Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1098_g240990.1 (Contig3483.g27020)
1.0 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.07 0.16 0.09 0.34 0.2 0.24 0.1 0.32 0.2 0.1 0.17 0.1 0.35 0.27 0.42 0.13 0.1 0.18 0.14 0.23 0.13
Sro110_g054840.1 (Contig1501.g13707)
0.29 0.14 0.03 0.03 0.06 0.0 0.1 0.08 0.05 0.46 0.04 1.0 0.03 0.42 0.08 0.09 0.0 0.04 0.05 0.15 0.66 0.09 0.08 0.65 0.59 0.58 0.04
Sro1122_g243530.1 (Contig3960.g30330)
0.25 0.07 0.06 0.11 0.17 0.11 0.13 0.16 0.15 0.67 0.33 1.0 0.66 0.7 0.35 0.63 0.48 0.42 0.65 0.88 0.8 0.31 0.23 0.18 0.21 0.4 0.28
Sro1126_g244080.1 (Contig1609.g14569)
1.0 0.02 0.02 0.06 0.03 0.04 0.18 0.13 0.05 0.39 0.06 0.52 0.05 0.24 0.21 0.04 0.09 0.03 0.43 0.1 0.25 0.11 0.09 0.19 0.11 0.05 0.04
Sro1129_g244400.1 (Contig2187.g18233)
1.0 0.09 0.03 0.11 0.06 0.1 0.26 0.35 0.16 0.5 0.2 0.75 0.05 0.37 0.33 0.2 0.19 0.03 0.2 0.11 0.39 0.27 0.31 0.65 0.53 0.15 0.23
Sro1192_g251030.1 (Contig331.g4399)
1.0 0.11 0.2 0.15 0.21 0.11 0.34 0.31 0.54 0.83 0.47 0.93 0.29 0.7 0.42 0.49 0.45 0.34 0.66 0.64 0.84 0.79 0.47 0.3 0.55 0.57 0.45
Sro125_g060220.1 (Contig2833.g22733)
0.04 0.09 0.14 0.09 0.06 0.05 0.22 0.16 0.1 0.57 0.3 0.63 0.54 0.98 0.4 0.58 0.26 0.22 0.33 1.0 0.62 0.27 0.14 0.2 0.17 0.46 0.4
Sro126_g060630.1 (Contig82.g880)
0.33 0.06 0.09 0.04 0.06 0.07 0.17 0.15 0.16 0.67 0.39 0.83 0.41 1.0 0.41 0.52 0.45 0.22 0.39 0.77 0.66 0.41 0.19 0.22 0.28 0.59 0.36
Sro1297_g260460.1 (Contig4097.g31295)
0.04 0.11 0.06 0.06 0.07 0.19 0.23 0.21 0.58 0.63 0.14 1.0 0.03 0.54 0.2 0.06 0.17 0.05 0.49 0.18 0.5 0.82 0.54 0.14 0.2 0.3 0.22
Sro1337_g264070.1 (Contig951.g9829)
0.02 0.06 0.04 0.05 0.08 0.12 0.11 0.14 0.22 0.58 0.2 0.71 0.33 0.7 0.21 0.13 0.11 0.41 0.83 1.0 0.56 0.64 0.36 0.2 0.26 0.42 0.23
Sro1364_g266470.1 (Contig3679.g28410)
0.07 0.02 0.15 0.12 0.07 0.03 0.14 0.11 0.3 0.41 0.05 1.0 0.13 0.08 0.06 0.09 0.08 0.08 0.07 0.3 0.26 0.24 0.07 0.04 0.0 0.03 0.06
Sro1453_g274030.1 (Contig3150.g24986)
0.68 0.85 0.63 0.62 0.6 0.05 0.12 0.28 0.28 0.86 0.36 1.0 0.05 0.24 0.12 0.16 0.17 0.08 0.4 0.25 1.0 0.46 0.41 0.31 0.61 0.34 0.28
Sro1489_g277000.1 (Contig2075.g17739)
1.0 0.3 0.23 0.19 0.22 0.03 0.08 0.09 0.1 0.48 0.06 0.75 0.05 0.24 0.12 0.03 0.07 0.1 0.5 0.18 0.32 0.09 0.07 0.14 0.15 0.07 0.06
Sro1533_g280330.1 (Contig2004.g17154)
0.15 0.32 0.18 0.25 0.23 0.29 0.48 0.34 0.38 0.69 0.34 0.95 0.42 0.25 0.32 0.35 0.54 0.35 0.53 0.63 1.0 0.35 0.38 0.53 0.7 0.73 0.35
Sro157_g071220.1 (Contig2362.g19412)
0.85 0.07 0.06 0.05 0.07 0.08 0.17 0.23 0.19 0.69 0.34 0.92 0.62 0.78 0.33 0.39 0.28 0.28 0.56 1.0 0.77 0.41 0.21 0.25 0.25 0.49 0.35
Sro1593_g284500.1 (Contig579.g7336)
0.74 0.1 0.14 0.13 0.15 0.2 0.23 0.19 0.37 0.76 0.45 0.96 0.69 0.79 0.42 0.39 0.45 0.63 0.77 0.98 1.0 0.69 0.52 0.35 0.33 0.45 0.33
Sro1601_g285200.1 (Contig4269.g32304)
0.36 0.02 0.03 0.03 0.03 0.08 0.07 0.17 0.26 0.68 0.38 1.0 0.12 0.91 0.47 0.46 0.53 0.23 0.49 0.61 0.64 0.41 0.33 0.13 0.17 0.44 0.33
Sro1610_g285790.1 (Contig4416.g33184)
1.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.21 0.1 0.22 0.2 0.27 0.12 0.04 0.12 0.06 0.19 0.3 0.28 0.1 0.06 0.06 0.11 0.13 0.07
Sro1610_g285820.1 (Contig4416.g33187)
1.0 0.06 0.16 0.03 0.04 0.05 0.11 0.15 0.15 0.45 0.33 0.52 0.23 0.56 0.31 0.34 0.36 0.22 0.37 0.47 0.43 0.3 0.17 0.13 0.06 0.32 0.29
Sro1655_g289000.1 (Contig2908.g23146)
1.0 0.05 0.81 0.05 0.03 0.02 0.07 0.08 0.2 0.35 0.08 0.41 0.1 0.23 0.12 0.1 0.07 0.04 0.11 0.34 0.27 0.22 0.17 0.03 0.04 0.08 0.08
Sro167_g074400.1 (Contig2973.g23621)
0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.18 0.12 0.48 0.11 1.0 0.09 0.22 0.15 0.12 0.07 0.08 0.19 0.18 0.26 0.09 0.06 0.11 0.08 0.07 0.1
Sro169_g075150.1 (Contig4412.g33135)
0.24 0.12 0.1 0.17 0.3 0.1 0.17 0.17 0.24 0.66 0.22 1.0 0.16 0.5 0.16 0.42 0.31 0.09 0.51 0.68 0.92 0.27 0.33 0.21 0.29 0.29 0.24
Sro1748_g295170.1 (Contig2256.g18676)
0.74 0.03 0.01 0.06 0.09 0.06 0.13 0.13 0.07 0.76 0.41 0.85 0.13 1.0 0.53 0.71 0.56 0.34 0.55 0.32 0.51 0.31 0.09 0.12 0.06 0.18 0.2
Sro1810_g299120.1 (Contig2202.g18319)
0.64 0.22 0.15 0.25 0.34 0.11 0.2 0.32 0.45 0.74 0.15 1.0 0.25 0.32 0.14 0.26 0.19 0.11 0.26 0.57 1.0 0.46 0.55 0.23 0.23 0.4 0.18
Sro1814_g299310.1 (Contig665.g7846)
0.1 0.14 0.09 0.12 0.14 0.05 0.12 0.15 0.18 0.26 0.04 0.3 0.17 0.19 0.1 0.02 0.05 0.2 1.0 0.36 0.19 0.27 0.1 0.07 0.12 0.09 0.05
Sro1838_g300780.1 (Contig106.g1228)
0.37 0.03 0.04 0.03 0.03 0.1 0.13 0.19 0.26 0.72 0.38 1.0 0.44 0.84 0.35 0.36 0.36 0.26 0.56 0.73 0.6 0.33 0.21 0.16 0.15 0.28 0.27
Sro1911_g304930.1 (Contig1415.g12987)
0.92 0.27 0.22 0.17 0.21 0.02 0.11 0.13 0.19 0.45 0.06 0.72 0.06 0.2 0.11 0.02 0.08 0.13 1.0 0.22 0.32 0.18 0.12 0.16 0.14 0.09 0.04
Sro200_g084810.1 (Contig201.g2372)
1.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.03 0.07 0.08 0.04 0.31 0.08 0.37 0.04 0.4 0.17 0.13 0.14 0.05 0.33 0.12 0.2 0.26 0.13 0.13 0.1 0.14 0.07
Sro201_g085140.1 (Contig2914.g23183)
0.07 0.07 0.15 0.05 0.06 0.09 0.11 0.14 0.17 0.59 0.5 0.75 0.3 1.0 0.48 0.59 0.53 0.27 0.54 0.62 0.65 0.44 0.19 0.14 0.08 0.54 0.45
Sro2087_g313880.1 (Contig3974.g30520)
0.45 0.03 0.07 0.07 0.09 0.05 0.06 0.05 0.45 0.57 0.13 0.9 0.04 0.58 0.25 0.05 0.26 0.18 0.73 0.37 0.49 0.76 0.37 0.08 0.09 1.0 0.44
Sro2115_g315160.1 (Contig3983.g30612)
0.27 0.1 0.19 0.14 0.18 0.16 0.32 0.3 0.45 0.69 0.58 0.8 0.67 0.82 0.48 0.68 0.57 0.41 0.62 0.93 1.0 0.5 0.57 0.39 0.45 0.68 0.52
Sro2299_g322460.1 (Contig2651.g21421)
1.0 0.31 0.34 0.23 0.28 0.08 0.12 0.17 0.26 0.46 0.18 0.59 0.38 0.44 0.14 0.17 0.22 0.14 0.4 0.48 0.59 0.4 0.36 0.17 0.18 0.28 0.22
Sro2365_g325030.1 (Contig2768.g22282)
0.19 0.09 0.04 0.15 0.07 0.03 0.09 0.38 0.16 0.33 0.17 0.5 0.04 0.15 0.3 0.19 0.18 0.11 0.28 0.09 0.25 0.39 0.02 0.59 1.0 0.3 0.11
Sro236_g095130.1 (Contig1410.g12951)
0.05 0.27 0.1 0.28 0.21 0.45 0.41 0.37 0.24 0.88 0.83 0.99 0.35 0.81 0.7 0.72 0.66 0.82 0.99 0.91 1.0 0.37 0.16 0.44 0.27 0.51 0.64
Sro244_g097200.1 (Contig2788.g22436)
0.68 0.03 0.02 0.06 0.06 0.09 0.25 0.16 0.34 0.6 0.22 0.78 0.11 0.84 0.35 0.27 0.28 0.1 0.4 0.31 0.43 1.0 0.29 0.09 0.1 0.29 0.21
Sro249_g098630.1 (Contig4691.g34867)
0.25 0.12 0.08 0.08 0.15 0.11 0.14 0.23 0.33 0.79 0.31 1.0 0.44 0.51 0.21 0.34 0.25 0.15 0.45 0.65 0.71 0.46 0.4 0.21 0.29 0.49 0.38
Sro251_g099180.1 (Contig687.g7998)
0.88 0.14 0.16 0.09 0.09 0.1 0.07 0.3 0.49 0.64 0.56 0.95 0.13 0.57 0.24 0.08 0.6 0.15 0.65 0.57 0.57 1.0 0.58 0.24 0.87 0.54 0.32
Sro2643_g333480.1 (Contig156.g1773)
0.03 0.08 0.03 0.05 0.02 0.12 0.29 0.23 0.14 0.56 0.37 0.68 0.35 0.5 0.41 0.43 0.24 0.32 1.0 0.46 0.62 0.23 0.1 0.32 0.5 0.4 0.34
Sro26_g017550.1 (Contig2432.g19926)
0.06 0.11 0.1 0.08 0.07 0.07 0.17 0.21 0.11 0.65 0.39 0.9 0.32 1.0 0.48 0.51 0.6 0.44 0.48 0.81 0.71 0.35 0.18 0.19 0.18 0.42 0.3
Sro2712_g335290.1 (Contig3697.g28485)
1.0 0.02 0.02 0.06 0.02 0.11 0.02 0.04 0.09 0.35 0.32 0.29 0.06 0.16 0.1 0.04 0.23 0.08 0.46 0.39 0.33 0.09 0.07 0.11 0.18 0.16 0.17
Sro2935_g340590.1 (Contig676.g7907)
1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.23 0.25 0.3 0.18 0.3 0.59 0.32 0.14 0.04 0.09 0.23 0.57 0.77 0.41 0.23 0.21 0.05 0.08 0.09 0.08
Sro299_g111380.1 (Contig1218.g11440)
0.71 0.04 0.02 0.03 0.06 0.09 0.14 0.22 0.15 0.69 0.31 1.0 0.28 0.93 0.34 0.38 0.39 0.21 0.39 0.65 0.66 0.38 0.17 0.15 0.15 0.44 0.34
Sro29_g019200.1 (Contig1384.g12763)
1.0 0.03 0.1 0.04 0.02 0.05 0.05 0.06 0.21 0.45 0.22 0.63 0.2 0.35 0.2 0.32 0.23 0.17 0.35 0.76 0.46 0.21 0.21 0.06 0.11 0.17 0.2
Sro31_g020380.1 (Contig420.g5633)
0.21 0.06 0.02 0.05 0.06 0.2 0.25 0.25 0.12 0.76 0.35 0.95 0.3 1.0 0.54 0.47 0.56 0.49 0.28 0.63 0.64 0.39 0.15 0.32 0.35 0.6 0.42
Sro341_g121550.1 (Contig3952.g30287)
0.78 0.17 0.64 0.09 0.1 0.1 0.33 0.29 0.36 0.68 0.66 0.8 0.25 0.27 0.38 0.49 0.43 0.4 0.45 0.75 1.0 0.34 0.46 0.49 0.51 0.45 0.41
Sro343_g122000.1 (Contig2616.g21251)
0.28 0.11 0.09 0.12 0.13 0.13 0.3 0.25 0.17 0.79 0.57 0.9 0.55 0.89 0.73 0.72 0.53 0.48 1.0 0.99 0.82 0.46 0.2 0.37 0.37 0.49 0.5
1.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.1 0.14 0.26 0.11 0.34 0.04 0.1 0.04 0.03 0.06 0.04 0.5 0.28 0.27 0.07 0.1 0.04 0.08 0.16 0.14
Sro372_g128770.1 (Contig2891.g23057)
0.14 0.04 0.05 0.05 0.07 0.06 0.15 0.22 0.25 0.65 0.35 1.0 0.28 0.96 0.34 0.34 0.32 0.19 0.73 0.66 0.59 0.54 0.24 0.22 0.23 0.56 0.35
Sro390_g132850.1 (Contig4620.g34474)
0.43 0.05 0.12 0.09 0.06 0.11 0.12 0.29 0.24 0.69 0.3 1.0 0.38 0.78 0.34 0.39 0.36 0.27 0.39 1.0 0.58 0.4 0.28 0.13 0.17 0.37 0.29
Sro392_g133260.1 (Contig4514.g33832)
1.0 0.01 0.01 0.07 0.03 0.08 0.05 0.09 0.1 0.31 0.2 0.29 0.07 0.15 0.15 0.17 0.19 0.08 0.4 0.39 0.3 0.08 0.07 0.18 0.3 0.13 0.17
Sro3_g002890.1 (Contig3832.g29474)
0.04 0.02 0.01 0.03 0.02 0.22 0.25 0.28 0.22 0.68 0.48 0.97 0.13 0.82 0.55 0.88 0.67 0.13 0.17 0.54 1.0 0.4 0.2 0.43 0.78 0.68 0.53
Sro408_g136830.1 (Contig3193.g25218)
0.16 0.07 0.06 0.06 0.06 0.09 0.2 0.21 0.16 0.65 0.4 0.87 0.38 1.0 0.46 0.34 0.42 0.23 0.65 0.67 0.65 0.34 0.2 0.24 0.19 0.33 0.33
Sro40_g024770.1 (Contig335.g4484)
1.0 0.04 0.05 0.08 0.09 0.06 0.09 0.13 0.32 0.49 0.15 0.8 0.07 0.72 0.16 0.12 0.26 0.05 0.4 0.22 0.28 0.58 0.31 0.13 0.18 0.48 0.25
Sro476_g150610.1 (Contig4641.g34593)
0.38 0.26 0.33 0.4 0.25 0.24 0.24 0.27 0.44 0.74 0.46 0.86 0.67 0.4 0.26 0.37 0.38 0.5 0.7 0.89 1.0 0.52 0.44 0.32 0.28 0.47 0.37
Sro492_g153840.1 (Contig2481.g20310)
0.17 0.14 0.04 0.08 0.11 0.06 0.14 0.17 0.25 0.79 0.28 0.98 0.09 0.51 0.16 0.27 0.38 0.1 0.51 0.55 1.0 0.44 0.33 0.26 0.3 0.65 0.5
Sro58_g033820.1 (Contig64.g576)
0.19 0.1 0.09 0.11 0.12 0.03 0.09 0.14 0.3 0.56 0.19 1.0 0.08 0.36 0.11 0.12 0.25 0.06 0.33 0.33 0.49 0.51 0.19 0.07 0.18 0.16 0.21
Sro5_g004070.1 (Contig4001.g30722)
1.0 0.04 0.02 0.1 0.03 0.07 0.37 0.4 0.2 0.62 0.17 0.87 0.15 0.48 0.37 0.1 0.2 0.03 0.36 0.2 0.59 0.3 0.21 0.5 0.26 0.14 0.12
Sro603_g173930.1 (Contig4246.g32152)
0.64 0.08 0.06 0.08 0.09 0.11 0.11 0.14 0.37 0.63 0.12 0.78 0.28 0.26 0.14 0.07 0.19 0.09 0.32 1.0 0.65 0.39 0.35 0.18 0.52 0.34 0.21
Sro619_g176490.1 (Contig2168.g18160)
0.09 0.23 0.12 0.14 0.1 0.19 0.54 0.37 0.31 0.77 0.94 1.0 0.44 0.88 0.57 0.45 0.63 0.46 0.53 0.79 0.7 0.56 0.32 0.48 0.39 0.42 0.51
Sro637_g179420.1 (Contig2599.g21063)
1.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.14 0.06 0.26 0.07 0.24 0.14 0.27 0.13 0.14 0.11 0.08 0.34 0.27 0.26 0.16 0.06 0.23 0.28 0.26 0.13
Sro649_g181180.1 (Contig1362.g12544)
0.47 0.22 0.15 0.21 0.25 0.45 0.19 0.21 0.29 0.7 0.27 0.97 0.08 0.47 0.24 0.26 0.37 0.28 0.37 0.48 1.0 0.3 0.32 0.33 0.42 0.6 0.43
Sro756_g197850.1 (Contig3619.g28001)
1.0 0.02 0.05 0.03 0.03 0.04 0.09 0.12 0.28 0.46 0.19 0.75 0.15 0.37 0.18 0.19 0.17 0.11 0.45 0.53 0.36 0.44 0.26 0.07 0.12 0.28 0.22
Sro791_g202930.1 (Contig1638.g14759)
0.78 0.03 0.04 0.04 0.04 0.06 0.12 0.13 0.14 0.61 0.22 1.0 0.06 0.5 0.24 0.27 0.28 0.17 0.23 0.25 0.61 0.42 0.22 0.29 0.44 0.45 0.23
Sro797_g203890.1 (Contig4746.g35165)
0.24 0.15 0.11 0.08 0.11 0.09 0.19 0.19 0.14 0.68 0.31 1.0 0.28 0.76 0.33 0.38 0.34 0.26 0.5 0.61 0.78 0.49 0.23 0.24 0.21 0.46 0.3
Sro92_g048070.1 (Contig486.g6567)
0.42 0.2 0.31 0.28 0.3 0.19 0.42 0.42 0.69 0.71 0.38 0.97 0.37 0.66 0.4 0.47 0.41 0.32 0.51 0.57 1.0 0.78 0.72 0.32 0.6 0.61 0.42
Sro95_g049360.1 (Contig45.g321)
0.13 0.04 0.03 0.03 0.05 0.15 0.22 0.49 0.35 0.72 0.19 1.0 0.17 0.32 0.19 0.16 0.11 0.08 0.35 0.55 0.62 0.44 0.25 0.1 0.1 0.1 0.15
Sro982_g227760.1 (Contig2831.g22687)
0.37 0.03 0.01 0.03 0.02 0.08 0.2 0.2 0.04 0.41 0.2 0.69 0.05 0.22 0.39 0.28 0.22 0.09 0.21 0.11 0.3 0.08 0.09 0.62 1.0 0.28 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)