Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro102_g051870.1 (Contig319.g4231)
1.0 0.12 0.2 0.31 0.27 0.22 0.41 0.31 0.45 0.37 0.38 0.49 0.69 0.24 0.33 0.3 0.38 0.31 0.33 0.57 0.53 0.3 0.3 0.4 0.64 0.3 0.22
Sro103_g052440.1 (Contig308.g4041)
1.0 0.06 0.05 0.1 0.08 0.15 0.44 0.31 0.29 0.37 0.25 0.38 0.51 0.45 0.27 0.27 0.21 0.25 0.26 0.39 0.36 0.24 0.35 0.16 0.22 0.17 0.15
Sro1088_g239990.1 (Contig3790.g29094)
1.0 0.09 0.06 0.11 0.14 0.01 0.06 0.15 0.19 0.07 0.02 0.07 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.09 0.14 0.05 0.07 0.37 0.08 0.02 0.04 0.03 0.01
Sro1108_g242150.1 (Contig1956.g16796)
0.76 0.13 0.18 0.18 0.09 0.09 0.22 0.12 0.18 0.38 0.15 0.39 1.0 0.4 0.19 0.3 0.19 0.38 0.58 0.77 0.73 0.43 0.24 0.07 0.1 0.1 0.11
Sro1153_g247040.1 (Contig4473.g33619)
1.0 0.04 0.03 0.04 0.04 0.1 0.21 0.16 0.17 0.34 0.2 0.39 0.68 0.38 0.21 0.12 0.25 0.37 0.45 0.68 0.54 0.39 0.19 0.16 0.15 0.19 0.11
Sro1180_g249800.1 (Contig2637.g21372)
0.3 0.27 0.21 0.3 0.28 0.28 0.24 0.09 0.09 0.54 0.43 0.76 0.61 0.54 0.34 0.28 0.2 0.46 0.91 1.0 0.65 0.43 0.2 0.55 0.46 0.33 0.3
Sro1222_g253800.1 (Contig1750.g15572)
1.0 0.2 0.16 0.21 0.21 0.1 0.22 0.16 0.13 0.43 0.27 0.54 0.38 0.32 0.24 0.12 0.33 0.41 0.66 0.42 0.7 0.15 0.16 0.16 0.17 0.13 0.15
1.0 0.35 0.36 0.44 0.47 0.16 0.38 0.34 0.35 0.43 0.47 0.41 0.79 0.42 0.41 0.4 0.4 0.36 0.48 0.52 0.46 0.49 0.37 0.59 0.83 0.37 0.27
Sro142_g066400.1 (Contig226.g2689)
1.0 0.13 0.1 0.12 0.1 0.27 0.52 0.36 0.38 0.57 0.54 0.69 0.77 0.83 0.49 0.47 0.56 0.48 0.47 0.66 0.62 0.32 0.4 0.2 0.16 0.23 0.33
Sro143_g066690.1 (Contig3754.g28775)
0.28 0.22 0.14 0.17 0.17 0.25 0.46 0.34 0.34 0.53 0.47 0.62 1.0 0.74 0.43 0.38 0.53 0.54 0.49 0.68 0.59 0.39 0.41 0.19 0.21 0.2 0.27
Sro143_g066740.1 (Contig3754.g28780)
1.0 0.07 0.05 0.06 0.06 0.14 0.29 0.23 0.19 0.36 0.25 0.4 0.47 0.4 0.24 0.25 0.25 0.29 0.27 0.35 0.38 0.2 0.23 0.11 0.12 0.12 0.15
Sro1461_g274750.1 (Contig2979.g23682)
0.74 0.04 0.06 0.06 0.07 0.15 0.42 0.27 0.33 0.49 0.36 0.56 0.85 0.52 0.32 0.26 0.25 0.7 0.68 1.0 0.73 0.36 0.25 0.3 0.38 0.22 0.15
Sro1475_g275800.1 (Contig4476.g33628)
0.13 0.18 0.24 0.38 0.36 0.17 0.33 0.22 0.3 0.34 0.32 0.39 1.0 0.6 0.35 0.6 0.36 0.34 0.3 0.6 0.39 0.29 0.36 0.15 0.22 0.16 0.2
Sro1650_g288660.1 (Contig3263.g25708)
1.0 0.22 0.2 0.2 0.18 0.07 0.16 0.15 0.19 0.21 0.16 0.2 0.32 0.16 0.15 0.21 0.14 0.21 0.26 0.31 0.25 0.35 0.15 0.12 0.18 0.1 0.1
Sro1724_g293710.1 (Contig1866.g16320)
1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.31 0.14 0.25 0.19 0.13 0.15 0.76 0.18 0.16 0.15 0.11 0.08 0.1 0.56 0.29 0.09 0.32 0.34 0.58 0.21 0.08
Sro1753_g295380.1 (Contig4414.g33151)
1.0 0.24 0.21 0.29 0.17 0.54 0.51 0.38 0.43 0.44 0.42 0.46 0.81 0.58 0.48 0.24 0.38 0.36 0.39 0.83 0.47 0.38 0.37 0.52 0.98 0.56 0.32
Sro1843_g301160.1 (Contig4701.g34964)
0.9 0.16 0.12 0.17 0.14 0.21 0.43 0.33 0.35 0.52 0.49 0.64 0.9 0.59 0.38 0.35 0.51 0.36 0.44 1.0 0.51 0.36 0.37 0.3 0.19 0.19 0.27
Sro1863_g302290.1 (Contig1972.g16859)
1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.07 0.16 0.07 0.09 0.2 0.12 0.25 0.32 0.31 0.14 0.13 0.11 0.14 0.1 0.46 0.22 0.21 0.12 0.11 0.23 0.17 0.06
Sro194_g082840.1 (Contig237.g2879)
1.0 0.16 0.14 0.17 0.18 0.11 0.31 0.25 0.27 0.38 0.24 0.42 0.62 0.38 0.25 0.24 0.22 0.38 0.4 0.55 0.44 0.38 0.25 0.13 0.27 0.17 0.16
Sro196_g083650.1 (Contig3206.g25361)
1.0 0.08 0.07 0.09 0.07 0.14 0.33 0.25 0.27 0.33 0.26 0.36 0.49 0.36 0.24 0.25 0.26 0.31 0.28 0.34 0.4 0.2 0.28 0.13 0.2 0.14 0.16
Sro196_g083660.1 (Contig3206.g25362)
0.51 0.25 0.31 0.22 0.18 0.08 0.35 0.3 0.24 0.68 0.39 0.75 0.65 0.71 0.35 0.54 0.35 0.58 0.87 0.81 1.0 0.49 0.23 0.38 0.48 0.36 0.31
Sro1985_g309420.1 (Contig949.g9798)
1.0 0.11 0.08 0.11 0.08 0.16 0.44 0.29 0.32 0.42 0.31 0.47 0.63 0.62 0.31 0.32 0.36 0.37 0.32 0.5 0.39 0.29 0.36 0.14 0.17 0.16 0.17
Sro219_g090300.1 (Contig3313.g25970)
0.95 0.14 0.08 0.1 0.08 0.14 0.29 0.17 0.14 0.56 0.49 0.64 0.89 0.46 0.49 0.39 0.46 0.39 0.57 1.0 0.76 0.69 0.22 0.38 0.47 0.23 0.33
Sro2362_g324880.1 (Contig1769.g15642)
1.0 0.11 0.08 0.07 0.07 0.11 0.26 0.43 0.49 0.3 0.32 0.31 0.6 0.23 0.28 0.54 0.36 0.29 0.22 0.5 0.38 0.26 0.57 0.19 0.32 0.24 0.27
Sro2611_g332570.1 (Contig4592.g34323)
1.0 0.04 0.03 0.04 0.03 0.15 0.1 0.07 0.03 0.23 0.17 0.32 0.18 0.33 0.11 0.08 0.11 0.1 0.2 0.26 0.28 0.29 0.06 0.19 0.24 0.15 0.18
Sro26_g017520.1 (Contig2432.g19923)
0.6 0.21 0.15 0.17 0.13 0.23 0.51 0.37 0.39 0.58 0.46 0.73 1.0 0.7 0.4 0.45 0.48 0.45 0.47 0.74 0.66 0.33 0.43 0.2 0.21 0.22 0.28
Sro272_g104780.1 (Contig2144.g18019)
1.0 0.05 0.04 0.05 0.03 0.04 0.15 0.1 0.14 0.22 0.13 0.23 0.35 0.28 0.14 0.18 0.14 0.13 0.15 0.3 0.3 0.28 0.12 0.07 0.11 0.07 0.06
Sro274_g105490.1 (Contig1557.g14173)
1.0 0.59 0.37 0.38 0.39 0.2 0.35 0.35 0.29 0.57 0.38 0.66 0.64 0.51 0.41 0.5 0.34 0.5 0.58 0.79 0.72 0.62 0.25 0.35 0.2 0.21 0.34
Sro2804_g337450.1 (Contig2399.g19648)
0.92 0.32 0.24 0.31 0.26 0.26 0.45 0.32 0.28 0.61 0.46 0.69 0.49 0.5 0.42 0.57 0.39 0.59 0.67 0.61 1.0 0.47 0.35 0.37 0.68 0.46 0.39
Sro295_g110510.1 (Contig4342.g32774)
1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.09 0.07 0.07 0.16 0.06 0.2 0.21 0.19 0.08 0.05 0.09 0.17 0.15 0.22 0.23 0.16 0.1 0.08 0.13 0.08 0.03
Sro2973_g341260.1 (Contig3400.g26575)
0.9 0.14 0.11 0.12 0.12 0.14 0.38 0.24 0.2 0.6 0.36 0.82 0.69 0.75 0.36 0.27 0.35 0.67 0.96 1.0 0.78 0.59 0.22 0.37 0.29 0.28 0.27
Sro299_g111310.1 (Contig1218.g11433)
1.0 0.47 0.31 0.4 0.42 0.2 0.26 0.18 0.27 0.51 0.37 0.65 0.81 0.41 0.35 0.47 0.61 0.54 0.67 0.9 0.6 0.27 0.2 0.32 0.21 0.2 0.27
Sro332_g119300.1 (Contig1165.g11117)
1.0 0.11 0.08 0.08 0.07 0.13 0.29 0.21 0.25 0.32 0.27 0.39 0.44 0.43 0.24 0.24 0.28 0.28 0.28 0.37 0.31 0.18 0.27 0.1 0.08 0.11 0.16
Sro338_g120750.1 (Contig15.g112)
1.0 0.08 0.11 0.06 0.08 0.07 0.23 0.15 0.17 0.34 0.25 0.52 0.42 0.35 0.26 0.36 0.27 0.35 0.43 0.45 0.44 0.43 0.16 0.18 0.2 0.17 0.19
Sro35_g022630.1 (Contig3323.g26140)
1.0 0.26 0.17 0.19 0.16 0.28 0.73 0.58 0.59 0.69 0.54 0.78 0.81 0.97 0.56 0.58 0.56 0.55 0.49 0.63 0.83 0.72 0.7 0.27 0.32 0.3 0.33
Sro3953_g352120.1 (Contig3138.g24897)
0.8 0.11 0.12 0.13 0.11 0.18 0.37 0.2 0.2 0.41 0.27 0.4 1.0 0.5 0.28 0.24 0.27 0.27 0.33 0.82 0.52 0.51 0.21 0.21 0.33 0.18 0.17
Sro413_g138100.1 (Contig3915.g30010)
1.0 0.24 0.13 0.21 0.17 0.28 0.8 0.66 0.52 0.68 0.54 0.69 0.84 0.93 0.58 0.54 0.57 0.55 0.5 0.62 0.75 0.67 0.67 0.27 0.32 0.27 0.31
Sro413_g138120.1 (Contig3915.g30012)
1.0 0.16 0.19 0.24 0.22 0.18 0.32 0.2 0.34 0.39 0.3 0.45 0.54 0.6 0.31 0.35 0.34 0.23 0.3 0.51 0.43 0.37 0.38 0.14 0.17 0.2 0.19
Sro469_g149310.1 (Contig2361.g19381)
1.0 0.33 0.4 0.28 0.11 0.16 0.32 0.3 0.25 0.53 0.65 0.62 0.57 0.51 0.45 0.35 0.47 0.49 0.58 0.63 0.75 0.39 0.37 0.25 0.16 0.2 0.4
Sro495_g154490.1 (Contig3243.g25629)
1.0 0.02 0.02 0.03 0.02 0.11 0.25 0.18 0.16 0.31 0.2 0.39 0.52 0.42 0.21 0.25 0.19 0.2 0.19 0.45 0.32 0.21 0.18 0.14 0.15 0.12 0.1
Sro4_g003050.1 (Contig3815.g29223)
1.0 0.06 0.09 0.12 0.12 0.08 0.18 0.08 0.22 0.23 0.16 0.29 0.47 0.31 0.16 0.15 0.16 0.19 0.27 0.38 0.33 0.26 0.18 0.14 0.18 0.08 0.06
Sro50_g028940.1 (Contig297.g3882)
1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.17 0.35 0.28 0.21 0.6 0.32 0.89 0.99 0.94 0.43 0.5 0.37 0.45 0.32 0.92 0.75 0.3 0.26 0.21 0.24 0.24 0.22
Sro536_g162160.1 (Contig299.g3946)
1.0 0.23 0.12 0.18 0.14 0.21 0.51 0.43 0.37 0.54 0.43 0.52 0.64 0.71 0.44 0.56 0.4 0.45 0.41 0.5 0.57 0.39 0.42 0.31 0.37 0.25 0.26
Sro545_g163780.1 (Contig1180.g11221)
1.0 0.11 0.08 0.12 0.09 0.11 0.25 0.2 0.2 0.28 0.22 0.27 0.36 0.33 0.2 0.2 0.2 0.18 0.18 0.26 0.26 0.19 0.22 0.1 0.14 0.11 0.12
Sro549_g164530.1 (Contig1749.g15558)
0.94 0.21 0.41 0.03 0.07 0.21 0.37 0.09 0.41 0.37 0.26 0.58 0.64 0.1 0.21 0.12 0.23 0.8 1.0 0.84 0.46 0.27 0.31 0.3 0.28 0.19 0.12
Sro54_g032010.1 (Contig2430.g19889)
1.0 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.17 0.1 0.07 0.27 0.19 0.31 0.25 0.53 0.22 0.17 0.19 0.12 0.11 0.31 0.33 0.26 0.1 0.22 0.28 0.13 0.09
Sro648_g181080.1 (Contig423.g5679)
0.72 0.6 0.66 0.57 0.47 0.31 0.4 0.31 0.46 0.64 0.66 0.75 1.0 0.49 0.55 0.51 0.64 0.57 0.64 0.96 0.72 0.45 0.37 0.34 0.42 0.32 0.45
Sro663_g183590.1 (Contig119.g1357)
0.52 0.24 0.3 0.29 0.31 0.25 0.41 0.28 0.21 0.61 0.51 0.83 0.52 0.68 0.36 0.26 0.34 0.78 1.0 0.79 0.73 0.43 0.27 0.6 0.4 0.43 0.48
Sro66_g037360.1 (Contig399.g5406)
0.36 0.13 0.1 0.15 0.17 0.24 0.41 0.27 0.32 0.49 0.41 0.55 1.0 0.7 0.45 0.69 0.46 0.55 0.47 0.76 0.47 0.31 0.44 0.25 0.37 0.28 0.31
Sro70_g039160.1 (Contig3352.g26263)
1.0 0.17 0.16 0.19 0.18 0.13 0.33 0.26 0.24 0.35 0.26 0.38 0.7 0.44 0.28 0.34 0.31 0.31 0.29 0.46 0.37 0.32 0.3 0.09 0.11 0.13 0.16
Sro756_g197750.1 (Contig3619.g27991)
1.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.16 0.05 0.14 0.2 0.27 0.08 0.2 0.1 0.13 0.17 0.27 0.22 0.21 0.06 0.02 0.02 0.1 0.03
Sro7_g005820.1 (Contig389.g5235)
0.92 0.3 0.38 0.27 0.24 0.32 0.35 0.26 0.32 0.59 0.55 0.71 0.76 0.62 0.47 0.46 0.45 0.49 0.77 1.0 0.8 0.4 0.39 0.27 0.2 0.37 0.42
Sro7_g005870.1 (Contig389.g5240)
1.0 0.18 0.25 0.16 0.16 0.14 0.27 0.14 0.32 0.42 0.38 0.48 0.53 0.45 0.3 0.3 0.32 0.44 0.54 0.62 0.62 0.4 0.3 0.27 0.17 0.21 0.22
Sro83_g044220.1 (Contig4450.g33396)
1.0 0.15 0.11 0.09 0.11 0.15 0.35 0.3 0.42 0.52 0.3 0.55 0.57 0.32 0.34 0.41 0.26 0.34 0.59 0.84 0.85 0.65 0.42 0.45 0.53 0.25 0.22
Sro864_g212560.1 (Contig2395.g19628)
0.71 0.19 0.14 0.19 0.15 0.06 0.44 0.3 0.25 0.4 0.27 0.37 0.82 0.37 0.26 0.32 0.17 0.19 0.3 0.83 0.44 1.0 0.27 0.17 0.31 0.17 0.16
Sro864_g212570.1 (Contig2395.g19629)
0.78 0.15 0.08 0.14 0.14 0.08 0.38 0.24 0.33 0.39 0.14 0.36 1.0 0.48 0.24 0.29 0.18 0.3 0.33 0.71 0.49 0.29 0.28 0.19 0.14 0.21 0.15
Sro93_g048490.1 (Contig3841.g29537)
1.0 0.07 0.43 0.16 0.19 0.11 0.22 0.19 0.32 0.3 0.31 0.29 0.27 0.12 0.18 0.18 0.19 0.94 0.69 0.4 0.45 0.13 0.12 0.26 0.51 0.26 0.18
Sro971_g226410.1 (Contig3611.g27890)
1.0 0.09 0.07 0.12 0.09 0.15 0.4 0.28 0.24 0.42 0.24 0.47 0.47 0.55 0.26 0.29 0.22 0.26 0.25 0.37 0.47 0.3 0.28 0.16 0.2 0.15 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)