Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1072_g238140.1 (Contig2124.g17944)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 7.11 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 1.0 8.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1103_g241730.1 (Contig4430.g33250)
0.12 9.62 7.31 9.56 8.12 1.01 5.58 5.06 4.62 6.72 3.88 6.4 38.39 9.75 4.94 3.05 7.17 12.93 13.84 38.78 3.06 4.34 4.14 1.84 1.94 2.17 2.99
Sro1129_g244380.1 (Contig2187.g18231)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro112_g055800.1 (Contig1575.g14305)
0.04 0.32 0.57 0.12 0.11 0.0 0.27 0.63 0.68 1.01 0.0 0.24 15.74 0.32 0.03 0.0 0.0 4.68 7.39 14.09 0.25 0.52 0.91 0.02 0.22 0.03 0.01
Sro1134_g244980.1 (Contig4360.g32856)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.38 0.13 0.79 5.3 0.15 0.11 0.0 0.22 0.38 0.59 3.98 0.65 0.42 0.02 0.12 0.07 0.0 0.18
Sro1232_g254680.1 (Contig645.g7737)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1236_g255100.1 (Contig1374.g12613)
0.0 0.06 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.35 0.01 0.17 0.0 0.0 5.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.34 3.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1250_g256090.1 (Contig233.g2811)
0.0 0.45 1.39 6.95 2.73 1.14 0.19 0.04 0.29 2.87 1.68 1.43 18.44 5.66 1.84 0.56 2.92 4.07 3.36 21.19 0.85 1.02 0.48 0.09 0.0 1.31 0.94
Sro132_g062380.1 (Contig2745.g22081)
0.02 0.17 0.19 0.05 0.04 0.02 0.23 0.53 0.42 0.46 0.57 0.09 10.51 0.17 0.18 0.18 0.0 1.66 1.45 9.1 0.1 0.23 0.14 0.1 0.01 0.09 0.23
Sro133_g063060.1 (Contig2274.g18865)
1.79 1.01 1.89 0.95 0.7 0.12 5.01 4.13 6.51 3.66 0.21 3.08 22.41 0.69 0.7 0.41 0.35 3.37 6.53 23.47 2.66 1.66 2.69 1.14 1.2 0.51 0.6
Sro1420_g271130.1 (Contig4232.g32091)
0.0 0.39 0.1 0.08 0.08 0.06 0.85 1.48 0.66 1.0 0.28 0.22 17.24 0.35 0.2 0.44 0.67 5.7 4.13 12.43 0.87 0.44 1.19 0.29 0.66 0.35 0.25
Sro1423_g271370.1 (Contig94.g1082)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro157_g071350.1 (Contig2362.g19425)
0.0 0.0 0.33 0.0 0.28 0.0 0.07 0.0 0.0 0.56 0.0 0.17 7.41 0.0 0.0 0.1 0.0 1.51 1.59 9.07 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.24 0.03
Sro1591_g284460.1 (Contig4558.g34036)
0.0 0.06 0.05 0.11 0.1 0.0 0.03 0.67 0.32 0.21 0.0 0.0 6.65 0.02 0.0 0.0 0.0 0.53 0.92 4.29 0.0 0.64 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1605_g285430.1 (Contig4243.g32128)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.75 1.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1605_g285440.1 (Contig4243.g32129)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 2.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.94 2.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1605_g285450.1 (Contig4243.g32130)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 2.67 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 1.53 2.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1613_g286000.1 (Contig3025.g24107)
0.33 1.35 1.78 1.25 1.15 1.92 4.43 3.68 2.04 7.4 4.33 6.06 37.27 2.23 5.29 5.05 2.8 20.68 20.93 46.19 6.62 1.08 1.3 3.81 3.61 2.43 4.9
Sro1643_g288120.1 (Contig2047.g17581)
0.01 0.04 0.07 0.01 0.0 0.01 0.05 1.58 0.59 0.35 0.01 0.0 5.45 0.0 0.02 0.01 0.03 0.98 2.53 10.05 0.09 0.52 0.15 0.01 0.0 0.05 0.01
Sro1643_g288130.1 (Contig2047.g17582)
0.0 0.16 1.47 0.08 0.14 0.0 0.0 0.58 1.15 0.71 0.0 0.0 9.01 0.0 0.02 0.05 0.0 2.47 5.18 18.74 0.1 0.54 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro170_g075290.1 (Contig2525.g20602)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 2.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.57 2.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro173_g076240.1 (Contig2926.g23305)
0.0 0.36 0.49 0.22 0.97 0.0 0.57 0.04 0.4 0.89 0.71 0.88 7.32 1.6 0.53 0.21 0.5 0.41 1.71 6.93 0.3 0.0 0.17 0.0 0.63 0.29 0.46
Sro181_g079040.1 (Contig4257.g32231)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1846_g301390.1 (Contig2969.g23592)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 7.32 0.0 0.0 0.0 0.0 1.63 1.04 10.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1915_g305170.1 (Contig3943.g30233)
0.0 0.0 0.28 0.59 0.27 0.13 1.68 1.79 1.11 0.93 0.32 0.41 8.18 0.35 0.11 0.19 0.0 2.97 3.41 11.83 0.17 1.03 0.89 0.09 0.87 0.0 0.05
Sro1954_g307650.1 (Contig2458.g20121)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.81 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1958_g307840.1 (Contig419.g5585)
0.03 2.12 1.2 0.97 1.06 2.43 0.0 0.17 0.08 2.58 2.19 0.28 32.68 3.64 2.61 0.82 3.31 9.09 4.21 34.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.5
Sro2091_g314040.1 (Contig29.g199)
0.0 0.0 0.13 0.17 0.0 0.0 0.09 0.07 0.03 0.68 0.0 0.68 9.6 0.39 0.31 0.0 0.0 2.5 0.16 4.53 0.49 0.06 0.39 0.22 0.38 0.25 0.05
Sro2121_g315430.1 (Contig4568.g34120)
0.07 0.15 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.06 0.03 0.23 0.0 0.05 1.52 0.19 0.26 0.05 0.23 0.68 1.14 3.01 0.1 0.04 0.09 0.46 0.0 0.0 0.17
Sro213_g088360.1 (Contig1149.g10976)
0.0 0.12 0.1 0.22 0.12 0.17 0.69 0.12 0.76 1.02 1.12 0.31 8.52 0.39 1.57 1.29 0.97 5.62 3.96 11.68 0.35 0.72 0.36 0.51 0.98 0.61 1.01
Sro218_g090120.1 (Contig1136.g10913)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.45 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro228_g092840.1 (Contig1235.g11598)
0.62 0.22 0.21 0.1 0.11 0.0 0.39 1.56 1.2 0.65 0.0 0.1 6.4 0.0 0.0 0.0 0.0 2.84 2.65 9.85 0.22 0.74 0.3 0.23 0.0 0.0 0.01
Sro2317_g323020.1 (Contig1342.g12366)
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.05 0.42 0.15 0.16 0.07 0.09 1.01 0.04 0.05 0.04 0.09 0.62 0.56 1.47 0.24 0.06 0.08 0.01 0.03 0.05 0.11
Sro23_g015610.1 (Contig2259.g18711)
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 1.1 0.09 0.13 0.6 0.0 0.0 7.0 0.13 0.41 0.1 0.0 1.68 0.69 6.69 0.0 0.09 0.16 0.23 0.84 0.32 0.41
Sro2429_g327420.1 (Contig1246.g11652)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.62 0.09 0.0 0.0 5.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.85 3.84 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro268_g103590.1 (Contig1776.g15708)
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 3.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 2.71 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2720_g335470.1 (Contig4604.g34369)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.32 0.42 0.64 0.7 0.17 0.95 1.78 1.08 1.24 0.64 0.84 3.93 0.55 0.63 0.63 0.15 2.31 1.88 6.74 1.55 1.42 0.59 1.08 1.37 0.66 0.52
Sro2859_g338790.1 (Contig4732.g35109)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.38 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3194_g344960.1 (Contig3696.g28482)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3306_g346480.1 (Contig1894.g16476)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.22 1.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro404_g135850.1 (Contig4176.g31845)
0.0 0.12 0.09 0.12 0.0 0.13 0.57 0.02 0.04 0.37 0.15 0.04 4.13 0.0 0.35 0.31 0.0 0.4 0.4 4.88 0.08 0.15 0.06 0.15 0.17 0.0 0.04
Sro407_g136550.1 (Contig2478.g20246)
0.16 0.79 0.97 1.2 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 9.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.26 0.87 7.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro418_g138860.1 (Contig289.g3791)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.24 0.01 0.02 2.95 0.0 0.03 0.0 0.04 0.95 1.18 3.05 0.03 0.42 0.1 0.0 0.0 0.01 0.02
Sro450_g145440.1 (Contig271.g3469)
0.03 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.21 0.18 0.17 0.34 0.0 0.11 3.08 0.02 0.03 0.05 0.03 0.63 0.52 3.6 0.05 0.04 0.08 0.05 0.0 0.02 0.06
Sro53_g031480.1 (Contig1592.g14488)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.31 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro541_g163200.1 (Contig3996.g30685)
0.02 0.06 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.14 0.09 0.09 1.55 0.02 0.04 0.01 0.05 0.17 0.12 1.63 0.17 0.14 0.11 0.03 0.0 0.0 0.02
Sro55_g032510.1 (Contig4458.g33525)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 10.82 0.0 0.0 0.0 0.0 1.43 1.85 10.63 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro579_g170050.1 (Contig368.g4989)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.23 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro586_g171150.1 (Contig1474.g13502)
0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.8 0.02 3.52 1.29 0.47 0.29 26.46 2.96 0.85 0.71 0.16 0.09 0.0 26.33 0.74 0.25 1.07 0.0 0.0 0.05 0.72
Sro60_g034460.1 (Contig797.g8923)
0.04 0.0 0.19 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 5.62 0.0 0.0 0.0 0.0 1.47 1.31 8.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro619_g176430.1 (Contig2168.g18154)
0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.08 0.14 0.25 0.09 0.75 0.47 0.76 7.8 0.21 0.43 0.4 0.69 3.22 1.73 8.61 0.66 0.11 0.02 0.79 0.62 0.91 0.37
Sro671_g184860.1 (Contig562.g7143)
0.0 0.05 0.32 0.3 0.27 0.03 0.01 0.01 0.02 0.36 0.02 0.3 4.39 0.01 0.03 0.16 0.02 0.75 0.62 5.34 0.17 0.19 0.08 0.0 0.0 0.05 0.03
Sro696_g188810.1 (Contig116.g1321)
0.01 0.18 0.05 0.06 0.07 0.13 0.4 0.63 0.46 0.89 0.93 0.57 10.04 0.8 0.83 0.74 0.41 1.57 0.86 10.64 0.88 0.47 0.3 0.34 0.51 0.4 0.44
Sro69_g038710.1 (Contig4677.g34780)
0.42 1.86 0.54 1.12 1.06 9.2 3.35 2.3 3.66 10.68 4.57 8.99 59.55 9.61 7.15 5.47 6.41 15.46 24.76 53.42 10.21 2.59 1.79 2.98 3.94 7.58 3.09
Sro788_g202610.1 (Contig3902.g29942)
0.2 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.06 2.88 0.0 0.01 0.0 0.0 0.77 0.21 3.52 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro790_g202870.1 (Contig4757.g458)
0.0 0.97 0.4 0.08 0.13 0.03 0.11 0.01 0.02 0.36 0.02 0.23 2.76 0.01 0.06 0.03 0.03 0.86 1.29 3.46 0.35 0.03 0.01 0.06 0.32 0.04 0.13
Sro822_g207470.1 (Contig2051.g17591)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.22 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro855_g211390.1 (Contig1132.g10853)
0.15 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.48 0.0 2.08 1.14 0.0 0.18 34.28 0.96 0.31 0.37 0.0 2.91 5.32 21.48 0.09 2.09 1.03 0.0 0.98 0.0 0.0
Sro917_g219940.1 (Contig3222.g25472)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.3 0.0 0.01 10.29 0.0 0.0 0.0 0.0 5.91 3.4 12.23 0.01 0.17 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro920_g220270.1 (Contig2508.g20527)
0.09 0.0 0.37 0.14 0.0 0.2 0.38 0.67 0.03 1.75 0.0 0.47 25.08 0.28 0.54 0.0 0.2 10.18 4.91 23.29 0.68 1.78 0.28 0.18 0.16 0.0 0.11
Sro95_g049300.1 (Contig45.g315)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 1.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.59 2.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro95_g049310.1 (Contig45.g316)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.25 1.8 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.92 0.64 0.33 0.41 0.0 1.01 2.87 2.39 2.61 0.28 0.11 38.15 2.41 1.02 0.59 1.26 13.93 16.12 50.56 0.15 4.12 3.78 0.0 0.0 0.05 0.67

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)