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Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1022_g232310.1 (Contig2862.g22945)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro104_g052640.1 (Contig1278.g11907)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1070_g237760.1 (Contig4107.g31349)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.47 0.38 0.45 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03
Sro1091_g240290.1 (Contig2884.g23030)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04
Sro1116_g242840.1 (Contig365.g4924)
 0.0 1.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro1142_g245740.1 (Contig2104.g17863)
 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 1.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.16
Sro1166_g248240.1 (Contig1574.g14266)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro116_g057090.1 (Contig2228.g18485)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1179_g249570.1 (Contig1870.g16342)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1194_g251320.1 (Contig2725.g21971)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro121_g058830.1 (Contig1619.g14637)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro122_g059350.1 (Contig71.g754)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.21
Sro1230_g254510.1 (Contig3922.g30042)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1245_g255660.1 (Contig1857.g16236)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.67 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro126_g060570.1 (Contig82.g874)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1271_g258030.1 (Contig3272.g25751)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1275_g258520.1 (Contig2428.g19851)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1297_g260540.1 (Contig4097.g31303)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1324_g262830.1 (Contig3409.g26612)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro139_g064980.1 (Contig4334.g32674)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Sro1498_g277660.1 (Contig121.g1367)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1645_g288270.1 (Contig4599.g34346)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1680_g290750.1 (Contig1582.g14369)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro16_g011550.1 (Contig916.g9592)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1705_g292410.1 (Contig4149.g31669)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1705_g292420.1 (Contig4149.g31670)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.08 0.29 0.0 0.0
Sro1728_g293970.1 (Contig1852.g16182)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1735_g294360.1 (Contig1888.g16459)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro177_g077830.1 (Contig795.g8909)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1823_g299950.1 (Contig3221.g25460)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro185_g080460.1 (Contig1228.g11521)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.52 0.0 0.63 1.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.2 0.0 0.0 0.36 0.21
Sro1918_g305360.1 (Contig9.g105)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1955_g307710.1 (Contig831.g9187)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1970_g308540.1 (Contig920.g9666)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.58
Sro1999_g310150.1 (Contig925.g9699)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2033_g311950.1 (Contig3617.g27954)
 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.57 0.0 0.22 0.32 0.89 0.35 0.0 0.0 0.26 0.38 0.0 0.0 0.0 0.51 0.5 0.15
Sro2054_g312740.1 (Contig1163.g11087)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro205_g086100.1 (Contig2217.g18423)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.38 0.0 0.62 0.0 0.09 0.0 0.25 0.08 0.16 0.79 0.46 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2060_g312920.1 (Contig2734.g22016)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro209_g087460.1 (Contig4070.g31217)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.21 1.0 0.1 0.06
Sro211_g087910.1 (Contig2667.g21583)
 0.0 0.0 0.1 0.13 0.09 0.1 0.1 1.0 0.39 0.99 0.06 0.04 0.25 0.0 0.2 0.1 0.0 0.26 0.27 0.49 0.35 0.61 0.14 0.0 0.0 0.15 0.11
Sro21_g014490.1 (Contig813.g9039)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro21_g014930.1 (Contig813.g9083)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2240_g320270.1 (Contig1293.g12025)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro225_g091720.1 (Contig1661.g14970)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro230_g093370.1 (Contig263.g3268)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
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Sro72_g040040.1 (Contig1459.g13403)
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Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)