Heatmap: Cluster_324 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1033_g233760.1 (Contig1396.g12850)
0.02 0.14 0.3 1.0 0.55 0.04 0.22 0.23 0.6 0.05 0.36 0.06 0.0 0.0 0.21 0.44 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.04 0.53 0.0 0.1 0.11 0.12
Sro1041_g234500.1 (Contig1456.g13335)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.08 0.49 0.13 0.0 0.0 0.22 0.18 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 1.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.24 0.0 0.08
0.0 0.0 0.09 0.14 0.12 0.0 0.56 0.2 1.0 0.05 0.02 0.08 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.12 0.1 0.02 0.09 0.02 0.2 0.11 0.46 0.24 0.01
Sro1047_g235100.1 (Contig1910.g16504)
0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.75 0.74 1.0 0.21 0.09 0.05 0.29 0.01 0.19 0.09 0.05 0.14 0.03 0.21 0.05 0.02 0.14 0.14 0.28 0.13 0.05
0.01 0.22 0.12 0.13 0.09 0.1 0.48 1.0 0.61 0.41 0.65 0.42 0.35 0.04 0.48 0.48 0.23 0.98 0.73 0.43 0.46 0.08 0.3 0.37 0.22 0.22 0.67
Sro106_g053570.1 (Contig1122.g10754)
0.02 0.04 0.02 0.01 0.02 0.05 0.96 0.57 1.0 0.33 0.36 0.27 0.74 0.16 0.45 0.4 0.22 0.56 0.24 0.64 0.37 0.04 0.25 0.53 0.65 0.5 0.22
Sro1086_g239670.1 (Contig2506.g20503)
0.0 0.21 1.0 0.69 0.7 0.0 0.43 0.12 0.53 0.1 0.07 0.06 0.41 0.22 0.06 0.1 0.02 0.15 0.18 0.26 0.08 0.07 0.21 0.2 0.47 0.14 0.04
Sro109_g054630.1 (Contig4753.g35245)
0.24 0.27 0.56 1.0 0.71 0.17 0.23 0.16 0.33 0.1 0.08 0.18 0.05 0.01 0.09 0.07 0.02 0.06 0.08 0.07 0.01 0.12 0.22 0.07 0.14 0.18 0.1
Sro1120_g243330.1 (Contig896.g9503)
0.0 0.74 0.9 0.9 0.76 0.01 0.88 0.82 1.0 0.06 0.01 0.03 0.03 0.06 0.07 0.04 0.01 0.28 0.02 0.03 0.04 0.37 0.59 0.0 0.0 0.01 0.02
Sro1122_g243510.1 (Contig3960.g30328)
0.01 0.18 0.16 0.07 0.08 0.42 1.0 0.75 0.53 0.35 0.25 0.3 0.15 0.23 0.39 0.23 0.14 0.31 0.23 0.23 0.53 0.07 0.31 0.66 0.71 0.46 0.39
Sro112_g055580.1 (Contig1575.g14283)
0.01 0.6 0.79 1.0 0.77 0.05 0.35 0.1 0.3 0.3 0.2 0.3 0.25 0.23 0.22 0.26 0.36 0.17 0.25 0.38 0.53 0.24 0.46 0.17 0.46 0.35 0.26
Sro1231_g254600.1 (Contig4451.g33436)
0.04 0.05 0.05 0.03 0.03 0.24 1.0 0.91 0.95 0.33 0.42 0.3 0.4 0.27 0.62 0.5 0.33 0.89 0.31 0.38 0.43 0.15 0.54 0.77 0.74 0.43 0.31
Sro12_g009100.1 (Contig2293.g18930)
0.06 0.16 0.13 0.07 0.07 0.19 0.33 0.6 0.38 0.28 0.83 0.23 0.49 0.05 0.6 0.87 0.39 0.2 0.16 0.37 0.34 0.1 0.19 0.83 1.0 0.41 0.45
0.01 0.17 0.78 0.8 0.5 0.34 0.33 0.26 1.0 0.09 0.22 0.04 0.42 0.1 0.2 0.19 0.46 0.23 0.12 0.15 0.02 0.24 0.74 0.05 0.03 0.48 0.25
Sro1313_g261990.1 (Contig4199.g31967)
0.0 0.18 0.51 0.32 0.19 0.07 0.47 0.64 0.37 0.2 0.29 0.06 1.0 0.11 0.5 0.37 0.26 0.78 0.68 0.66 0.23 0.42 0.82 0.25 0.23 0.21 0.31
Sro1366_g266710.1 (Contig4192.g31933)
0.33 0.29 0.31 0.3 0.1 0.09 0.36 1.0 0.82 0.38 0.39 0.24 0.65 0.17 0.19 0.17 0.19 0.52 0.48 0.69 0.15 0.46 0.49 0.07 0.01 0.12 0.23
Sro136_g064070.1 (Contig2000.g17118)
0.01 0.05 0.15 0.05 0.02 0.0 0.22 0.05 0.52 0.05 0.02 0.03 0.13 0.13 0.04 0.01 0.09 0.06 0.01 0.18 0.03 0.63 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0
Sro149_g068300.1 (Contig259.g3198)
0.0 0.37 1.0 0.92 0.64 0.05 0.11 0.05 0.37 0.05 0.07 0.02 0.1 0.05 0.09 0.02 0.08 0.05 0.02 0.11 0.0 0.04 0.16 0.07 0.11 0.14 0.03
Sro1660_g289330.1 (Contig4018.g30907)
0.15 0.38 0.22 0.2 0.2 0.15 0.68 1.0 0.66 0.39 0.43 0.38 0.24 0.2 0.48 0.51 0.24 0.52 0.33 0.34 0.36 0.13 0.26 0.52 0.42 0.26 0.39
Sro167_g074550.1 (Contig2973.g23636)
0.01 0.15 0.59 0.8 1.0 0.07 0.23 0.13 0.29 0.07 0.06 0.09 0.31 0.14 0.1 0.05 0.07 0.07 0.07 0.42 0.01 0.04 0.22 0.07 0.33 0.11 0.04
Sro181_g079150.1 (Contig4257.g32242)
0.01 0.29 0.25 0.25 0.31 0.22 1.0 0.79 0.96 0.29 0.27 0.33 0.25 0.08 0.24 0.27 0.44 0.16 0.19 0.31 0.39 0.36 0.64 0.19 0.11 0.16 0.23
Sro1878_g303110.1 (Contig3110.g24732)
0.0 0.12 0.11 1.0 0.84 0.0 0.19 0.0 0.68 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro191_g082230.1 (Contig2614.g21216)
0.03 0.78 0.5 0.6 0.69 0.28 0.7 0.74 0.62 0.6 0.81 0.75 0.55 0.5 0.65 0.5 0.61 0.94 1.0 0.75 0.79 0.4 0.55 0.59 0.46 0.39 0.55
Sro192_g082550.1 (Contig482.g6521)
0.0 0.7 1.0 0.72 0.27 0.0 0.07 0.05 0.3 0.05 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro195_g083250.1 (Contig4576.g34162)
0.03 0.28 0.4 0.38 0.33 0.17 0.47 0.37 0.62 0.29 0.57 0.2 1.0 0.33 0.53 0.63 0.53 0.72 0.58 0.74 0.3 0.25 0.6 0.23 0.21 0.22 0.46
Sro1960_g308030.1 (Contig1426.g13170)
0.01 0.16 0.23 0.34 0.33 0.13 0.85 0.49 1.0 0.13 0.28 0.08 0.0 0.07 0.21 0.07 0.4 0.0 0.0 0.0 0.2 0.31 0.79 0.06 0.11 0.17 0.11
Sro1992_g309840.1 (Contig129.g1453)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.69 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro19_g013550.1 (Contig446.g6019)
0.09 0.62 0.42 0.31 0.28 0.2 0.9 0.66 0.87 0.48 0.7 0.48 0.49 0.32 0.55 0.54 0.47 1.0 0.85 0.72 0.59 0.29 0.5 0.55 0.36 0.27 0.51
Sro205_g086370.1 (Contig2217.g18450)
0.02 0.31 0.75 0.42 0.21 0.15 0.33 0.55 0.21 0.23 0.59 0.31 0.26 0.21 0.42 0.36 0.37 0.27 0.2 0.22 0.17 0.01 0.05 1.0 0.26 0.11 0.33
Sro2192_g318420.1 (Contig3677.g28397)
0.0 0.54 0.86 1.0 0.69 0.2 0.72 0.44 0.81 0.16 0.26 0.04 0.92 0.25 0.4 0.44 0.41 0.7 0.22 0.67 0.08 0.24 0.54 0.25 0.28 0.3 0.35
Sro2235_g320190.1 (Contig1457.g13350)
0.0 0.95 0.53 0.41 0.38 0.05 0.76 0.26 1.0 0.07 0.01 0.01 0.29 0.1 0.03 0.01 0.11 0.16 0.02 0.07 0.11 0.17 0.6 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro2389_g325810.1 (Contig1021.g10190)
0.02 0.88 0.99 0.54 0.48 0.31 1.0 0.77 0.82 0.69 0.85 0.87 0.9 0.57 0.78 0.62 0.69 0.68 0.65 0.95 0.89 0.58 0.58 0.79 0.45 0.35 0.66
Sro23_g015550.1 (Contig2259.g18705)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.33 0.0 0.64 0.01 0.02 0.01 0.0 0.11 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2642_g333460.1 (Contig3242.g25616)
0.0 0.36 0.49 0.39 0.29 0.14 0.46 0.53 0.3 0.58 0.37 0.83 0.79 0.26 0.4 0.75 0.31 0.6 0.91 1.0 0.68 0.22 0.25 0.31 0.75 0.3 0.39
Sro2730_g335720.1 (Contig943.g9769)
0.09 0.07 0.09 0.02 0.05 0.0 0.43 0.84 1.0 0.06 0.01 0.05 0.24 0.01 0.01 0.0 0.02 0.12 0.06 0.51 0.02 0.11 0.53 0.02 0.01 0.01 0.01
Sro292_g109600.1 (Contig484.g6530)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro300_g111730.1 (Contig270.g3461)
0.0 0.57 0.96 1.0 0.51 0.06 0.54 0.11 0.96 0.13 0.2 0.11 0.33 0.02 0.08 0.02 0.2 0.5 0.65 0.19 0.04 0.15 0.58 0.05 0.16 0.36 0.05
Sro3146_g344430.1 (Contig4187.g31910)
0.02 0.49 0.37 0.54 0.53 0.09 0.38 0.22 0.79 0.08 0.04 0.03 0.08 0.15 0.24 0.03 0.09 0.24 0.05 0.05 0.02 0.22 1.0 0.07 0.01 0.08 0.06
Sro315_g115280.1 (Contig447.g6051)
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.81 0.58 1.0 0.06 0.06 0.11 0.12 0.01 0.05 0.03 0.09 0.0 0.0 0.22 0.14 0.01 0.82 0.04 0.02 0.05 0.08
Sro328_g118630.1 (Contig3574.g27618)
0.76 0.18 0.19 0.19 0.15 0.19 0.73 0.49 0.71 0.3 0.25 0.27 0.25 0.27 0.34 0.22 0.26 0.43 0.27 0.21 0.25 0.22 0.36 0.51 1.0 0.48 0.13
Sro359_g126000.1 (Contig295.g3861)
0.01 0.0 0.01 0.04 0.04 0.0 0.74 0.18 1.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.0 0.01 0.84 0.05 0.1 0.04 0.0
0.02 0.26 0.17 0.24 0.23 0.15 0.38 1.0 0.52 0.44 0.85 0.62 0.82 0.12 0.55 0.66 0.23 0.9 0.61 0.69 0.6 0.11 0.23 0.28 0.26 0.3 0.47
Sro397_g134460.1 (Contig157.g1784)
0.11 0.97 0.59 0.43 0.6 0.4 0.82 0.83 0.68 0.69 0.75 0.87 0.84 0.67 0.71 0.68 0.64 0.82 0.67 1.0 0.79 0.44 0.63 0.56 0.47 0.36 0.53
Sro404_g135990.1 (Contig4176.g31859)
0.01 0.03 0.04 0.01 0.04 0.28 0.59 1.0 0.49 0.39 0.61 0.37 0.18 0.36 0.55 0.61 0.42 0.17 0.15 0.18 0.44 0.14 0.39 0.65 0.81 0.52 0.61
Sro43_g025980.1 (Contig2453.g20064)
0.04 0.23 0.31 0.18 0.14 0.19 0.26 0.45 0.24 0.37 0.63 0.49 0.27 0.02 0.54 1.0 0.38 0.26 0.18 0.4 0.37 0.04 0.11 0.76 0.78 0.55 0.6
Sro497_g154860.1 (Contig738.g8468)
0.02 0.06 0.43 0.2 0.14 0.03 0.73 0.92 1.0 0.07 0.1 0.09 0.09 0.08 0.06 0.02 0.23 0.12 0.06 0.05 0.01 0.3 0.67 0.0 0.0 0.04 0.03
Sro500_g155290.1 (Contig407.g5538)
0.35 0.07 0.07 0.12 0.13 0.02 0.56 0.65 1.0 0.38 0.26 0.36 0.15 0.14 0.18 0.32 0.17 0.42 0.27 0.22 0.3 0.16 0.39 0.32 0.29 0.14 0.17
Sro506_g156340.1 (Contig3494.g27111)
0.0 0.04 0.11 0.23 0.11 0.39 0.4 0.49 0.65 0.24 0.32 0.29 1.0 0.32 0.43 0.22 0.75 0.25 0.43 0.62 0.12 0.35 0.61 0.02 0.01 0.23 0.34
Sro50_g029120.1 (Contig297.g3900)
0.09 0.21 0.23 0.33 0.32 0.19 0.3 0.35 0.57 0.21 0.37 0.15 1.0 0.4 0.43 0.37 0.53 0.6 0.41 0.59 0.22 0.28 0.72 0.2 0.05 0.09 0.27
Sro555_g165820.1 (Contig677.g7930)
0.03 0.81 0.59 0.35 0.35 0.15 0.54 0.41 0.35 0.61 0.33 0.71 0.78 0.39 0.51 0.62 0.31 0.87 0.86 1.0 0.9 0.23 0.31 0.34 0.91 0.57 0.47
Sro577_g169620.1 (Contig448.g6069)
0.16 0.49 0.21 0.18 0.22 0.07 0.57 0.43 0.94 0.19 0.16 0.09 0.12 0.07 0.21 0.14 0.35 0.37 0.12 0.09 0.09 0.34 1.0 0.07 0.07 0.13 0.2
Sro629_g178180.1 (Contig2563.g20827)
0.29 0.32 0.47 0.31 0.32 0.28 0.8 0.72 0.85 0.18 0.26 0.05 0.31 0.21 0.36 0.09 0.47 0.47 0.15 0.29 0.07 0.35 1.0 0.2 0.05 0.14 0.21
Sro631_g178420.1 (Contig3194.g25247)
0.01 0.74 0.83 0.41 0.36 0.14 0.68 0.34 1.0 0.32 0.45 0.14 0.08 0.25 0.33 0.26 0.15 0.25 0.26 0.25 0.32 0.06 0.87 0.42 0.31 0.73 0.46
Sro658_g182690.1 (Contig1438.g13219)
0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.54 0.59 1.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.07 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro663_g183440.1 (Contig119.g1342)
0.02 0.05 0.19 0.15 0.09 0.02 0.72 0.53 1.0 0.2 0.09 0.31 0.28 0.12 0.13 0.02 0.25 0.25 0.22 0.21 0.11 0.06 0.76 0.03 0.15 0.18 0.13
Sro691_g187870.1 (Contig1133.g10882)
0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.09 1.0 0.85 0.82 0.16 0.18 0.09 0.02 0.03 0.32 0.3 0.07 0.2 0.05 0.05 0.16 0.02 0.2 0.82 0.36 0.14 0.27
Sro70_g038960.1 (Contig3352.g26243)
0.03 0.05 0.03 0.04 0.03 0.23 0.58 0.68 0.53 0.26 0.44 0.23 0.71 0.23 0.58 0.35 0.44 1.0 0.28 0.45 0.28 0.05 0.32 0.43 0.45 0.26 0.15
Sro730_g194030.1 (Contig80.g835)
1.0 0.06 0.06 0.03 0.02 0.19 0.59 0.61 0.67 0.35 0.25 0.25 0.24 0.09 0.5 0.33 0.2 0.76 0.17 0.21 0.31 0.01 0.27 0.44 0.39 0.24 0.11
Sro742_g195930.1 (Contig1214.g11409)
0.02 0.0 0.07 0.04 0.05 0.03 0.55 0.75 1.0 0.09 0.17 0.13 0.24 0.01 0.14 0.05 0.0 0.45 0.18 0.22 0.0 0.08 0.85 0.0 0.0 0.04 0.04
Sro74_g040700.1 (Contig4700.g34932)
0.01 0.66 0.39 0.57 0.67 0.27 0.55 0.49 0.4 0.62 0.75 0.88 0.67 0.31 0.69 0.73 0.51 0.97 0.78 0.79 0.85 0.17 0.45 0.61 1.0 0.54 0.68
Sro765_g199200.1 (Contig2703.g21779)
0.0 0.46 1.0 0.36 0.29 0.21 0.27 0.38 0.33 0.24 0.33 0.13 0.59 0.23 0.46 0.43 0.34 0.79 0.8 0.52 0.23 0.35 0.5 0.24 0.1 0.16 0.35
Sro875_g214300.1 (Contig1071.g10429)
0.01 0.58 0.34 0.93 1.0 0.05 0.24 0.32 0.54 0.2 0.12 0.15 0.14 0.18 0.15 0.3 0.12 0.35 0.37 0.18 0.18 0.3 1.0 0.05 0.09 0.16 0.09
Sro885_g216080.1 (Contig1350.g12417)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.5 0.75 0.03 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.13 0.0 0.16 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro89_g047000.1 (Contig3846.g29621)
0.01 0.12 0.19 0.19 0.17 0.1 0.56 0.41 1.0 0.34 0.35 0.31 0.93 0.25 0.38 0.57 0.32 0.96 0.96 0.81 0.32 0.18 0.7 0.26 0.22 0.3 0.37
Sro905_g218520.1 (Contig2792.g22464)
0.01 0.21 0.27 0.19 0.24 0.08 0.25 0.34 0.21 0.17 0.19 0.15 0.21 0.05 0.17 0.46 0.09 0.11 0.1 0.11 0.31 0.02 0.06 0.44 1.0 0.4 0.16
Sro954_g224350.1 (Contig1658.g14947)
0.14 0.36 0.18 0.16 0.16 0.06 0.43 0.59 1.0 0.32 0.35 0.36 0.14 0.24 0.27 0.26 0.2 0.45 0.36 0.23 0.46 0.06 0.32 0.7 0.83 0.39 0.27
Sro959_g224740.1 (Contig3743.g28690)
0.28 0.36 0.12 0.12 0.14 0.02 0.68 0.33 1.0 0.14 0.03 0.08 0.45 0.01 0.04 0.03 0.09 0.04 0.02 0.34 0.07 0.3 0.88 0.06 0.05 0.04 0.03
Sro98_g050580.1 (Contig3362.g26350)
0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.47 0.3 0.92 0.54 0.22 0.58 0.12 0.77 0.33 0.47 0.21 0.98 1.0 0.2 0.45 0.15 0.02 0.41 0.45 0.69 0.42 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)