Heatmap: Cluster_305 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1086_g239700.1 (Contig2506.g20506)
0.03 0.14 0.12 0.1 0.05 0.18 0.22 0.27 0.24 0.18 0.24 0.27 1.0 0.8 0.2 0.1 0.45 0.07 0.19 0.24 0.2 0.44 0.42 0.27 0.01 0.3 0.1
Sro1124_g243860.1 (Contig4358.g32844)
0.02 0.35 0.32 0.12 0.16 0.29 0.23 0.15 0.39 0.36 0.11 0.46 0.67 0.81 0.27 0.13 0.19 0.19 0.78 0.1 0.29 1.0 0.51 0.68 0.39 0.1 0.13
Sro1176_g249270.1 (Contig4140.g31631)
0.02 0.24 0.38 0.18 0.12 0.3 0.32 0.46 0.62 0.25 0.3 0.27 0.53 0.59 0.42 0.31 0.49 0.23 0.69 0.15 0.32 0.51 0.65 1.0 0.19 0.14 0.29
Sro1187_g250480.1 (Contig433.g5846)
0.0 0.2 0.32 0.22 0.19 0.21 0.14 0.5 0.61 0.16 0.18 0.17 0.66 0.37 0.18 0.11 0.39 0.36 1.0 0.38 0.16 0.74 0.54 0.39 0.11 0.12 0.14
Sro1193_g251150.1 (Contig4499.g33738)
0.01 0.53 0.51 0.22 0.29 0.35 0.28 0.23 0.13 0.4 0.2 0.66 0.4 1.0 0.31 0.04 0.08 0.2 0.29 0.15 0.4 0.76 0.39 0.8 0.41 0.2 0.22
0.01 0.47 0.29 0.49 0.9 0.17 0.48 0.36 1.0 0.19 0.14 0.07 0.02 0.17 0.22 0.01 0.25 0.03 0.06 0.0 0.01 0.49 0.64 0.0 0.0 0.17 0.08
Sro1204_g252190.1 (Contig1757.g15594)
0.0 0.02 0.04 0.03 0.03 0.01 0.17 0.63 0.55 0.06 0.06 0.03 1.0 0.02 0.14 0.07 0.15 0.1 0.08 0.67 0.05 0.36 0.56 0.06 0.06 0.09 0.04
Sro129_g061620.1 (Contig1945.g16736)
0.03 0.03 0.06 0.05 0.05 0.09 0.39 0.67 0.36 0.15 0.28 0.19 0.83 0.02 0.19 0.18 0.17 0.26 0.2 0.53 0.07 0.87 1.0 0.05 0.05 0.04 0.16
Sro1464_g274930.1 (Contig485.g6552)
0.0 0.02 0.02 0.03 0.02 1.0 0.32 0.26 0.19 0.46 0.27 0.57 0.35 0.86 0.61 0.08 0.2 0.14 0.11 0.41 0.67 0.27 0.15 0.51 0.51 0.41 0.34
Sro146_g067430.1 (Contig2363.g19433)
0.01 0.52 0.47 0.4 0.34 0.84 0.41 0.67 0.61 0.33 0.28 0.37 0.47 1.0 0.45 0.01 0.23 0.22 0.06 0.17 0.27 0.34 0.36 0.63 0.29 0.36 0.3
Sro1492_g277230.1 (Contig3627.g28047)
0.02 0.42 0.34 0.24 0.32 0.42 0.81 0.68 0.9 0.31 0.22 0.28 0.7 0.54 0.4 0.12 0.68 0.4 0.78 0.38 0.33 0.42 1.0 0.8 0.07 0.3 0.23
Sro1503_g278010.1 (Contig1159.g11074)
0.0 0.06 0.23 0.07 0.1 0.02 0.09 0.1 0.1 0.06 0.11 0.01 0.53 0.01 0.03 0.0 0.35 0.14 1.0 0.31 0.1 0.95 0.2 0.13 0.27 0.21 0.01
Sro1534_g280420.1 (Contig2033.g17453)
0.0 0.07 0.0 0.06 0.03 0.01 0.0 0.29 0.24 0.14 0.02 0.05 0.97 0.0 0.04 0.0 0.0 0.52 0.94 1.0 0.07 0.47 0.21 0.02 0.07 0.0 0.02
Sro1667_g289830.1 (Contig4103.g31337)
0.11 0.6 0.29 0.11 0.34 0.33 0.34 0.14 0.5 0.25 0.12 0.26 0.56 0.39 0.29 0.01 0.61 0.09 0.5 0.03 0.01 0.47 1.0 0.39 0.01 0.13 0.1
Sro1701_g292170.1 (Contig516.g6810)
0.04 0.47 0.6 0.37 0.44 0.22 0.66 0.55 0.97 0.34 0.28 0.54 0.4 0.51 0.39 0.24 0.42 0.12 0.17 0.2 0.25 0.66 1.0 0.6 0.38 0.27 0.27
Sro1745_g294930.1 (Contig2557.g20796)
0.01 0.35 1.0 0.35 0.42 0.07 0.16 0.75 0.88 0.26 0.45 0.57 0.65 0.34 0.34 0.86 0.42 0.28 0.86 0.33 0.18 0.71 0.81 0.68 0.23 0.12 0.26
Sro1818_g299600.1 (Contig4294.g32425)
0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.09 0.71 0.68 0.04 0.04 0.01 1.0 0.27 0.01 0.02 0.0 0.92 0.3 0.62 0.01 0.46 0.54 0.1 0.23 0.08 0.01
Sro1938_g306510.1 (Contig3016.g24074)
0.56 0.87 0.72 0.46 0.56 0.3 0.75 0.39 0.89 0.58 0.39 1.0 0.79 0.66 0.49 0.36 0.41 0.21 0.51 0.65 0.56 0.77 0.9 0.5 0.27 0.31 0.33
Sro1_g000070.1 (Contig3007.g23922)
0.0 0.14 0.11 0.05 0.14 0.34 0.13 0.36 0.09 0.28 0.02 0.34 0.04 0.44 0.13 0.0 0.04 0.48 0.04 0.0 0.54 0.83 0.29 1.0 0.11 0.02 0.08
Sro214_g088620.1 (Contig282.g3647)
0.11 0.67 0.3 0.42 0.41 0.57 0.73 0.5 0.85 0.49 0.18 0.68 0.34 1.0 0.33 0.25 0.46 0.23 0.36 0.41 0.3 0.54 0.77 0.19 0.04 0.28 0.27
Sro21_g014860.1 (Contig813.g9076)
0.03 0.4 0.72 0.79 0.45 0.77 0.52 0.44 0.24 0.38 0.52 0.44 0.49 0.18 0.39 0.12 0.39 0.52 0.59 0.24 0.64 0.47 0.25 1.0 0.31 0.28 0.26
Sro223_g091380.1 (Contig370.g5007)
0.12 0.45 1.0 0.57 0.56 0.27 0.52 0.35 0.55 0.34 0.33 0.33 0.34 0.35 0.46 0.28 0.29 0.35 0.61 0.25 0.36 0.46 0.43 0.62 0.59 0.3 0.23
Sro230_g093430.1 (Contig263.g3274)
0.04 0.29 0.32 0.13 0.28 0.42 0.15 0.69 0.26 0.23 0.07 0.36 0.33 0.69 0.27 0.0 0.04 0.03 0.03 0.01 0.4 0.52 0.23 1.0 0.44 0.09 0.12
Sro2335_g323820.1 (Contig3717.g28592)
0.03 0.32 0.55 0.31 0.17 0.64 0.45 0.33 0.47 0.37 0.56 0.34 1.0 0.67 0.53 0.2 0.72 0.39 0.61 0.33 0.37 0.58 0.4 0.99 0.36 0.36 0.22
Sro2344_g324150.1 (Contig1082.g10517)
0.15 0.31 0.15 0.31 0.37 0.16 0.53 0.57 0.59 0.41 0.21 0.73 0.23 1.0 0.28 0.2 0.42 0.17 0.31 0.26 0.2 0.37 0.41 0.13 0.04 0.15 0.21
Sro238_g095510.1 (Contig99.g1197)
0.0 0.31 0.3 0.24 0.36 0.59 0.3 0.44 0.31 0.24 0.13 0.2 0.21 0.66 0.31 0.02 0.13 0.13 0.09 0.14 0.13 0.21 0.37 1.0 0.31 0.23 0.17
Sro238_g095670.1 (Contig99.g1213)
0.0 0.33 0.24 0.31 0.45 0.14 0.57 0.64 1.0 0.17 0.1 0.09 0.13 0.16 0.09 0.06 0.23 0.41 0.15 0.03 0.16 0.49 0.7 0.01 0.01 0.2 0.11
Sro2576_g331740.1 (Contig3418.g26640)
0.0 0.19 0.27 0.09 0.13 0.1 0.13 0.04 0.18 0.06 0.03 0.02 0.15 0.12 0.08 0.06 0.05 0.07 0.57 0.03 0.02 0.09 0.3 1.0 0.22 0.05 0.04
Sro265_g102780.1 (Contig1806.g15908)
0.0 0.04 0.15 0.12 0.09 0.3 0.04 0.5 0.5 0.13 0.23 0.11 0.45 0.51 0.29 0.12 0.63 0.39 1.0 0.24 0.07 0.73 0.2 0.07 0.02 0.06 0.16
Sro269_g104110.1 (Contig1337.g12332)
0.01 0.36 0.83 0.23 0.29 0.04 0.21 0.19 0.34 0.19 0.14 0.11 0.18 0.09 0.2 0.21 0.11 0.07 0.64 0.05 0.15 0.21 0.37 1.0 0.59 0.33 0.12
Sro290_g109260.1 (Contig380.g5097)
1.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.56 0.65 0.08 0.04 0.0 0.12 0.0 0.03 0.0 0.1 0.11 0.1 0.17 0.12 0.41 0.48 0.1 0.19 0.32 0.01
Sro2_g001090.1 (Contig467.g6267)
0.0 0.07 0.21 0.22 0.15 0.09 0.24 0.53 0.72 0.12 0.07 0.02 1.0 0.03 0.11 0.1 0.06 0.63 0.71 0.77 0.12 0.48 0.7 0.02 0.12 0.09 0.1
0.14 0.0 0.0 0.3 0.0 0.07 0.0 0.22 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.6 0.31 0.19 0.0 0.0 0.0 0.62 0.76 0.04 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.66 0.0 0.35 0.0 0.0 1.0 0.99 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro318_g115910.1 (Contig3475.g26935)
0.0 0.23 0.43 0.27 0.22 0.07 0.12 0.53 0.31 0.11 0.21 0.07 0.05 0.05 0.12 0.04 0.24 0.16 0.26 0.07 0.18 0.39 0.55 1.0 0.39 0.46 0.12
Sro3250_g345840.1 (Contig4650.g34621)
0.0 0.71 1.0 0.56 0.61 0.0 0.0 0.54 0.58 0.08 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.35 0.19 0.0 0.44 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro337_g120650.1 (Contig2800.g22523)
0.22 1.0 0.69 0.53 0.69 0.17 0.52 0.67 0.95 0.36 0.33 0.38 0.22 0.39 0.32 0.51 0.34 0.58 0.4 0.14 0.38 0.46 0.96 0.64 0.54 0.19 0.3
Sro3469_g348360.1 (Contig4528.g33911)
0.06 0.2 0.22 0.21 0.13 0.21 0.13 0.12 0.1 0.3 0.17 0.35 0.1 0.19 0.16 0.1 0.09 0.26 0.46 0.37 0.24 0.83 0.3 1.0 0.76 0.08 0.09
Sro363_g126940.1 (Contig698.g8133)
0.01 0.37 0.54 0.32 0.27 0.19 0.47 0.38 0.62 0.32 0.37 0.47 0.8 0.63 0.45 0.38 0.4 0.43 0.58 0.37 0.41 1.0 0.62 0.36 0.15 0.16 0.31
Sro3859_g351490.1 (Contig4723.g35066)
0.01 0.08 0.03 0.09 0.04 0.03 0.12 0.3 0.52 0.14 0.12 0.17 0.44 0.18 0.11 0.12 0.07 0.21 1.0 0.65 0.15 0.33 0.13 0.06 0.1 0.06 0.1
Sro423_g139710.1 (Contig1760.g15608)
0.11 0.44 0.87 0.31 0.28 0.3 0.55 0.66 0.84 0.46 0.45 0.57 0.9 1.0 0.61 0.44 0.77 0.54 0.61 0.62 0.52 0.59 0.7 0.32 0.15 0.3 0.32
Sro425_g140210.1 (Contig3537.g27366)
0.14 0.7 0.75 1.0 0.88 0.31 0.76 0.46 0.87 0.57 0.4 0.79 0.27 0.43 0.43 0.26 0.87 0.18 0.31 0.21 0.38 0.86 0.99 0.38 0.21 0.25 0.31
Sro447_g144830.1 (Contig3064.g24405)
0.0 0.95 0.77 0.89 0.89 0.2 0.4 0.44 0.95 0.4 0.56 0.37 0.94 0.3 0.45 0.36 0.55 0.48 0.76 0.44 0.29 0.81 1.0 0.46 0.32 0.27 0.37
Sro4537_g354200.1 (Contig3924.g30056)
0.01 0.16 0.2 0.12 0.17 0.12 0.1 0.27 0.16 0.23 0.53 0.6 0.32 0.3 0.4 0.85 0.37 0.06 0.32 0.07 0.15 0.28 0.25 1.0 0.37 0.2 0.33
Sro4714_g354500.1 (Contig1262.g11812)
0.02 0.52 0.73 0.29 0.42 0.16 0.14 0.52 0.55 0.24 0.49 0.43 0.23 0.31 0.38 0.64 0.44 0.03 0.43 0.05 0.19 0.86 0.46 1.0 0.39 0.18 0.26
Sro488_g152990.1 (Contig4435.g33266)
0.02 0.7 0.44 0.26 0.51 0.09 0.6 0.38 0.71 0.38 0.25 0.52 0.52 0.24 0.3 0.21 0.4 0.13 0.25 0.48 0.32 0.87 1.0 0.16 0.08 0.24 0.23
Sro489_g153290.1 (Contig402.g5438)
0.01 0.21 0.1 0.21 0.13 0.1 0.42 1.0 0.74 0.11 0.25 0.01 0.37 0.01 0.22 0.26 0.13 0.61 0.57 0.48 0.03 0.21 0.81 0.15 0.16 0.11 0.29
Sro509_g157090.1 (Contig4289.g32402)
0.45 0.12 0.15 0.16 0.23 0.64 0.32 0.4 0.29 0.3 0.3 0.48 0.57 1.0 0.5 0.09 0.21 0.11 0.05 0.12 0.3 0.36 0.3 0.82 0.37 0.17 0.24
Sro518_g158870.1 (Contig3565.g27542)
0.14 0.77 0.74 0.51 0.6 0.37 0.6 0.51 0.68 0.61 0.35 0.63 0.75 1.0 0.51 0.39 0.57 0.7 0.85 0.74 0.44 0.92 0.87 0.67 0.27 0.39 0.33
Sro538_g162600.1 (Contig95.g1101)
0.01 0.78 0.79 0.5 0.61 0.16 0.35 0.47 0.51 0.39 0.17 0.34 0.57 0.28 0.23 0.22 0.11 0.42 0.68 0.39 0.32 0.25 0.54 1.0 0.76 0.54 0.19
Sro5_g004050.1 (Contig4001.g30720)
0.01 0.64 0.72 0.53 0.4 0.72 0.37 0.79 0.59 0.45 0.69 0.48 0.93 0.83 0.51 0.41 1.0 0.52 0.84 0.67 0.29 0.64 0.72 0.3 0.11 0.46 0.57
Sro659_g182910.1 (Contig2136.g17999)
0.02 0.18 0.08 0.13 0.08 0.41 0.12 0.01 0.35 0.25 0.59 0.45 0.68 0.46 0.25 0.08 0.81 0.02 0.27 0.18 0.13 1.0 0.55 0.14 0.0 0.64 0.3
Sro663_g183490.1 (Contig119.g1347)
0.02 0.73 0.8 0.54 0.63 0.44 0.72 0.59 0.6 0.58 0.64 0.6 0.79 0.54 0.56 0.76 1.0 0.56 0.77 0.73 0.51 0.62 0.84 0.34 0.23 0.43 0.56
Sro667_g184170.1 (Contig793.g8878)
0.03 0.2 0.15 0.17 0.14 0.15 0.24 0.26 0.25 0.18 0.19 0.15 0.99 0.28 0.17 0.05 0.47 0.2 1.0 0.23 0.22 0.7 0.23 0.13 0.11 0.15 0.12
Sro713_g191480.1 (Contig2997.g23815)
0.11 0.09 0.17 0.4 0.17 0.0 0.1 0.16 0.19 0.11 0.06 0.01 0.1 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.45 1.0 0.37 0.02 0.02
Sro73_g040260.1 (Contig3929.g30127)
0.07 0.57 1.0 0.68 0.58 0.09 0.23 0.19 0.26 0.37 0.11 0.39 0.25 0.4 0.3 0.13 0.11 0.21 0.33 0.17 0.4 0.34 0.25 0.8 0.46 0.33 0.1
Sro74_g040850.1 (Contig4700.g34947)
0.01 0.53 0.18 0.25 0.13 0.9 0.45 0.38 0.22 0.65 0.53 0.62 0.6 0.61 0.57 0.34 0.55 0.72 0.76 0.76 0.77 1.0 0.27 0.65 0.65 0.78 0.55
Sro782_g201700.1 (Contig2391.g19594)
0.05 0.27 0.44 0.24 0.19 0.1 0.63 0.38 0.77 0.41 0.44 0.81 0.76 0.74 0.48 0.36 0.41 0.41 0.74 0.57 0.56 1.0 0.84 0.62 0.36 0.3 0.23
Sro788_g202430.1 (Contig3902.g29924)
0.07 1.0 0.8 0.63 0.66 0.35 0.55 0.6 0.9 0.23 0.36 0.15 0.17 0.21 0.35 0.2 0.49 0.18 0.2 0.04 0.11 0.39 0.93 0.53 0.4 0.42 0.29
Sro788_g202440.1 (Contig3902.g29925)
0.04 1.0 0.74 0.48 0.57 0.19 0.4 0.5 0.84 0.18 0.21 0.09 0.11 0.12 0.26 0.13 0.3 0.12 0.13 0.03 0.08 0.65 0.76 0.49 0.29 0.24 0.18
Sro830_g208190.1 (Contig4325.g32634)
0.0 0.1 0.37 0.24 0.1 0.01 0.08 0.81 0.95 0.04 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.61 1.0 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro857_g211710.1 (Contig1150.g11009)
0.01 0.37 0.31 0.3 0.2 0.62 0.22 0.14 0.32 0.51 0.59 0.52 1.0 0.66 0.59 0.44 0.78 0.51 0.77 0.78 0.41 0.83 0.44 0.22 0.12 0.54 0.45
Sro858_g211760.1 (Contig4009.g30822)
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.36 0.0 0.0 0.01 0.02
Sro886_g216220.1 (Contig1359.g12534)
0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.01 0.13 0.48 0.42 0.13 0.08 0.13 1.0 0.69 0.06 0.04 0.05 0.49 0.64 0.5 0.18 0.3 0.2 0.31 0.35 0.32 0.07
Sro97_g050140.1 (Contig689.g8068)
0.01 0.45 0.63 0.5 0.49 0.43 0.36 0.91 0.77 0.42 0.49 0.87 0.58 0.91 0.43 0.32 0.51 0.47 0.88 0.18 0.43 0.71 1.0 0.6 0.3 0.36 0.33
Sro993_g228910.1 (Contig4395.g33022)
0.0 0.13 0.4 0.18 0.14 0.11 0.13 0.2 0.3 0.15 0.06 0.15 0.43 1.0 0.2 0.12 0.17 0.07 0.7 0.08 0.13 0.52 0.46 0.66 0.22 0.12 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)