Heatmap: Cluster_234 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro102_g051900.1 (Contig319.g4234)
0.01 0.39 1.0 0.28 0.32 0.12 0.24 0.15 0.31 0.49 0.35 0.46 0.53 0.52 0.34 0.34 0.46 0.31 0.43 0.74 0.81 0.32 0.3 0.19 0.23 0.26 0.32
0.35 0.56 1.0 0.38 0.73 0.1 0.32 0.25 0.25 0.52 0.33 0.82 0.67 0.18 0.29 0.56 0.31 0.34 0.57 0.51 0.65 0.1 0.14 0.57 0.34 0.09 0.34
Sro1099_g241050.1 (Contig806.g8993)
0.17 0.71 0.85 0.62 0.55 0.26 0.48 0.4 0.37 0.7 0.51 0.73 0.91 0.61 0.48 0.42 0.44 0.4 0.72 1.0 0.8 0.55 0.48 0.57 0.94 0.62 0.48
Sro109_g054700.1 (Contig4753.g35252)
0.0 0.22 0.73 0.1 0.06 0.02 0.23 0.08 0.15 0.38 0.2 0.38 0.53 0.38 0.26 0.25 0.2 0.25 0.32 1.0 0.53 0.18 0.14 0.41 0.59 0.38 0.24
0.22 0.93 1.0 0.36 0.44 0.27 0.39 0.42 0.4 0.55 0.52 0.51 0.87 0.26 0.38 0.42 0.45 0.36 0.54 0.8 0.53 0.26 0.34 0.35 0.26 0.2 0.38
0.22 0.93 1.0 0.36 0.44 0.27 0.39 0.42 0.4 0.55 0.52 0.51 0.87 0.26 0.38 0.42 0.45 0.36 0.54 0.8 0.53 0.26 0.34 0.35 0.26 0.2 0.38
Sro111_g055290.1 (Contig567.g7206)
0.25 1.0 0.61 0.53 0.55 0.16 0.17 0.4 0.47 0.56 0.3 0.67 0.08 0.32 0.17 0.09 0.16 0.12 0.54 0.45 0.3 0.62 0.33 0.27 0.21 0.4 0.33
Sro1142_g245770.1 (Contig2104.g17866)
0.0 0.33 1.0 0.32 0.32 0.1 0.19 0.2 0.22 0.32 0.28 0.4 0.21 0.27 0.21 0.29 0.34 0.1 0.3 0.3 0.35 0.17 0.19 0.25 0.27 0.2 0.21
0.2 0.56 0.44 0.19 0.31 0.07 0.23 0.18 0.12 0.41 0.17 0.48 1.0 0.16 0.27 0.22 0.22 0.58 0.82 0.85 0.37 0.26 0.15 0.29 0.22 0.12 0.17
Sro1151_g246770.1 (Contig4710.g35028)
0.03 1.0 0.74 0.53 0.48 0.08 0.2 0.26 0.36 0.43 0.19 0.63 0.39 0.15 0.2 0.17 0.16 0.25 0.33 0.46 0.43 0.32 0.28 0.17 0.29 0.23 0.19
Sro1156_g247230.1 (Contig4160.g31770)
0.01 0.18 0.63 0.15 0.08 0.03 0.13 0.07 0.17 0.34 0.23 0.33 0.35 0.36 0.14 0.11 0.18 0.24 0.61 1.0 0.46 0.23 0.18 0.11 0.24 0.16 0.26
0.04 0.8 0.72 0.38 0.53 0.27 0.57 0.45 0.45 0.51 0.73 0.64 1.0 0.38 0.53 0.52 0.73 0.49 0.6 0.66 0.61 0.16 0.32 0.6 0.43 0.23 0.44
Sro1228_g254400.1 (Contig2695.g21741)
0.01 0.5 0.95 0.43 0.33 0.08 0.36 0.21 0.49 0.59 0.44 0.84 0.49 0.76 0.38 0.42 0.47 0.28 0.48 0.64 1.0 0.62 0.54 0.37 0.37 0.55 0.4
Sro1269_g257900.1 (Contig3033.g24211)
0.06 1.0 0.95 0.85 0.67 0.04 0.27 0.14 0.37 0.66 0.26 0.8 0.42 0.31 0.3 0.19 0.22 0.16 0.32 0.77 0.65 0.33 0.27 0.26 0.46 0.22 0.19
Sro1289_g259670.1 (Contig3644.g28153)
0.0 0.41 1.0 0.35 0.29 0.04 0.14 0.1 0.12 0.29 0.14 0.3 0.27 0.14 0.17 0.16 0.15 0.1 0.16 0.39 0.49 0.15 0.11 0.2 0.43 0.21 0.16
0.53 0.55 1.0 0.31 0.48 0.26 0.43 0.55 0.27 0.51 0.5 0.56 0.59 0.23 0.36 0.4 0.39 0.38 0.37 0.5 0.57 0.11 0.19 0.48 0.28 0.18 0.36
0.53 0.55 1.0 0.31 0.48 0.26 0.43 0.55 0.27 0.51 0.5 0.56 0.59 0.23 0.36 0.4 0.39 0.38 0.37 0.5 0.57 0.11 0.19 0.48 0.28 0.18 0.36
Sro139_g065220.1 (Contig4334.g32698)
0.01 0.44 1.0 0.37 0.33 0.22 0.28 0.31 0.35 0.57 0.51 0.51 0.59 0.47 0.42 0.64 0.38 0.38 0.51 0.79 0.72 0.4 0.4 0.35 0.52 0.46 0.42
Sro1406_g269870.1 (Contig4418.g33195)
0.0 0.1 1.0 0.06 0.05 0.0 0.12 0.07 0.06 0.23 0.12 0.33 0.11 0.09 0.16 0.15 0.18 0.11 0.12 0.5 0.48 0.11 0.06 0.19 0.48 0.3 0.11
Sro149_g068350.1 (Contig259.g3203)
0.02 0.38 1.0 0.22 0.13 0.05 0.09 0.07 0.12 0.28 0.23 0.39 0.37 0.42 0.24 0.23 0.2 0.27 0.3 0.49 0.32 0.21 0.11 0.17 0.14 0.29 0.24
Sro150_g068790.1 (Contig1519.g13842)
0.02 0.16 0.99 0.08 0.03 0.02 0.26 0.08 0.19 0.49 0.28 0.55 0.66 0.2 0.31 0.3 0.24 0.23 0.53 1.0 0.61 0.17 0.19 0.26 0.76 0.4 0.26
Sro150_g068820.1 (Contig1519.g13845)
0.06 0.94 0.97 0.92 1.0 0.03 0.14 0.23 0.32 0.6 0.28 0.84 0.28 0.23 0.15 0.21 0.18 0.4 0.46 0.4 0.53 0.22 0.18 0.14 0.33 0.24 0.22
Sro1534_g280470.1 (Contig2033.g17458)
0.16 0.83 0.9 0.81 0.73 0.2 0.43 0.45 0.46 0.65 0.57 0.79 0.82 0.6 0.55 0.82 0.51 0.56 0.53 0.74 1.0 0.51 0.56 0.36 0.52 0.52 0.53
Sro1553_g281980.1 (Contig1252.g11693)
0.01 0.05 0.88 0.05 0.03 0.1 0.15 0.06 0.07 0.49 0.35 0.69 0.54 0.57 0.23 0.35 0.44 0.13 0.44 1.0 0.47 0.39 0.27 0.15 0.31 0.48 0.45
Sro1664_g289500.1 (Contig291.g3805)
0.03 1.0 0.53 0.29 0.23 0.03 0.08 0.03 0.08 0.3 0.11 0.88 0.62 0.07 0.08 0.11 0.06 0.21 0.17 0.49 0.29 0.12 0.11 0.06 0.16 0.13 0.11
0.06 0.84 1.0 0.48 0.52 0.15 0.47 0.34 0.33 0.48 0.38 0.53 0.66 0.22 0.35 0.32 0.47 0.27 0.4 0.54 0.58 0.15 0.21 0.47 0.32 0.15 0.29
Sro176_g077290.1 (Contig203.g2416)
0.04 0.31 0.68 0.39 0.3 0.07 0.33 0.19 0.24 0.5 0.42 0.64 0.42 0.54 0.45 0.46 0.47 0.42 0.61 1.0 0.62 0.23 0.41 0.36 0.44 0.81 0.55
Sro194_g082720.1 (Contig237.g2867)
0.03 0.21 1.0 0.39 0.38 0.01 0.09 0.05 0.25 0.23 0.1 0.25 0.04 0.05 0.09 0.12 0.09 0.21 0.39 0.22 0.34 0.15 0.15 0.11 0.28 0.26 0.1
Sro2013_g310960.1 (Contig2748.g22126)
0.01 0.4 0.97 0.51 0.5 0.09 0.33 0.26 0.27 0.7 0.56 0.9 0.95 0.74 0.49 0.56 0.42 0.38 0.6 0.88 1.0 0.38 0.39 0.33 0.7 0.55 0.52
Sro2030_g311810.1 (Contig2022.g17315)
0.02 0.31 0.38 0.38 0.43 0.21 0.28 0.24 0.33 0.57 0.35 0.84 1.0 0.53 0.42 0.4 0.34 0.25 0.67 0.82 0.61 0.34 0.41 0.26 0.3 0.35 0.36
Sro2103_g314690.1 (Contig3031.g24200)
0.04 0.43 0.42 0.35 0.29 0.19 0.49 0.5 0.32 0.61 0.37 0.6 0.9 0.36 0.54 0.56 0.57 0.5 0.73 0.9 1.0 0.41 0.3 0.56 0.73 0.34 0.35
0.06 0.88 0.92 0.42 0.56 0.11 0.25 0.27 0.32 0.46 0.34 0.52 1.0 0.21 0.32 0.31 0.38 0.64 0.7 0.9 0.43 0.18 0.21 0.22 0.17 0.17 0.26
Sro2218_g319540.1 (Contig3225.g25510)
0.02 0.18 0.7 0.38 0.31 0.02 0.11 0.1 0.21 0.47 0.31 0.79 0.47 0.4 0.23 0.32 0.15 0.13 0.24 1.0 0.7 0.37 0.29 0.23 0.75 0.4 0.35
Sro230_g093460.1 (Contig263.g3277)
0.01 0.17 1.0 0.09 0.06 0.0 0.02 0.02 0.01 0.15 0.09 0.22 0.17 0.23 0.08 0.24 0.12 0.07 0.15 0.16 0.18 0.1 0.05 0.01 0.05 0.07 0.08
Sro230_g093470.1 (Contig263.g3278)
0.02 0.07 0.57 0.17 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.56 0.16 0.77 0.56 1.0 0.26 0.62 0.8 0.1 0.29 0.53 0.95 0.13 0.13 0.02 0.07 0.16 0.46
Sro2496_g329340.1 (Contig1887.g16455)
0.02 1.0 0.96 0.89 0.81 0.3 0.57 0.33 0.34 0.74 0.67 0.76 0.46 0.67 0.73 0.99 0.52 0.34 0.48 0.82 0.95 0.5 0.35 0.5 0.77 0.68 0.55
0.16 0.81 1.0 0.38 0.5 0.24 0.4 0.31 0.39 0.38 0.35 0.36 0.27 0.21 0.26 0.28 0.28 0.13 0.15 0.28 0.45 0.13 0.24 0.28 0.09 0.07 0.25
Sro305_g112900.1 (Contig560.g7131)
0.06 0.61 0.6 0.48 0.43 0.23 0.5 0.41 0.35 0.69 0.58 0.78 0.4 0.44 0.63 0.75 0.5 0.58 0.6 0.5 1.0 0.47 0.41 0.55 0.6 0.54 0.49
Sro307_g113360.1 (Contig2839.g22806)
0.0 0.17 1.0 0.11 0.15 0.02 0.08 0.03 0.04 0.29 0.15 0.32 0.45 0.38 0.22 0.22 0.16 0.12 0.2 0.56 0.46 0.3 0.1 0.07 0.2 0.1 0.12
0.22 0.73 1.0 0.38 0.43 0.14 0.31 0.2 0.19 0.45 0.41 0.42 0.75 0.32 0.38 0.38 0.43 0.41 0.5 0.68 0.5 0.18 0.16 0.34 0.25 0.13 0.29
0.53 0.7 1.0 0.4 0.61 0.2 0.3 0.25 0.31 0.57 0.55 0.67 0.83 0.29 0.43 0.31 0.48 0.25 0.54 0.71 0.61 0.31 0.24 0.41 0.35 0.22 0.35
0.02 0.69 1.0 0.47 0.63 0.09 0.24 0.36 0.48 0.38 0.25 0.37 0.65 0.16 0.23 0.32 0.2 0.36 0.58 0.66 0.49 0.18 0.14 0.34 0.19 0.06 0.29
Sro343_g122010.1 (Contig2616.g21252)
0.37 0.92 1.0 0.37 0.45 0.14 0.38 0.42 0.31 0.48 0.49 0.51 0.31 0.31 0.41 0.44 0.46 0.28 0.34 0.47 0.45 0.24 0.39 0.21 0.19 0.24 0.3
Sro346_g122680.1 (Contig4731.g35095)
0.01 1.0 0.49 0.39 0.98 0.02 0.25 0.21 0.36 0.35 0.43 0.17 0.08 0.49 0.2 0.18 0.14 0.47 0.2 0.14 0.38 0.16 0.41 0.12 0.08 0.12 0.38
Sro35_g022400.1 (Contig3323.g26117)
0.0 0.48 0.74 0.43 0.35 0.01 0.11 0.04 0.11 0.34 0.22 0.51 0.3 1.0 0.32 0.49 0.39 0.15 0.16 0.62 0.39 0.36 0.13 0.09 0.11 0.08 0.14
0.72 0.84 1.0 0.36 0.39 0.11 0.36 0.27 0.26 0.46 0.37 0.42 0.66 0.2 0.32 0.34 0.22 0.57 0.43 0.58 0.44 0.16 0.21 0.31 0.22 0.13 0.28
Sro479_g151120.1 (Contig1858.g16247)
0.01 0.68 1.0 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.17 0.33 0.08 0.36 0.19 0.23 0.15 0.15 0.21 0.24 0.22 0.91 0.5 0.18 0.18 0.03 0.02 0.07 0.09
Sro486_g152580.1 (Contig3152.g24997)
0.03 0.53 1.0 0.47 0.31 0.24 0.35 0.34 0.37 0.58 0.5 0.69 0.48 0.4 0.5 0.55 0.49 0.33 0.36 0.69 0.8 0.34 0.36 0.44 0.53 0.37 0.35
Sro487_g152730.1 (Contig367.g4949)
0.0 0.67 0.62 0.52 0.47 0.13 0.51 0.21 0.33 0.54 0.37 0.51 0.59 0.41 0.48 0.44 0.22 0.31 0.37 0.79 0.7 0.52 0.23 0.35 1.0 0.5 0.34
Sro490_g153500.1 (Contig328.g4370)
0.03 0.2 1.0 0.11 0.09 0.02 0.04 0.04 0.05 0.17 0.2 0.25 0.21 0.4 0.24 0.22 0.22 0.18 0.18 0.34 0.13 0.34 0.09 0.06 0.07 0.11 0.08
Sro492_g153780.1 (Contig2481.g20304)
0.55 0.35 0.6 1.0 0.59 0.25 0.26 0.32 0.25 0.61 0.47 0.5 0.31 0.28 0.45 0.82 0.31 0.5 0.56 0.54 0.61 0.32 0.16 0.42 0.51 0.39 0.61
Sro530_g161120.1 (Contig4609.g34397)
0.06 0.08 0.62 0.12 0.07 0.05 0.12 0.28 0.14 0.35 0.27 0.34 0.19 0.23 0.23 0.34 0.1 0.22 0.49 1.0 0.38 0.14 0.11 0.2 0.36 0.32 0.27
0.08 0.97 0.92 0.37 0.43 0.17 0.09 0.11 0.1 0.33 0.19 0.26 1.0 0.2 0.21 0.2 0.31 0.55 0.56 0.73 0.29 0.07 0.03 0.17 0.07 0.14 0.19
0.25 0.8 1.0 0.41 0.74 0.08 0.32 0.19 0.19 0.42 0.27 0.23 0.78 0.27 0.26 0.27 0.22 0.31 0.34 0.68 0.3 0.11 0.17 0.25 0.2 0.1 0.2
Sro55_g032470.1 (Contig4458.g33521)
0.03 0.47 1.0 0.34 0.21 0.12 0.27 0.07 0.17 0.29 0.3 0.32 0.53 0.22 0.42 0.26 0.07 0.21 0.33 0.55 0.3 0.32 0.11 0.12 0.18 0.09 0.18
Sro604_g174170.1 (Contig2463.g20171)
0.01 0.3 0.3 0.21 0.25 0.1 0.22 0.27 0.29 0.68 0.58 0.94 0.94 0.99 0.39 0.56 0.17 0.14 0.55 1.0 0.79 0.37 0.32 0.25 0.36 0.53 0.44
0.17 0.66 1.0 0.46 0.42 0.22 0.17 0.27 0.09 0.45 0.52 0.45 0.93 0.28 0.37 0.4 0.37 0.73 0.87 0.86 0.52 0.2 0.08 0.26 0.25 0.19 0.36
Sro616_g176050.1 (Contig2621.g21297)
0.01 0.16 1.0 0.14 0.03 0.19 0.11 0.1 0.22 0.35 0.26 0.35 0.54 0.35 0.23 0.47 0.26 0.19 0.48 0.87 0.61 0.42 0.29 0.13 0.28 0.32 0.21
Sro65_g036620.1 (Contig155.g1732)
0.01 0.65 0.9 0.52 0.44 0.17 0.21 0.37 0.39 0.49 0.29 0.55 0.41 0.42 0.34 0.57 0.23 0.18 0.31 0.53 1.0 0.21 0.37 0.21 0.13 0.23 0.41
Sro743_g196070.1 (Contig2729.g22005)
0.01 0.25 1.0 0.2 0.12 0.08 0.14 0.14 0.11 0.29 0.22 0.42 0.39 0.33 0.26 0.17 0.43 0.11 0.2 0.53 0.45 0.31 0.26 0.25 0.23 0.2 0.21
Sro757_g197900.1 (Contig322.g4279)
0.06 0.53 0.58 0.46 0.46 0.21 0.49 0.35 0.31 0.61 0.36 0.7 0.96 0.58 0.48 0.46 0.48 0.16 0.51 0.69 0.9 0.49 0.38 0.63 1.0 0.5 0.3
Sro758_g198100.1 (Contig434.g5862)
0.08 0.43 0.61 0.31 0.3 0.08 0.16 0.17 0.37 0.47 0.24 0.63 1.0 0.35 0.22 0.45 0.22 0.27 0.37 0.59 0.5 0.31 0.25 0.18 0.08 0.14 0.22
0.16 1.0 0.86 0.62 0.64 0.21 0.23 0.24 0.14 0.41 0.25 0.34 0.84 0.12 0.19 0.19 0.24 0.11 0.48 0.6 0.4 0.16 0.17 0.32 0.31 0.13 0.27
Sro82_g043740.1 (Contig4032.g30965)
0.02 0.88 1.0 0.91 0.88 0.08 0.11 0.12 0.26 0.6 0.2 0.63 0.28 0.15 0.1 0.13 0.18 0.22 0.46 0.62 0.38 0.29 0.31 0.14 0.21 0.26 0.29
0.0 0.53 0.55 0.61 0.56 0.39 0.25 0.19 0.24 0.68 0.48 0.88 1.0 0.79 0.46 0.54 0.54 0.27 0.56 0.91 0.83 0.3 0.29 0.21 0.37 0.37 0.52
Sro851_g210850.1 (Contig461.g6211)
0.08 0.79 0.79 1.0 0.76 0.17 0.39 0.41 0.24 0.63 0.54 0.63 0.59 0.3 0.42 0.69 0.4 0.37 0.55 0.9 0.53 0.26 0.17 0.61 0.55 0.4 0.54
Sro877_g214630.1 (Contig139.g1544)
0.01 0.95 1.0 0.65 0.53 0.11 0.5 0.36 0.33 0.71 0.77 0.9 0.6 0.39 0.61 0.63 0.64 0.48 0.73 0.91 0.9 0.4 0.43 0.57 0.47 0.45 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)