1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_244 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1055_g236050.1 (Contig2523.g20593)
 0.07 0.12 0.07 0.04 0.03 0.25 0.57 0.47 0.21 0.46 0.62 0.61 0.44 0.45 0.72 0.71 0.49 1.0 0.56 0.42 0.53 0.03 0.21 0.82 0.39 0.28 0.43
Sro1167_g248350.1 (Contig525.g6875)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.49 0.43 0.11 0.35 0.52 0.28 0.34 0.13 0.77 1.0 0.49 0.77 0.12 0.28 0.43 0.02 0.06 0.63 0.53 0.32 0.31
Sro120_g058640.1 (Contig2411.g19742)
 0.01 0.11 0.13 0.04 0.05 0.18 0.69 0.25 0.19 0.48 0.64 0.56 1.0 0.5 0.81 0.84 0.29 0.92 0.43 0.81 0.52 0.24 0.13 0.62 0.38 0.29 0.39
Sro1331_g263520.1 (Contig1733.g15458)
 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.12 0.68 0.28 0.1 0.56 0.39 0.74 0.79 0.62 0.67 0.39 0.19 0.55 0.31 1.0 0.83 0.1 0.04 0.72 0.74 0.48 0.27
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.06 0.33 0.25 0.09 0.58 0.6 0.62 0.83 0.73 0.77 0.75 0.46 1.0 0.39 0.59 0.8 0.01 0.06 0.62 0.82 0.51 0.31
Sro1365_g266540.1 (Contig1439.g13235)
 0.02 0.12 0.09 0.12 0.09 0.5 0.52 0.65 0.36 0.35 0.71 0.3 0.6 0.2 0.83 0.7 0.7 1.0 0.3 0.28 0.41 0.02 0.24 0.73 0.81 0.48 0.48
Sro139_g065260.1 (Contig4334.g32702)
 0.03 0.05 0.05 0.04 0.03 0.3 0.72 0.56 0.2 0.35 0.4 0.32 0.13 0.32 0.87 0.6 0.28 0.71 0.24 0.15 0.58 0.0 0.2 0.92 1.0 0.6 0.24
Sro1416_g270820.1 (Contig660.g7804)
 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.15 0.3 0.16 0.07 0.32 0.36 0.29 0.43 0.38 0.57 0.62 0.3 1.0 0.31 0.45 0.45 0.04 0.04 0.36 0.23 0.16 0.22
Sro1459_g274480.1 (Contig2263.g18780)
 0.0 0.08 0.06 0.05 0.07 0.34 0.66 0.31 0.07 0.69 0.6 0.95 0.39 0.66 0.99 0.93 0.42 0.82 0.5 0.51 1.0 0.01 0.1 0.66 0.84 0.79 0.55
Sro1461_g274740.1 (Contig2979.g23681)
 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.23 0.18 0.03 0.31 0.62 0.2 0.38 0.07 0.6 0.74 0.33 0.6 0.24 0.47 0.45 0.02 0.02 0.49 1.0 0.38 0.18
Sro1473_g275570.1 (Contig4548.g33988)
 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.27 0.28 0.11 0.41 0.44 0.41 0.31 0.58 0.7 0.85 0.3 1.0 0.26 0.35 0.37 0.1 0.11 0.31 0.25 0.17 0.32
Sro1473_g275650.1 (Contig4548.g33996)
 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.2 0.79 0.31 0.11 0.48 0.51 0.6 0.41 0.15 0.68 1.0 0.29 0.81 0.29 0.42 0.81 0.02 0.12 0.65 0.73 0.48 0.26
Sro1504_g278090.1 (Contig3213.g25410)
 0.05 0.14 0.04 0.04 0.02 0.34 0.55 0.52 0.19 0.42 0.87 0.47 0.52 0.15 0.99 0.8 0.55 1.0 0.33 0.5 0.34 0.06 0.11 0.63 0.39 0.29 0.41
Sro157_g071150.1 (Contig2362.g19405)
 0.02 0.24 0.1 0.26 0.25 0.18 0.85 0.37 0.22 0.66 0.74 0.79 0.88 0.73 0.88 0.93 0.49 0.85 0.41 1.0 0.77 0.12 0.22 0.72 0.84 0.57 0.41
Sro160_g072210.1 (Contig2985.g23717)
 0.02 0.13 0.1 0.1 0.09 0.15 0.37 0.33 0.2 0.28 0.53 0.25 0.54 0.31 0.68 0.6 0.36 1.0 0.34 0.46 0.33 0.04 0.13 0.47 0.57 0.39 0.29
Sro162_g072980.1 (Contig2670.g21634)
 0.01 0.08 0.03 0.02 0.02 0.09 0.43 0.27 0.18 0.51 0.47 0.47 0.62 0.71 0.53 0.64 0.27 1.0 0.49 0.63 0.63 0.22 0.18 0.16 0.19 0.15 0.21
Sro1652_g288780.1 (Contig1839.g16139)
 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.38 0.44 0.42 0.13 0.28 0.49 0.19 0.32 0.03 0.69 0.62 0.49 1.0 0.22 0.22 0.36 0.01 0.06 0.66 0.67 0.39 0.28
Sro17_g012040.1 (Contig269.g3383)
 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.1 0.19 0.03 0.32 0.2 0.53 0.52 0.79 0.49 1.0 0.17 0.64 0.24 0.45 0.33 0.0 0.06 0.11 0.08 0.02 0.1
Sro180_g078720.1 (Contig350.g4751)
 0.01 0.16 0.12 0.08 0.1 0.15 0.7 0.38 0.29 0.65 0.83 0.78 0.76 0.69 0.83 0.97 0.45 1.0 0.51 0.88 0.76 0.18 0.15 0.61 0.42 0.33 0.49
Sro180_g078730.1 (Contig350.g4752)
 0.01 0.14 0.1 0.03 0.15 0.38 0.68 0.52 0.18 0.52 0.58 0.51 0.7 0.52 0.56 0.85 0.4 0.99 0.59 1.0 0.67 0.17 0.12 0.42 0.32 0.5 0.45
Sro189_g081430.1 (Contig744.g8507)
 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.36 0.39 0.24 0.29 0.52 0.21 0.35 0.27 0.84 1.0 0.46 0.29 0.13 0.38 0.51 0.14 0.17 0.52 0.92 0.47 0.41
Sro2015_g311110.1 (Contig3461.g26856)
 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.12 0.46 0.21 0.08 0.51 0.38 0.45 0.31 0.54 0.75 1.0 0.44 0.87 0.29 0.43 0.67 0.09 0.05 0.43 0.52 0.24 0.46
Sro205_g086200.1 (Contig2217.g18433)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.51 0.3 0.07 0.34 0.58 0.27 0.56 0.06 0.64 1.0 0.37 0.79 0.11 0.25 0.32 0.03 0.04 0.68 0.52 0.27 0.3
Sro231_g093570.1 (Contig3051.g24270)
 0.03 0.12 0.08 0.06 0.03 0.3 0.41 0.59 0.2 0.41 0.62 0.5 0.19 0.16 0.76 0.72 0.58 1.0 0.35 0.28 0.58 0.01 0.15 0.9 0.61 0.37 0.48
Sro254_g100050.1 (Contig387.g5200)
 0.32 0.14 0.06 0.05 0.04 0.13 0.46 0.26 0.11 0.56 0.78 0.69 0.48 0.25 0.72 1.0 0.4 0.71 0.26 0.44 0.38 0.08 0.08 0.43 0.23 0.27 0.53
Sro2691_g334750.1 (Contig4382.g32962)
 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.26 0.16 0.11 0.44 0.65 0.43 0.33 0.72 0.83 1.0 0.18 0.85 0.23 0.44 0.61 0.2 0.12 0.51 0.28 0.31 0.47
Sro2805_g337520.1 (Contig2204.g18340)
 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.13 0.42 0.33 0.08 0.45 0.5 0.42 0.37 0.69 0.76 1.0 0.45 0.79 0.26 0.37 0.56 0.18 0.14 0.78 0.7 0.47 0.54
Sro2814_g337680.1 (Contig2221.g18456)
 0.02 0.03 0.11 0.08 0.05 0.19 0.4 0.3 0.27 0.59 0.64 0.88 0.77 0.73 0.84 0.95 0.23 0.87 0.36 0.83 1.0 0.13 0.11 0.47 0.66 0.29 0.37
Sro285_g108050.1 (Contig491.g6611)
 0.01 0.12 0.12 0.07 0.06 0.4 0.52 0.42 0.21 0.25 0.68 0.12 0.38 0.03 0.93 0.94 0.52 1.0 0.25 0.25 0.18 0.05 0.17 0.72 0.4 0.37 0.31
Sro287_g108670.1 (Contig252.g3108)
 0.0 0.04 0.01 0.03 0.05 0.04 0.49 0.25 0.04 0.32 0.4 0.18 0.34 0.09 0.84 1.0 0.54 0.52 0.2 0.26 0.11 0.03 0.03 0.3 0.48 0.42 0.45
Sro300_g111760.1 (Contig270.g3464)
 0.01 0.09 0.14 0.08 0.07 0.23 0.59 0.29 0.16 0.54 0.7 0.57 0.88 0.53 0.87 1.0 0.41 0.93 0.29 0.8 0.64 0.14 0.1 0.54 0.91 0.51 0.3
Sro3058_g342900.1 (Contig2493.g20436)
 0.02 0.17 0.11 0.04 0.05 0.04 0.35 0.23 0.05 0.6 0.4 0.54 0.25 0.49 0.7 0.96 0.4 1.0 0.33 0.42 0.76 0.02 0.03 0.67 0.41 0.39 0.48
Sro307_g113340.1 (Contig2839.g22804)
 0.02 0.1 1.0 0.09 0.18 0.12 0.24 0.16 0.13 0.43 0.49 0.45 0.68 0.97 0.56 1.0 0.31 0.69 0.16 0.56 0.43 0.04 0.07 0.23 0.2 0.21 0.25
Sro359_g126030.1 (Contig295.g3864)
 0.02 0.35 0.27 0.35 0.28 0.14 0.9 0.56 0.31 0.65 0.51 0.78 0.58 0.97 0.74 1.0 0.31 0.81 0.37 0.74 1.0 0.11 0.28 0.95 0.92 0.56 0.42
Sro361_g126650.1 (Contig1094.g10590)
 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.63 0.58 0.39 0.13 0.42 0.74 0.18 0.57 0.24 1.0 0.92 0.52 1.0 0.17 0.28 0.24 0.02 0.12 0.8 0.41 0.25 0.63
0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.11 0.08 0.07 0.03 0.38 0.28 0.37 0.3 1.0 0.43 0.46 0.3 0.66 0.44 0.38 0.5 0.05 0.03 0.03 0.02 0.06 0.24
Sro3765_g350910.1 (Contig3676.g28392)
 0.06 0.1 0.0 0.0 0.04 0.3 0.63 0.31 0.17 0.43 0.75 0.65 0.22 0.21 1.0 0.92 0.33 0.7 0.25 0.22 0.35 0.0 0.14 0.7 0.3 0.21 0.57
Sro411_g137710.1 (Contig243.g2977)
 0.01 0.16 0.14 0.19 0.17 0.2 0.65 0.5 0.2 0.33 0.51 0.28 0.3 0.18 0.66 0.61 0.34 0.86 0.33 0.27 0.38 0.03 0.21 1.0 0.86 0.39 0.39
Sro43_g026180.1 (Contig2453.g20084)
 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.18 0.46 0.31 0.16 0.5 0.64 0.53 0.31 0.57 0.65 0.94 0.55 1.0 0.4 0.43 0.47 0.05 0.18 0.46 0.29 0.19 0.39
Sro447_g144890.1 (Contig3064.g24411)
 0.0 0.07 0.07 0.1 0.08 0.17 0.52 0.15 0.22 0.59 0.44 1.0 0.89 0.94 0.59 0.61 0.23 0.42 0.16 0.7 0.7 0.08 0.13 0.51 0.58 0.55 0.25
Sro519_g158920.1 (Contig1321.g12209)
 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.17 0.49 0.32 0.3 0.47 0.47 0.59 0.63 0.45 0.54 1.0 0.24 0.81 0.24 0.62 0.58 0.02 0.12 0.5 0.4 0.17 0.38
Sro554_g165550.1 (Contig3803.g29154)
 0.01 0.06 0.03 0.03 0.01 0.23 0.3 0.47 0.16 0.28 0.45 0.22 0.42 0.12 0.7 0.73 0.38 1.0 0.22 0.3 0.34 0.01 0.11 0.57 0.48 0.21 0.28
Sro562_g167020.1 (Contig149.g1654)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.36 0.18 0.08 0.32 0.28 0.3 0.48 0.38 0.42 0.35 0.15 1.0 0.29 0.51 0.47 0.0 0.08 0.39 0.46 0.39 0.18
Sro564_g167410.1 (Contig73.g779)
 0.01 0.11 0.08 0.09 0.06 0.15 0.86 0.46 0.34 0.6 0.42 0.69 0.83 0.96 0.67 0.55 0.22 0.77 0.3 0.81 0.69 0.07 0.21 0.75 1.0 0.57 0.34
Sro621_g176770.1 (Contig1511.g13794)
 0.01 0.13 0.11 0.09 0.08 0.3 0.71 0.24 0.28 0.57 0.68 0.75 0.84 0.69 0.8 0.59 0.17 0.64 0.38 1.0 0.54 0.1 0.14 0.64 0.6 0.5 0.34
Sro695_g188760.1 (Contig4098.g31323)
 0.04 0.11 0.04 0.08 0.07 0.19 0.63 0.37 0.17 0.5 0.42 0.58 0.32 0.46 0.72 1.0 0.22 0.91 0.46 0.49 0.58 0.1 0.2 0.46 0.28 0.24 0.37
Sro72_g039750.1 (Contig1459.g13374)
 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.18 0.41 0.36 0.12 0.38 0.48 0.42 0.17 0.21 0.56 1.0 0.36 0.6 0.11 0.15 0.59 0.0 0.08 0.54 0.68 0.33 0.28
Sro874_g214210.1 (Contig589.g7372)
 0.02 0.15 0.1 0.1 0.12 0.73 0.76 0.5 0.26 0.59 0.66 0.56 0.87 0.58 0.84 0.92 0.52 1.0 0.34 0.55 0.71 0.15 0.26 0.72 0.61 0.37 0.5
Sro882_g215360.1 (Contig1771.g15679)
 0.03 0.03 0.06 0.01 0.01 0.3 0.53 0.45 0.24 0.31 0.19 0.07 0.32 0.33 0.81 0.94 0.18 0.98 0.17 0.26 0.44 0.01 0.18 0.84 1.0 0.38 0.28
Sro8_g006460.1 (Contig89.g959)
 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.3 0.23 0.05 0.28 0.19 0.19 0.35 0.13 0.59 1.0 0.34 0.48 0.15 0.36 0.36 0.05 0.03 0.37 0.39 0.15 0.31
Sro964_g225410.1 (Contig2151.g18103)
 0.0 0.04 0.03 0.02 0.05 0.25 0.18 0.13 0.01 0.58 0.47 0.76 0.47 0.73 0.84 0.76 0.35 0.76 0.44 0.69 1.0 0.0 0.01 0.5 0.44 0.58 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)