Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1047_g235190.1 (Contig1910.g16513)	0.0	0.26	0.24	0.04	0.18	0.16	0.07	0.98	0.6	0.49	0.26	0.5	0.09	0.2	0.28	0.51	0.27	0.09	0.42	0.17	1.0	0.32	0.04	0.17	0.7	0.47	0.38
Sro116_g057010.1 (Contig2228.g18477)	0.0	0.0	0.27	0.25	0.34	0.0	0.05	0.69	0.74	0.64	0.0	0.11	0.25	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.12	0.35	1.0	0.29	0.02	0.0	0.0	0.0	0.08
Sro118_g057880.1 (Contig2714.g21858)	0.8	0.52	0.68	0.34	0.41	0.08	0.4	0.71	0.89	0.61	0.45	0.69	0.33	0.24	0.31	0.39	0.21	0.6	0.7	1.0	0.77	0.59	0.59	0.73	0.58	0.61	0.39
Sro1203_g252050.1 (Contig3938.g30199)	0.03	0.09	0.0	0.09	0.18	0.06	0.33	0.52	0.75	0.6	0.24	0.62	0.4	0.17	0.47	0.72	0.27	0.49	0.45	1.0	0.66	0.15	0.11	0.09	0.2	0.35	0.42
Sro121_g058740.1 (Contig1619.g14628)	0.12	0.05	0.0	0.21	0.06	0.04	0.42	1.0	0.77	0.29	0.28	0.22	0.12	0.17	0.14	0.46	0.06	0.51	0.56	0.6	0.46	0.11	0.08	0.16	0.55	0.63	0.1
Sro1274_g258410.1 (Contig1491.g13630)	0.43	0.34	0.46	0.46	0.31	0.11	0.28	1.0	0.81	0.27	0.38	0.23	0.22	0.12	0.28	0.29	0.25	0.21	0.23	0.36	0.25	0.29	0.2	0.21	0.19	0.16	0.23
Sro1425_g271550.1 (Contig1471.g13483)	0.18	0.03	0.03	0.03	0.04	0.0	0.06	1.0	0.6	0.13	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.09	0.02	0.05	0.06	0.01
Sro1437_g272600.1 (Contig1494.g13649)	0.01	0.03	0.08	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.46	0.12	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro144_g066920.1 (Contig3873.g29791)	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.65	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0
Sro156_g070660.1 (Contig473.g6404)	0.0	0.33	0.14	0.32	0.0	0.06	0.03	1.0	0.75	0.58	0.0	0.27	0.06	0.32	0.07	0.0	0.0	0.06	0.18	0.26	0.11	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.24
Sro167_g074520.1 (Contig2973.g23633)	1.0	0.21	0.3	0.28	0.21	0.12	0.2	0.79	0.68	0.18	0.17	0.17	0.18	0.09	0.15	0.15	0.16	0.12	0.13	0.22	0.13	0.14	0.15	0.11	0.08	0.08	0.13
Sro1881_g303280.1 (Contig2771.g22302)	0.48	0.05	0.16	0.07	0.08	0.01	0.09	1.0	0.8	0.25	0.01	0.39	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.1	0.13	0.06	0.17	0.22	0.2	0.07	0.2	0.08	0.03
Sro1881_g303290.1 (Contig2771.g22303)	1.0	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.63	0.54	0.09	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.11	0.06	0.0	0.0	0.01	0.03
Sro191_g082150.1 (Contig2614.g21208)	0.02	0.08	0.2	0.17	0.31	0.01	0.1	0.93	0.36	0.18	0.04	0.12	0.1	0.04	0.07	0.12	0.1	0.56	0.59	0.1	0.13	0.21	0.16	0.18	1.0	0.31	0.05
Sro194_g082740.1 (Contig237.g2869)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.01	0.0	1.0	0.45	0.0	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.03	0.1	0.19	0.03	0.0	0.0	0.13	0.0
Sro1_g000380.1 (Contig3007.g23953)	0.0	0.14	0.32	0.26	0.42	0.0	0.01	1.0	0.83	0.1	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro206_g086470.1 (Contig4750.g35184)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.42	0.94	1.0	0.11	0.04	0.04	0.08	0.0	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.06	0.11	0.15	0.06	0.11	0.07	0.03
Sro216_g089450.1 (Contig227.g2722)	0.05	0.69	0.77	0.32	0.36	0.25	0.53	0.82	0.54	0.62	0.31	0.64	0.72	0.42	0.47	0.69	0.33	0.14	0.15	1.0	0.51	0.3	0.17	0.45	0.14	0.23	0.51
Sro2311_g322830.1 (Contig3301.g25897)	0.02	0.04	0.0	0.01	0.04	0.01	0.02	1.0	0.5	0.15	0.0	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.01	0.05	0.05	0.01
Sro2398_g326110.1 (Contig2821.g22600)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.0	0.01	0.96	1.0	0.73	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.11	0.0	0.36	0.0	0.02	0.03	0.15	1.0	0.11	0.65	0.07	0.03
Sro244_g097190.1 (Contig2788.g22435)	0.31	0.0	0.19	0.0	0.12	0.0	0.05	0.33	1.0	0.24	0.0	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.49	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02
Sro2472_g328650.1 (Contig2276.g18886)	0.08	0.04	0.05	0.02	0.04	0.05	0.49	1.0	0.81	0.14	0.08	0.1	0.03	0.02	0.23	0.22	0.12	0.26	0.09	0.05	0.21	0.01	0.18	0.46	0.5	0.21	0.18
Sro248_g098400.1 (Contig288.g3774)	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.0	0.02	1.0	0.68	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro286_g108320.1 (Contig956.g9868)	0.42	0.05	0.0	0.01	0.05	0.0	0.04	1.0	0.83	0.15	0.01	0.05	0.13	0.0	0.05	0.03	0.0	0.02	0.02	0.09	0.05	0.05	0.08	0.02	0.0	0.03	0.03
Sro30_g019840.1 (Contig3962.g30384)	0.8	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.29	0.93	1.0	0.92	0.27	0.29	0.0	0.0	0.16	0.57	0.26	0.0	0.0	0.0	0.59	0.23	0.06	0.0	0.14	0.53	0.69
Sro310_g113970.1 (Contig2751.g22157)	0.01	0.21	0.27	0.34	0.36	0.01	0.07	1.0	0.69	0.15	0.09	0.03	0.53	0.14	0.07	0.02	0.18	0.26	0.17	0.4	0.04	0.19	0.25	0.05	0.05	0.07	0.01
Sro331_g119120.1 (Contig3186.g25149)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.04	1.0	0.0	0.23	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.08	0.07	0.33	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Sro364_g127060.1 (Contig2146.g18057)	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.0	0.1	0.62	1.0	0.27	0.0	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.01	0.15	0.0	0.17	0.12	0.0	0.0	0.01	0.02
Sro364_g127070.1 (Contig2146.g18058)	0.01	0.03	0.07	0.06	0.05	0.05	0.18	1.0	0.68	0.21	0.21	0.08	0.3	0.22	0.42	0.27	0.1	0.24	0.07	0.31	0.23	0.08	0.06	0.27	0.81	0.33	0.08
Sro367_g127820.1 (Contig623.g7607)	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.07	0.08	0.8	1.0	0.35	0.42	0.59	0.05	0.27	0.18	0.02	0.32	0.02	0.0	0.12	0.76	0.04	0.01	0.13	0.03	0.02	0.21
Sro371_g128540.1 (Contig736.g8432)	0.04	0.05	0.07	0.14	0.4	0.04	0.12	1.0	0.94	0.46	0.15	0.63	0.32	0.36	0.19	0.18	0.16	0.19	0.2	0.46	0.52	0.22	0.07	0.26	0.51	0.37	0.17
Sro3_g002650.1 (Contig3832.g29450)	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.09	0.89	1.0	0.19	0.11	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.14	0.07
Sro433_g141780.1 (Contig4540.g33940)	0.0	0.01	0.18	0.05	0.02	0.0	0.01	1.0	0.14	0.15	0.01	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.13	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0
Sro45_g027230.1 (Contig2311.g19105)	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.44	0.17	0.1	0.03	0.23	0.06	0.05	0.04	0.0	0.0	0.04	0.35	0.24	0.15	0.01	0.06	0.09	0.18	0.03
Sro48_g028310.1 (Contig1255.g11726)	0.1	0.04	0.07	0.05	0.05	0.05	0.36	1.0	0.71	0.16	0.09	0.13	0.11	0.06	0.11	0.12	0.08	0.24	0.08	0.13	0.18	0.07	0.21	0.21	0.4	0.17	0.07
Sro510_g157260.1 (Contig2749.g22141)	0.06	0.03	0.03	0.01	0.03	0.0	0.33	1.0	0.72	0.15	0.06	0.11	0.08	0.01	0.07	0.09	0.01	0.12	0.07	0.11	0.26	0.06	0.17	0.09	0.25	0.09	0.06
Sro569_g168340.1 (Contig1581.g14360)	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.19	0.09	0.15	0.54	0.09	0.17	0.06	0.0	0.0	0.28	0.06	0.36	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro592_g172160.1 (Contig2562.g20818)	0.01	0.07	0.19	0.25	0.37	0.02	0.23	1.0	0.76	0.1	0.04	0.03	0.1	0.01	0.06	0.06	0.02	0.68	0.52	0.16	0.0	0.01	0.24	0.27	0.34	0.37	0.05
Sro625_g177650.1 (Contig691.g8103)	0.0	0.04	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.91	1.0	0.15	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.0	0.1	0.03	0.21	0.1	0.13	0.09	0.04	0.0	0.1	0.0
Sro644_g180550.1 (Contig3672.g28385)	0.04	0.03	0.1	0.1	0.09	0.02	0.3	1.0	0.69	0.32	0.11	0.28	0.12	0.03	0.09	0.11	0.03	0.27	0.14	0.24	0.5	0.16	0.19	0.37	0.83	0.29	0.14
Sro65_g036720.1 (Contig155.g1742)	0.21	0.02	0.0	0.04	0.04	0.06	0.29	1.0	0.64	0.25	0.2	0.22	0.14	0.05	0.14	0.31	0.11	0.09	0.05	0.21	0.33	0.33	0.12	0.27	0.14	0.18	0.17
Sro664_g183690.1 (Contig3359.g26305)	0.04	0.12	0.07	0.04	0.05	0.04	0.29	0.89	1.0	0.3	0.1	0.25	0.58	0.11	0.25	0.37	0.13	0.25	0.25	0.35	0.26	0.39	0.28	0.03	0.07	0.09	0.13
Sro710_g191060.1 (Contig1639.g14778)	0.03	0.41	1.0	0.68	0.55	0.0	0.01	0.87	0.69	0.23	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.11	0.04	0.0	0.0	0.02	0.01
Sro738_g195250.1 (Contig2916.g23204)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.5	1.0	0.82	0.12	0.03	0.01	0.45	0.0	0.06	0.07	0.02	0.48	0.16	0.4	0.01	0.03	0.15	0.05	0.07	0.08	0.04
Sro769_g199840.1 (Contig2367.g19486)	0.26	0.25	0.36	0.3	0.36	0.16	0.2	0.93	1.0	0.5	0.22	0.68	0.06	0.14	0.15	0.11	0.16	0.2	0.24	0.19	0.39	0.18	0.15	0.2	0.31	0.2	0.14
Sro77_g042020.1 (Contig338.g4597)	0.07	0.0	0.09	0.0	0.06	0.03	0.09	1.0	0.57	0.47	0.11	0.51	0.17	0.05	0.12	0.03	0.09	0.14	0.02	0.43	0.27	0.24	0.27	0.15	0.11	0.45	0.2
Sro815_g206560.1 (Contig3639.g28104)	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.57	0.67	0.29	0.17	0.13	0.0	0.07	0.04	0.04	0.26	0.0	0.07	0.11	0.32	0.17	0.14	0.01	0.02	0.12	0.13
Sro874_g214230.1 (Contig589.g7374)	1.0	0.15	0.2	0.23	0.22	0.09	0.11	0.88	0.68	0.14	0.16	0.12	0.14	0.05	0.1	0.11	0.19	0.1	0.1	0.16	0.06	0.21	0.14	0.07	0.05	0.06	0.11
Sro889_g216590.1 (Contig1913.g16524)	0.27	0.0	0.2	0.1	0.0	0.0	0.12	0.8	1.0	0.43	0.0	0.27	0.03	0.0	0.02	0.11	0.05	0.02	0.05	0.15	0.13	0.02	0.0	0.08	0.4	0.32	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)