Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051620.1 (Contig348.g4715)
0.22 1.44 1.05 0.66 0.36 7.81 21.66 12.26 4.81 13.35 20.36 13.74 22.87 13.86 24.17 26.59 11.31 18.51 14.85 23.65 18.18 17.77 3.08 32.96 42.28 26.97 14.7
Sro1124_g243780.1 (Contig4358.g32836)
0.3 8.19 7.8 4.4 2.09 34.33 69.63 42.7 17.81 29.59 16.06 27.6 47.48 22.98 36.51 25.98 13.97 34.69 13.45 46.79 64.98 16.37 15.71 88.18 72.91 25.05 28.47
Sro1140_g245500.1 (Contig821.g9114)
0.12 1.16 2.18 2.62 3.05 0.93 4.82 2.26 2.48 4.85 3.86 4.46 11.5 5.06 4.7 5.23 4.36 5.62 6.47 12.46 7.39 2.79 2.18 7.42 14.0 6.93 2.9
Sro1178_g249480.1 (Contig1120.g10719)
0.08 4.48 4.37 4.64 4.41 5.37 8.52 5.29 7.22 11.85 14.64 14.16 27.61 9.6 12.81 12.53 13.83 8.5 14.24 23.21 18.84 8.05 4.89 14.76 25.78 14.16 9.84
Sro1271_g258130.1 (Contig3272.g25761)
0.03 0.46 0.37 1.08 0.11 0.41 2.31 1.15 0.45 2.94 3.28 2.55 6.7 2.61 3.59 2.99 1.37 2.58 1.06 5.72 3.28 1.13 0.34 2.43 4.09 0.9 1.04
Sro12_g009490.1 (Contig2293.g18969)
0.2 2.64 0.59 1.28 0.71 4.57 6.55 6.49 2.57 7.51 6.06 7.99 8.1 6.99 6.31 7.13 3.51 15.23 7.23 12.0 10.99 8.87 3.41 9.36 22.71 12.74 5.13
Sro1311_g261800.1 (Contig1682.g15107)
0.05 0.28 0.0 0.1 0.0 0.92 3.85 1.89 1.48 4.18 4.47 5.38 5.73 5.78 5.63 8.23 2.79 2.29 1.59 5.62 6.82 3.17 0.8 5.49 8.33 2.67 2.3
Sro1338_g264210.1 (Contig2752.g22177)
7.29 42.85 25.18 19.83 15.99 127.12 166.64 105.82 92.01 120.36 101.24 146.35 178.17 89.13 113.68 130.88 97.86 163.81 110.85 198.5 169.84 151.91 85.59 186.89 377.06 175.09 74.99
Sro135_g063640.1 (Contig2231.g18509)
0.03 10.32 7.65 7.06 6.5 2.32 9.56 3.69 3.9 9.82 8.41 9.75 12.27 7.84 10.22 9.74 10.81 6.06 8.0 13.35 12.34 8.03 3.75 9.18 16.08 10.6 6.08
Sro137_g064540.1 (Contig3969.g30469)
0.1 13.17 10.12 15.48 9.62 8.89 19.38 12.8 14.78 18.42 20.45 27.93 23.15 12.02 17.11 21.17 16.32 11.55 13.73 25.24 22.6 20.07 9.5 24.91 37.05 19.6 13.19
Sro139_g064920.1 (Contig4334.g32668)
0.07 0.29 0.0 0.21 0.1 0.9 4.28 1.72 1.44 3.19 3.87 3.69 3.83 1.77 4.24 5.06 1.69 3.87 2.64 4.36 6.19 4.64 1.03 6.81 14.95 6.62 2.32
Sro139_g065230.1 (Contig4334.g32699)
0.19 6.22 3.55 2.35 3.02 1.95 5.19 3.82 3.73 5.22 4.97 5.67 9.33 4.37 4.31 5.15 3.66 5.19 6.13 9.25 8.71 2.92 3.99 7.1 12.85 7.48 3.17
Sro1401_g269380.1 (Contig1376.g12622)
0.25 5.4 3.46 3.72 3.09 7.89 11.81 6.59 5.23 14.82 13.59 19.59 26.11 13.72 12.74 16.41 17.77 14.97 14.88 21.43 19.52 17.68 6.91 16.69 32.6 22.17 9.87
Sro1480_g276180.1 (Contig3471.g26920)
0.02 3.93 2.05 1.54 2.08 2.6 3.53 2.97 1.58 6.2 4.79 7.82 9.7 4.66 6.22 6.1 4.49 2.61 4.41 11.59 10.27 3.38 2.54 6.39 10.56 8.23 4.95
Sro1537_g280700.1 (Contig3053.g24294)
0.79 0.34 0.63 0.3 0.88 0.87 10.0 3.47 2.7 11.6 8.41 12.41 9.93 11.46 8.27 9.87 9.8 5.82 6.15 17.36 20.78 8.96 3.52 14.71 52.26 16.4 5.38
Sro1552_g281830.1 (Contig3671.g28366)
0.36 2.23 1.86 6.31 1.9 5.06 4.8 4.32 2.38 6.39 3.29 10.42 4.47 5.85 5.31 5.81 3.15 7.45 5.44 7.82 10.46 4.54 0.9 8.44 11.62 6.97 4.11
Sro1579_g283720.1 (Contig3855.g29673)
1.01 0.53 0.68 0.7 0.53 2.16 2.46 1.19 0.74 2.57 3.38 2.85 4.52 2.6 3.09 2.6 2.51 2.57 2.15 3.43 2.92 1.26 0.26 2.15 3.09 3.05 1.93
Sro160_g072120.1 (Contig2985.g23708)
0.34 4.78 2.14 3.59 3.39 4.57 7.79 6.01 2.26 7.42 11.23 6.59 5.37 3.96 12.76 21.5 7.56 10.78 8.44 10.95 9.81 5.11 2.39 13.18 15.7 8.54 9.15
Sro161_g072550.1 (Contig3982.g30596)
0.27 5.48 3.99 4.44 3.73 7.86 9.35 4.98 4.9 10.36 6.96 11.67 13.06 8.9 6.31 5.57 7.27 6.41 8.89 12.37 11.48 8.33 3.84 11.36 13.33 9.2 7.0
Sro185_g080240.1 (Contig1228.g11499)
0.13 11.78 3.74 5.33 5.57 3.31 14.07 10.68 4.83 12.65 7.96 16.94 7.44 22.68 12.54 9.75 7.07 12.06 12.25 14.08 19.63 11.03 5.18 19.73 25.81 15.94 7.65
Sro1863_g302280.1 (Contig1972.g16858)
0.06 0.23 0.13 0.09 0.06 0.97 4.58 2.05 0.5 3.7 3.01 4.31 2.88 3.11 4.87 7.25 2.52 3.73 2.17 4.11 5.32 2.34 0.55 6.72 6.1 3.81 2.77
Sro194_g082930.1 (Contig237.g2888)
0.13 0.8 0.73 0.49 0.52 1.78 2.5 2.72 0.92 3.72 1.17 7.21 6.47 5.63 3.37 2.43 1.42 1.09 1.7 2.61 7.59 2.24 0.77 4.04 6.26 2.28 2.88
Sro206_g086450.1 (Contig4750.g35182)
0.07 0.62 0.24 0.34 0.32 1.15 3.31 2.25 0.98 3.68 4.38 4.38 4.61 2.11 4.82 5.11 2.02 4.13 3.05 6.56 4.81 2.96 0.51 2.6 4.57 3.53 3.08
Sro206_g086660.1 (Contig4750.g35203)
0.07 1.41 0.73 0.92 0.64 1.25 6.6 1.9 0.79 2.23 3.61 0.97 2.51 1.17 2.57 3.57 2.23 4.75 2.21 2.89 2.92 3.63 1.15 8.33 10.22 6.5 2.01
Sro2098_g314380.1 (Contig3059.g24355)
0.33 2.65 3.13 2.0 2.9 1.69 3.41 2.31 1.48 3.75 3.76 4.92 4.88 3.28 4.02 6.47 2.41 1.87 3.79 4.61 4.15 2.77 1.6 2.7 4.14 2.81 3.12
Sro2155_g316870.1 (Contig4384.g32969)
14.9 4.15 3.99 6.56 4.67 8.3 15.92 14.29 10.45 17.62 21.27 20.44 29.57 17.09 20.22 18.35 19.49 10.81 13.23 28.53 24.02 13.87 14.1 26.39 34.9 20.39 13.97
Sro218_g090240.1 (Contig1136.g10925)
0.37 56.9 59.14 40.37 46.24 29.6 75.82 73.51 39.57 50.0 50.82 51.32 2.41 72.65 71.99 69.96 69.53 1.91 0.98 4.06 63.98 91.48 38.22 117.35 193.68 132.52 51.99
Sro2213_g319300.1 (Contig935.g9731)
0.27 1.72 2.14 1.15 0.96 2.83 3.44 1.86 1.82 4.61 4.73 5.3 5.57 6.33 5.82 6.42 4.22 2.89 2.49 6.48 5.71 2.79 1.17 4.67 5.15 2.91 2.63
Sro222_g091220.1 (Contig3134.g24885)
0.48 2.98 4.54 7.67 5.84 2.94 8.57 4.16 3.07 8.16 9.4 11.39 6.77 16.03 9.2 14.94 6.81 7.09 6.9 6.69 11.05 7.6 3.5 19.45 20.47 12.74 5.26
Sro227_g092270.1 (Contig327.g4339)
0.0 0.84 0.36 1.59 0.41 1.28 6.34 2.45 1.93 5.46 5.73 7.85 5.65 5.58 6.03 4.99 5.33 3.05 2.46 4.71 8.63 4.69 1.29 4.26 9.53 4.05 2.12
Sro238_g095680.1 (Contig99.g1214)
0.0 0.24 0.0 0.0 0.17 0.5 3.14 3.0 1.61 3.8 3.23 4.09 6.63 0.28 3.68 6.58 5.18 4.62 2.2 4.86 6.48 2.2 1.21 4.54 17.7 9.55 3.87
Sro23_g015940.1 (Contig2259.g18744)
0.1 0.52 1.05 0.37 0.3 6.44 7.31 5.91 1.66 6.93 4.11 5.9 6.32 4.75 7.21 8.68 3.22 4.83 2.77 8.62 12.34 5.91 1.86 7.05 20.48 7.62 4.68
Sro2588_g331990.1 (Contig4630.g34537)
0.15 0.25 0.16 0.0 0.04 0.26 2.06 0.95 0.72 3.2 1.49 3.47 1.36 2.04 3.56 4.16 0.9 3.18 2.43 3.23 4.41 1.83 0.33 1.37 3.92 2.09 2.11
Sro2842_g338260.1 (Contig3207.g25369)
0.0 0.54 0.22 0.07 0.08 0.35 4.39 0.9 0.72 2.04 2.27 2.95 2.25 2.46 2.32 1.62 1.2 1.68 1.43 1.6 4.03 1.7 0.67 3.87 5.36 4.15 1.38
Sro2902_g339820.1 (Contig3967.g30414)
0.17 1.3 0.52 0.34 0.0 1.07 21.54 10.26 6.1 14.51 11.95 16.86 17.78 9.4 15.34 18.3 4.11 9.89 5.68 14.21 20.98 5.05 4.54 29.59 38.69 15.35 9.49
Sro295_g110350.1 (Contig4342.g32758)
0.06 0.42 0.13 0.09 0.03 1.07 4.27 3.35 1.31 5.92 5.16 5.87 4.23 2.44 7.7 12.57 2.98 12.91 5.61 6.7 6.42 4.82 1.22 4.98 4.58 2.62 5.29
Sro301_g112090.1 (Contig455.g6157)
0.05 0.11 0.07 0.03 0.0 0.13 1.27 0.26 0.15 1.45 1.43 1.24 2.15 0.8 1.86 3.32 0.53 1.27 1.23 3.06 2.19 0.9 0.09 0.82 1.71 0.88 0.7
Sro333_g119520.1 (Contig3012.g24048)
0.19 0.14 0.3 0.16 0.17 1.36 5.96 7.78 1.76 9.19 5.58 6.36 6.48 7.3 16.59 23.65 7.04 25.08 9.05 13.32 16.01 6.74 1.77 6.25 13.9 7.25 10.46
Sro334_g119850.1 (Contig278.g3595)
1.13 8.72 5.0 5.68 5.35 6.74 9.76 4.77 3.87 9.41 11.27 11.17 14.04 11.71 10.49 14.39 9.91 5.58 6.62 12.77 10.4 8.76 4.29 12.26 13.63 7.06 8.33
Sro3547_g349140.1 (Contig1656.g14938)
0.02 0.62 0.28 0.28 0.41 2.12 5.15 1.88 1.59 4.28 2.99 4.95 4.66 6.37 5.93 5.2 2.4 4.09 2.01 5.48 6.89 3.08 1.23 5.1 7.09 4.72 2.33
Sro361_g126470.1 (Contig1094.g10572)
0.16 5.48 10.06 5.49 2.65 2.85 7.52 6.16 4.98 9.12 10.13 9.71 24.51 7.8 8.22 5.76 8.17 8.24 11.0 18.95 13.79 8.65 3.96 11.04 22.06 9.24 5.46
Sro372_g128750.1 (Contig2891.g23055)
0.99 9.95 3.42 3.61 3.08 10.06 52.81 30.29 21.8 39.59 40.58 44.51 50.57 33.48 39.79 50.28 27.34 37.6 41.17 71.61 47.83 40.3 25.71 94.17 131.45 44.34 35.56
Sro391_g133130.1 (Contig2759.g22214)
0.29 2.29 0.9 1.14 1.56 1.58 8.52 3.59 4.04 10.39 8.88 10.51 14.46 11.81 13.64 16.05 11.81 5.66 3.19 12.8 14.52 6.54 3.12 5.38 15.59 7.66 7.58
Sro440_g143460.1 (Contig2528.g20658)
0.58 2.54 1.36 1.09 0.28 10.66 18.41 10.81 5.07 11.02 7.52 9.56 12.09 8.51 13.3 8.95 4.89 12.51 5.25 14.39 24.04 13.63 6.75 24.25 30.54 12.27 8.16
Sro460_g147420.1 (Contig3843.g29567)
0.09 0.49 0.61 0.38 0.06 1.5 7.43 3.48 1.74 5.25 4.43 7.0 3.92 7.9 4.87 3.07 2.35 3.72 2.06 4.59 7.26 4.73 1.24 8.49 16.61 9.57 3.02
Sro487_g152750.1 (Contig367.g4951)
0.24 3.15 2.31 2.64 3.0 6.76 10.09 3.72 3.55 10.64 9.13 11.57 8.4 6.69 11.23 9.34 7.04 13.5 3.0 6.39 13.43 6.21 2.63 5.57 8.51 6.8 7.04
Sro487_g152800.1 (Contig367.g4956)
0.0 0.38 2.55 3.56 1.46 2.76 9.18 9.56 2.79 5.54 5.64 4.74 2.62 2.85 6.43 10.82 2.44 5.25 4.11 4.57 8.93 9.96 3.43 8.95 22.41 10.92 6.15
Sro519_g158950.1 (Contig1321.g12212)
0.05 0.64 0.46 0.52 0.46 2.52 4.04 1.65 0.56 3.58 1.45 3.33 5.56 2.01 2.23 1.46 1.05 2.87 3.24 8.6 5.55 2.29 0.84 2.93 5.75 3.08 1.74
Sro533_g161570.1 (Contig3819.g29325)
7.52 1.46 1.45 1.99 1.26 5.89 13.94 9.46 5.25 12.39 12.44 17.01 14.51 19.64 12.34 8.17 9.43 8.02 6.65 11.59 16.78 6.56 5.45 21.55 25.65 12.77 6.84
Sro588_g171490.1 (Contig4679.g34791)
0.07 1.58 1.47 1.39 1.69 4.62 11.34 7.3 4.72 9.45 9.89 8.61 9.03 9.33 8.81 8.72 10.28 10.34 9.4 13.52 11.4 10.08 3.84 11.67 21.3 13.68 5.91
Sro58_g033770.1 (Contig64.g571)
0.16 1.59 0.72 0.76 0.65 4.26 11.63 9.72 7.82 8.32 10.63 11.79 12.22 5.64 8.88 9.38 9.92 10.84 12.54 8.8 14.24 5.66 8.73 14.65 33.89 19.26 7.07
Sro63_g035780.1 (Contig2778.g22343)
0.09 1.64 1.61 0.99 0.49 3.95 11.3 5.38 3.71 6.63 8.54 8.81 14.16 3.78 8.08 11.67 6.64 8.96 4.15 10.37 8.85 4.99 2.16 12.91 12.37 7.99 7.46
Sro67_g037630.1 (Contig495.g6679)
0.25 11.73 11.54 15.17 15.61 6.42 27.69 27.39 12.79 18.09 20.74 18.38 18.93 18.67 23.23 28.94 16.75 23.79 13.68 22.23 17.64 26.36 10.89 41.67 75.05 42.11 15.39
Sro706_g190410.1 (Contig127.g1437)
0.61 4.02 3.58 3.16 3.57 2.73 7.4 6.2 7.86 9.12 9.7 13.74 15.31 8.92 9.35 12.52 8.93 7.38 9.45 14.14 11.95 5.26 5.23 10.81 16.33 8.74 6.22
Sro712_g191460.1 (Contig2484.g20351)
0.0 0.0 0.53 0.1 0.14 0.15 3.24 2.26 3.1 2.21 1.9 1.44 13.75 4.31 3.64 1.44 1.12 0.95 1.24 14.42 4.11 3.88 0.95 4.27 14.48 3.52 1.72
Sro759_g198190.1 (Contig608.g7519)
0.34 1.18 0.56 0.45 0.52 0.33 5.06 2.08 1.03 4.99 6.1 4.82 4.33 5.4 5.95 6.75 3.23 4.61 2.69 10.33 7.84 2.61 0.95 5.93 6.84 3.08 4.73
Sro761_g198590.1 (Contig3384.g26468)
0.17 20.76 14.47 16.7 17.07 17.38 21.99 23.51 27.42 17.94 17.84 21.96 10.79 15.75 20.81 24.7 15.18 7.11 7.87 9.19 19.71 16.68 18.83 25.84 36.23 28.67 17.7
Sro770_g199990.1 (Contig300.g3964)
0.26 0.25 0.15 0.1 0.1 0.33 1.97 1.05 0.27 3.13 1.4 3.0 5.4 2.72 3.3 7.99 2.45 4.79 1.63 6.61 4.11 1.59 0.36 4.84 6.7 3.47 1.77
Sro808_g205510.1 (Contig630.g7660)
1.16 7.75 8.1 16.87 13.8 3.51 17.0 12.07 7.95 10.15 16.16 8.73 19.94 5.47 22.02 44.82 7.88 17.76 16.64 17.82 15.0 8.38 7.41 37.62 68.02 25.07 8.01
Sro809_g205520.1 (Contig3027.g24115)
0.42 2.78 1.65 1.16 0.72 3.45 7.4 4.46 2.34 7.2 6.29 8.06 6.81 5.04 8.63 8.36 5.79 13.71 6.38 6.85 8.49 3.99 2.99 7.29 6.25 3.57 5.52
Sro867_g213140.1 (Contig3090.g24644)
0.13 0.31 0.27 0.04 0.0 2.85 5.15 2.05 0.89 4.88 1.29 4.91 5.02 5.97 2.11 1.03 0.74 3.25 2.88 6.48 7.43 1.83 0.69 3.95 6.26 6.72 2.35
Sro900_g217780.1 (Contig2813.g22556)
0.0 0.4 0.47 0.23 0.21 0.22 1.87 0.79 1.15 1.74 1.18 0.56 10.34 2.92 1.89 1.59 2.06 1.19 0.24 14.04 4.63 2.19 0.9 2.84 12.71 3.88 1.0
Sro901_g218050.1 (Contig2989.g23749)
1.21 13.49 14.64 12.56 14.92 12.8 80.15 47.36 40.28 48.31 40.09 66.95 50.0 47.67 46.08 34.97 30.99 32.99 19.4 53.01 77.85 26.35 51.89 80.13 169.2 47.72 26.43
Sro92_g048040.1 (Contig486.g6564)
3.83 0.71 2.01 1.52 1.47 1.83 12.38 6.98 2.72 5.29 12.72 2.96 11.43 3.3 15.04 20.74 3.32 6.01 1.8 8.12 9.12 5.69 1.87 31.03 51.47 17.71 6.44
Sro938_g222270.1 (Contig3860.g29708)
0.26 2.06 1.6 1.9 1.24 1.37 7.5 3.93 5.21 6.53 6.14 5.71 17.57 4.2 7.8 12.77 5.53 6.23 6.35 18.03 13.63 6.13 2.99 14.39 30.71 10.14 4.73
Sro959_g224820.1 (Contig3743.g28698)
0.0 0.15 0.06 0.08 0.0 0.23 3.06 1.86 0.87 1.99 1.95 2.94 1.3 0.75 2.53 3.46 0.98 1.87 0.66 1.14 2.72 1.38 0.47 3.79 5.68 1.58 1.38

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)