Heatmap: Cluster_328 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1017_g231790.1 (Contig3686.g28454)
0.01 0.13 0.09 0.09 0.08 0.85 0.45 0.45 0.12 0.45 0.7 0.52 1.0 0.1 0.77 0.55 0.53 0.74 0.45 0.74 0.63 0.17 0.12 0.67 0.44 0.33 0.58
Sro103_g052540.1 (Contig308.g4051)
0.01 0.13 0.08 0.12 0.08 0.31 0.63 0.34 0.19 0.6 0.73 0.81 0.63 0.84 0.98 1.0 0.69 0.33 0.16 0.59 0.73 0.13 0.11 0.52 0.54 0.46 0.46
Sro1044_g234910.1 (Contig685.g7977)
0.01 0.05 0.05 0.05 0.04 0.44 0.4 0.44 0.26 0.45 0.4 0.63 1.0 0.81 0.52 0.29 0.43 0.81 0.43 0.66 0.52 0.25 0.26 0.46 0.37 0.46 0.38
Sro108_g054150.1 (Contig2294.g18995)
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.1 0.13 0.14 0.07 0.39 0.37 0.55 1.0 0.64 0.41 0.55 0.71 0.45 0.43 0.99 0.59 0.11 0.08 0.13 0.05 0.12 0.21
Sro108_g054160.1 (Contig2294.g18996)
0.01 0.2 0.25 0.27 0.22 0.23 0.37 0.34 0.32 0.49 0.85 0.62 1.0 0.53 0.52 0.62 0.55 0.48 0.54 0.72 0.6 0.33 0.26 0.33 0.4 0.41 0.53
Sro10_g007940.1 (Contig1.g18)
0.02 0.24 0.29 0.32 0.2 0.27 0.39 0.3 0.39 0.56 0.9 0.61 0.79 0.45 0.59 0.7 0.64 0.64 0.79 1.0 0.64 0.53 0.34 0.49 0.44 0.5 0.65
Sro1177_g249340.1 (Contig1274.g11875)
0.01 0.03 0.04 0.03 0.03 0.13 0.39 0.25 0.19 0.46 0.38 0.62 1.0 0.63 0.42 0.52 0.29 0.35 0.32 0.81 0.64 0.24 0.09 0.31 0.36 0.24 0.26
Sro123_g059480.1 (Contig66.g637)
0.0 0.07 0.05 0.03 0.12 0.1 0.4 0.23 0.14 0.4 0.2 0.43 1.0 0.4 0.47 0.3 0.28 0.37 0.27 0.8 0.58 0.19 0.09 0.27 0.39 0.35 0.25
Sro1289_g259640.1 (Contig3644.g28150)
0.01 0.13 0.14 0.1 0.07 0.09 0.14 0.12 0.07 0.29 0.35 0.33 0.83 0.42 0.37 0.35 0.41 0.48 0.41 1.0 0.37 0.19 0.05 0.15 0.09 0.13 0.25
Sro1289_g259650.1 (Contig3644.g28151)
0.01 0.35 0.44 0.24 0.23 0.21 0.15 0.24 0.14 0.28 0.36 0.23 0.82 0.4 0.36 0.31 0.33 0.48 0.41 1.0 0.37 0.36 0.09 0.13 0.11 0.1 0.2
Sro1290_g259780.1 (Contig199.g2317)
0.0 0.04 0.03 0.06 0.03 0.14 0.44 0.12 0.13 0.58 0.77 0.54 1.0 0.78 0.96 0.83 0.45 0.32 0.32 0.98 0.62 0.16 0.11 0.56 0.76 0.65 0.48
Sro131_g062250.1 (Contig67.g677)
0.03 0.2 0.06 0.02 0.04 0.12 0.3 0.16 0.12 0.35 0.52 0.39 0.92 0.28 0.54 0.72 0.35 0.3 0.39 1.0 0.52 0.12 0.12 0.24 0.38 0.22 0.35
Sro1435_g272370.1 (Contig4058.g31113)
0.31 0.11 0.06 0.14 0.05 0.22 0.25 0.17 0.13 0.4 0.34 0.4 0.77 0.49 0.45 0.47 0.22 0.5 0.52 1.0 0.55 0.21 0.05 0.33 0.22 0.19 0.32
Sro147_g067770.1 (Contig246.g3000)
0.07 0.06 0.05 0.0 0.02 0.14 0.31 0.1 0.12 0.53 0.55 0.64 0.86 0.48 0.54 0.67 0.53 0.58 0.89 1.0 0.71 0.13 0.05 0.46 0.28 0.29 0.44
Sro149_g068510.1 (Contig259.g3219)
0.03 0.06 0.04 0.11 0.12 0.15 0.57 0.37 0.27 0.47 0.48 0.54 0.8 0.21 0.58 0.5 0.28 0.42 0.31 1.0 0.48 0.11 0.1 0.37 0.47 0.27 0.34
Sro1547_g281500.1 (Contig3266.g25722)
0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.27 0.04 0.12 0.04 0.24 0.86 0.31 0.62 0.1 0.52 1.0 0.88 0.07 0.1 0.74 0.33 0.06 0.01 0.01 0.03 0.19 0.49
Sro155_g070540.1 (Contig395.g5361)
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19 0.07 0.04 0.21 0.18 0.04 0.71 0.04 0.37 0.14 0.07 0.18 0.17 1.0 0.16 0.11 0.01 0.18 0.48 0.45 0.3
Sro1567_g282980.1 (Contig3738.g28664)
0.0 0.07 0.09 0.06 0.02 0.06 0.21 0.06 0.09 0.24 0.31 0.29 1.0 0.28 0.34 0.34 0.3 0.23 0.23 0.73 0.31 0.12 0.07 0.21 0.3 0.17 0.18
Sro1596_g284790.1 (Contig2886.g23039)
0.0 0.3 0.22 0.27 0.15 0.27 0.44 0.26 0.16 0.46 0.7 0.42 0.75 0.48 0.53 0.62 0.64 0.5 0.6 1.0 0.62 0.35 0.13 0.49 0.53 0.48 0.42
Sro1616_g286270.1 (Contig599.g7474)
0.09 0.13 0.11 0.09 0.13 0.4 0.54 0.39 0.26 0.46 1.0 0.67 0.81 0.36 0.72 0.55 0.75 0.76 0.56 0.62 0.44 0.25 0.16 0.52 0.27 0.24 0.54
Sro1692_g291520.1 (Contig1662.g14994)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.22 0.24 0.11 0.08 0.37 0.37 0.32 1.0 0.32 0.35 0.54 0.26 0.55 0.39 0.98 0.35 0.07 0.04 0.18 0.44 0.17 0.31
Sro1749_g295190.1 (Contig825.g9153)
0.01 0.44 0.33 0.13 0.25 0.15 0.34 0.38 0.33 0.42 0.58 0.46 0.81 0.44 0.47 0.36 0.35 0.37 0.52 1.0 0.47 0.34 0.27 0.41 0.38 0.35 0.45
Sro177_g077710.1 (Contig795.g8897)
0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.08 0.2 0.13 0.03 0.36 0.46 0.25 1.0 0.47 0.52 0.61 0.28 0.63 0.38 0.98 0.52 0.1 0.03 0.43 0.43 0.3 0.39
Sro180_g078890.1 (Contig350.g4768)
0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.17 0.12 0.07 0.23 0.23 0.19 1.0 0.1 0.25 0.27 0.08 0.52 0.59 0.99 0.32 0.19 0.04 0.15 0.18 0.13 0.22
Sro184_g079880.1 (Contig2216.g18391)
0.0 0.08 0.09 0.1 0.07 0.26 0.45 0.27 0.2 0.55 1.0 0.84 0.43 0.34 0.68 0.67 0.53 0.49 0.79 0.89 0.62 0.29 0.13 0.51 0.18 0.35 0.5
Sro194_g082920.1 (Contig237.g2887)
0.0 0.21 0.11 0.14 0.14 0.2 0.28 0.28 0.16 0.39 0.43 0.41 1.0 0.39 0.42 0.42 0.36 0.2 0.34 0.68 0.53 0.22 0.13 0.4 0.35 0.28 0.38
Sro2078_g313660.1 (Contig3499.g27147)
0.01 0.11 0.09 0.05 0.09 0.06 0.28 0.12 0.14 0.29 0.2 0.33 1.0 0.38 0.39 0.33 0.24 0.31 0.25 0.85 0.29 0.16 0.09 0.32 0.31 0.2 0.18
Sro214_g088790.1 (Contig282.g3664)
0.02 0.15 0.15 0.09 0.07 0.18 0.69 0.35 0.29 0.48 0.6 0.52 1.0 0.2 0.61 0.77 0.42 0.66 0.29 0.88 0.44 0.08 0.14 0.42 0.25 0.21 0.47
Sro2172_g317550.1 (Contig4373.g32912)
0.04 0.12 0.12 0.12 0.11 0.26 0.45 0.31 0.35 0.54 0.49 0.69 1.0 0.67 0.58 0.61 0.44 0.66 0.35 0.95 0.65 0.67 0.3 0.52 0.57 0.39 0.4
Sro217_g089890.1 (Contig1718.g15363)
0.05 0.04 0.03 0.01 0.0 0.4 0.85 0.48 0.34 0.71 0.73 1.0 0.75 0.41 0.94 0.63 0.44 0.44 0.24 0.67 0.97 0.03 0.14 0.61 0.79 0.53 0.45
Sro2181_g317980.1 (Contig4545.g33959)
0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.2 0.23 0.09 0.25 0.39 0.3 0.45 0.14 0.3 0.35 0.24 0.51 0.4 1.0 0.35 0.02 0.03 0.27 0.16 0.18 0.27
Sro220_g090670.1 (Contig3599.g27829)
0.02 0.04 0.03 0.01 0.04 0.12 0.61 0.36 0.09 0.47 0.35 0.78 0.67 0.12 0.64 0.66 0.45 0.45 0.31 1.0 0.64 0.1 0.09 0.51 0.93 0.46 0.43
Sro2246_g320560.1 (Contig1042.g10301)
0.0 0.23 0.22 0.2 0.18 0.33 0.39 0.29 0.24 0.42 0.37 0.53 1.0 0.67 0.58 0.55 0.38 0.38 0.4 0.82 0.51 0.28 0.14 0.55 0.5 0.3 0.28
Sro2629_g333040.1 (Contig3211.g25380)
0.01 0.03 0.03 0.05 0.02 0.14 0.67 0.41 0.25 0.49 0.42 0.54 0.92 0.45 0.48 0.35 0.34 0.83 0.23 1.0 0.5 0.44 0.32 0.31 0.41 0.3 0.24
Sro2629_g333060.1 (Contig3211.g25382)
0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.3 0.61 0.32 0.16 0.6 0.56 1.0 0.8 0.69 0.79 0.56 0.21 0.74 0.25 0.47 0.74 0.05 0.17 0.33 0.4 0.43 0.26
Sro2643_g333490.1 (Contig156.g1774)
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.41 0.4 0.21 0.47 0.4 0.55 1.0 0.39 0.52 0.44 0.24 0.42 0.44 0.9 0.5 0.11 0.15 0.36 0.54 0.38 0.38
Sro268_g103810.1 (Contig1776.g15730)
0.01 0.08 0.04 0.05 0.03 0.25 0.43 0.22 0.19 0.36 0.28 0.37 1.0 0.32 0.4 0.28 0.14 0.44 0.47 0.86 0.39 0.09 0.1 0.35 0.22 0.24 0.29
Sro282_g107530.1 (Contig1420.g13096)
0.02 0.16 0.19 0.17 0.09 0.2 0.49 0.25 0.28 0.4 0.5 0.57 1.0 0.42 0.63 0.65 0.72 0.35 0.2 0.78 0.52 0.04 0.08 0.36 0.28 0.15 0.41
Sro29_g019180.1 (Contig1384.g12761)
0.01 0.05 0.03 0.03 0.03 0.17 0.69 0.69 0.29 0.48 0.52 0.6 0.87 0.33 0.58 0.58 0.43 0.58 0.42 1.0 0.47 0.43 0.2 0.65 0.78 0.71 0.37
Sro319_g116190.1 (Contig204.g2459)
0.02 0.32 0.15 0.12 0.11 0.29 0.46 0.41 0.21 0.42 0.58 0.48 1.0 0.32 0.58 0.47 0.4 0.78 0.58 0.91 0.53 0.41 0.2 0.51 0.53 0.38 0.47
Sro364_g127240.1 (Contig2146.g18075)
0.04 0.25 0.29 0.16 0.12 0.11 0.31 0.21 0.13 0.45 0.67 0.53 0.92 0.56 0.58 0.56 0.47 0.45 0.49 1.0 0.47 0.11 0.1 0.48 0.4 0.38 0.48
Sro364_g127250.1 (Contig2146.g18076)
0.02 0.09 0.09 0.08 0.05 0.17 0.23 0.19 0.14 0.37 0.45 0.49 1.0 0.5 0.48 0.52 0.41 0.39 0.42 1.0 0.38 0.06 0.09 0.44 0.27 0.28 0.35
Sro367_g127750.1 (Contig623.g7600)
0.03 0.49 0.41 0.41 0.34 0.28 0.58 0.34 0.34 0.61 0.7 0.84 0.77 0.5 0.69 1.0 0.64 0.68 0.64 0.97 0.67 0.39 0.38 0.57 0.76 0.55 0.57
Sro39_g024320.1 (Contig234.g2852)
0.01 0.15 0.02 0.06 0.0 0.06 0.32 0.12 0.08 0.22 0.14 0.11 0.73 0.05 0.24 0.28 0.16 0.43 0.54 1.0 0.3 0.17 0.07 0.21 0.43 0.11 0.17
Sro404_g135840.1 (Contig4176.g31844)
0.01 0.33 0.19 0.16 0.13 0.24 0.34 0.19 0.21 0.36 0.47 0.39 0.87 0.31 0.45 0.4 0.26 0.44 0.62 1.0 0.4 0.22 0.14 0.37 0.37 0.28 0.34
Sro421_g139590.1 (Contig1157.g11072)
0.01 0.08 0.03 0.02 0.03 0.1 0.57 0.33 0.19 0.53 0.4 0.7 1.0 0.43 0.53 0.65 0.45 0.82 0.44 0.9 0.76 0.38 0.13 0.37 0.57 0.48 0.3
Sro42_g025430.1 (Contig312.g4120)
0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.07 0.33 0.06 0.1 0.4 0.32 0.4 0.94 0.57 0.5 0.6 0.32 0.71 0.38 1.0 0.62 0.16 0.07 0.26 0.4 0.33 0.32
Sro431_g141550.1 (Contig2042.g17558)
0.02 0.15 0.15 0.15 0.09 0.22 0.37 0.31 0.23 0.48 0.69 0.63 0.93 0.31 0.56 0.51 0.47 0.49 0.52 1.0 0.65 0.15 0.12 0.48 0.24 0.22 0.44
0.04 0.23 0.39 0.16 0.14 0.1 0.32 0.21 0.17 0.39 0.54 0.41 0.77 0.33 0.49 0.45 0.4 0.58 0.53 1.0 0.5 0.06 0.1 0.44 0.47 0.29 0.3
Sro521_g159370.1 (Contig1979.g16927)
0.03 0.2 0.17 0.18 0.23 0.21 0.38 0.42 0.19 0.45 0.48 0.52 1.0 0.54 0.47 0.55 0.33 0.41 0.5 0.61 0.55 0.32 0.19 0.36 0.21 0.27 0.44
Sro522_g159670.1 (Contig3319.g26053)
0.02 0.05 0.03 0.12 0.07 0.11 0.38 0.14 0.13 0.42 0.52 0.53 1.0 0.8 0.78 0.67 0.48 0.35 0.27 0.96 0.77 0.23 0.09 0.32 0.51 0.27 0.43
Sro553_g165360.1 (Contig1023.g10212)
0.04 0.03 0.03 0.01 0.0 0.16 0.61 0.31 0.14 0.61 0.56 1.0 0.6 0.4 0.68 0.54 0.35 0.56 0.32 0.77 0.55 0.11 0.13 0.61 0.54 0.42 0.26
Sro558_g166300.1 (Contig3624.g28028)
0.27 0.12 0.17 0.13 0.08 0.23 0.39 0.39 0.34 0.52 0.78 0.66 0.9 0.57 0.54 0.59 0.46 0.42 0.67 1.0 0.63 0.43 0.26 0.6 0.33 0.4 0.53
Sro622_g177000.1 (Contig2850.g22861)
0.45 0.24 0.2 0.15 0.08 0.55 0.48 0.28 0.21 0.66 1.0 0.76 0.49 0.63 0.81 0.9 0.79 0.62 0.87 0.6 0.93 0.38 0.23 0.75 0.48 0.46 0.69
Sro69_g038650.1 (Contig4677.g34774)
0.01 0.13 0.21 0.09 0.1 0.18 0.31 0.08 0.12 0.36 0.25 0.43 1.0 0.42 0.47 0.27 0.17 0.29 0.26 0.73 0.58 0.25 0.12 0.26 0.35 0.16 0.2
Sro706_g190470.1 (Contig127.g1443)
0.01 0.2 0.1 0.15 0.14 0.04 0.4 0.1 0.12 0.33 0.38 0.35 1.0 0.22 0.36 0.31 0.12 0.41 0.27 0.88 0.53 0.23 0.14 0.24 0.27 0.06 0.21
Sro725_g193260.1 (Contig3530.g27278)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.63 0.25 0.14 0.45 0.54 0.39 0.7 0.26 0.74 0.44 0.04 0.8 0.63 1.0 0.45 0.0 0.09 0.59 0.33 0.42 0.42
Sro764_g199000.1 (Contig1534.g13929)
0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.09 0.45 0.29 0.2 0.43 0.44 0.61 1.0 0.44 0.46 0.31 0.19 0.89 0.38 0.96 0.47 0.18 0.18 0.31 0.3 0.25 0.17
Sro781_g201540.1 (Contig678.g7937)
0.02 0.04 0.04 0.01 0.0 0.13 0.37 0.27 0.11 0.34 0.38 0.28 0.73 0.22 0.32 0.35 0.23 0.47 0.32 1.0 0.48 0.24 0.09 0.51 0.47 0.28 0.31
Sro795_g203610.1 (Contig372.g5054)
0.0 0.18 0.08 0.02 0.06 0.08 0.26 0.07 0.13 0.22 0.19 0.13 0.66 0.14 0.19 0.21 0.07 0.38 0.37 1.0 0.31 0.15 0.09 0.24 0.15 0.18 0.13
Sro83_g044160.1 (Contig4450.g33390)
0.48 0.12 0.06 0.17 0.17 0.61 0.85 0.69 0.33 0.72 0.72 1.0 0.76 0.73 0.68 0.34 0.38 0.6 0.25 0.9 0.7 0.17 0.24 0.54 0.46 0.32 0.42
Sro926_g220990.1 (Contig4614.g34424)
0.12 0.05 0.03 0.02 0.02 0.19 0.43 0.33 0.19 0.62 0.64 0.75 0.83 0.38 0.62 0.47 0.32 0.47 0.4 1.0 0.63 0.11 0.09 0.45 0.26 0.33 0.51
Sro952_g224040.1 (Contig1940.g16682)
0.0 0.02 0.04 0.05 0.03 0.05 0.26 0.13 0.07 0.34 0.34 0.34 1.0 0.33 0.33 0.31 0.25 0.2 0.33 0.77 0.43 0.14 0.08 0.22 0.31 0.19 0.2
Sro978_g227110.1 (Contig212.g2517)
0.04 0.44 0.21 0.21 0.16 0.32 0.45 0.2 0.2 0.49 0.62 0.59 0.87 0.4 0.65 0.84 0.47 0.48 0.55 1.0 0.66 0.19 0.11 0.47 0.52 0.43 0.5
Sro98_g050250.1 (Contig3362.g26317)
0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.1 0.37 0.29 0.15 0.4 0.31 0.48 1.0 0.5 0.5 0.58 0.22 0.41 0.43 0.92 0.45 0.14 0.07 0.35 0.34 0.27 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)