1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_334 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1070_g237810.1 (Contig4107.g31354)
 0.02 1.0 0.82 0.78 0.67 0.14 0.43 0.45 0.52 0.35 0.45 0.31 0.31 0.16 0.31 0.35 0.6 0.42 0.35 0.24 0.24 0.41 0.54 0.29 0.31 0.36 0.3
Sro1070_g237820.1 (Contig4107.g31355)
 0.0 1.0 0.54 0.96 0.79 0.08 0.35 0.17 0.41 0.11 0.13 0.04 0.13 0.02 0.1 0.06 0.39 0.12 0.11 0.03 0.01 0.25 0.4 0.02 0.04 0.11 0.17
Sro108_g054260.1 (Contig2294.g19006)
 0.0 0.94 0.98 0.93 0.93 0.36 0.48 0.8 0.74 0.4 1.0 0.39 0.38 0.36 0.57 0.49 0.83 0.31 0.36 0.26 0.2 0.21 0.65 0.35 0.22 0.28 0.59
0.2 0.52 0.77 1.0 0.92 0.03 0.24 0.21 0.34 0.13 0.1 0.05 0.21 0.03 0.11 0.07 0.07 0.56 0.25 0.17 0.04 0.1 0.35 0.14 0.42 0.37 0.07
0.21 0.61 0.91 1.0 0.96 0.06 0.21 0.27 0.27 0.16 0.07 0.05 0.79 0.02 0.1 0.07 0.07 0.51 0.23 0.55 0.05 0.25 0.39 0.18 0.49 0.37 0.06
Sro1284_g259240.1 (Contig3866.g29733)
 0.24 0.85 1.0 0.85 0.95 0.04 0.22 0.17 0.39 0.17 0.1 0.12 0.31 0.03 0.08 0.05 0.05 0.31 0.28 0.33 0.11 0.24 0.47 0.21 0.29 0.2 0.05
Sro134_g063590.1 (Contig145.g1621)
 0.22 0.43 1.0 0.63 0.53 0.09 0.22 0.19 0.28 0.23 0.19 0.19 0.21 0.17 0.21 0.22 0.13 0.24 0.27 0.19 0.16 0.15 0.31 0.19 0.11 0.2 0.2
0.17 0.62 1.0 0.72 0.7 0.14 0.22 0.35 0.29 0.21 0.33 0.24 0.09 0.09 0.25 0.28 0.29 0.33 0.25 0.2 0.09 0.23 0.39 0.46 0.23 0.36 0.18
Sro1390_g268650.1 (Contig2158.g18121)
 0.17 0.79 1.0 0.88 0.78 0.15 0.22 0.29 0.37 0.29 0.32 0.28 0.34 0.18 0.29 0.34 0.22 0.53 0.4 0.37 0.26 0.28 0.4 0.21 0.18 0.21 0.25
Sro1440_g272850.1 (Contig840.g9263)
 0.04 0.23 0.63 0.54 1.0 0.01 0.04 0.31 0.22 0.05 0.1 0.02 0.07 0.06 0.04 0.04 0.02 0.08 0.02 0.03 0.01 0.12 0.02 0.04 0.04 0.06 0.07
Sro1537_g280670.1 (Contig3053.g24291)
 0.06 0.6 1.0 0.61 0.47 0.15 0.14 0.16 0.2 0.22 0.15 0.28 0.21 0.57 0.15 0.12 0.19 0.05 0.17 0.12 0.28 0.17 0.19 0.19 0.16 0.12 0.15
Sro1544_g281240.1 (Contig2133.g17982)
 0.01 0.71 1.0 0.65 0.6 0.17 0.25 0.3 0.29 0.21 0.38 0.21 0.17 0.14 0.28 0.21 0.42 0.39 0.24 0.12 0.13 0.2 0.27 0.16 0.15 0.21 0.27
Sro158_g071720.1 (Contig163.g1857)
 0.02 0.91 0.99 1.0 0.94 0.03 0.18 0.16 0.25 0.26 0.15 0.13 0.32 0.16 0.11 0.14 0.22 0.4 0.41 0.44 0.17 0.06 0.21 0.19 0.2 0.31 0.08
Sro164_g073490.1 (Contig4339.g32723)
 0.0 0.7 1.0 0.85 0.89 0.18 0.23 0.26 0.29 0.17 0.29 0.12 0.01 0.05 0.16 0.1 0.23 0.04 0.16 0.09 0.09 0.05 0.36 0.2 0.31 0.33 0.25
Sro1713_g292950.1 (Contig2943.g23375)
 0.03 0.91 1.0 0.82 0.79 0.15 0.26 0.34 0.36 0.26 0.45 0.3 0.15 0.17 0.27 0.26 0.29 0.27 0.23 0.17 0.17 0.09 0.37 0.16 0.11 0.15 0.26
Sro1798_g298310.1 (Contig1745.g15545)
 0.33 0.7 0.67 0.47 0.56 0.09 0.43 0.39 0.58 0.29 0.35 0.2 1.0 0.17 0.28 0.3 0.34 0.46 0.37 0.98 0.2 0.48 0.49 0.2 0.16 0.21 0.24
Sro18_g012810.1 (Contig1351.g12441)
 0.22 0.64 0.99 0.83 1.0 0.13 0.25 0.43 0.47 0.16 0.26 0.2 0.16 0.03 0.17 0.2 0.24 0.1 0.08 0.17 0.13 0.21 0.31 0.11 0.08 0.09 0.16
Sro18_g012900.1 (Contig1351.g12450)
 0.04 0.75 0.91 0.87 1.0 0.02 0.12 0.29 0.34 0.07 0.06 0.02 0.02 0.01 0.07 0.07 0.04 0.1 0.03 0.03 0.02 0.1 0.3 0.05 0.09 0.09 0.04
Sro1985_g309440.1 (Contig949.g9800)
 0.01 0.52 1.0 0.94 0.63 0.0 0.01 0.27 0.42 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0
Sro1_g000250.1 (Contig3007.g23940)
 0.01 0.23 0.32 1.0 0.95 0.03 0.1 0.2 0.37 0.03 0.03 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.06 0.06 0.0 0.03 0.01 0.13 0.08 0.02 0.0 0.03 0.04
Sro2192_g318440.1 (Contig3677.g28399)
 0.0 0.67 0.61 0.93 1.0 0.06 0.26 0.09 0.35 0.09 0.14 0.03 0.12 0.04 0.11 0.04 0.29 0.12 0.06 0.05 0.01 0.24 0.41 0.04 0.04 0.11 0.06
Sro226_g091930.1 (Contig565.g7165)
 0.01 0.37 0.62 1.0 0.85 0.0 0.02 0.3 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.03 0.03 0.04 0.0
Sro227_g092160.1 (Contig327.g4328)
 0.0 0.79 1.0 0.83 0.83 0.12 0.3 0.47 0.59 0.26 0.3 0.29 0.5 0.33 0.28 0.44 0.35 0.53 0.32 0.3 0.23 0.37 0.53 0.13 0.09 0.15 0.25
Sro2323_g323320.1 (Contig737.g8449)
 0.55 0.58 0.59 0.55 0.63 0.19 0.51 0.45 0.63 0.36 0.53 0.29 1.0 0.29 0.42 0.54 0.46 0.5 0.37 0.93 0.28 0.44 0.55 0.21 0.18 0.28 0.4
0.01 1.0 0.79 0.94 0.69 0.15 0.17 0.37 0.38 0.1 0.05 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.11 0.01 0.04 0.03 0.02 0.16 0.27 0.11 0.04 0.03 0.03
Sro249_g098720.1 (Contig4691.g34876)
 0.02 0.63 0.86 1.0 0.9 0.09 0.21 0.25 0.32 0.13 0.23 0.11 0.19 0.04 0.17 0.2 0.15 0.09 0.05 0.09 0.05 0.09 0.23 0.1 0.09 0.08 0.15
Sro2502_g329530.1 (Contig3589.g27741)
 0.04 0.91 0.67 1.0 0.79 0.04 0.03 0.02 0.0 0.18 0.11 0.12 0.15 0.07 0.09 0.08 0.17 0.16 0.07 0.11 0.14 0.0 0.0 0.2 0.42 0.22 0.11
Sro255_g100290.1 (Contig2336.g19206)
 0.58 0.42 0.62 0.83 1.0 0.06 0.07 0.55 0.66 0.11 0.2 0.08 0.03 0.02 0.16 0.27 0.18 0.1 0.06 0.03 0.03 0.38 0.28 0.04 0.03 0.09 0.16
Sro267_g103420.1 (Contig4506.g33804)
 0.04 0.81 0.84 0.97 1.0 0.1 0.23 0.28 0.46 0.17 0.22 0.12 0.08 0.1 0.19 0.15 0.22 0.24 0.18 0.08 0.05 0.1 0.34 0.22 0.14 0.17 0.2
Sro268_g103710.1 (Contig1776.g15720)
 0.03 0.74 1.0 0.6 0.51 0.2 0.43 0.58 0.71 0.37 0.48 0.35 0.55 0.43 0.45 0.4 0.52 0.45 0.44 0.49 0.35 0.52 0.54 0.37 0.16 0.23 0.44
Sro2849_g338520.1 (Contig2096.g17840)
 0.0 0.77 1.0 1.0 0.93 0.02 0.05 0.56 0.49 0.09 0.02 0.0 0.2 0.01 0.03 0.02 0.14 0.2 0.09 0.25 0.03 0.17 0.24 0.06 0.08 0.0 0.03
Sro2940_g340700.1 (Contig1872.g16364)
 0.02 0.35 1.0 0.5 0.49 0.03 0.09 0.18 0.13 0.18 0.05 0.24 0.06 0.11 0.1 0.05 0.03 0.07 0.06 0.05 0.15 0.13 0.16 0.05 0.07 0.04 0.05
Sro2_g001910.1 (Contig467.g6349)
 0.13 0.5 1.0 0.53 0.49 0.01 0.14 0.12 0.37 0.05 0.01 0.0 0.04 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.09 0.19 0.03 0.0 0.0 0.01
Sro3068_g343130.1 (Contig3176.g25110)
 0.0 0.8 0.87 1.0 1.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.11 0.02 0.11 0.0 0.03 0.06 0.02 0.07 0.0 0.0 0.01 0.12 0.02 0.01 0.0 0.02 0.06 0.03
Sro342_g121840.1 (Contig3070.g24484)
 0.0 0.23 0.75 1.0 0.46 0.0 0.02 0.27 0.26 0.05 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.16 0.0 0.01 0.01 0.0
Sro371_g128590.1 (Contig736.g8437)
 0.12 0.65 0.9 0.99 1.0 0.05 0.19 0.29 0.46 0.27 0.28 0.23 0.67 0.2 0.25 0.3 0.21 0.48 0.36 0.72 0.14 0.3 0.33 0.22 0.25 0.13 0.22
Sro380_g130590.1 (Contig3948.g30251)
 0.0 0.9 0.97 0.91 1.0 0.0 0.02 0.22 0.48 0.06 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.12 0.2 0.04 0.04 0.04 0.03
Sro412_g137930.1 (Contig2922.g23265)
 0.03 1.0 0.8 0.73 0.93 0.14 0.15 0.15 0.23 0.23 0.29 0.16 0.15 0.09 0.2 0.16 0.33 0.17 0.14 0.12 0.13 0.06 0.13 0.26 0.16 0.24 0.18
Sro472_g149830.1 (Contig4323.g32598)
 0.0 0.75 0.51 0.82 1.0 0.02 0.11 0.21 0.59 0.09 0.04 0.03 0.04 0.02 0.03 0.01 0.05 0.16 0.09 0.03 0.01 0.08 0.35 0.07 0.1 0.07 0.02
Sro475_g150340.1 (Contig3232.g25560)
 0.01 0.74 1.0 0.64 0.66 0.15 0.18 0.34 0.37 0.23 0.36 0.21 0.29 0.11 0.25 0.19 0.23 0.18 0.25 0.15 0.2 0.21 0.25 0.32 0.28 0.24 0.26
Sro480_g151270.1 (Contig2927.g23328)
 0.01 1.0 0.83 0.75 0.71 0.01 0.06 0.03 0.11 0.09 0.05 0.05 0.03 0.02 0.07 0.05 0.09 0.07 0.01 0.02 0.06 0.01 0.16 0.01 0.01 0.04 0.05
Sro487_g152770.1 (Contig367.g4953)
 0.0 0.4 0.28 1.0 0.55 0.0 0.02 0.35 0.45 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.05 0.02
Sro48_g028290.1 (Contig1255.g11724)
 0.0 0.12 0.34 1.0 0.85 0.04 0.01 0.21 0.2 0.04 0.03 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.03 0.1 0.04 0.05 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03
Sro48_g028300.1 (Contig1255.g11725)
 0.02 0.42 1.0 0.5 0.43 0.06 0.48 0.56 0.4 0.13 0.05 0.33 0.06 0.02 0.13 0.18 0.05 0.15 0.06 0.07 0.06 0.17 0.18 0.26 0.34 0.19 0.08
Sro498_g154870.1 (Contig3753.g28741)
 0.05 0.67 1.0 0.53 0.44 0.18 0.23 0.21 0.4 0.27 0.32 0.28 0.35 0.2 0.3 0.26 0.48 0.37 0.41 0.43 0.26 0.27 0.37 0.12 0.09 0.14 0.3
Sro4_g003700.1 (Contig3815.g29288)
 0.0 0.51 1.0 0.76 0.76 0.24 0.34 0.3 0.44 0.22 0.36 0.18 0.23 0.06 0.27 0.28 0.31 0.52 0.32 0.24 0.18 0.3 0.41 0.14 0.17 0.24 0.26
Sro509_g156940.1 (Contig4289.g32387)
 0.0 0.32 0.6 0.63 1.0 0.0 0.05 0.09 0.18 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.19 0.01 0.03 0.0 0.08 0.16 0.01 0.02 0.02 0.02
Sro54_g031680.1 (Contig2430.g19856)
 0.14 0.75 1.0 0.57 0.39 0.09 0.18 0.11 0.14 0.28 0.22 0.27 0.25 0.47 0.2 0.19 0.22 0.11 0.19 0.44 0.25 0.23 0.14 0.2 0.1 0.06 0.16
Sro56_g032820.1 (Contig3029.g24158)
 0.06 0.58 0.82 1.0 0.77 0.05 0.22 0.17 0.38 0.08 0.07 0.03 0.04 0.02 0.11 0.07 0.06 0.04 0.01 0.02 0.03 0.34 0.3 0.06 0.06 0.05 0.03
Sro5_g003990.1 (Contig4001.g30714)
 0.0 0.68 0.65 0.93 1.0 0.02 0.01 0.36 0.21 0.08 0.09 0.02 0.24 0.02 0.05 0.18 0.06 0.09 0.06 0.17 0.04 0.05 0.04 0.02 0.13 0.16 0.09
Sro5_g004790.1 (Contig4001.g30794)
 0.07 0.73 1.0 0.53 0.51 0.1 0.26 0.22 0.6 0.2 0.18 0.21 0.62 0.15 0.13 0.08 0.28 0.3 0.29 0.47 0.14 0.49 0.55 0.08 0.08 0.07 0.1
0.01 1.0 0.88 0.97 0.84 0.07 0.11 0.34 0.21 0.09 0.05 0.02 0.15 0.01 0.06 0.02 0.05 0.04 0.02 0.02 0.0 0.25 0.28 0.01 0.02 0.0 0.02
Sro66_g037160.1 (Contig399.g5386)
 0.07 0.55 1.0 0.99 0.83 0.13 0.06 0.28 0.39 0.09 0.14 0.03 0.02 0.04 0.11 0.08 0.13 0.02 0.02 0.01 0.04 0.26 0.27 0.03 0.01 0.07 0.08
Sro688_g187340.1 (Contig1782.g15780)
 0.0 1.0 0.76 0.67 0.78 0.04 0.33 0.33 0.54 0.16 0.13 0.11 0.25 0.21 0.14 0.06 0.2 0.17 0.17 0.2 0.11 0.58 0.55 0.1 0.1 0.11 0.08
Sro703_g190100.1 (Contig314.g4178)
 0.01 0.72 1.0 0.54 0.52 0.14 0.15 0.13 0.3 0.16 0.23 0.12 0.62 0.17 0.22 0.08 0.39 0.23 0.32 0.28 0.08 0.41 0.25 0.09 0.05 0.06 0.08
0.0 0.17 0.67 0.16 0.16 0.0 0.55 0.38 0.65 0.09 0.02 0.07 1.0 0.06 0.04 0.01 0.05 0.01 0.05 1.0 0.0 0.3 0.35 0.03 0.03 0.01 0.01
Sro78_g042390.1 (Contig1698.g15215)
 0.09 0.6 1.0 0.77 0.75 0.13 0.19 0.32 0.38 0.23 0.34 0.17 0.17 0.17 0.23 0.25 0.21 0.3 0.32 0.19 0.15 0.19 0.25 0.16 0.1 0.17 0.28
Sro806_g205100.1 (Contig1260.g11796)
 0.1 0.85 1.0 0.74 0.79 0.19 0.32 0.41 0.49 0.3 0.23 0.3 0.3 0.17 0.26 0.3 0.28 0.47 0.4 0.34 0.26 0.29 0.35 0.28 0.26 0.19 0.23
Sro849_g210530.1 (Contig3240.g25599)
 0.36 0.13 1.0 0.61 0.13 0.07 0.09 0.07 0.09 0.23 0.09 0.32 0.14 0.1 0.1 0.1 0.06 0.05 0.05 0.12 0.18 0.1 0.05 0.09 0.06 0.02 0.09
Sro84_g044790.1 (Contig220.g2612)
 0.14 0.68 1.0 0.89 0.81 0.21 0.28 0.37 0.29 0.23 0.22 0.25 0.17 0.39 0.18 0.16 0.31 0.11 0.17 0.11 0.16 0.11 0.23 0.17 0.13 0.14 0.18
Sro904_g218390.1 (Contig2814.g22576)
 0.03 0.51 1.0 0.6 0.54 0.21 0.21 0.84 0.58 0.21 0.26 0.19 0.14 0.11 0.18 0.49 0.25 0.22 0.12 0.08 0.11 0.16 0.23 0.11 0.05 0.08 0.22
Sro986_g228090.1 (Contig4404.g33094)
 0.11 0.28 1.0 0.89 0.6 0.04 0.2 0.38 0.34 0.17 0.15 0.1 0.14 0.04 0.16 0.12 0.08 0.41 0.19 0.13 0.16 0.08 0.32 0.55 0.81 0.45 0.13
Sro9_g007680.1 (Contig4120.g31536)
 0.04 0.79 1.0 0.84 0.87 0.12 0.29 0.26 0.23 0.2 0.32 0.2 0.08 0.06 0.22 0.29 0.21 0.17 0.15 0.12 0.16 0.12 0.21 0.24 0.17 0.22 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)