Heatmap: Cluster_121 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1046_g235000.1 (Contig1884.g16421)	0.02	1.0	0.72	0.42	0.74	0.16	0.13	0.29	0.34	0.25	0.44	0.25	0.21	0.11	0.33	0.45	0.37	0.21	0.14	0.23	0.19	0.29	0.19	0.08	0.11	0.13	0.34
Sro104_g052700.1 (Contig1278.g11913)	0.0	0.48	0.98	0.8	0.84	0.28	0.55	1.0	0.76	0.43	0.3	0.46	0.84	0.54	0.43	0.47	0.4	0.61	0.31	0.55	0.54	0.7	0.8	0.3	0.34	0.34	0.44
Sro1113_g242680.1 (Contig761.g8642)	0.05	1.0	0.73	0.49	0.78	0.19	0.44	0.54	0.47	0.38	0.47	0.51	0.15	0.23	0.4	0.51	0.35	0.28	0.35	0.27	0.39	0.39	0.5	0.29	0.35	0.25	0.35
Sro1146_g246330.1 (Contig2727.g21994)	0.04	1.0	0.93	0.65	0.83	0.09	0.52	0.9	0.8	0.19	0.17	0.12	0.19	0.15	0.2	0.22	0.27	0.25	0.13	0.29	0.09	0.86	0.47	0.04	0.02	0.08	0.19
Sro11_g008460.1 (Contig724.g8320)	0.19	1.0	0.75	0.3	0.42	0.03	0.06	0.4	0.39	0.07	0.02	0.07	0.06	0.0	0.02	0.04	0.0	0.39	0.19	0.13	0.04	0.21	0.16	0.01	0.04	0.01	0.03
Sro121_g058780.1 (Contig1619.g14632)	0.03	1.0	0.77	0.41	0.59	0.06	0.19	0.41	0.36	0.15	0.16	0.13	0.03	0.07	0.12	0.11	0.1	0.09	0.1	0.03	0.07	0.29	0.26	0.12	0.08	0.05	0.1
Sro1270_g257960.1 (Contig750.g8559)	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.07	1.0	0.59	0.13	0.12	0.02	0.03	0.01	0.29	0.16	0.02	0.06	0.26	0.19	0.1	0.4	0.12	0.0	0.01	0.0	0.6
Sro1310_g261710.1 (Contig1983.g16985)	0.01	1.0	0.34	0.21	0.3	0.05	0.1	0.17	0.17	0.07	0.02	0.07	0.06	0.01	0.04	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.04	0.03	0.24	0.02	0.01	0.02	0.03
Sro138_g064660.1 (Contig2021.g17288)	0.0	1.0	0.56	0.51	0.86	0.18	0.22	0.57	0.54	0.21	0.34	0.09	0.24	0.04	0.34	0.39	0.16	0.1	0.09	0.16	0.05	0.04	0.23	0.15	0.09	0.12	0.31
Sro138_g064700.1 (Contig2021.g17292)	0.15	1.0	0.95	0.57	0.68	0.14	0.23	0.55	0.45	0.25	0.15	0.23	0.2	0.08	0.14	0.07	0.1	0.23	0.15	0.2	0.22	0.21	0.18	0.29	0.24	0.16	0.12
Sro1438_g272660.1 (Contig3435.g26745)	0.06	0.92	1.0	0.73	0.87	0.07	0.27	0.48	0.55	0.25	0.15	0.2	0.37	0.18	0.15	0.11	0.14	0.44	0.26	0.46	0.26	0.3	0.39	0.18	0.39	0.38	0.16
Sro1491_g277100.1 (Contig3009.g24027)	0.02	1.0	0.88	0.45	0.63	0.05	0.32	0.5	0.42	0.14	0.16	0.14	0.15	0.06	0.13	0.16	0.1	0.31	0.16	0.19	0.09	0.26	0.31	0.14	0.17	0.09	0.11
Sro1501_g277890.1 (Contig2462.g20152)	0.01	0.24	0.22	0.14	0.13	0.1	0.16	0.67	0.8	0.13	0.11	0.17	0.35	0.05	0.1	0.03	0.24	1.0	0.44	0.39	0.14	0.3	0.47	0.09	0.14	0.21	0.07
Sro1524_g279600.1 (Contig122.g1373)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1554_g282020.1 (Contig1398.g12859)	0.25	0.89	0.45	0.28	0.43	0.12	0.25	1.0	0.7	0.18	0.19	0.12	0.2	0.18	0.25	0.26	0.19	0.43	0.17	0.25	0.14	0.72	0.4	0.05	0.11	0.14	0.19
Sro16_g011860.1 (Contig916.g9623)	0.02	1.0	0.83	0.48	0.72	0.05	0.1	0.15	0.41	0.18	0.1	0.25	0.07	0.08	0.04	0.03	0.1	0.15	0.11	0.05	0.11	0.13	0.02	0.07	0.08	0.07	0.08
Sro170_g075470.1 (Contig2525.g20620)	0.03	0.69	0.68	1.0	0.56	0.0	0.01	0.3	0.27	0.04	0.01	0.03	0.04	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.05	0.06	0.01	0.01	0.08	0.02
Sro1739_g294580.1 (Contig2001.g17139)	0.14	0.95	0.8	0.53	0.77	0.13	0.57	0.98	1.0	0.28	0.28	0.34	0.5	0.22	0.25	0.25	0.27	0.52	0.26	0.4	0.27	0.66	0.76	0.18	0.11	0.12	0.27
Sro1759_g295810.1 (Contig1689.g15130)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1805_g298760.1 (Contig1266.g11820)	0.2	0.83	0.77	1.0	0.94	0.05	0.06	0.36	0.53	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.27	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01
Sro191_g082110.1 (Contig2614.g21204)	0.01	1.0	0.86	0.72	0.69	0.08	0.17	0.57	0.45	0.13	0.14	0.07	0.05	0.06	0.11	0.07	0.23	0.12	0.12	0.07	0.07	0.46	0.32	0.07	0.05	0.09	0.1
Sro1938_g306540.1 (Contig3016.g24077)	0.04	0.09	0.03	0.0	0.06	0.57	0.05	1.0	0.83	0.16	0.52	0.28	0.02	0.09	0.14	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.26	0.04	0.02	0.12	0.17	0.05	0.85
Sro1960_g308070.1 (Contig1426.g13174)	0.06	0.3	0.89	0.31	0.28	0.01	0.6	0.68	1.0	0.36	0.21	0.54	0.06	0.17	0.12	0.08	0.13	0.06	0.08	0.14	0.25	0.45	0.36	0.22	0.21	0.16	0.09
Sro214_g088820.1 (Contig282.g3667)	0.06	1.0	0.93	0.42	0.65	0.03	0.23	0.42	0.3	0.11	0.05	0.12	0.01	0.06	0.09	0.07	0.06	0.08	0.02	0.01	0.09	0.12	0.29	0.1	0.12	0.06	0.05
Sro2166_g317280.1 (Contig1985.g16988)	0.1	0.36	0.38	0.26	0.31	0.53	0.49	0.87	1.0	0.38	0.41	0.46	0.2	0.22	0.37	0.33	0.38	0.27	0.33	0.37	0.44	0.37	0.38	0.28	0.31	0.32	0.28
Sro2197_g318670.1 (Contig1089.g10538)	0.05	0.78	1.0	0.75	0.75	0.18	0.22	0.39	0.48	0.26	0.26	0.26	0.21	0.14	0.18	0.26	0.2	0.3	0.47	0.26	0.21	0.39	0.17	0.21	0.2	0.21	0.3
Sro222_g091160.1 (Contig3134.g24879)	0.14	1.0	0.61	0.58	0.64	0.12	0.27	0.55	0.75	0.28	0.25	0.32	0.27	0.23	0.29	0.26	0.26	0.3	0.23	0.3	0.3	0.38	0.45	0.19	0.23	0.27	0.18
Sro227_g092180.1 (Contig327.g4330)	0.01	0.67	1.0	0.7	0.69	0.01	0.15	0.22	0.4	0.2	0.04	0.19	0.2	0.02	0.09	0.1	0.0	0.16	0.44	0.19	0.31	0.42	0.17	0.06	0.11	0.09	0.03
Sro2386_g325770.1 (Contig2766.g22279)	0.01	0.99	0.74	0.44	0.6	0.11	0.42	1.0	0.88	0.22	0.25	0.12	0.26	0.15	0.23	0.23	0.2	0.43	0.27	0.24	0.22	0.65	0.52	0.07	0.08	0.1	0.22
Sro2419_g327040.1 (Contig1625.g14662)	0.04	0.75	1.0	0.63	0.76	0.05	0.13	0.39	0.46	0.14	0.11	0.13	0.24	0.11	0.09	0.07	0.06	0.21	0.14	0.26	0.11	0.23	0.2	0.07	0.13	0.19	0.06
Sro276_g105940.1 (Contig2556.g20774)	0.0	0.46	0.4	1.0	0.21	0.0	0.0	0.13	0.16	0.04	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01
Sro3018_g342170.3	0.1	1.0	0.69	0.5	0.59	0.0	0.43	0.19	0.36	0.14	0.06	0.08	0.01	0.02	0.14	0.1	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.12	0.42	0.13	0.2	0.04	0.07
Sro3018_g342170.4	0.3	0.92	0.87	0.69	0.93	0.07	0.59	0.99	1.0	0.29	0.26	0.39	0.07	0.11	0.27	0.32	0.13	0.4	0.12	0.12	0.43	0.59	0.68	0.25	0.29	0.23	0.21
Sro315_g115350.1 (Contig447.g6058)	0.0	1.0	0.86	0.66	0.26	0.51	0.11	0.34	0.13	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.14	0.05	0.0	0.0	0.0
Sro357_g125690.1 (Contig708.g8197)	0.09	1.0	0.73	0.74	0.72	0.18	0.25	0.59	0.7	0.23	0.26	0.19	0.43	0.11	0.22	0.25	0.27	0.69	0.37	0.29	0.2	0.45	0.37	0.13	0.28	0.27	0.19
Sro3614_g349690.1 (Contig1241.g11616)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro362_g126770.1 (Contig50.g359)	0.01	0.85	0.68	0.33	0.71	0.03	0.29	0.62	0.73	0.21	0.16	0.17	0.39	0.12	0.13	0.17	0.15	1.0	0.43	0.36	0.19	0.28	0.33	0.08	0.15	0.09	0.11
Sro377_g130140.1 (Contig75.g817)	0.04	0.98	1.0	0.71	1.0	0.05	0.15	0.4	0.53	0.33	0.18	0.53	0.03	0.07	0.13	0.17	0.16	0.21	0.17	0.06	0.5	0.28	0.21	0.25	0.27	0.31	0.14
Sro394_g133950.1 (Contig4153.g31725)	0.69	1.0	0.84	0.55	0.73	0.11	0.43	0.7	0.66	0.34	0.35	0.32	0.35	0.22	0.34	0.41	0.33	0.63	0.33	0.33	0.32	0.41	0.55	0.19	0.2	0.16	0.34
Sro3991_g352370.1 (Contig4148.g31667)	0.01	1.0	0.32	0.23	0.43	0.01	0.07	0.13	0.18	0.13	0.02	0.13	0.05	0.13	0.06	0.01	0.0	0.05	0.03	0.08	0.08	0.1	0.15	0.04	0.0	0.0	0.01
Sro402_g135420.1 (Contig305.g4003)	0.03	1.0	0.56	0.52	0.65	0.11	0.22	0.51	0.4	0.26	0.31	0.26	0.24	0.17	0.2	0.23	0.24	0.15	0.21	0.29	0.2	0.31	0.21	0.18	0.23	0.2	0.21
Sro414_g138340.1 (Contig453.g6109)	0.0	1.0	0.56	0.43	0.53	0.03	0.1	0.42	0.53	0.11	0.06	0.06	0.08	0.04	0.03	0.03	0.04	0.31	0.43	0.1	0.08	0.25	0.29	0.07	0.18	0.15	0.05
Sro42_g025470.1 (Contig312.g4124)	0.03	0.64	0.46	0.58	0.59	0.16	0.16	1.0	0.99	0.21	0.09	0.12	0.4	0.4	0.13	0.06	0.31	0.2	0.31	0.27	0.11	0.26	0.56	0.1	0.11	0.12	0.06
Sro43_g026110.1 (Contig2453.g20077)	0.36	0.96	0.73	0.76	0.98	0.11	0.35	0.82	0.87	0.27	0.28	0.17	0.38	0.15	0.25	0.35	0.32	1.0	0.45	0.32	0.16	0.55	0.46	0.27	0.24	0.19	0.28
Sro45_g026980.1 (Contig2311.g19080)	0.04	1.0	0.62	0.42	0.47	0.03	0.06	0.24	0.17	0.15	0.05	0.13	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.17	0.3	0.12	0.08	0.29	0.16	0.05	0.07	0.2	0.07
Sro481_g151670.1 (Contig3107.g24725)	0.0	0.67	1.0	0.44	0.5	0.46	0.06	0.35	0.19	0.27	0.42	0.12	0.14	0.22	0.31	0.35	0.45	0.11	0.16	0.29	0.21	0.37	0.05	0.07	0.02	0.25	0.24
Sro483_g152160.1 (Contig4159.g31768)	0.09	0.4	0.37	0.48	0.46	0.03	0.29	0.46	0.71	0.22	0.2	0.18	0.34	0.11	0.14	0.18	0.29	1.0	0.52	0.47	0.31	0.36	0.31	0.09	0.13	0.18	0.15
Sro524_g160040.1 (Contig202.g2401)	0.27	1.0	0.74	0.37	0.52	0.06	0.36	0.68	0.65	0.25	0.22	0.19	0.27	0.18	0.24	0.21	0.23	0.41	0.26	0.36	0.14	0.6	0.45	0.08	0.08	0.13	0.23
Sro538_g162520.1 (Contig95.g1093)	0.01	0.31	0.11	1.0	0.17	0.01	0.02	0.08	0.14	0.07	0.04	0.04	0.0	0.01	0.03	0.08	0.07	0.0	0.05	0.01	0.09	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.09
Sro594_g172490.1 (Contig3536.g27343)	0.04	0.88	0.57	0.85	0.94	0.21	0.15	0.95	1.0	0.22	0.29	0.13	0.25	0.22	0.36	0.29	0.45	0.97	0.34	0.17	0.21	0.72	0.56	0.15	0.15	0.2	0.23
Sro618_g176300.1 (Contig3757.g28823)	0.21	0.88	1.0	0.87	0.89	0.02	0.23	0.78	0.85	0.09	0.1	0.01	0.02	0.0	0.06	0.1	0.07	0.05	0.03	0.03	0.01	0.4	0.16	0.14	0.08	0.06	0.17
Sro665_g183870.1 (Contig1678.g15080)	0.05	0.71	1.0	0.89	0.71	0.28	0.4	0.7	0.55	0.33	0.4	0.35	0.87	0.31	0.41	0.4	0.32	0.36	0.38	0.53	0.3	0.39	0.51	0.37	0.24	0.22	0.38
Sro669_g184460.1 (Contig2091.g17818)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro818_g206930.1 (Contig3760.g28839)	0.0	0.64	1.0	0.51	0.61	0.09	0.22	0.62	0.28	0.27	0.27	0.23	0.47	0.22	0.34	0.34	0.21	0.52	0.36	0.33	0.27	0.11	0.27	0.12	0.15	0.33	0.28
Sro876_g214490.1 (Contig165.g1864)	0.86	0.32	0.35	0.18	0.27	0.01	0.51	0.82	1.0	0.22	0.05	0.43	0.05	0.06	0.1	0.05	0.04	0.02	0.02	0.11	0.14	0.21	0.78	0.03	0.07	0.05	0.05
Sro884_mit_g215760.1 (Atp9-fragment)	0.0	0.21	0.0	1.0	0.11	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro919_g220160.1 (Contig2964.g23553)	0.47	0.46	0.67	1.0	0.21	0.05	0.07	0.38	0.62	0.1	0.01	0.07	0.12	0.1	0.09	0.02	0.01	0.04	0.07	0.09	0.09	0.16	0.08	0.09	0.01	0.03	0.03
Sro933_g221740.1 (Contig254.g3128)	0.09	1.0	0.61	0.16	0.24	0.03	0.19	0.15	0.21	0.21	0.08	0.18	0.18	0.27	0.11	0.12	0.09	0.16	0.15	0.36	0.17	0.14	0.31	0.1	0.15	0.15	0.1
Sro95_g049190.1 (Contig45.g304)	0.56	0.93	1.0	0.8	0.8	0.23	0.51	0.91	0.94	0.51	0.5	0.67	0.42	0.33	0.45	0.55	0.35	0.82	0.64	0.42	0.47	0.66	0.74	0.55	0.3	0.3	0.41
Sro95_g049200.1 (Contig45.g305)	0.38	0.51	0.57	0.57	0.53	0.22	0.58	0.92	1.0	0.39	0.38	0.5	0.48	0.31	0.38	0.37	0.29	0.6	0.5	0.4	0.48	0.52	0.71	0.54	0.24	0.3	0.32
Sro998_g229580.1 (Contig4084.g31265)	0.53	1.0	0.94	0.59	0.72	0.47	0.3	0.59	0.54	0.33	0.37	0.21	0.05	0.14	0.3	0.16	0.49	0.13	0.19	0.27	0.23	0.34	0.31	0.46	0.19	0.13	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)