 0.43 0.76 0.44 0.24 0.44 1.0 0.48 0.14 0.14 0.12 0.49
Sro244_g097110.1 (Contig2788.g22427)
0.19 0.38 1.0 0.89 0.6 0.27 0.32 0.58 0.57 0.27 0.37 0.28 0.18 0.07 0.25 0.39 0.3 0.49 0.32 0.27 0.2 0.22 0.25 0.43 0.69 0.31 0.31
Sro244_g097120.1 (Contig2788.g22428)
0.05 0.42 0.74 0.52 0.36 0.13 0.41 0.62 0.37 0.44 0.54 0.34 0.69 0.36 0.42 0.59 0.46 1.0 0.78 0.97 0.54 0.63 0.23 0.41 0.55 0.3 0.43
Sro244_g097130.1 (Contig2788.g22429)
0.02 0.18 0.41 0.46 0.33 0.14 0.33 0.37 0.49 0.21 0.49 0.12 0.25 0.06 0.31 0.5 0.38 1.0 0.49 0.33 0.15 0.43 0.19 0.28 0.5 0.41 0.38
Sro2500_g329430.1 (Contig545.g7034)
0.0 0.25 0.98 0.66 0.64 0.04 0.52 0.68 1.0 0.08 0.04 0.02 0.02 0.01 0.16 0.11 0.07 0.43 0.1 0.02 0.08 0.44 0.44 0.03 0.03 0.06 0.15
Sro2558_g331230.1 (Contig4411.g33114)
0.0 0.29 0.19 0.22 0.23 0.15 0.49 0.5 1.0 0.09 0.1 0.04 0.02 0.03 0.17 0.16 0.15 0.43 0.15 0.02 0.1 0.42 0.54 0.02 0.04 0.09 0.12
0.0 0.26 0.54 0.36 0.13 0.05 0.43 0.22 0.51 0.18 0.19 0.12 1.0 0.0 0.2 0.33 0.0 0.57 0.39 0.97 0.04 0.25 0.45 0.0 0.25 0.05 0.09
Sro2751_g336220.1 (Contig970.g9917)
0.52 0.29 0.89 0.46 0.19 0.35 0.42 0.71 0.64 0.36 0.74 0.29 0.63 0.07 0.45 0.54 0.69 1.0 0.45 0.66 0.37 0.15 0.4 0.55 0.72 0.69 0.58
Sro2940_g340670.1 (Contig1872.g16361)
0.0 0.07 0.12 0.15 0.11 0.15 0.18 0.16 0.25 0.15 0.2 0.02 0.34 0.07 0.24 0.3 0.34 1.0 0.47 0.31 0.24 0.48 0.32 0.13 0.16 0.15 0.3
Sro3039_g342620.1 (Contig1480.g13512)
0.32 0.94 0.97 0.95 0.84 0.11 0.49 0.81 0.77 0.44 0.52 0.45 0.38 0.22 0.5 0.71 0.33 0.36 0.33 0.47 0.63 0.49 0.49 0.77 1.0 0.56 0.38
Sro309_g113910.1 (Contig3477.g26981)
0.4 0.21 0.32 0.36 0.13 0.21 0.56 0.36 0.34 0.3 0.8 0.28 0.33 0.2 0.47 0.91 0.34 0.45 0.2 0.41 0.26 0.07 0.25 1.0 0.88 0.24 0.52
0.24 0.02 0.09 0.17 0.08 0.02 0.48 0.23 0.37 0.24 0.29 0.25 0.24 0.16 0.38 0.53 0.42 0.29 0.2 0.26 0.08 0.08 0.23 0.89 1.0 0.71 0.17
Sro32_g020990.1 (Contig3715.g28572)
0.0 0.64 0.77 0.75 0.75 0.14 0.53 0.56 0.63 0.15 0.28 0.04 0.2 0.04 0.36 0.44 0.21 1.0 0.39 0.19 0.1 0.81 0.65 0.09 0.09 0.18 0.3
Sro333_g119650.1 (Contig3012.g24061)
0.0 0.11 0.51 0.21 0.19 0.04 1.0 0.96 0.75 0.12 0.23 0.01 0.06 0.01 0.23 0.58 0.62 0.89 0.17 0.08 0.13 0.92 0.46 0.08 0.13 0.36 0.55
Sro356_g125360.1 (Contig3618.g27972)
0.29 0.44 0.69 0.67 0.48 0.28 0.66 0.9 0.79 0.42 0.92 0.43 0.2 0.19 0.64 0.66 0.69 0.56 0.26 0.2 0.49 0.3 0.54 1.0 0.65 0.54 0.58
Sro36_g022670.1 (Contig97.g1122)
0.0 0.22 0.33 0.12 0.18 0.0 0.37 0.67 1.0 0.1 0.07 0.06 0.08 0.02 0.12 0.06 0.07 0.54 0.15 0.06 0.12 0.35 0.56 0.08 0.08 0.12 0.09
0.01 0.38 0.5 0.28 0.35 0.29 0.59 0.54 0.71 0.39 0.45 0.31 0.44 0.36 0.62 0.63 0.51 1.0 0.64 0.49 0.41 0.89 0.66 0.25 0.17 0.29 0.51
Sro464_g148460.1 (Contig363.g4894)
0.06 0.27 0.44 1.0 0.57 0.04 0.33 0.35 0.67 0.03 0.03 0.02 0.01 0.04 0.05 0.07 0.11 0.04 0.01 0.01 0.01 0.34 0.18 0.05 0.03 0.04 0.04
Sro525_g160190.1 (Contig3147.g24967)
0.7 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.37 0.21 1.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.9 0.02 0.0 0.0 0.02 0.11 0.14 0.04 0.25 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro549_g164550.1 (Contig1749.g15560)
0.01 0.14 0.26 0.2 0.18 0.18 0.57 0.63 1.0 0.18 0.28 0.17 0.26 0.09 0.21 0.27 0.38 0.72 0.3 0.26 0.14 0.39 0.37 0.08 0.1 0.34 0.28
Sro555_g165780.1 (Contig677.g7926)
0.1 0.37 0.68 0.92 0.45 0.23 0.49 0.31 0.47 0.36 0.3 0.48 0.2 0.2 0.26 0.28 0.32 0.35 0.28 0.28 0.27 0.1 0.28 0.63 1.0 0.56 0.4
Sro55_g032540.1 (Contig4458.g33528)
0.01 0.71 1.0 0.77 0.62 0.19 0.34 0.39 0.6 0.22 0.38 0.09 0.2 0.05 0.38 0.65 0.34 0.6 0.34 0.2 0.12 0.97 0.4 0.14 0.21 0.3 0.48
Sro566_g167790.1 (Contig3739.g28674)
0.0 0.38 1.0 0.42 0.32 0.14 0.35 0.6 0.5 0.14 0.26 0.03 0.07 0.07 0.44 0.69 0.28 0.97 0.43 0.13 0.05 0.62 0.31 0.19 0.24 0.17 0.57
Sro581_g170330.1 (Contig2661.g21538)
0.0 0.34 0.39 0.23 0.25 0.07 0.32 0.38 0.4 0.14 0.23 0.07 0.23 0.22 0.28 0.31 0.13 1.0 0.4 0.14 0.06 0.36 0.31 0.4 0.35 0.32 0.26
Sro599_g173320.1 (Contig1154.g11043)
0.39 0.41 0.45 0.22 0.19 0.26 0.92 0.19 0.65 0.27 0.62 0.22 0.0 0.43 0.36 0.69 0.23 0.11 0.0 0.26 0.32 0.26 0.42 0.86 0.51 0.25 1.0
0.25 0.1 0.19 0.25 0.15 0.23 0.45 0.47 0.31 0.2 0.34 0.2 0.07 0.11 0.35 0.64 0.42 0.04 0.06 0.02 0.05 0.16 0.26 0.86 1.0 0.43 0.09
Sro660_g183040.1 (Contig1196.g11309)
0.01 0.38 0.69 1.0 0.82 0.02 0.69 0.63 0.97 0.11 0.05 0.03 0.23 0.03 0.15 0.17 0.04 0.26 0.2 0.21 0.04 0.3 0.32 0.07 0.52 0.27 0.09
Sro727_g193580.1 (Contig1496.g13663)
0.0 0.12 0.06 0.15 0.16 0.26 0.86 0.37 0.58 0.14 0.12 0.02 0.04 0.6 0.39 0.45 0.53 0.14 0.12 0.04 0.04 1.0 0.94 0.12 0.05 0.21 0.32
Sro752_g197130.1 (Contig1730.g15437)
1.0 0.17 0.48 0.66 0.38 0.19 0.48 0.44 0.48 0.36 0.53 0.37 0.58 0.16 0.4 0.66 0.47 0.38 0.26 0.42 0.3 0.2 0.28 0.53 0.73 0.35 0.35
Sro794_g203340.1 (Contig1634.g14703)
0.02 0.24 0.24 0.36 0.32 0.19 0.61 0.64 1.0 0.19 0.26 0.19 0.11 0.08 0.25 0.32 0.2 0.4 0.18 0.13 0.18 0.16 0.47 0.16 0.17 0.22 0.29
Sro796_g203810.1 (Contig2034.g17479)
0.03 0.3 0.4 0.49 0.44 0.09 0.62 0.79 1.0 0.2 0.26 0.2 0.37 0.28 0.37 0.16 0.3 0.52 0.36 0.32 0.31 0.34 0.48 0.1 0.1 0.13 0.13
Sro87_g045980.1 (Contig2014.g17206)
0.04 0.64 0.51 0.3 0.4 0.3 0.8 0.51 0.85 0.55 0.42 0.51 0.79 0.58 0.58 0.51 0.43 1.0 0.72 0.97 0.46 0.72 0.78 0.33 0.26 0.28 0.42
Sro95_g049250.1 (Contig45.g310)
0.07 0.36 0.76 0.75 0.51 0.26 0.83 1.0 0.9 0.36 0.49 0.37 0.19 0.17 0.5 0.58 0.3 0.53 0.34 0.25 0.43 0.42 0.41 0.74 0.7 0.53 0.46
Sro986_g228110.1 (Contig4404.g33096)
0.03 0.16 0.14 0.09 0.09 0.0 0.37 0.25 0.91 0.09 0.01 0.01 0.52 0.15 0.08 0.03 0.05 0.3 1.0 0.6 0.03 0.29 0.82 0.05 0.01 0.01 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)