Heatmap: Cluster_292 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1000_g229740.1 (Contig128.g1451)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.12	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.33	0.64	0.0	0.77	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1105_g241890.1 (Contig2574.g20908)	0.0	0.05	0.08	0.0	0.06	0.0	0.08	0.42	0.24	0.13	0.03	0.14	1.0	0.01	0.01	0.06	0.01	0.43	0.16	0.96	0.12	0.62	0.06	0.01	0.01	0.0	0.07
Sro1156_g247270.1 (Contig4160.g31774)	0.06	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.25	0.58	0.59	0.18	0.11	0.2	0.93	0.39	0.16	0.06	0.03	0.06	0.09	1.0	0.23	0.62	0.41	0.01	0.03	0.04	0.06
Sro118_g057760.1 (Contig2714.g21846)	0.1	0.07	0.09	0.05	0.02	0.06	0.12	0.35	0.09	0.11	0.07	0.06	0.66	0.01	0.05	0.07	0.1	0.27	0.24	1.0	0.11	0.42	0.15	0.09	0.09	0.04	0.04
Sro119_g058200.1 (Contig2194.g18293)	0.01	0.25	0.22	0.25	0.21	0.12	0.33	0.23	0.13	0.47	0.24	0.6	0.81	0.51	0.27	0.2	0.2	0.52	0.99	1.0	0.63	0.9	0.19	0.44	0.43	0.24	0.16
Sro124_g059820.1 (Contig2339.g19233)	0.0	0.07	0.67	0.19	0.15	0.02	0.22	0.6	0.42	0.12	0.09	0.02	0.76	0.04	0.1	0.16	0.09	0.77	0.94	1.0	0.07	0.79	0.5	0.13	0.26	0.28	0.1
Sro1320_g262420.1 (Contig4115.g31421)	0.0	0.21	0.27	0.27	0.28	0.0	0.19	0.66	0.39	0.08	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.64	1.0	0.0	0.47	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1345_g264800.1 (Contig4713.g35054)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.36	0.18	0.06	0.01	0.09	1.0	0.03	0.04	0.04	0.09	0.07	0.11	0.94	0.07	0.26	0.09	0.0	0.05	0.12	0.03
Sro1352_g265310.1 (Contig343.g4650)	0.0	0.03	0.04	0.05	0.02	0.0	0.05	0.69	0.31	0.06	0.0	0.01	0.46	0.0	0.01	0.0	0.0	0.48	0.52	1.0	0.0	0.45	0.22	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro1383_g268020.1 (Contig1647.g14861)	0.0	0.19	0.2	0.08	0.1	0.02	0.08	0.17	0.15	0.14	0.04	0.03	0.7	0.06	0.06	0.06	0.01	0.83	0.82	1.0	0.1	0.66	0.1	0.02	0.03	0.02	0.04
Sro144_g066830.1 (Contig3873.g29782)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.24	0.61	0.37	0.22	0.16	0.29	0.85	0.2	0.24	0.23	0.13	0.43	0.48	1.0	0.21	0.91	0.33	0.22	0.3	0.16	0.16
Sro1553_g281930.1 (Contig1252.g11688)	0.05	0.17	0.2	0.06	0.06	0.05	0.13	0.19	0.18	0.2	0.12	0.19	0.63	0.18	0.18	0.25	0.16	0.36	0.44	1.0	0.18	0.32	0.17	0.11	0.12	0.13	0.15
Sro1605_g285410.1 (Contig4243.g32126)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.47	0.05	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.41	1.0	0.0	0.71	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1667_g289750.1 (Contig4103.g31329)	0.06	0.43	0.25	0.18	0.2	0.03	0.2	0.65	0.39	0.21	0.08	0.2	0.83	0.19	0.08	0.02	0.02	0.39	0.34	1.0	0.11	0.99	0.29	0.07	0.02	0.02	0.05
Sro1718_g293360.1 (Contig3856.g29684)	0.01	0.14	0.05	0.09	0.14	0.01	0.12	0.11	0.11	0.23	0.22	0.21	0.28	0.12	0.07	0.24	0.24	0.31	1.0	0.55	0.22	0.79	0.16	0.0	0.0	0.09	0.31
Sro171_g075620.1 (Contig113.g1271)	0.0	0.55	0.81	0.24	0.35	0.07	0.33	0.45	0.14	0.32	0.39	0.29	0.59	0.24	0.28	0.41	0.3	0.44	0.62	1.0	0.41	0.98	0.18	0.34	0.34	0.31	0.26
Sro173_g076450.1 (Contig2926.g23326)	0.0	0.19	0.17	0.17	0.22	0.1	0.34	0.53	0.42	0.38	0.34	0.52	1.0	0.55	0.38	0.47	0.16	0.39	0.74	0.8	0.44	0.63	0.27	0.41	0.23	0.3	0.33
Sro1790_g297700.1 (Contig4724.g35068)	0.0	0.17	0.04	0.07	0.13	0.0	0.26	0.32	0.18	0.08	0.0	0.01	0.3	0.0	0.01	0.01	0.0	0.58	0.94	0.47	0.0	1.0	0.16	0.0	0.02	0.01	0.01
Sro1801_g298480.1 (Contig3478.g26984)	0.0	0.33	0.2	0.31	0.29	0.0	0.0	0.3	0.17	0.1	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.59	0.77	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1948_g307240.1 (Contig1161.g11083)	0.02	0.08	0.1	0.14	0.14	0.08	0.71	0.94	0.46	0.23	0.21	0.28	1.0	0.21	0.42	0.26	0.26	0.43	0.47	0.94	0.35	0.9	0.3	0.14	0.32	0.1	0.22
Sro195_g083240.1 (Contig4576.g34161)	0.02	0.33	0.37	0.29	0.36	0.36	0.39	0.35	0.4	0.47	0.47	0.64	1.0	0.7	0.42	0.56	0.43	0.39	0.72	0.83	0.49	0.79	0.57	0.37	0.32	0.26	0.32
Sro1_g001040.1 (Contig3007.g24019)	0.09	0.11	0.15	0.13	0.12	0.08	0.22	0.31	0.28	0.24	0.21	0.22	0.99	0.22	0.19	0.2	0.33	0.25	0.46	1.0	0.33	0.41	0.42	0.13	0.09	0.13	0.17
Sro208_g087180.1 (Contig351.g4789)	0.02	0.03	0.01	0.0	0.03	0.02	0.34	0.26	0.4	0.19	0.12	0.21	0.78	0.15	0.15	0.16	0.1	0.32	0.41	1.0	0.2	0.61	0.26	0.14	0.15	0.06	0.09
Sro2126_g315710.1 (Contig622.g7591)	0.01	0.22	0.44	0.43	0.42	0.05	0.05	0.71	0.38	0.14	0.1	0.08	0.75	0.0	0.07	0.09	0.06	0.2	0.42	1.0	0.03	0.35	0.1	0.03	0.03	0.04	0.12
Sro2270_g321390.1 (Contig1037.g10275)	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.39	0.05	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.35	1.0	0.0	0.87	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro2401_g326320.1 (Contig1955.g16794)	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.08	0.05	0.19	0.07	0.14	0.58	0.14	0.24	0.39	0.06	1.0	0.33	0.66	0.21	0.29	0.04	0.23	0.13	0.28	0.16
Sro2528_g330350.1 (Contig3353.g26270)	0.0	0.47	0.25	0.32	0.72	0.0	0.0	0.43	0.01	0.1	0.0	0.02	0.86	0.02	0.01	0.0	0.0	0.59	0.41	1.0	0.03	0.56	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06
Sro2639_g333370.1 (Contig4525.g33893)	0.0	0.12	0.26	0.08	0.07	0.0	0.2	0.67	0.32	0.05	0.01	0.01	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49	0.6	0.01	0.75	0.33	0.02	0.0	0.0	0.0
Sro2699_g335010.1 (Contig2762.g22249)	0.01	0.05	0.07	0.07	0.04	0.02	0.39	0.78	0.41	0.23	0.08	0.25	0.51	0.09	0.06	0.08	0.0	0.91	1.0	0.8	0.07	0.76	0.45	0.05	0.19	0.2	0.06
Sro2773_g336810.1 (Contig487.g6583)	0.02	0.29	0.6	0.09	0.17	0.0	0.0	0.59	0.0	0.07	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.56	1.0	0.0	0.54	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro289_g109190.1 (Contig4471.g33603)	0.0	0.06	0.05	0.03	0.02	0.13	0.15	0.18	0.13	0.2	0.24	0.06	1.0	0.13	0.31	0.24	0.16	0.52	0.35	0.86	0.21	0.37	0.04	0.09	0.31	0.14	0.22
Sro297_g110860.1 (Contig251.g3075)	0.0	0.24	0.15	0.24	0.15	0.0	0.0	0.17	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.21	0.63	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro316_g115530.1 (Contig2414.g19759)	0.02	0.43	0.51	0.31	0.23	0.21	0.35	0.43	0.36	0.39	0.42	0.39	1.0	0.43	0.38	0.34	0.39	0.32	0.39	0.68	0.38	0.55	0.33	0.37	0.29	0.2	0.36
Sro3426_g347890.1 (Contig2686.g21708)	0.0	0.32	0.17	0.47	0.3	0.0	0.0	0.14	0.02	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.5	0.45	0.92	0.0	0.69	0.15	0.0	0.0	0.0	0.02
Sro381_g130930.1 (Contig161.g1826)	0.0	0.17	0.23	0.21	0.55	0.0	0.0	0.08	0.22	0.07	0.0	0.0	0.3	0.01	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.57	0.0	0.98	0.16	0.0	0.0	0.01	0.0
Sro389_g132490.1 (Contig669.g7866)	0.0	0.05	0.0	0.0	0.06	0.0	0.01	0.06	0.0	0.09	0.02	0.0	0.55	0.03	0.01	0.03	0.0	1.0	0.23	0.67	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro390_g132810.1 (Contig4620.g34470)	0.0	0.35	1.0	0.24	0.29	0.19	0.17	0.55	0.48	0.23	0.0	0.17	0.75	0.27	0.24	0.13	0.1	0.48	0.73	0.62	0.08	0.58	0.53	0.3	0.18	0.0	0.23
Sro3945_g352070.1 (Contig4400.g33055)	0.0	0.35	0.22	0.34	0.27	0.01	0.24	0.36	0.29	0.21	0.07	0.16	0.49	0.05	0.16	0.2	0.09	0.49	0.46	1.0	0.17	0.6	0.22	0.08	0.05	0.1	0.12
Sro538_g162460.1 (Contig95.g1087)	0.0	0.07	0.06	0.06	0.0	0.0	0.13	0.01	0.13	0.12	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.51	1.0	0.0	0.57	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro569_g168260.1 (Contig1581.g14352)	0.01	0.63	0.5	0.42	0.63	0.14	0.38	0.53	0.41	0.34	0.29	0.29	1.0	0.3	0.29	0.28	0.29	0.47	0.52	0.87	0.36	0.84	0.29	0.31	0.21	0.25	0.26
Sro56_g033070.1 (Contig3029.g24183)	0.01	0.11	0.09	0.08	0.04	0.19	0.0	0.11	0.0	0.04	0.13	0.0	0.68	0.0	0.11	0.0	0.27	0.2	0.83	0.46	0.0	1.0	0.18	0.0	0.02	0.0	0.0
Sro598_g173050.1 (Contig1655.g14931)	0.01	0.29	0.33	0.17	0.16	0.09	0.39	0.37	0.35	0.38	0.29	0.4	0.83	0.35	0.32	0.35	0.21	0.51	0.53	1.0	0.48	0.73	0.32	0.23	0.25	0.18	0.22
Sro598_g173090.1 (Contig1655.g14935)	0.0	0.55	0.38	0.23	0.23	0.2	0.67	0.44	0.32	0.28	0.14	0.13	0.74	0.05	0.08	0.02	0.08	0.53	0.55	1.0	0.4	0.84	0.39	0.4	0.47	0.31	0.18
Sro605_g174300.1 (Contig514.g6796)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.23	0.01	0.07	0.0	0.01	0.84	0.04	0.02	0.0	0.0	0.42	0.37	1.0	0.05	0.32	0.0	0.06	0.02	0.19	0.01
Sro632_g178680.1 (Contig512.g6776)	0.01	0.44	0.33	0.22	0.19	0.13	0.25	0.25	0.18	0.25	0.34	0.25	1.0	0.14	0.33	0.38	0.31	0.39	0.3	0.69	0.29	0.54	0.17	0.17	0.27	0.16	0.27
Sro6_g005270.1 (Contig175.g2032)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.13	0.04	0.04	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.2	0.21	0.99	0.0	0.26	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro782_g201710.2	0.52	0.07	0.1	0.03	0.02	0.06	0.5	1.0	0.56	0.27	0.22	0.33	0.43	0.08	0.25	0.17	0.3	0.45	0.21	0.43	0.35	0.68	0.19	0.27	0.46	0.42	0.18
Sro88_g046390.1 (Contig265.g3297)	0.0	0.07	0.06	0.0	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.02	0.06	0.34	0.01	0.01	0.0	0.07	0.09	0.97	0.84	0.13	1.0	0.04	0.0	0.0	0.07	0.04
Sro899_g217700.1 (Contig130.g1457)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.03	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.42	0.66	0.0	0.7	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro919_g220080.2	0.03	0.32	0.46	0.33	0.37	0.0	0.03	0.33	0.31	0.18	0.16	0.23	0.89	0.09	0.11	0.22	0.15	0.69	1.0	0.83	0.14	0.69	0.2	0.04	0.16	0.05	0.14
Sro99_g050790.1 (Contig1378.g12650)	0.13	0.24	0.21	0.18	0.24	0.24	0.21	0.49	0.34	0.41	0.23	0.39	0.7	0.2	0.18	0.21	0.21	0.26	0.61	0.71	0.54	1.0	0.21	0.26	0.39	0.22	0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)