Heatmap: Cluster_328 (HCCA)

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(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1017_g231790.1 (Contig3686.g28454)
0.29 4.4 3.09 2.93 2.49 27.67 14.71 14.82 4.06 14.56 22.99 16.95 32.68 3.17 25.19 17.91 17.18 24.34 14.59 24.08 20.48 5.68 3.89 21.8 14.46 10.74 18.94
Sro103_g052540.1 (Contig308.g4051)
0.08 0.8 0.49 0.75 0.49 1.98 3.97 2.15 1.21 3.8 4.63 5.13 3.97 5.33 6.21 6.33 4.39 2.12 1.0 3.74 4.6 0.84 0.69 3.28 3.43 2.93 2.93
Sro1044_g234910.1 (Contig685.g7977)
1.08 7.34 8.28 8.82 6.78 71.05 65.43 72.16 41.76 73.05 64.55 102.12 162.25 130.71 85.11 47.34 70.11 132.09 69.24 106.81 85.15 41.13 41.45 74.66 59.88 75.42 61.0
Sro108_g054150.1 (Contig2294.g18995)
0.07 0.17 0.05 0.0 0.0 0.79 1.09 1.13 0.58 3.23 3.06 4.51 8.24 5.25 3.36 4.5 5.86 3.68 3.56 8.18 4.85 0.93 0.64 1.09 0.39 1.02 1.77
Sro108_g054160.1 (Contig2294.g18996)
0.09 2.01 2.45 2.64 2.22 2.3 3.69 3.36 3.2 4.85 8.38 6.12 9.9 5.27 5.14 6.18 5.41 4.8 5.38 7.12 5.99 3.24 2.61 3.27 3.92 4.06 5.28
Sro10_g007940.1 (Contig1.g18)
0.42 4.33 5.08 5.62 3.5 4.73 6.95 5.28 6.91 9.93 15.96 10.76 13.96 7.97 10.48 12.43 11.38 11.29 13.98 17.7 11.28 9.42 5.93 8.62 7.82 8.88 11.46
Sro1177_g249340.1 (Contig1274.g11875)
0.12 0.48 0.6 0.5 0.49 2.08 6.06 3.88 2.89 7.19 5.9 9.59 15.58 9.82 6.47 8.09 4.51 5.42 4.97 12.67 9.9 3.8 1.35 4.87 5.64 3.72 4.02
Sro123_g059480.1 (Contig66.g637)
0.0 0.34 0.24 0.16 0.58 0.44 1.83 1.05 0.66 1.84 0.91 1.98 4.63 1.87 2.17 1.4 1.29 1.69 1.24 3.72 2.7 0.86 0.43 1.25 1.8 1.64 1.17
Sro1289_g259640.1 (Contig3644.g28150)
0.13 1.33 1.41 1.04 0.78 0.95 1.47 1.28 0.75 2.98 3.62 3.42 8.68 4.38 3.81 3.64 4.27 5.01 4.31 10.4 3.86 1.96 0.5 1.6 0.88 1.4 2.61
Sro1289_g259650.1 (Contig3644.g28151)
0.08 5.31 6.59 3.63 3.46 3.07 2.18 3.62 2.05 4.17 5.37 3.47 12.29 6.0 5.33 4.64 4.88 7.12 6.1 14.98 5.51 5.45 1.38 1.94 1.67 1.55 3.03
Sro1290_g259780.1 (Contig199.g2317)
0.0 0.2 0.14 0.3 0.12 0.66 2.08 0.56 0.61 2.75 3.61 2.53 4.72 3.7 4.54 3.91 2.12 1.51 1.51 4.61 2.93 0.76 0.5 2.66 3.56 3.08 2.26
Sro131_g062250.1 (Contig67.g677)
0.21 1.43 0.45 0.13 0.32 0.85 2.17 1.16 0.86 2.5 3.77 2.83 6.65 2.0 3.91 5.16 2.56 2.15 2.84 7.21 3.77 0.88 0.86 1.76 2.71 1.57 2.53
Sro1435_g272370.1 (Contig4058.g31113)
1.83 0.63 0.32 0.84 0.31 1.26 1.46 1.0 0.74 2.36 1.98 2.36 4.53 2.85 2.61 2.76 1.28 2.92 3.03 5.85 3.22 1.2 0.31 1.91 1.27 1.11 1.88
Sro147_g067770.1 (Contig246.g3000)
0.29 0.23 0.2 0.0 0.07 0.57 1.27 0.43 0.48 2.17 2.24 2.64 3.51 1.98 2.23 2.74 2.18 2.37 3.62 4.09 2.93 0.52 0.2 1.87 1.14 1.2 1.8
Sro149_g068510.1 (Contig259.g3219)
0.95 1.85 1.3 3.56 3.82 4.74 18.32 11.81 8.77 15.05 15.44 17.4 25.73 6.63 18.7 15.99 8.86 13.39 10.1 32.11 15.37 3.52 3.21 11.76 15.09 8.6 10.86
Sro1547_g281500.1 (Contig3266.g25722)
0.0 0.05 0.0 0.09 0.04 1.22 0.18 0.56 0.19 1.1 3.96 1.43 2.83 0.45 2.4 4.58 4.04 0.34 0.47 3.4 1.51 0.28 0.03 0.06 0.15 0.88 2.23
Sro155_g070540.1 (Contig395.g5361)
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.16 0.95 0.33 0.2 1.03 0.87 0.22 3.5 0.19 1.81 0.71 0.34 0.89 0.84 4.94 0.8 0.56 0.04 0.87 2.35 2.22 1.49
Sro1567_g282980.1 (Contig3738.g28664)
0.0 0.52 0.7 0.43 0.15 0.44 1.63 0.47 0.72 1.84 2.41 2.22 7.75 2.15 2.6 2.62 2.32 1.8 1.82 5.64 2.38 0.95 0.57 1.64 2.3 1.32 1.39
Sro1596_g284790.1 (Contig2886.g23039)
0.0 1.47 1.1 1.36 0.74 1.34 2.2 1.28 0.8 2.32 3.51 2.1 3.76 2.41 2.66 3.09 3.18 2.49 3.0 4.99 3.07 1.77 0.67 2.46 2.63 2.41 2.12
Sro1616_g286270.1 (Contig599.g7474)
1.57 2.34 1.89 1.6 2.26 7.17 9.64 6.95 4.55 8.13 17.73 11.87 14.31 6.41 12.82 9.68 13.25 13.52 9.96 11.06 7.79 4.45 2.9 9.3 4.85 4.28 9.56
Sro1692_g291520.1 (Contig1662.g14994)
0.09 0.2 0.19 0.09 0.21 3.15 3.4 1.59 1.12 5.39 5.27 4.66 14.38 4.66 5.1 7.75 3.7 7.95 5.55 14.08 5.03 1.02 0.58 2.53 6.27 2.39 4.52
Sro1749_g295190.1 (Contig825.g9153)
0.08 4.09 3.05 1.19 2.34 1.34 3.11 3.46 3.04 3.85 5.37 4.22 7.45 4.06 4.29 3.31 3.26 3.4 4.79 9.2 4.28 3.11 2.5 3.82 3.54 3.19 4.18
Sro177_g077710.1 (Contig795.g8897)
0.0 0.0 0.07 0.24 0.15 0.71 1.88 1.26 0.25 3.38 4.33 2.36 9.43 4.44 4.91 5.76 2.65 5.92 3.59 9.24 4.89 0.92 0.28 4.04 4.09 2.83 3.7
Sro180_g078890.1 (Contig350.g4768)
0.12 0.13 0.06 0.04 0.02 0.18 0.92 0.64 0.35 1.24 1.24 0.99 5.28 0.52 1.3 1.44 0.45 2.77 3.1 5.22 1.68 1.02 0.2 0.78 0.94 0.67 1.14
Sro184_g079880.1 (Contig2216.g18391)
0.01 0.22 0.26 0.27 0.19 0.74 1.26 0.76 0.57 1.54 2.81 2.35 1.2 0.94 1.91 1.89 1.5 1.38 2.22 2.51 1.74 0.8 0.38 1.44 0.51 0.99 1.4
Sro194_g082920.1 (Contig237.g2887)
0.04 3.38 1.72 2.2 2.21 3.2 4.41 4.44 2.62 6.28 6.85 6.61 15.99 6.21 6.78 6.7 5.8 3.16 5.52 10.86 8.53 3.54 2.12 6.4 5.63 4.5 6.05
Sro2078_g313660.1 (Contig3499.g27147)
0.07 1.3 1.14 0.64 1.13 0.77 3.37 1.46 1.63 3.44 2.46 3.97 12.04 4.53 4.66 3.99 2.84 3.78 2.95 10.26 3.48 1.87 1.08 3.87 3.75 2.4 2.12
Sro214_g088790.1 (Contig282.g3664)
0.17 1.25 1.32 0.77 0.6 1.52 5.97 3.0 2.47 4.14 5.19 4.5 8.6 1.73 5.22 6.67 3.6 5.72 2.53 7.54 3.75 0.71 1.23 3.63 2.17 1.76 4.05
Sro2172_g317550.1 (Contig4373.g32912)
1.78 5.96 5.71 5.8 5.17 12.62 21.78 14.78 16.89 26.24 23.73 33.53 48.26 32.45 27.98 29.39 21.18 31.79 17.07 45.98 31.6 32.3 14.28 25.17 27.35 18.74 19.23
Sro217_g089890.1 (Contig1718.g15363)
0.63 0.43 0.32 0.11 0.04 4.72 10.2 5.7 4.04 8.46 8.7 11.96 9.02 4.89 11.18 7.59 5.32 5.28 2.81 8.06 11.66 0.37 1.73 7.33 9.45 6.35 5.34
Sro2181_g317980.1 (Contig4545.g33959)
0.12 0.11 0.19 0.15 0.11 0.28 1.58 1.74 0.71 1.95 2.99 2.3 3.51 1.1 2.28 2.72 1.88 3.97 3.06 7.71 2.74 0.14 0.22 2.07 1.21 1.39 2.05
Sro220_g090670.1 (Contig3599.g27829)
0.12 0.21 0.2 0.06 0.25 0.7 3.57 2.12 0.51 2.79 2.06 4.61 3.95 0.69 3.76 3.88 2.63 2.64 1.84 5.88 3.75 0.58 0.52 3.02 5.46 2.69 2.55
Sro2246_g320560.1 (Contig1042.g10301)
0.0 1.4 1.31 1.18 1.08 2.0 2.38 1.76 1.44 2.53 2.24 3.22 6.03 4.05 3.52 3.29 2.29 2.29 2.44 4.95 3.06 1.68 0.83 3.32 3.01 1.82 1.67
Sro2629_g333040.1 (Contig3211.g25380)
0.18 0.57 0.69 0.99 0.43 2.83 13.43 8.29 5.01 9.8 8.39 10.8 18.33 8.96 9.64 6.95 6.84 16.53 4.67 19.98 10.0 8.69 6.44 6.28 8.16 5.93 4.82
Sro2629_g333060.1 (Contig3211.g25382)
0.05 0.0 0.07 0.1 0.04 1.85 3.77 1.96 0.98 3.73 3.47 6.16 4.95 4.28 4.88 3.44 1.29 4.58 1.57 2.93 4.56 0.3 1.04 2.04 2.49 2.62 1.61
Sro2643_g333490.1 (Contig156.g1774)
0.25 0.16 0.07 0.26 0.13 1.72 8.21 8.06 4.14 9.43 7.94 11.06 20.1 7.79 10.52 8.79 4.73 8.35 8.9 18.19 10.04 2.21 3.08 7.3 10.85 7.69 7.54
Sro268_g103810.1 (Contig1776.g15730)
0.1 0.59 0.33 0.39 0.25 1.97 3.36 1.69 1.47 2.81 2.16 2.85 7.75 2.49 3.07 2.2 1.08 3.42 3.66 6.64 3.06 0.67 0.78 2.73 1.71 1.82 2.26
Sro282_g107530.1 (Contig1420.g13096)
0.13 0.98 1.18 1.05 0.55 1.25 3.08 1.56 1.76 2.52 3.16 3.57 6.26 2.65 3.92 4.06 4.51 2.17 1.27 4.88 3.26 0.27 0.51 2.23 1.74 0.94 2.57
Sro29_g019180.1 (Contig1384.g12761)
0.18 0.88 0.51 0.54 0.49 3.09 12.26 12.23 5.19 8.56 9.28 10.65 15.46 5.88 10.26 10.35 7.65 10.27 7.44 17.78 8.35 7.65 3.59 11.61 13.86 12.66 6.5
Sro319_g116190.1 (Contig204.g2459)
0.59 8.82 4.14 3.35 3.09 7.95 12.44 11.29 5.62 11.42 15.73 12.97 27.23 8.62 15.88 12.83 11.03 21.27 15.75 24.72 14.36 11.06 5.36 13.87 14.56 10.32 12.85
Sro364_g127240.1 (Contig2146.g18075)
0.84 4.72 5.36 3.08 2.16 1.97 5.87 3.89 2.46 8.44 12.59 9.94 17.14 10.43 10.94 10.5 8.71 8.34 9.14 18.73 8.72 2.15 1.89 9.03 7.57 7.07 9.08
Sro364_g127250.1 (Contig2146.g18076)
0.22 1.09 1.12 0.96 0.69 2.14 3.01 2.5 1.8 4.73 5.83 6.32 12.78 6.4 6.17 6.69 5.19 5.03 5.34 12.82 4.81 0.71 1.14 5.6 3.4 3.62 4.44
Sro367_g127750.1 (Contig623.g7600)
0.28 5.09 4.26 4.23 3.46 2.86 6.0 3.51 3.52 6.28 7.23 8.62 7.92 5.11 7.07 10.31 6.59 6.98 6.65 9.95 6.93 4.06 3.89 5.88 7.82 5.67 5.91
Sro39_g024320.1 (Contig234.g2852)
0.02 0.48 0.05 0.2 0.0 0.2 1.05 0.38 0.27 0.73 0.45 0.37 2.39 0.16 0.79 0.9 0.52 1.39 1.76 3.26 0.98 0.55 0.23 0.68 1.39 0.37 0.56
Sro404_g135840.1 (Contig4176.g31844)
0.1 3.56 2.03 1.73 1.43 2.56 3.61 2.06 2.22 3.84 5.06 4.23 9.32 3.32 4.81 4.32 2.83 4.69 6.62 10.7 4.3 2.39 1.45 3.92 3.91 3.01 3.6
Sro421_g139590.1 (Contig1157.g11072)
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0.17 1.74 0.81 0.81 0.61 1.25 1.76 0.77 0.79 1.93 2.42 2.31 3.42 1.56 2.55 3.28 1.83 1.88 2.17 3.92 2.58 0.76 0.41 1.85 2.03 1.7 1.98
Sro98_g050250.1 (Contig3362.g26317)
0.21 0.56 0.51 0.31 0.21 1.21 4.76 3.69 1.95 5.04 3.91 6.18 12.75 6.38 6.42 7.34 2.76 5.19 5.48 11.77 5.78 1.73 0.92 4.44 4.33 3.45 3.71

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)