Heatmap: Cluster_342 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1007_g230440.1 (Contig188.g2182)
0.01 0.46 0.28 0.26 0.26 0.17 0.27 0.19 0.18 0.45 0.43 0.36 1.0 0.7 0.44 0.56 0.43 0.33 0.33 0.75 0.82 0.27 0.21 0.23 0.15 0.22 0.3
Sro1053_g235820.1 (Contig4118.g31453)
0.07 0.13 0.12 0.09 0.12 0.24 0.54 0.32 0.4 0.64 0.46 0.81 0.78 0.81 0.56 0.8 0.46 0.82 0.84 1.0 0.96 0.6 0.44 0.3 0.31 0.42 0.38
Sro1097_g240900.1 (Contig538.g6984)
0.01 0.05 0.08 0.04 0.04 0.05 0.18 0.16 0.33 0.22 0.16 0.27 1.0 0.32 0.23 0.37 0.2 0.21 0.3 0.59 0.36 0.08 0.12 0.18 0.18 0.1 0.1
Sro1099_g241140.1 (Contig806.g9002)
0.22 0.09 0.06 0.07 0.08 0.19 0.49 0.35 0.39 0.56 0.38 0.67 0.97 0.76 0.48 0.59 0.43 0.74 0.62 1.0 0.76 0.62 0.48 0.38 0.65 0.43 0.26
Sro1310_g261600.1 (Contig1983.g16974)
0.01 0.05 0.06 0.03 0.03 0.06 0.21 0.12 0.21 0.3 0.18 0.33 1.0 0.37 0.28 0.61 0.17 0.34 0.31 0.98 0.34 0.29 0.13 0.11 0.25 0.18 0.11
Sro1318_g262210.1 (Contig4479.g33661)
0.01 0.08 0.03 0.05 0.03 0.13 0.33 0.15 0.36 0.51 0.33 0.62 0.94 1.0 0.42 0.74 0.54 0.4 0.32 0.85 0.69 0.43 0.29 0.2 0.4 0.33 0.15
Sro13_g010240.1 (Contig337.g4565)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.16 0.02 0.27 0.25 0.1 0.27 1.0 0.57 0.24 0.67 0.19 0.24 0.23 0.61 0.32 0.14 0.13 0.05 0.05 0.12 0.09
Sro140_g065410.1 (Contig1537.g13957)
0.0 0.15 0.19 0.2 0.15 0.27 0.42 0.28 0.59 0.49 0.5 0.59 1.0 0.59 0.5 0.59 0.48 0.32 0.46 0.82 0.52 0.26 0.38 0.27 0.27 0.26 0.41
Sro140_g065510.1 (Contig1537.g13967)
0.03 0.38 0.4 0.39 0.36 0.34 0.38 0.32 0.47 0.5 0.52 0.64 1.0 0.75 0.53 0.76 0.59 0.46 0.59 0.9 0.59 0.28 0.36 0.25 0.18 0.26 0.41
Sro1518_g279240.1 (Contig2320.g19156)
0.07 0.17 0.16 0.07 0.11 0.2 0.53 0.4 0.38 0.52 0.41 0.53 1.0 0.57 0.45 0.47 0.16 0.57 0.54 0.93 0.65 0.38 0.35 0.29 0.54 0.31 0.34
Sro152_g069420.1 (Contig69.g702)
0.07 0.13 0.15 0.18 0.18 0.23 0.36 0.27 0.39 0.42 0.39 0.47 1.0 0.57 0.41 0.47 0.36 0.52 0.44 0.93 0.5 0.42 0.36 0.26 0.38 0.32 0.27
Sro1653_g288830.1 (Contig3957.g30319)
0.01 0.02 0.04 0.11 0.14 0.17 0.61 0.21 0.27 0.5 0.39 0.62 0.97 0.79 0.56 0.66 0.36 0.49 0.37 1.0 0.66 0.27 0.23 0.35 0.53 0.41 0.21
Sro1679_g290680.1 (Contig1151.g11017)
0.01 0.05 0.01 0.07 0.05 0.02 0.05 0.01 0.05 0.1 0.16 0.05 1.0 0.28 0.19 0.3 0.17 0.23 0.18 0.59 0.1 0.13 0.04 0.03 0.0 0.04 0.06
Sro1679_g290690.1 (Contig1151.g11018)
0.01 0.04 0.04 0.07 0.03 0.03 0.06 0.03 0.06 0.12 0.21 0.07 1.0 0.22 0.25 0.39 0.18 0.25 0.16 0.59 0.16 0.06 0.03 0.07 0.05 0.04 0.06
0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.11 0.12 0.15 0.12 0.09 0.15 1.0 0.13 0.11 0.19 0.1 0.18 0.19 0.77 0.24 0.11 0.05 0.05 0.06 0.06 0.04
Sro1748_g295130.1 (Contig2256.g18672)
0.02 0.03 0.03 0.05 0.06 0.16 0.08 0.08 0.06 0.22 0.19 0.24 1.0 0.16 0.23 0.29 0.15 0.1 0.17 0.88 0.35 0.2 0.05 0.12 0.17 0.08 0.18
Sro180_g078860.1 (Contig350.g4765)
0.02 0.18 0.28 0.08 0.07 0.09 0.13 0.06 0.22 0.32 0.23 0.4 1.0 0.46 0.19 0.16 0.14 0.14 0.24 0.78 0.58 0.31 0.18 0.2 0.25 0.15 0.13
Sro196_g083430.1 (Contig3206.g25339)
0.01 0.17 0.16 0.14 0.14 0.22 0.24 0.18 0.25 0.41 0.26 0.48 1.0 0.48 0.29 0.35 0.34 0.18 0.4 0.71 0.64 0.48 0.26 0.12 0.24 0.26 0.29
Sro1_g000550.1 (Contig3007.g23970)
0.0 0.02 0.01 0.05 0.03 0.05 0.12 0.01 0.03 0.13 0.05 0.16 1.0 0.18 0.17 0.3 0.2 0.16 0.09 0.79 0.21 0.11 0.04 0.02 0.13 0.03 0.08
Sro1_g000700.1 (Contig3007.g23985)
0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.17 0.34 0.19 0.32 0.42 0.4 0.48 1.0 0.62 0.43 0.8 0.39 0.48 0.48 0.96 0.55 0.36 0.26 0.23 0.41 0.31 0.24
Sro200_g084700.1 (Contig201.g2361)
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.07 0.02 0.09 0.24 0.15 0.32 1.0 0.5 0.24 0.51 0.18 0.25 0.31 0.89 0.42 0.19 0.04 0.0 0.03 0.13 0.09
Sro20_g013900.1 (Contig2954.g23420)
0.02 0.07 0.08 0.05 0.05 0.36 0.28 0.12 0.3 0.45 0.44 0.52 0.86 0.66 0.44 0.52 0.51 0.49 0.59 1.0 0.69 0.21 0.11 0.26 0.52 0.32 0.24
Sro2197_g318650.1 (Contig1089.g10536)
0.1 0.39 0.34 0.41 0.42 0.29 0.41 0.42 0.35 0.53 0.47 0.55 1.0 0.51 0.61 0.86 0.45 0.57 0.45 0.69 0.89 0.22 0.36 0.21 0.31 0.37 0.59
Sro2229_g319940.1 (Contig3573.g27603)
0.01 0.04 0.04 0.03 0.03 0.07 0.36 0.11 0.22 0.42 0.34 0.63 1.0 0.75 0.34 0.49 0.38 0.42 0.33 1.0 0.71 0.19 0.13 0.25 0.25 0.24 0.11
Sro2274_g321570.1 (Contig1830.g16101)
0.06 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.12 0.11 0.04 0.29 0.15 0.31 0.63 0.4 0.19 0.31 0.14 0.36 0.15 1.0 0.29 0.22 0.06 0.11 0.09 0.05 0.09
Sro23_g015880.1 (Contig2259.g18738)
0.01 0.06 0.01 0.01 0.02 0.04 0.22 0.11 0.2 0.27 0.26 0.22 1.0 0.63 0.27 0.37 0.14 0.25 0.21 0.8 0.51 0.25 0.11 0.1 0.12 0.17 0.12
Sro2411_g326710.1 (Contig3293.g25861)
0.01 0.08 0.06 0.08 0.1 0.09 0.1 0.13 0.16 0.21 0.19 0.24 1.0 0.14 0.21 0.25 0.11 0.27 0.29 0.72 0.26 0.16 0.08 0.09 0.08 0.07 0.15
Sro2426_g327310.1 (Contig96.g1116)
0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.06 0.14 0.02 0.15 0.4 0.22 0.44 0.98 1.0 0.34 0.62 0.24 0.21 0.27 0.75 0.83 0.29 0.11 0.15 0.21 0.15 0.08
Sro2445_g327900.1 (Contig786.g8797)
0.0 0.25 0.26 0.18 0.12 0.1 0.21 0.3 0.25 0.38 0.46 0.47 1.0 0.51 0.34 0.3 0.3 0.21 0.29 0.86 0.51 0.36 0.27 0.13 0.27 0.23 0.26
Sro247_g097990.1 (Contig3058.g24332)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.17 0.18 0.22 0.31 0.18 1.0 0.26 0.33 0.35 0.17 0.22 0.16 0.97 0.3 0.4 0.14 0.16 0.2 0.13 0.13
Sro247_g098000.1 (Contig3058.g24333)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.16 0.14 0.15 0.14 0.2 0.25 0.15 1.0 0.29 0.31 0.35 0.22 0.22 0.21 0.82 0.33 0.18 0.09 0.06 0.17 0.11 0.12
Sro2552_g330980.1 (Contig4642.g34598)
0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.2 0.39 0.24 0.3 0.63 0.45 0.92 0.61 0.69 0.58 1.0 0.5 0.52 0.48 0.89 0.99 0.42 0.31 0.37 0.55 0.42 0.26
Sro262_g102000.1 (Contig809.g9020)
0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.11 0.48 0.26 0.39 0.5 0.42 0.61 0.96 0.91 0.51 1.0 0.32 0.6 0.44 0.93 0.77 0.38 0.3 0.27 0.62 0.35 0.19
Sro272_g104870.1 (Contig2144.g18028)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.37 0.07 0.31 0.43 0.59 0.31 0.86 1.0 0.66 0.42 0.3 0.22 0.17 0.75 0.83 0.19 0.08 0.07 0.16 0.2 0.11
Sro2764_g336570.1 (Contig1366.g12560)
0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.07 0.06 0.05 0.14 0.19 0.06 0.19 1.0 0.24 0.16 0.52 0.21 0.38 0.29 0.5 0.31 0.07 0.04 0.07 0.09 0.07 0.09
Sro282_g107590.1 (Contig1420.g13102)
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.1 0.26 0.18 0.23 0.22 0.22 0.21 1.0 0.39 0.33 0.59 0.16 0.32 0.17 0.84 0.28 0.27 0.14 0.16 0.23 0.16 0.12
Sro298_g110990.1 (Contig4399.g33030)
0.01 0.06 0.04 0.03 0.03 0.05 0.17 0.1 0.3 0.2 0.17 0.2 1.0 0.45 0.26 0.37 0.22 0.24 0.24 0.95 0.2 0.21 0.22 0.09 0.08 0.08 0.11
Sro30_g019810.1 (Contig3962.g30381)
0.0 0.08 0.1 0.13 0.12 0.22 0.19 0.15 0.16 0.24 0.29 0.23 1.0 0.43 0.33 0.44 0.32 0.39 0.32 0.67 0.34 0.19 0.11 0.18 0.29 0.17 0.16
Sro312_g114550.1 (Contig2832.g22700)
0.13 0.15 0.15 0.04 0.07 0.06 0.21 0.11 0.19 0.37 0.18 0.43 0.89 0.48 0.29 0.52 0.22 0.31 0.42 1.0 0.51 0.3 0.13 0.1 0.18 0.15 0.17
Sro316_g115620.1 (Contig2414.g19768)
0.22 0.28 0.29 0.25 0.2 0.27 0.35 0.34 0.49 0.51 0.46 0.66 1.0 0.63 0.5 0.47 0.43 0.59 0.72 0.89 0.53 0.27 0.43 0.42 0.19 0.24 0.46
0.0 0.04 0.06 0.05 0.06 0.09 0.17 0.07 0.13 0.22 0.24 0.24 1.0 0.37 0.26 0.37 0.18 0.2 0.18 0.51 0.26 0.09 0.09 0.07 0.14 0.11 0.13
Sro326_g118180.1 (Contig1080.g10506)
0.0 0.03 0.02 0.03 0.06 0.01 0.11 0.04 0.1 0.2 0.05 0.15 1.0 0.39 0.19 0.93 0.08 0.48 0.4 0.71 0.16 0.06 0.08 0.02 0.02 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 1.0 0.19 0.01 0.0 0.01 0.17 0.07 0.85 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro341_g121390.1 (Contig3952.g30271)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.11 0.04 0.08 0.23 0.14 0.19 1.0 0.28 0.25 0.94 0.1 0.31 0.34 0.8 0.26 0.19 0.06 0.02 0.08 0.08 0.12
Sro345_g122530.1 (Contig2266.g18812)
0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.07 0.22 0.03 0.13 0.28 0.18 0.36 1.0 0.44 0.27 0.21 0.09 0.16 0.17 0.84 0.43 0.3 0.08 0.11 0.11 0.09 0.15
Sro352_g124180.1 (Contig2645.g21394)
0.0 0.04 0.02 0.0 0.01 0.1 0.18 0.04 0.05 0.31 0.13 0.35 0.88 0.43 0.28 0.39 0.14 0.25 0.28 1.0 0.41 0.29 0.05 0.26 0.35 0.34 0.19
Sro368_g128060.1 (Contig2761.g22245)
0.05 0.35 0.37 0.13 0.14 0.06 0.21 0.17 0.21 0.32 0.2 0.34 1.0 0.35 0.23 0.26 0.21 0.17 0.19 0.71 0.83 0.51 0.28 0.11 0.05 0.08 0.15
Sro369_g128300.1 (Contig1690.g15153)
0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.14 0.03 0.39 0.18 0.18 0.23 1.0 0.39 0.21 0.31 0.23 0.2 0.25 0.59 0.25 0.15 0.15 0.06 0.05 0.11 0.09
Sro382_g131130.1 (Contig4152.g31697)
0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.07 0.07 0.09 0.0 0.03 0.66 0.0 0.03 0.03 0.0 0.39 0.1 1.0 0.11 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro399_g134800.1 (Contig279.g3607)
0.0 0.33 0.39 0.26 0.13 0.2 0.29 0.28 0.46 0.44 0.59 0.45 1.0 0.42 0.51 0.46 0.88 0.44 0.51 0.99 0.58 0.42 0.31 0.2 0.3 0.25 0.39
Sro460_g147540.1 (Contig3843.g29579)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.09 0.09 0.08 0.04 0.86 0.09 0.07 0.13 0.11 0.25 0.35 1.0 0.1 0.02 0.04 0.06 0.15 0.04 0.04
Sro50_g029210.1 (Contig297.g3909)
0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.27 0.15 0.19 0.46 0.36 0.54 0.74 1.0 0.42 0.71 0.28 0.57 0.62 0.85 0.72 0.48 0.19 0.22 0.23 0.29 0.2
Sro543_g163600.1 (Contig1245.g11646)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.03 0.1 0.15 0.08 0.15 0.93 0.23 0.19 0.16 0.04 0.15 0.07 1.0 0.28 0.23 0.06 0.04 0.15 0.01 0.05
Sro557_g166210.1 (Contig1427.g13191)
0.03 0.03 0.04 0.03 0.01 0.11 0.29 0.21 0.23 0.31 0.4 0.36 1.0 0.51 0.36 0.39 0.3 0.31 0.24 0.93 0.42 0.24 0.15 0.31 0.29 0.23 0.14
Sro588_g171550.1 (Contig4679.g34797)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.05 0.1 0.12 0.1 0.16 0.78 0.04 0.16 0.07 0.21 0.25 0.42 1.0 0.12 0.1 0.09 0.07 0.18 0.05 0.08
Sro591_g171980.1 (Contig3321.g26069)
0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.06 0.18 0.07 0.2 0.12 0.19 0.05 0.77 0.64 0.27 0.09 0.26 0.17 0.17 1.0 0.03 0.26 0.12 0.07 0.02 0.03 0.08
Sro625_g177500.1 (Contig691.g8088)
0.01 0.1 0.13 0.07 0.08 0.05 0.2 0.2 0.11 0.37 0.28 0.44 0.84 0.53 0.37 0.58 0.17 0.48 0.26 1.0 0.51 0.36 0.07 0.18 0.2 0.17 0.18
Sro66_g037270.1 (Contig399.g5397)
0.1 0.04 0.02 0.05 0.02 0.06 0.21 0.14 0.1 0.3 0.33 0.4 0.68 0.41 0.27 0.21 0.22 0.2 0.16 1.0 0.29 0.18 0.03 0.28 0.3 0.15 0.11
Sro672_g185020.1 (Contig919.g9650)
0.0 0.03 0.05 0.03 0.03 0.04 0.32 0.09 0.25 0.3 0.24 0.27 1.0 0.63 0.31 0.53 0.35 0.33 0.2 0.82 0.44 0.11 0.16 0.16 0.19 0.16 0.12
Sro702_g189930.1 (Contig1416.g12996)
0.09 0.12 0.07 0.06 0.08 0.31 0.69 0.37 0.53 0.6 0.43 0.78 1.0 0.73 0.55 0.66 0.51 0.62 0.53 0.92 0.75 0.57 0.63 0.36 0.64 0.35 0.26
Sro70_g039010.1 (Contig3352.g26248)
0.04 0.43 0.44 0.42 0.4 0.2 0.24 0.21 0.26 0.41 0.38 0.39 1.0 0.54 0.38 0.51 0.41 0.33 0.41 0.85 0.78 0.42 0.24 0.16 0.1 0.18 0.28
Sro782_g201750.1 (Contig2391.g19599)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.02 0.2 0.1 0.04 0.06 1.0 0.33 0.14 0.12 0.06 0.1 0.04 1.0 0.16 0.16 0.09 0.04 0.09 0.03 0.02
Sro810_g205840.1 (Contig3420.g26662)
0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.05 0.26 0.11 0.2 0.32 0.21 0.37 1.0 0.53 0.28 0.59 0.15 0.34 0.27 0.68 0.56 0.39 0.18 0.12 0.24 0.21 0.11
Sro827_g207800.1 (Contig2896.g23085)
0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.04 0.36 0.15 0.31 0.37 0.28 0.42 1.0 0.71 0.35 0.81 0.22 0.51 0.47 0.98 0.54 0.28 0.24 0.26 0.25 0.3 0.16
Sro874_g214240.1 (Contig589.g7375)
0.07 0.3 0.3 0.29 0.24 0.14 0.22 0.13 0.3 0.37 0.3 0.42 1.0 0.41 0.31 0.52 0.22 0.25 0.39 0.73 0.42 0.09 0.26 0.12 0.05 0.17 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.19 0.11 0.19 0.04 1.0 0.48 0.2 0.5 0.12 0.07 0.06 0.78 0.19 0.2 0.1 0.02 0.0 0.03 0.03
Sro94_g048850.1 (Contig150.g1675)
0.01 0.2 0.23 0.18 0.16 0.21 0.27 0.16 0.4 0.4 0.47 0.47 1.0 0.74 0.48 0.6 0.46 0.45 0.62 0.89 0.38 0.36 0.3 0.12 0.06 0.18 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)