Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

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(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1003_g229940.1 (Contig3777.g28990)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.01 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1009_g230720.1 (Contig1546.g14037)
0.57 0.99 0.68 0.23 0.47 0.11 0.6 3.04 2.45 1.78 0.58 1.86 2.1 0.13 0.9 0.37 0.24 4.39 2.09 2.39 1.14 0.32 13.31 0.18 0.48 1.83 0.56
Sro1013_g231320.1 (Contig3614.g27941)
0.0 0.24 0.09 0.16 0.08 0.11 0.02 0.46 0.25 0.22 0.0 0.53 0.25 0.02 0.15 0.0 0.13 0.66 0.11 0.24 0.0 0.02 0.55 0.0 0.0 0.15 0.07
Sro1013_g231350.1 (Contig3614.g27944)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro106_g053460.1 (Contig1122.g10743)
2.47 9.12 2.06 6.24 8.91 0.17 1.42 9.08 10.66 1.44 0.58 0.88 0.11 0.07 0.4 0.53 0.51 0.3 0.14 0.17 0.29 2.34 11.76 2.78 9.1 4.23 0.49
Sro109_g054420.1 (Contig4753.g35224)
0.0 0.0 0.44 0.21 0.52 0.0 0.56 0.56 0.81 0.12 0.0 0.19 1.19 0.06 0.15 0.0 0.0 0.24 0.07 0.39 0.2 0.31 2.42 0.0 0.09 0.0 0.12
Sro109_g054710.1 (Contig4753.g35253)
0.15 10.06 6.74 12.83 8.23 2.5 8.34 8.43 19.19 5.89 6.96 6.73 3.67 5.86 3.94 4.1 5.23 19.58 9.72 5.21 6.77 4.44 13.97 20.55 20.54 5.82 5.83
Sro10_g008210.1 (Contig1.g45)
0.47 0.45 0.8 0.44 0.41 0.09 1.12 1.33 1.74 0.49 0.09 1.14 0.1 0.97 0.51 0.06 0.05 0.23 0.12 0.04 0.34 1.54 1.86 0.46 0.08 0.12 0.11
0.01 1.66 2.29 0.83 0.35 0.02 0.63 0.31 1.05 0.3 0.0 0.08 0.06 0.07 0.23 0.0 0.39 0.05 0.04 0.15 0.23 0.29 0.79 0.28 0.0 0.04 0.1
Sro10_g008270.1 (Contig1.g51)
0.1 6.18 8.15 3.42 6.91 17.04 46.27 49.94 50.4 12.12 14.37 10.48 16.96 27.18 13.96 0.11 10.67 27.96 11.81 8.72 14.58 34.91 44.65 36.01 14.37 15.13 4.03
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.45 0.55 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.51 0.0 0.0 0.03 0.01
Sro1128_g244320.1 (Contig1354.g12497)
1.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.14 1.15 3.42 4.42 0.73 0.57 0.9 3.38 0.3 0.28 0.81 0.3 0.49 0.79 4.34 0.42 1.78 3.2 0.42 1.06 0.26 0.33
Sro114_g056250.1 (Contig1482.g13525)
1.56 10.67 5.95 13.65 15.21 12.35 3.34 25.81 15.7 2.7 2.68 2.48 2.8 0.0 1.5 7.34 0.18 10.27 2.54 2.52 0.59 4.08 33.24 0.2 1.92 3.53 2.29
0.26 3.63 3.65 4.08 4.33 0.6 1.93 5.09 5.14 1.89 5.71 2.07 0.47 0.21 3.25 3.38 2.88 0.35 1.48 0.9 0.77 1.08 7.18 0.12 0.3 0.78 3.68
Sro1181_g249820.1 (Contig2161.g18133)
0.0 1.97 1.97 1.24 0.74 0.0 0.48 0.59 0.73 0.33 0.43 0.11 0.55 0.0 0.14 0.33 0.22 0.32 2.58 0.84 0.17 0.2 2.08 0.35 0.02 0.11 0.33
0.31 12.48 8.52 6.24 8.76 0.11 0.37 1.83 2.21 0.63 0.0 0.0 0.04 0.04 0.17 0.01 0.0 0.86 0.4 0.54 0.26 1.51 2.95 0.1 1.28 0.18 0.15
Sro1188_g250610.1 (Contig3566.g27553)
0.0 0.4 0.4 0.0 0.35 0.0 0.25 0.0 0.71 0.19 0.0 0.14 1.02 0.15 0.58 0.0 0.0 0.19 1.28 0.81 0.01 1.61 1.74 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro1188_g250620.1 (Contig3566.g27554)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1222_g253780.1 (Contig1750.g15570)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.13 0.13 0.16 0.0 0.17 0.33 0.0 0.07 0.02 0.0 0.65 0.24 0.25 0.0 0.03 0.74 0.0 0.0 0.09 0.03
Sro1230_g254570.1 (Contig3922.g30048)
1.09 2.68 1.57 1.18 1.08 2.36 6.25 3.29 8.18 4.05 3.62 5.13 8.88 0.69 3.13 4.08 3.33 0.28 0.25 8.11 5.57 0.3 12.65 4.32 7.29 3.92 2.72
Sro1235_g255020.1 (Contig1411.g12960)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro123_g059760.1 (Contig66.g665)
5.76 1.07 0.75 0.39 1.45 0.0 3.67 28.62 21.15 0.72 0.12 0.59 2.14 0.03 0.2 0.56 0.38 0.31 0.1 0.58 0.2 0.5 28.62 0.07 0.3 0.2 0.15
Sro1245_g255720.1 (Contig1857.g16242)
5.53 11.08 16.32 7.46 5.98 1.83 16.04 21.5 24.9 4.78 6.28 3.53 2.61 0.93 4.39 4.22 3.71 1.88 1.22 2.48 2.5 3.25 37.65 4.66 1.9 2.05 2.21
Sro1261_g256980.1 (Contig24.g168)
0.2 0.36 1.9 1.69 1.92 0.0 0.99 1.95 3.47 0.3 0.39 0.56 0.66 0.05 0.09 0.12 0.05 1.04 1.67 0.42 0.67 0.3 6.99 0.69 2.25 3.04 0.13
Sro1275_g258470.1 (Contig2428.g19846)
0.06 0.11 0.08 0.02 0.04 0.02 0.15 0.39 0.5 0.08 0.0 0.04 0.34 0.27 0.05 0.0 0.01 0.15 1.33 0.36 0.13 0.03 3.13 0.02 0.0 0.02 0.01
Sro127_g060900.1 (Contig98.g1177)
0.13 4.17 7.06 2.6 2.39 4.25 9.43 17.45 17.93 5.72 2.48 4.78 2.05 5.42 3.39 7.98 11.01 9.04 4.23 3.08 5.0 4.76 17.38 1.7 2.59 5.47 5.84
Sro127_g060940.1 (Contig98.g1181)
6.88 1.07 1.6 0.92 1.35 0.48 2.12 2.97 2.64 2.68 2.06 5.33 1.92 0.66 1.61 2.36 2.18 1.32 1.69 1.19 2.92 1.37 2.79 1.87 2.19 1.43 1.54
0.12 12.51 10.15 7.73 6.95 0.0 2.41 6.67 5.98 0.96 0.0 0.37 3.76 0.84 0.19 0.42 0.44 1.85 1.92 1.83 0.08 0.69 11.39 0.91 1.53 2.53 0.03
Sro12_g009340.1 (Contig2293.g18954)
0.08 0.61 7.15 4.46 2.05 4.5 33.02 28.91 23.56 8.52 6.03 9.61 13.35 4.91 10.34 4.53 4.08 20.93 15.95 9.63 13.65 22.79 21.31 6.52 12.84 11.33 5.85
Sro131_g062370.1 (Contig67.g689)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro134_g063540.1 (Contig145.g1616)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.11 0.06 0.08 0.02 0.0 0.07 0.0 0.13 0.33 0.02 0.13 0.04 0.03 0.01 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro1351_g265270.1 (Contig2702.g21770)
0.07 14.05 16.68 13.55 10.61 1.46 5.82 14.33 33.34 2.36 2.42 0.73 2.84 0.99 2.52 1.45 9.12 25.73 2.11 3.58 0.14 4.68 16.9 0.96 1.95 5.24 1.93
Sro1355_g265550.1 (Contig1703.g15252)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1360_g266140.1 (Contig2203.g18335)
8.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.62 0.59 2.07 1.12 0.38 0.55 1.7 1.63 0.66 1.21 0.91 0.46 0.21 1.23 1.25 0.04 2.49 1.42 3.82 2.28 0.63
Sro1378_g267630.1 (Contig1373.g12608)
0.76 12.25 8.91 11.06 13.25 11.26 57.14 162.36 128.49 14.31 9.36 5.97 43.99 23.17 12.28 14.97 10.16 71.51 59.5 41.83 6.15 56.02 122.34 13.31 22.76 17.24 9.47
Sro1405_g269790.1 (Contig1156.g11048)
25.79 0.03 0.12 0.06 0.09 0.06 10.12 35.53 13.18 1.97 0.46 0.2 0.81 0.02 4.02 0.26 0.42 5.63 0.53 0.37 1.08 0.33 16.88 3.12 3.55 0.06 9.55
Sro1405_g269800.1 (Contig1156.g11049)
35.17 0.0 0.05 0.0 0.24 0.0 18.53 66.02 29.82 3.4 1.48 0.18 1.07 0.07 11.56 1.6 0.84 8.19 0.36 0.65 0.16 0.8 56.77 5.88 8.25 0.55 30.53
Sro1408_g270110.1 (Contig2286.g18912)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro140_g065480.1 (Contig1537.g13964)
0.0 0.23 0.08 0.07 0.0 0.57 0.65 0.43 0.18 0.21 0.61 0.11 0.14 0.39 0.27 0.3 0.46 0.6 0.31 0.19 0.68 0.08 0.44 0.22 0.53 0.03 0.32
Sro1414_g270640.1 (Contig3607.g27865)
2.86 9.91 9.14 7.02 12.79 12.42 45.6 105.46 78.27 23.08 15.48 13.89 40.1 11.29 15.34 13.71 25.35 152.05 179.87 33.27 29.08 16.02 155.74 35.72 113.1 31.66 19.52
Sro1414_g270650.1 (Contig3607.g27866)
7.9 6.61 5.29 3.43 3.67 1.73 6.83 17.51 8.72 5.72 4.41 7.4 8.99 4.97 6.28 3.15 5.71 9.66 14.73 7.41 9.72 7.72 24.44 9.34 4.14 2.17 4.7
Sro1418_g270950.1 (Contig4752.g35211)
0.2 0.12 0.09 0.06 0.04 0.09 3.83 4.75 8.35 0.78 0.51 2.28 0.63 0.07 0.2 0.13 0.04 0.44 0.23 0.62 1.47 0.05 9.23 0.07 0.31 0.12 0.13
Sro141_g065660.1 (Contig65.g590)
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.3 0.22 0.03 0.02 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.18 0.05 0.03 0.24 0.02 0.0 0.0 0.02
Sro141_g065830.1 (Contig65.g607)
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.82 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.17 0.46 0.05 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1444_g273230.1 (Contig2917.g23215)
22.23 7.08 5.38 4.0 5.29 2.81 16.45 24.26 17.53 6.44 8.0 12.03 6.15 1.21 6.39 7.4 6.34 6.72 4.05 10.75 2.14 2.11 17.47 4.23 4.8 2.84 5.62
Sro1463_g274870.1 (Contig87.g922)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro14_g010770.1 (Contig1128.g10826)
0.4 0.0 0.0 0.01 0.01 2.08 21.59 44.08 35.32 1.67 7.45 1.35 0.04 0.27 5.15 5.24 4.16 0.03 0.01 0.08 0.26 0.57 38.45 1.05 1.01 1.29 3.62
Sro1524_g279650.1 (Contig122.g1378)
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Sro259_g101370.1 (Contig240.g2927)
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Sro259_g101430.1 (Contig240.g2933)
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Sro913_g219440.1 (Contig577.g7325)
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Sro990_g228630.1 (Contig427.g5787)
0.12 5.68 9.42 10.19 9.64 0.18 2.76 13.36 8.55 1.09 0.49 1.63 0.72 0.16 0.59 0.21 0.56 1.95 0.65 0.77 0.68 1.25 12.29 0.04 0.32 0.56 0.25

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)