Heatmap: Cluster_272 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1015_g231500.1 (Contig1632.g14687)	0.1	0.51	1.0	0.36	0.2	0.17	0.17	0.17	0.25	0.23	0.15	0.22	0.44	0.21	0.16	0.07	0.33	0.32	0.46	0.37	0.12	0.77	0.38	0.15	0.09	0.22	0.14
Sro1036_g233980.1 (Contig614.g7564)	0.01	0.48	1.0	0.31	0.32	0.02	0.03	0.03	0.0	0.2	0.12	0.0	0.15	0.04	0.34	0.23	0.07	0.08	0.25	0.03	0.08	0.76	0.19	0.5	0.13	0.05	0.07
Sro1067_g237390.1 (Contig2309.g19054)	0.93	0.2	0.23	0.06	0.04	0.04	0.28	0.47	0.27	0.3	0.12	0.57	0.3	0.21	0.12	0.08	0.08	0.12	0.35	0.16	0.36	1.0	0.38	0.19	0.13	0.11	0.1
Sro1106_g242010.1 (Contig673.g7896)	0.3	0.75	0.37	0.2	0.39	0.54	0.41	0.23	0.64	0.37	0.37	0.42	0.36	0.29	0.38	0.23	0.53	0.24	0.54	0.28	0.29	1.0	0.6	0.54	0.45	0.35	0.28
Sro1281_g258940.1 (Contig268.g3379)	0.0	0.54	1.0	0.32	0.33	0.08	0.12	0.07	0.39	0.14	0.11	0.13	0.24	0.05	0.11	0.01	0.19	0.15	0.25	0.14	0.31	0.69	0.27	0.06	0.05	0.16	0.08
Sro1290_g259740.1 (Contig199.g2313)	0.11	0.66	0.83	0.71	0.28	0.41	0.16	0.16	0.62	0.37	0.23	0.09	0.2	0.23	0.22	0.26	0.33	0.1	0.11	0.3	0.35	1.0	0.8	0.33	0.28	0.51	0.17
Sro144_g066910.1 (Contig3873.g29790)	0.01	0.53	0.95	0.44	0.31	0.1	0.3	0.29	0.41	0.29	0.18	0.19	0.61	0.27	0.18	0.15	0.22	0.46	0.6	0.56	0.32	1.0	0.31	0.19	0.1	0.18	0.14
Sro1475_g275830.1 (Contig4476.g33631)	0.0	0.45	1.0	0.29	0.24	0.06	0.16	0.25	0.46	0.12	0.05	0.1	0.1	0.02	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.05	0.07	0.67	0.44	0.12	0.05	0.05	0.03
Sro153_g069800.1 (Contig466.g6260)	0.14	0.83	0.89	0.31	0.37	0.0	0.01	0.41	1.0	0.16	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.03	0.0	0.09	0.17	0.03	0.02	0.86	0.61	0.15	0.13	0.12	0.01
Sro157_g071410.1 (Contig2362.g19431)	0.01	0.9	1.0	0.6	0.83	0.0	0.23	0.41	0.37	0.15	0.06	0.05	0.1	0.05	0.03	0.03	0.0	0.02	0.06	0.11	0.11	0.58	0.47	0.04	0.05	0.02	0.01
Sro1624_g286700.1 (Contig3628.g28050)	0.01	1.0	0.8	0.47	0.57	0.19	0.12	0.31	0.19	0.17	0.16	0.14	0.14	0.2	0.14	0.17	0.14	0.06	0.19	0.14	0.15	0.75	0.13	0.12	0.14	0.15	0.13
Sro1719_g293430.1 (Contig4364.g32875)	0.04	0.54	0.51	0.38	0.44	0.03	0.48	0.58	1.0	0.25	0.04	0.12	0.15	0.05	0.15	0.12	0.02	0.16	0.62	0.07	0.23	0.85	0.57	0.54	0.35	0.28	0.07
Sro1856_g302010.1 (Contig4465.g33555)	0.7	0.69	1.0	0.57	0.62	0.04	0.2	0.09	0.44	0.21	0.08	0.12	0.14	0.2	0.13	0.11	0.11	0.06	0.28	0.12	0.1	0.96	0.45	0.24	0.17	0.1	0.06
Sro2068_g313320.1 (Contig541.g6986)	0.0	1.0	0.9	0.41	0.59	0.0	0.0	0.1	0.0	0.13	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.71	0.79	0.0	0.43	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro211_g087820.1 (Contig2667.g21574)	0.01	0.79	0.89	0.54	0.56	0.15	0.18	0.26	0.63	0.27	0.29	0.26	0.4	0.3	0.31	0.14	0.31	0.49	0.48	0.33	0.24	1.0	0.51	0.36	0.36	0.19	0.16
Sro211_g087830.2	0.0	0.87	0.85	0.48	0.69	0.2	0.38	1.0	0.87	0.38	0.23	0.38	0.46	0.46	0.38	0.3	0.42	0.85	0.58	0.4	0.32	0.79	0.78	0.67	0.37	0.3	0.26
Sro2196_g318610.1 (Contig767.g8688)	0.02	0.52	1.0	0.62	0.49	0.16	0.29	0.15	0.32	0.29	0.14	0.24	0.28	0.34	0.23	0.06	0.13	0.12	0.26	0.32	0.28	0.74	0.47	0.57	0.49	0.45	0.15
Sro233_g094200.1 (Contig310.g4081)	0.0	0.56	0.82	0.39	0.56	0.13	0.48	0.97	0.69	0.22	0.23	0.07	0.29	0.25	0.34	0.46	0.21	0.07	0.12	0.03	0.07	0.8	0.81	1.0	0.37	0.1	0.2
Sro2419_g327110.1 (Contig1625.g14669)	0.0	0.28	0.21	0.23	0.19	0.0	0.12	0.22	0.84	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.28	0.26	0.17	0.03	0.0
Sro241_g096360.1 (Contig4317.g32554)	0.04	1.0	0.73	0.54	0.5	0.14	0.32	0.27	0.32	0.3	0.17	0.17	0.33	0.2	0.17	0.06	0.18	0.46	0.8	0.37	0.17	0.88	0.33	0.41	0.3	0.27	0.08
Sro275_g105680.1 (Contig3464.g26870)	0.01	0.75	1.0	0.26	0.3	0.05	0.15	0.15	0.2	0.18	0.15	0.12	0.17	0.03	0.14	0.11	0.11	0.11	0.23	0.26	0.13	0.48	0.23	0.12	0.12	0.1	0.1
Sro2829_g338080.1 (Contig18.g142)	0.0	0.81	0.81	0.3	0.38	0.01	0.05	0.1	0.6	0.14	0.0	0.0	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	0.0	1.0	0.42	0.22	0.1	0.0	0.01
Sro283_g107670.1 (Contig4255.g32198)	0.05	0.84	1.0	0.56	0.51	0.11	0.3	0.36	0.65	0.26	0.29	0.22	0.22	0.16	0.3	0.33	0.36	0.17	0.18	0.21	0.22	0.89	0.46	0.16	0.07	0.07	0.24
Sro2853_g338650.1 (Contig1140.g10942)	0.37	0.79	0.62	0.25	0.43	0.24	0.4	0.24	0.77	0.47	0.37	0.34	0.28	0.33	0.37	0.23	0.65	0.12	0.62	0.21	0.26	1.0	0.78	0.5	0.41	0.36	0.31
Sro309_g113890.1 (Contig3477.g26979)	0.0	0.43	1.0	0.37	0.28	0.0	0.0	0.27	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.57	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro315_g115270.1 (Contig447.g6050)	0.0	0.68	1.0	0.57	0.51	0.06	0.36	0.61	0.72	0.18	0.15	0.18	0.19	0.12	0.18	0.19	0.13	0.4	0.24	0.16	0.21	0.83	0.63	0.24	0.29	0.19	0.15
Sro3233_g345690.1 (Contig2864.g22961)	1.0	0.31	0.28	0.13	0.14	0.08	0.09	0.06	0.18	0.14	0.1	0.12	0.16	0.08	0.12	0.06	0.12	0.12	0.16	0.12	0.13	0.29	0.22	0.14	0.08	0.14	0.07
Sro327_g118360.1 (Contig839.g9244)	0.0	0.5	0.39	0.18	0.24	0.07	0.14	0.11	0.18	0.13	0.08	0.04	0.1	0.04	0.18	0.06	0.05	0.07	0.07	0.04	0.05	1.0	0.19	0.35	0.12	0.11	0.06
Sro35_g022270.1 (Contig3323.g26104)	0.0	0.94	0.97	0.51	0.71	0.19	0.21	0.96	0.98	0.2	0.17	0.27	0.18	0.4	0.17	0.09	0.2	0.15	0.3	0.05	0.12	1.0	0.8	0.28	0.04	0.11	0.11
Sro364_g127140.1 (Contig2146.g18065)	0.01	1.0	0.82	0.39	0.36	0.21	0.11	0.13	0.14	0.2	0.11	0.11	0.25	0.21	0.14	0.06	0.26	0.42	0.55	0.35	0.09	0.48	0.25	0.14	0.05	0.24	0.14
Sro3683_g350240.1 (Contig1808.g15945)	0.0	0.69	1.0	0.42	0.59	0.0	0.15	0.17	0.25	0.08	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.15	0.28	0.0	0.45	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro41_g025010.1 (Contig169.g1907)	0.01	0.8	1.0	0.57	0.57	0.05	0.11	0.15	0.37	0.27	0.21	0.32	0.09	0.24	0.15	0.08	0.15	0.09	0.36	0.27	0.14	0.92	0.49	0.12	0.12	0.21	0.17
Sro421_g139540.1 (Contig1157.g11067)	0.01	0.37	1.0	0.23	0.16	0.09	0.05	0.11	0.22	0.1	0.02	0.09	0.21	0.25	0.05	0.01	0.09	0.07	0.09	0.11	0.05	0.36	0.21	0.19	0.09	0.04	0.03
Sro446_g144720.1 (Contig1578.g14341)	1.0	0.44	0.76	0.44	0.29	0.1	0.13	0.11	0.25	0.34	0.26	0.38	0.22	0.42	0.24	0.28	0.19	0.08	0.34	0.2	0.31	0.74	0.39	0.73	0.41	0.28	0.19
Sro451_g145670.1 (Contig1599.g14511)	0.05	0.89	0.99	0.36	0.41	0.09	0.07	0.03	0.17	0.31	0.05	0.16	0.24	0.3	0.17	0.01	0.04	0.15	0.65	0.03	0.14	1.0	0.36	0.44	0.24	0.03	0.06
Sro482_g151910.1 (Contig232.g2801)	0.0	0.66	1.0	0.44	0.69	0.05	0.19	0.2	0.33	0.27	0.34	0.18	0.31	0.1	0.22	0.08	0.17	0.05	0.21	0.36	0.31	0.74	0.28	0.3	0.57	0.39	0.2
Sro50_g029070.1 (Contig297.g3895)	0.01	0.32	1.0	0.31	0.34	0.03	0.11	0.44	0.35	0.24	0.09	0.28	0.36	0.27	0.16	0.2	0.13	0.11	0.16	0.35	0.25	0.94	0.21	0.14	0.33	0.15	0.1
Sro511_g157540.1 (Contig3003.g23895)	0.0	0.66	1.0	0.69	0.81	0.12	0.43	0.68	0.88	0.26	0.1	0.3	0.46	0.31	0.26	0.2	0.19	0.59	0.38	0.1	0.11	0.38	0.49	0.2	0.12	0.15	0.14
Sro547_g164220.1 (Contig2126.g17950)	0.01	0.84	1.0	0.9	0.79	0.14	0.21	0.72	0.73	0.41	0.92	0.41	0.82	0.32	0.54	0.42	0.66	0.81	0.8	0.71	0.26	0.83	0.66	0.33	0.29	0.3	0.48
Sro548_g164430.1 (Contig1714.g15323)	0.01	0.81	1.0	0.63	0.95	0.24	0.3	0.69	0.79	0.35	0.25	0.52	0.16	0.44	0.24	0.22	0.29	0.31	0.47	0.04	0.13	1.0	0.75	0.69	0.36	0.23	0.19
Sro559_g166390.1 (Contig536.g6955)	0.0	0.6	1.0	0.63	0.36	0.05	0.2	0.23	0.23	0.14	0.17	0.12	0.31	0.13	0.22	0.17	0.17	0.15	0.12	0.2	0.1	0.51	0.22	0.17	0.16	0.12	0.08
Sro594_g172380.1 (Contig3536.g27332)	0.01	0.22	0.73	0.22	0.24	0.03	0.09	0.0	0.03	0.14	0.16	0.03	0.35	0.09	0.63	0.2	0.05	0.03	0.37	0.02	0.1	1.0	0.51	0.78	0.2	0.12	0.16
Sro626_g177730.1 (Contig1809.g15948)	0.0	0.49	1.0	0.44	0.5	0.0	0.09	0.4	0.34	0.14	0.0	0.05	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.02	0.93	0.34	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro644_g180440.1 (Contig3672.g28374)	0.02	0.57	1.0	0.35	0.26	0.01	0.08	0.41	0.15	0.2	0.07	0.13	0.15	0.07	0.09	0.06	0.03	0.05	0.17	0.17	0.28	0.32	0.21	0.28	0.39	0.35	0.03
Sro647_g180860.1 (Contig3562.g27502)	1.0	0.19	0.41	0.16	0.18	0.06	0.08	0.09	0.2	0.16	0.08	0.14	0.18	0.15	0.09	0.03	0.08	0.11	0.26	0.17	0.14	0.65	0.32	0.2	0.11	0.1	0.04
Sro68_g038080.1 (Contig2027.g17389)	0.0	0.51	1.0	0.55	0.29	0.0	0.14	0.06	0.13	0.05	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.35	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro732_g194430.1 (Contig2721.g21952)	0.02	0.72	1.0	0.8	0.87	0.05	0.28	0.2	0.29	0.14	0.16	0.04	0.17	0.08	0.16	0.08	0.11	0.06	0.17	0.08	0.08	0.55	0.35	0.21	0.2	0.12	0.07
Sro796_g203640.1 (Contig2034.g17462)	0.0	0.66	0.66	0.55	0.63	0.11	0.42	0.53	0.85	0.17	0.07	0.14	0.13	0.1	0.08	0.04	0.09	0.04	0.12	0.07	0.06	1.0	0.56	0.27	0.14	0.07	0.07
Sro7_g006120.1 (Contig389.g5265)	0.0	0.54	1.0	0.27	0.21	0.07	0.12	0.1	0.14	0.17	0.11	0.09	0.07	0.1	0.14	0.07	0.14	0.08	0.1	0.07	0.14	0.54	0.11	0.2	0.3	0.14	0.1
Sro7_g006190.2	0.0	0.51	1.0	0.31	0.19	0.04	0.08	0.06	0.09	0.08	0.1	0.04	0.04	0.15	0.08	0.07	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.3	0.14	0.32	0.09	0.03	0.04
Sro808_g205450.1 (Contig630.g7654)	0.01	0.9	1.0	0.73	0.64	0.1	0.21	0.73	0.62	0.35	0.19	0.31	0.52	0.39	0.3	0.23	0.21	0.3	0.4	0.67	0.33	0.79	0.42	0.34	0.25	0.21	0.26
Sro84_g044820.1 (Contig220.g2615)	0.0	0.58	1.0	0.59	0.56	0.25	0.26	0.36	0.17	0.22	0.11	0.21	0.19	0.16	0.18	0.13	0.11	0.08	0.13	0.16	0.27	0.74	0.34	0.15	0.16	0.13	0.12
Sro860_g212140.1 (Contig2239.g18596)	0.87	0.03	0.04	0.06	0.02	0.06	0.12	0.03	0.07	0.12	0.12	0.07	0.17	0.04	0.12	0.03	0.07	0.06	1.0	0.17	0.08	0.36	0.32	0.7	0.19	0.04	0.05
Sro873_g214050.1 (Contig3883.g29843)	0.03	0.56	1.0	0.45	0.37	0.27	0.2	0.28	0.44	0.34	0.44	0.33	0.73	0.44	0.46	0.29	0.48	0.6	0.77	0.71	0.34	0.77	0.63	0.28	0.32	0.36	0.29
Sro895_g217240.1 (Contig1937.g16666)	0.18	0.71	0.69	0.4	0.5	0.67	0.2	0.68	0.55	0.27	0.13	0.09	0.23	0.08	0.1	0.24	0.13	0.09	0.1	0.13	0.29	1.0	0.4	0.37	0.25	0.01	0.08
Sro91_g047560.1 (Contig190.g2207)	0.01	0.94	0.95	0.64	1.0	0.03	0.08	0.2	0.76	0.17	0.06	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.06	0.05	0.01	0.0	0.7	0.64	0.45	0.26	0.2	0.04
Sro94_g049130.1 (Contig150.g1703)	0.0	0.97	1.0	0.72	0.69	0.47	0.42	0.49	0.49	0.47	0.51	0.5	0.3	0.49	0.47	0.46	0.64	0.28	0.4	0.34	0.38	0.95	0.7	0.65	0.64	0.6	0.51
Sro970_g226360.1 (Contig1965.g16832)	0.02	0.67	1.0	0.7	0.58	0.11	0.27	0.17	0.24	0.2	0.1	0.16	0.23	0.24	0.1	0.1	0.09	0.07	0.13	0.17	0.19	0.61	0.3	0.15	0.29	0.13	0.1
Sro982_g227740.1 (Contig2831.g22685)	1.0	0.41	0.44	0.29	0.29	0.07	0.2	0.18	0.31	0.26	0.11	0.3	0.16	0.18	0.11	0.06	0.11	0.18	0.31	0.23	0.4	0.65	0.28	0.34	0.36	0.16	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)