Heatmap: Cluster_314 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1022_g232420.1 (Contig2862.g22956)	0.19	0.03	0.04	0.05	0.04	0.13	0.12	0.08	0.05	0.2	0.13	0.22	0.11	0.07	0.11	0.05	0.21	0.45	0.16	0.19	0.36	1.0	0.08	0.56	0.65	0.29	0.07
Sro102_g052050.1 (Contig319.g4249)	0.0	0.15	0.17	0.13	0.19	0.2	0.28	0.15	0.33	0.64	0.53	0.77	0.47	0.59	0.49	0.48	0.26	0.29	0.49	0.76	0.89	1.0	0.26	0.16	0.38	0.39	0.52
Sro1152_g246940.1 (Contig333.g4434)	0.01	0.05	0.16	0.06	0.03	0.11	0.51	0.32	0.35	0.44	0.76	0.43	0.2	0.31	0.59	0.73	0.32	0.23	0.25	0.37	0.61	1.0	0.24	0.69	0.93	0.51	0.35
Sro119_g058260.1 (Contig2194.g18299)	0.0	0.27	0.14	0.09	0.04	0.56	0.6	0.22	0.25	0.48	0.17	0.98	0.06	0.55	0.34	0.04	0.12	0.06	0.26	0.19	0.68	1.0	0.4	0.57	0.92	0.75	0.25
Sro1278_g258750.1 (Contig703.g8149)	0.14	0.31	0.05	0.06	0.08	0.14	0.5	0.25	0.3	0.48	0.33	0.52	0.73	0.63	0.59	0.42	0.57	0.61	0.62	0.82	0.58	1.0	0.24	0.4	0.37	0.28	0.31
Sro128_g061320.1 (Contig1654.g14908)	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.29	0.38	0.4	0.32	0.29	0.15	0.32	0.07	0.17	0.34	0.16	0.25	0.5	0.45	0.61	0.5	0.74	0.28	0.62	1.0	0.81	0.16
Sro134_g063470.1 (Contig145.g1609)	0.06	0.31	0.12	0.06	0.15	0.06	0.6	0.07	0.27	0.34	0.37	0.55	0.39	0.44	0.39	0.32	0.32	0.05	0.11	0.31	0.53	1.0	0.3	0.7	0.82	0.36	0.35
Sro1392_g268810.1 (Contig2185.g18216)	0.08	0.17	0.13	0.14	0.09	0.41	0.31	0.15	0.23	0.38	0.24	0.35	0.16	0.14	0.24	0.07	0.39	0.43	0.63	0.51	0.35	0.41	0.31	0.76	1.0	0.8	0.28
Sro148_g068220.1 (Contig3597.g27814)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.2	0.14	0.15	0.26	0.19	0.27	0.1	0.05	0.35	0.27	0.06	0.25	0.49	0.23	0.69	0.72	0.06	0.62	1.0	0.92	0.25
Sro150_g068910.1 (Contig1519.g13854)	0.0	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.09	0.19	0.29	0.12	0.27	0.39	0.25	0.19	0.22	0.06	0.38	0.4	0.5	0.84	1.0	0.23	0.08	0.18	0.31	0.13
Sro1672_g290180.2	0.01	0.07	0.01	0.11	0.03	0.0	0.42	0.19	0.13	0.37	0.21	0.35	0.07	0.1	0.38	0.65	0.26	0.01	0.02	0.07	0.36	1.0	0.17	0.16	0.4	0.5	0.17
Sro1715_g293090.1 (Contig3682.g28419)	0.01	0.13	0.08	0.03	0.09	0.24	0.31	0.28	0.09	0.24	0.17	0.28	0.13	0.12	0.24	0.07	0.2	0.17	0.17	0.22	0.33	0.53	0.12	0.48	1.0	0.77	0.23
Sro1715_g293100.1 (Contig3682.g28420)	0.0	0.13	0.08	0.02	0.02	0.04	0.14	0.03	0.05	0.14	0.23	0.09	0.08	0.08	0.16	0.06	0.11	0.17	0.08	0.37	0.18	1.0	0.16	0.43	0.27	0.37	0.05
Sro177_g077840.2	0.0	0.12	0.1	0.06	0.1	0.0	0.02	0.12	0.0	0.05	0.0	0.02	0.07	0.03	0.08	0.01	0.0	0.13	0.02	0.09	0.07	1.0	0.11	0.05	0.02	0.0	0.03
Sro1798_g298240.1 (Contig1745.g15538)	0.01	0.71	1.0	0.43	0.39	0.13	0.38	0.37	0.45	0.38	0.35	0.42	0.34	0.21	0.34	0.41	0.4	0.35	0.4	0.42	0.41	0.67	0.37	0.37	0.28	0.3	0.28
Sro1916_g305260.1 (Contig4310.g32506)	0.04	0.22	0.19	0.1	0.08	0.23	0.69	0.13	0.33	0.47	0.34	0.69	0.85	0.86	0.47	0.49	0.18	0.2	0.25	0.4	0.6	1.0	0.36	0.75	0.57	0.22	0.24
Sro200_g084740.1 (Contig201.g2365)	0.28	0.42	0.42	0.32	0.2	0.08	0.41	0.31	0.43	0.4	0.37	0.48	0.44	0.48	0.35	0.27	0.22	0.28	0.51	0.55	0.42	1.0	0.46	0.38	0.49	0.34	0.27
Sro205_g086070.1 (Contig2217.g18420)	0.11	0.07	0.13	0.05	0.11	0.09	0.22	0.23	0.29	0.61	0.27	0.91	0.43	0.37	0.34	0.38	0.3	0.52	0.19	0.49	0.62	0.81	0.22	0.49	1.0	0.44	0.26
Sro213_g088520.1 (Contig1149.g10992)	0.03	0.2	0.25	0.18	0.28	0.04	0.11	0.48	0.66	0.37	0.03	0.32	0.11	0.1	0.13	0.08	0.05	0.55	0.8	0.11	0.65	1.0	0.73	0.22	0.2	0.12	0.06
Sro223_g091450.1 (Contig370.g5014)	0.0	1.0	0.86	0.44	0.38	0.07	0.32	0.37	0.85	0.37	0.14	0.39	0.16	0.3	0.28	0.3	0.37	0.12	0.32	0.19	0.7	0.69	0.55	0.41	0.27	0.24	0.22
Sro263_g102150.1 (Contig612.g7537)	0.01	0.38	0.25	0.18	0.16	0.18	0.43	0.27	0.37	0.51	0.45	0.72	0.68	0.4	0.41	0.3	0.3	0.3	0.55	0.69	0.67	1.0	0.36	0.91	0.77	0.51	0.29
Sro2851_g338580.1 (Contig1949.g16754)	0.0	0.03	0.09	0.02	0.04	0.03	0.02	0.31	0.28	0.21	0.08	0.17	0.03	0.09	0.09	0.08	0.03	0.31	0.27	0.15	0.85	1.0	0.17	0.03	0.08	0.06	0.13
Sro2920_g340260.1 (Contig2919.g23236)	0.0	0.58	0.68	0.66	0.44	0.14	0.65	0.36	0.53	0.24	0.33	0.06	0.06	0.46	0.5	0.35	0.59	0.15	0.21	0.08	0.4	1.0	0.37	0.17	0.3	0.5	0.43
Sro304_g112630.1 (Contig465.g6237)	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0	0.04	0.01	0.0	0.14	0.07	0.13	0.0	0.13	0.0	0.12	0.11	0.0	0.03	0.1	0.17	0.02	1.0	0.07	0.15	0.0	0.0	0.03
Sro30_g019550.1 (Contig3962.g30355)	0.01	0.09	0.14	0.07	0.08	0.58	0.41	0.5	0.33	0.5	0.56	0.68	0.32	0.6	0.62	0.51	0.64	0.89	0.78	0.52	0.66	1.0	0.31	0.6	0.94	0.55	0.57
Sro30_g019860.1 (Contig3962.g30386)	0.04	0.33	0.22	0.2	0.24	0.14	0.39	0.18	0.32	0.67	0.44	0.67	0.8	0.65	0.51	0.58	0.43	0.44	0.63	1.0	0.94	0.94	0.4	0.35	0.72	0.58	0.39
Sro31_g020340.1 (Contig420.g5629)	0.07	0.34	0.43	0.32	0.28	0.25	0.32	0.33	0.62	0.37	0.31	0.35	0.4	0.2	0.2	0.17	0.42	0.7	0.8	0.66	0.48	1.0	0.59	0.23	0.21	0.29	0.25
Sro342_g121660.1 (Contig3070.g24466)	0.14	0.68	0.91	0.13	0.29	0.2	0.19	0.18	0.71	0.42	0.18	0.33	0.38	0.48	0.27	0.07	0.08	0.28	0.61	0.18	0.59	1.0	0.63	0.25	0.13	0.26	0.21
Sro402_g135450.1 (Contig305.g4006)	0.01	0.33	0.21	0.4	0.06	0.27	0.16	0.39	0.65	0.17	0.0	0.14	0.14	0.17	0.24	0.16	0.18	0.04	0.12	0.21	0.29	1.0	0.56	0.25	0.18	0.0	0.2
Sro402_g135450.3	0.08	0.39	0.31	0.04	0.17	0.0	0.12	0.27	0.31	0.14	0.4	0.15	0.07	0.15	0.09	0.12	0.12	0.11	0.25	0.15	0.15	1.0	0.39	0.0	0.07	0.11	0.13
Sro402_g135450.4	0.07	0.87	0.71	0.36	0.32	0.1	0.31	0.38	0.6	0.33	0.36	0.24	0.41	0.13	0.34	0.28	0.08	0.42	0.64	0.59	0.36	1.0	0.61	0.57	0.52	0.28	0.23
Sro43_g026290.1 (Contig2453.g20095)	0.02	0.25	0.13	0.05	0.07	0.33	0.08	0.11	0.29	0.38	0.27	0.6	0.62	1.0	0.41	0.26	0.4	0.09	0.4	0.18	0.47	0.76	0.08	0.06	0.02	0.03	0.13
Sro440_g143490.1 (Contig2528.g20661)	0.0	0.19	0.24	0.08	0.03	0.36	0.35	0.16	0.05	0.23	0.14	0.17	0.12	0.08	0.27	0.02	0.07	0.16	0.51	0.36	0.26	0.51	0.1	0.46	1.0	0.66	0.18
Sro475_g150420.1 (Contig3232.g25568)	0.07	0.57	0.48	0.21	0.24	0.06	0.23	0.35	0.47	0.48	0.32	0.35	0.23	0.23	0.27	0.31	0.2	0.41	0.87	0.47	0.62	1.0	0.61	0.25	0.37	0.28	0.3
Sro4_g003290.2	0.01	0.15	0.19	0.09	0.09	0.78	0.58	0.51	0.38	0.37	0.74	0.29	0.35	0.15	0.62	0.59	0.46	0.71	0.72	0.5	0.42	1.0	0.32	0.78	0.77	0.63	0.61
Sro53_g031570.1 (Contig1592.g14497)	0.03	0.35	1.0	0.45	0.28	0.01	0.18	0.15	0.16	0.14	0.24	0.03	0.05	0.1	0.1	0.15	0.31	0.13	0.11	0.19	0.3	0.71	0.27	0.51	0.23	0.18	0.1
Sro548_g164380.1 (Contig1714.g15318)	0.04	0.58	1.0	0.19	0.28	0.04	0.13	0.11	0.12	0.16	0.11	0.13	0.12	0.04	0.17	0.18	0.07	0.08	0.1	0.14	0.16	0.48	0.25	0.15	0.16	0.16	0.11
Sro569_g168320.1 (Contig1581.g14358)	0.05	0.63	0.37	0.2	0.22	0.62	0.28	0.4	0.27	0.7	0.38	0.94	0.33	0.61	0.44	0.41	0.33	0.33	0.49	0.53	1.0	0.96	0.35	0.59	0.88	0.44	0.39
Sro570_g168500.1 (Contig131.g1473)	0.0	0.56	0.79	0.63	0.31	0.04	0.07	0.19	0.19	0.19	0.27	0.15	0.25	0.04	0.11	0.12	0.35	0.19	0.18	0.32	0.11	1.0	0.37	0.15	0.17	0.07	0.07
Sro662_g183360.1 (Contig3613.g27930)	0.11	0.07	0.05	0.03	0.01	0.04	0.36	0.15	0.44	0.18	0.11	0.14	0.4	0.02	0.14	0.09	0.05	0.28	0.23	0.92	0.31	1.0	0.51	0.17	0.4	0.29	0.12
Sro700_g189640.1 (Contig1498.g13681)	0.06	0.12	0.06	0.05	0.02	0.11	0.23	0.18	0.27	0.39	0.3	0.6	0.36	0.25	0.33	0.22	0.28	0.33	0.61	0.42	0.75	1.0	0.31	0.27	0.32	0.31	0.25
Sro71_g039230.2	0.05	0.19	0.0	0.02	0.04	0.05	0.18	0.03	0.06	0.2	0.15	0.34	0.06	0.22	0.12	0.09	0.0	0.04	0.09	0.14	0.25	1.0	0.23	0.27	0.93	0.37	0.11
Sro740_g195540.1 (Contig168.g1893)	0.0	0.04	0.09	0.1	0.04	0.12	0.3	0.2	0.16	0.2	0.07	0.17	0.28	0.07	0.16	0.04	0.06	0.17	0.16	0.37	0.74	0.6	0.17	0.48	1.0	0.55	0.08
Sro742_g195971.1	0.0	0.13	0.13	0.06	0.04	0.06	0.13	0.16	0.19	0.25	0.1	0.13	0.22	0.08	0.11	0.14	0.15	0.24	0.3	0.31	0.24	1.0	0.13	0.1	0.15	0.11	0.12
Sro742_g195971.2	0.1	0.38	0.35	0.17	0.19	0.11	0.35	0.12	0.2	0.4	0.3	0.33	0.26	0.23	0.42	0.54	0.13	0.25	0.23	0.32	0.53	1.0	0.27	0.37	0.72	0.39	0.35
Sro876_g214500.1 (Contig165.g1865)	0.01	0.2	0.34	0.17	0.14	0.09	0.42	0.29	0.34	0.27	0.29	0.08	0.41	0.21	0.43	0.49	0.39	0.44	0.52	0.33	0.33	1.0	0.28	0.15	0.11	0.2	0.44
Sro968_g226080.1 (Contig1973.g16883)	0.02	0.05	0.16	0.07	0.06	0.02	0.2	0.41	0.19	0.35	0.11	0.51	0.7	0.12	0.23	0.22	0.12	0.29	0.24	1.0	0.57	0.48	0.1	0.33	0.53	0.36	0.12
Sro982_g227710.1 (Contig2831.g22682)	0.01	0.33	0.56	0.32	0.28	0.29	0.44	0.69	0.32	0.54	0.49	0.54	0.82	0.37	0.52	0.49	0.35	0.68	0.61	1.0	0.77	0.43	0.31	0.59	0.86	0.94	0.44
Sro9_g007130.1 (Contig4120.g31481)	0.44	0.29	0.23	0.17	0.14	0.15	0.37	0.29	0.43	0.45	0.22	0.44	0.37	0.19	0.23	0.11	0.24	0.34	0.63	0.64	0.62	1.0	0.45	0.62	0.45	0.32	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)