1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1047_g235190.1 (Contig1910.g16513)
 0.0 0.55 0.52 0.09 0.38 0.35 0.16 2.1 1.28 1.06 0.55 1.07 0.19 0.44 0.61 1.08 0.59 0.18 0.89 0.36 2.14 0.69 0.09 0.37 1.49 1.0 0.81
Sro116_g057010.1 (Contig2228.g18477)
 0.0 0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.01 0.08 0.08 0.07 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro118_g057880.1 (Contig2714.g21858)
 3.6 2.35 3.06 1.54 1.84 0.35 1.8 3.17 3.97 2.72 2.01 3.11 1.48 1.09 1.41 1.77 0.93 2.68 3.15 4.49 3.44 2.67 2.66 3.27 2.59 2.76 1.76
Sro1203_g252050.1 (Contig3938.g30199)
 0.14 0.39 0.0 0.38 0.78 0.24 1.44 2.3 3.31 2.64 1.06 2.75 1.75 0.76 2.08 3.16 1.2 2.15 1.99 4.41 2.9 0.66 0.49 0.4 0.87 1.52 1.84
Sro121_g058740.1 (Contig1619.g14628)
 0.06 0.02 0.0 0.1 0.03 0.02 0.21 0.49 0.38 0.14 0.14 0.11 0.06 0.09 0.07 0.23 0.03 0.25 0.27 0.3 0.23 0.06 0.04 0.08 0.27 0.31 0.05
Sro1274_g258410.1 (Contig1491.g13630)
 14.67 11.68 15.59 15.84 10.77 3.87 9.68 34.21 27.71 9.29 13.12 7.92 7.5 4.24 9.71 10.04 8.52 7.16 7.91 12.49 8.65 10.02 6.93 7.26 6.41 5.47 7.71
Sro1425_g271550.1 (Contig1471.g13483)
 33.98 6.03 6.09 4.84 7.45 0.25 11.14 185.77 111.24 24.52 1.65 5.82 2.84 1.29 1.94 1.87 1.97 3.36 1.5 3.39 3.91 20.78 15.97 3.21 8.76 10.66 2.57
Sro1437_g272600.1 (Contig1494.g13649)
 1.12 2.82 6.24 1.01 0.33 0.04 1.24 82.69 38.27 9.59 0.15 0.71 0.04 0.0 0.08 0.08 1.01 0.93 0.33 0.41 0.56 2.61 1.66 0.03 0.0 0.52 0.51
Sro144_g066920.1 (Contig3873.g29791)
 56.59 0.0 0.48 0.16 0.0 0.0 3.12 141.49 91.52 48.08 0.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.15 0.42 0.69 0.21 0.2 5.31 1.9 0.36 0.12 2.7 0.53
Sro156_g070660.1 (Contig473.g6404)
 0.0 0.55 0.23 0.53 0.0 0.11 0.05 1.67 1.25 0.97 0.0 0.45 0.1 0.53 0.11 0.0 0.0 0.1 0.3 0.44 0.19 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.4
Sro167_g074520.1 (Contig2973.g23633)
 94.37 19.45 28.33 26.38 20.09 11.53 18.84 74.61 63.75 16.64 16.21 16.48 16.95 8.24 14.33 14.22 14.72 11.63 12.19 20.36 11.93 12.92 14.11 10.58 7.81 7.54 11.96
Sro1881_g303280.1 (Contig2771.g22302)
 100.77 9.55 33.43 14.63 17.27 2.63 20.0 212.1 169.11 53.22 2.42 82.29 9.11 2.28 3.02 4.92 9.97 21.89 27.08 13.73 35.73 46.78 42.75 13.81 41.78 16.51 5.88
Sro1881_g303290.1 (Contig2771.g22303)
 17.36 0.29 0.59 0.53 0.61 0.24 0.33 10.94 9.39 1.48 0.37 1.41 0.37 0.16 0.28 0.19 0.4 0.12 0.13 0.62 0.53 1.99 1.07 0.07 0.0 0.26 0.53
Sro191_g082150.1 (Contig2614.g21208)
 0.16 0.61 1.53 1.28 2.38 0.06 0.76 7.02 2.72 1.33 0.32 0.93 0.74 0.33 0.56 0.93 0.79 4.28 4.5 0.78 0.97 1.6 1.2 1.39 7.59 2.37 0.38
Sro194_g082740.1 (Contig237.g2869)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.56 0.25 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.11 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0
Sro1_g000380.1 (Contig3007.g23953)
 0.06 4.91 11.33 8.91 14.73 0.15 0.36 34.86 28.99 3.43 0.13 0.4 0.2 0.2 0.44 0.36 0.0 0.32 0.27 0.18 0.45 5.89 2.6 0.04 0.12 0.31 0.28
Sro206_g086470.1 (Contig4750.g35184)
 49.56 1.75 1.74 1.88 2.2 16.42 279.35 632.16 672.49 76.92 23.85 24.96 50.67 2.74 24.06 24.76 9.72 42.77 15.92 33.57 40.15 71.81 98.83 42.61 76.82 44.62 23.52
Sro216_g089450.1 (Contig227.g2722)
 0.98 13.17 14.68 6.08 6.83 4.81 9.99 15.51 10.32 11.88 5.96 12.09 13.65 8.08 8.85 13.2 6.3 2.61 2.91 19.01 9.63 5.79 3.19 8.58 2.67 4.29 9.63
Sro2311_g322830.1 (Contig3301.g25897)
 0.51 1.03 0.07 0.31 1.16 0.17 0.65 26.2 13.03 3.84 0.1 1.06 0.44 0.61 0.39 0.38 0.33 1.32 0.52 0.77 0.74 1.85 1.28 0.36 1.42 1.29 0.28
Sro2398_g326110.1 (Contig2821.g22600)
 0.0 0.0 0.0 0.22 0.29 0.0 0.04 5.38 5.62 4.13 0.0 0.0 0.3 0.0 0.03 0.64 0.0 2.04 0.0 0.1 0.19 0.82 5.62 0.61 3.64 0.38 0.14
Sro244_g097190.1 (Contig2788.g22435)
 0.12 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.02 0.13 0.39 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro2472_g328650.1 (Contig2276.g18886)
 4.91 2.4 3.08 1.23 2.42 2.9 28.21 57.85 46.68 8.03 4.51 5.78 1.68 1.08 13.18 12.75 7.01 15.27 5.18 3.04 12.15 0.5 10.29 26.68 28.7 12.03 10.54
Sro248_g098400.1 (Contig288.g3774)
 0.25 0.38 0.16 0.26 0.15 0.0 0.21 12.88 8.75 2.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.06 0.27 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro286_g108320.1 (Contig956.g9868)
 1.13 0.13 0.0 0.03 0.14 0.0 0.12 2.72 2.26 0.4 0.04 0.12 0.35 0.0 0.13 0.07 0.0 0.05 0.06 0.25 0.14 0.12 0.22 0.04 0.0 0.07 0.07
Sro30_g019840.1 (Contig3962.g30384)
 1.34 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.49 1.56 1.68 1.54 0.45 0.48 0.0 0.0 0.27 0.96 0.44 0.0 0.0 0.0 0.99 0.39 0.1 0.01 0.23 0.88 1.15
Sro310_g113970.1 (Contig2751.g22157)
 0.06 0.88 1.16 1.46 1.53 0.04 0.31 4.28 2.94 0.64 0.38 0.12 2.26 0.58 0.28 0.08 0.77 1.13 0.73 1.7 0.18 0.82 1.06 0.22 0.22 0.31 0.05
Sro331_g119120.1 (Contig3186.g25149)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro364_g127060.1 (Contig2146.g18057)
 0.15 0.32 0.49 3.01 3.78 0.0 2.35 13.93 22.43 6.06 0.0 0.17 0.87 0.0 0.2 0.0 0.0 1.19 0.29 3.44 0.09 3.85 2.61 0.08 0.0 0.22 0.36
Sro364_g127070.1 (Contig2146.g18058)
 0.35 1.56 3.41 2.98 2.49 2.66 9.25 51.53 35.27 11.0 11.07 4.1 15.57 11.21 21.77 13.89 4.93 12.55 3.61 15.81 11.83 4.27 2.97 13.75 41.96 17.25 4.23
Sro367_g127820.1 (Contig623.g7607)
 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.06 0.06 0.65 0.82 0.29 0.34 0.48 0.04 0.22 0.15 0.01 0.26 0.01 0.0 0.1 0.62 0.03 0.01 0.1 0.02 0.02 0.17
Sro371_g128540.1 (Contig736.g8432)
 0.56 0.75 1.09 2.1 5.95 0.65 1.8 14.7 13.83 6.74 2.13 9.25 4.67 5.31 2.85 2.59 2.3 2.82 2.98 6.77 7.66 3.17 1.07 3.75 7.53 5.44 2.48
Sro3_g002650.1 (Contig3832.g29450)
 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.22 2.19 2.47 0.46 0.27 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.09 0.04 0.04 0.35 0.18
Sro433_g141780.1 (Contig4540.g33940)
 0.0 0.02 0.4 0.11 0.04 0.0 0.02 2.23 0.32 0.33 0.02 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.3 0.01 0.08 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0
Sro45_g027230.1 (Contig2311.g19105)
 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.54 0.24 0.09 0.05 0.02 0.13 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.19 0.13 0.08 0.0 0.03 0.05 0.1 0.02
Sro48_g028310.1 (Contig1255.g11726)
 90.9 36.18 63.24 45.29 44.54 40.41 314.04 884.0 625.7 142.66 77.66 118.43 95.48 52.74 100.12 107.18 74.75 211.27 69.23 116.51 161.57 58.84 181.87 183.44 354.17 150.02 64.32
Sro510_g157260.1 (Contig2749.g22141)
 15.49 7.25 8.06 2.39 8.21 0.92 85.94 256.8 184.56 38.5 15.62 29.13 21.45 1.77 18.52 23.31 3.31 31.94 18.42 27.74 67.37 15.58 43.17 23.58 64.45 22.89 14.35
Sro569_g168340.1 (Contig1581.g14360)
 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.44 0.0 0.09 0.04 0.07 0.24 0.04 0.08 0.02 0.0 0.0 0.12 0.02 0.16 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro592_g172160.1 (Contig2562.g20818)
 0.62 2.92 8.03 10.63 15.87 0.74 9.59 42.39 32.09 4.43 1.84 1.46 4.2 0.58 2.44 2.55 1.02 29.01 21.92 6.96 0.16 0.57 10.23 11.58 14.23 15.55 2.06
Sro625_g177650.1 (Contig691.g8103)
 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.65 0.71 0.11 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0 0.07 0.02 0.15 0.07 0.09 0.07 0.02 0.0 0.07 0.0
Sro644_g180550.1 (Contig3672.g28385)
 0.63 0.51 1.73 1.77 1.5 0.37 5.26 17.57 12.07 5.65 1.91 4.97 2.19 0.58 1.66 2.01 0.57 4.73 2.45 4.19 8.8 2.75 3.33 6.46 14.53 5.17 2.49
Sro65_g036720.1 (Contig155.g1742)
 0.64 0.06 0.0 0.1 0.12 0.19 0.87 2.96 1.91 0.75 0.58 0.66 0.42 0.16 0.41 0.93 0.33 0.28 0.16 0.63 0.97 0.98 0.35 0.79 0.41 0.52 0.5
Sro664_g183690.1 (Contig3359.g26305)
 0.21 0.69 0.41 0.23 0.28 0.23 1.64 5.02 5.63 1.68 0.58 1.41 3.26 0.64 1.38 2.1 0.76 1.41 1.43 1.97 1.47 2.18 1.56 0.18 0.4 0.48 0.76
Sro710_g191060.1 (Contig1639.g14778)
 0.84 10.7 25.82 17.67 14.17 0.08 0.33 22.48 17.93 5.93 0.16 0.32 0.42 0.1 0.25 0.17 0.55 0.3 0.04 0.32 0.29 2.84 1.1 0.03 0.09 0.53 0.27
Sro738_g195250.1 (Contig2916.g23204)
 0.55 0.04 0.16 0.0 0.0 0.24 16.54 33.37 27.45 4.16 1.15 0.25 15.18 0.0 1.9 2.5 0.62 15.86 5.4 13.2 0.48 1.02 5.07 1.72 2.37 2.76 1.17
Sro769_g199840.1 (Contig2367.g19486)
 8.64 8.58 12.09 10.29 12.32 5.39 6.87 31.54 33.76 16.95 7.28 22.83 2.08 4.69 5.11 3.83 5.27 6.79 8.12 6.44 13.11 6.07 5.17 6.9 10.36 6.74 4.75
Sro77_g042020.1 (Contig338.g4597)
 0.27 0.0 0.34 0.0 0.22 0.12 0.34 3.64 2.08 1.7 0.4 1.84 0.62 0.19 0.44 0.11 0.35 0.51 0.07 1.58 0.98 0.86 0.99 0.56 0.39 1.63 0.71
Sro815_g206560.1 (Contig3639.g28104)
 9.21 0.13 0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 5.26 6.16 2.69 1.58 1.22 0.0 0.6 0.4 0.33 2.39 0.0 0.63 1.04 2.91 1.56 1.29 0.11 0.21 1.12 1.16
Sro874_g214230.1 (Contig589.g7374)
 80.3 11.84 15.67 18.5 17.84 6.85 8.51 71.05 54.83 11.22 13.19 9.79 11.23 4.21 8.37 8.58 14.97 7.79 8.01 12.97 4.96 16.59 11.48 5.51 3.73 5.09 8.79
Sro889_g216590.1 (Contig1913.g16524)
 0.32 0.0 0.25 0.12 0.0 0.0 0.15 0.96 1.21 0.52 0.0 0.33 0.03 0.0 0.02 0.14 0.06 0.03 0.06 0.19 0.15 0.03 0.0 0.09 0.49 0.39 0.01

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)