1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_277 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1018_g231910.1 (Contig4480.g33673)
 0.08 0.4 0.21 0.18 0.26 0.48 0.43 0.29 0.27 0.64 0.47 0.98 0.47 1.0 0.55 0.46 0.36 0.44 0.65 0.61 0.85 0.7 0.48 0.61 0.83 0.77 0.41
Sro1024_g232600.1 (Contig4464.g33539)
 0.04 0.34 0.28 0.41 0.39 1.0 0.9 0.57 0.4 0.69 0.53 0.81 0.41 0.83 0.61 0.0 0.43 0.46 0.36 0.38 0.92 0.86 0.49 0.94 0.95 0.66 0.38
Sro1036_g234000.1 (Contig614.g7566)
 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.53 0.2 0.11 0.11 0.22 0.0 0.16 0.3 0.38 0.53 0.13 0.54 0.35 0.46 0.42 0.38 0.03 0.81 1.0 0.69 0.22
Sro111_g055120.1 (Contig567.g7189)
 0.01 0.03 0.02 0.03 0.08 0.21 0.23 0.22 0.08 0.57 0.33 0.72 0.23 0.81 0.38 0.61 0.49 0.17 0.5 0.32 0.63 1.0 0.13 0.3 0.38 0.6 0.43
Sro120_g058670.1 (Contig2411.g19745)
 0.02 0.5 0.25 0.27 0.3 0.57 0.49 0.36 0.18 0.45 0.32 0.58 0.1 0.6 0.34 0.15 0.38 0.24 0.4 0.3 0.49 0.88 0.23 0.78 1.0 0.62 0.44
Sro1292_g260050.1 (Contig3668.g28346)
 0.04 0.55 0.28 0.39 0.39 0.31 0.89 0.38 0.11 0.52 0.14 0.46 0.12 0.78 0.36 0.17 0.07 0.39 0.16 0.19 0.58 0.32 0.29 0.94 1.0 0.77 0.2
Sro1296_g260400.1 (Contig1348.g12406)
 0.04 0.15 0.12 0.12 0.23 0.17 0.25 0.22 0.14 0.57 0.24 1.0 0.27 0.59 0.21 0.36 0.38 0.55 0.66 0.45 0.9 0.68 0.32 0.34 0.44 0.21 0.19
Sro1308_g261470.1 (Contig2858.g22923)
 0.04 0.23 0.2 0.12 0.13 0.43 0.67 0.29 0.18 0.32 0.18 0.3 0.15 0.26 0.37 0.15 0.19 0.25 0.2 0.15 0.25 1.0 0.17 0.72 0.31 0.41 0.28
Sro1308_g261480.1 (Contig2858.g22924)
 0.01 0.21 0.21 0.2 0.32 0.63 0.42 0.21 0.29 0.39 0.26 0.52 0.9 0.49 0.59 0.02 0.92 0.62 0.37 0.72 0.2 1.0 0.21 0.31 0.02 0.64 0.35
Sro1320_g262380.1 (Contig4115.g31417)
 0.0 0.13 0.11 0.12 0.16 0.5 0.91 0.45 0.19 0.41 0.38 0.28 0.13 0.34 0.64 0.44 0.14 0.33 0.33 0.23 0.42 0.66 0.19 0.88 1.0 0.76 0.62
Sro133_g062910.1 (Contig2274.g18850)
 0.06 0.17 0.1 0.08 0.12 0.63 0.49 0.35 0.26 0.64 0.37 0.85 0.54 0.9 0.59 0.24 0.49 0.79 0.98 0.88 1.0 0.92 0.61 0.6 0.73 0.82 0.33
Sro1389_g268510.1 (Contig3774.g28971)
 0.0 0.24 0.09 0.18 0.16 0.93 0.62 0.38 0.11 0.76 0.69 0.61 0.3 1.0 0.84 0.59 0.59 0.89 0.56 0.51 0.7 0.39 0.19 0.74 0.77 0.7 0.82
Sro151_g069090.1 (Contig294.g3835)
 0.01 0.16 0.16 0.11 0.13 0.43 0.41 0.25 0.19 0.43 0.31 0.55 0.46 1.0 0.43 0.23 0.4 0.2 0.23 0.31 0.51 0.61 0.23 0.58 0.47 0.4 0.3
Sro155_g070350.1 (Contig395.g5342)
 0.06 0.4 0.24 0.38 0.33 0.26 0.39 0.21 0.19 0.54 0.29 0.86 0.14 0.41 0.2 0.2 0.33 0.21 0.63 0.48 0.95 0.69 0.17 0.56 1.0 0.55 0.33
Sro1616_g286220.1 (Contig599.g7469)
 0.03 0.15 0.07 0.16 0.23 0.4 0.69 0.36 0.12 0.59 0.52 0.72 0.42 1.0 0.73 0.82 0.39 0.38 0.15 0.3 0.59 0.32 0.2 0.66 0.44 0.35 0.4
Sro1769_g296430.1 (Contig4211.g32033)
 0.0 0.54 0.65 0.4 0.09 0.49 0.98 0.14 0.08 0.39 0.39 0.44 0.27 1.0 0.62 0.22 0.15 0.2 0.06 0.19 0.33 0.11 0.1 0.46 0.18 0.51 0.1
0.01 1.0 0.2 0.18 0.8 0.31 0.54 0.15 0.23 0.42 0.47 0.22 0.68 0.41 0.46 0.18 0.2 0.15 0.03 0.55 0.33 0.24 0.16 0.32 0.62 0.47 0.16
Sro176_g077210.1 (Contig203.g2408)
 0.87 0.24 0.17 0.18 0.17 0.51 0.65 0.4 0.16 0.55 0.47 0.68 0.65 0.6 0.49 0.07 0.3 0.62 0.13 0.65 0.48 0.42 0.17 1.0 0.93 0.42 0.17
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.52 0.01 0.42 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.28 0.0 0.13 0.97 0.17 0.28 1.0 0.0 0.04
Sro1839_g300860.1 (Contig1409.g12916)
 0.02 0.28 0.57 0.13 0.25 0.11 0.86 0.46 0.37 0.27 0.43 0.2 0.35 0.16 0.25 0.29 0.01 0.38 0.22 0.18 0.34 1.0 0.22 0.53 0.46 0.25 0.25
Sro185_g080220.1 (Contig1228.g11497)
 0.01 0.14 0.1 0.15 0.19 0.28 0.26 0.12 0.03 0.33 0.17 0.58 0.05 1.0 0.27 0.04 0.22 0.26 0.42 0.21 0.31 0.4 0.12 0.35 0.32 0.43 0.22
Sro190_g081810.1 (Contig3488.g27056)
 0.02 0.06 0.04 0.09 0.11 0.19 0.31 0.35 0.13 0.47 0.55 0.47 0.99 0.73 0.5 0.34 0.45 0.38 0.66 0.81 0.52 0.6 0.14 0.48 1.0 0.83 0.26
Sro1917_g305280.1 (Contig4179.g31876)
 0.08 0.61 0.4 0.6 0.65 0.54 0.88 0.86 0.47 0.81 0.68 0.87 0.5 0.68 0.59 0.67 0.63 0.2 0.25 0.25 0.71 0.56 0.39 1.0 0.92 0.76 0.74
Sro214_g088700.1 (Contig282.g3655)
 0.06 0.3 0.16 0.17 0.21 0.52 0.32 0.58 0.26 0.65 0.5 0.95 0.29 0.58 0.36 0.18 0.48 0.27 0.81 0.71 0.69 1.0 0.24 0.62 0.7 0.57 0.48
0.03 0.37 0.06 0.36 0.0 0.14 0.21 0.11 0.05 0.28 0.0 0.31 0.54 0.09 0.31 0.22 0.37 0.42 0.05 0.59 0.24 1.0 0.09 0.67 0.58 0.54 0.04
Sro2228_g319890.1 (Contig884.g9450)
 0.1 0.11 0.06 0.22 0.15 0.3 0.39 0.21 0.19 0.61 0.34 0.94 0.33 1.0 0.46 0.31 0.34 0.45 0.6 0.48 0.7 0.51 0.32 0.37 0.29 0.54 0.34
Sro2370_g325190.1 (Contig2982.g23692)
 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.79 0.44 0.23 0.11 0.57 0.48 0.82 0.22 0.72 0.53 0.28 0.47 0.2 0.14 0.27 0.86 0.35 0.1 0.7 1.0 0.61 0.38
Sro2381_g325500.1 (Contig4498.g33730)
 0.04 0.39 0.15 0.11 0.18 0.38 0.74 0.47 0.11 0.56 0.58 0.54 0.1 1.0 0.7 0.45 0.5 0.83 0.44 0.23 0.56 0.64 0.19 0.79 0.37 0.8 0.75
Sro244_g097080.1 (Contig2788.g22424)
 0.0 0.1 0.18 0.15 0.13 0.12 0.51 0.31 0.35 0.5 0.39 0.65 0.38 1.0 0.36 0.42 0.45 0.45 0.42 0.52 0.66 0.68 0.33 0.59 0.91 0.8 0.27
Sro245_g097540.1 (Contig3087.g24625)
 0.01 0.23 0.1 0.13 0.17 0.92 0.8 0.55 0.17 0.69 0.44 0.6 0.31 0.92 0.65 0.61 0.46 0.37 0.49 0.44 0.88 0.66 0.28 0.89 1.0 0.8 0.64
Sro271_g104670.1 (Contig2573.g20900)
 0.08 0.06 0.01 0.01 0.03 0.14 0.51 0.17 0.06 0.29 0.16 0.11 0.36 0.3 0.22 0.18 0.13 0.28 0.26 0.47 0.28 0.78 0.08 0.26 1.0 0.26 0.15
0.01 0.47 0.29 0.25 0.19 0.16 0.14 0.21 0.13 0.37 0.02 0.32 0.36 0.26 0.27 0.16 0.2 0.12 0.4 0.56 0.34 1.0 0.15 0.11 0.19 0.03 0.19
Sro294_g110280.1 (Contig215.g2576)
 0.02 0.41 0.56 0.45 0.58 0.59 0.32 0.12 0.24 0.69 0.57 1.0 0.74 0.85 0.41 0.44 0.53 0.25 0.58 0.66 0.95 0.64 0.15 0.41 0.68 0.48 0.59
0.0 0.21 0.17 0.1 0.06 0.0 0.45 0.55 0.34 0.27 0.54 0.41 0.63 0.17 0.21 0.74 0.33 0.18 0.06 0.13 0.32 0.94 0.15 1.0 0.55 0.0 0.15
Sro301_g111810.1 (Contig455.g6129)
 0.01 0.36 0.23 0.46 0.55 0.7 0.5 0.28 0.11 0.65 0.46 0.72 0.62 0.58 0.49 0.19 0.5 0.82 0.36 1.0 0.54 0.24 0.16 0.59 0.69 0.55 0.44
Sro3158_g344620.1 (Contig2445.g20023)
 0.0 0.11 0.1 0.06 0.08 0.08 0.7 0.21 0.05 0.27 0.14 0.19 0.03 0.05 0.41 0.29 0.28 0.12 0.09 0.09 0.19 1.0 0.14 0.68 0.79 0.55 0.38
Sro315_g115320.1 (Contig447.g6055)
 0.04 0.24 0.23 0.26 0.28 0.18 0.41 0.28 0.16 0.58 0.49 0.78 0.53 1.0 0.58 0.54 0.52 0.47 0.49 0.69 0.65 0.78 0.27 0.56 0.51 0.85 0.46
Sro335_g120210.1 (Contig3868.g29778)
 0.06 0.27 0.33 0.39 0.35 0.32 0.42 0.24 0.24 0.69 0.65 1.0 0.67 0.83 0.48 0.3 0.59 0.59 0.6 0.75 0.78 0.6 0.34 0.62 0.84 0.86 0.48
Sro395_g134040.1 (Contig4272.g32323)
 0.04 0.39 0.26 0.29 0.38 0.84 0.72 0.53 0.22 0.7 0.39 0.89 0.42 0.9 0.65 0.33 0.46 0.67 0.4 0.54 0.93 0.45 0.2 1.0 0.64 0.76 0.51
Sro504_g156000.1 (Contig4263.g32266)
 0.01 0.1 0.04 0.11 0.08 0.81 0.35 0.28 0.25 0.45 0.51 0.65 0.32 1.0 0.53 0.14 0.48 0.46 0.52 0.29 0.38 0.9 0.4 0.66 0.38 0.46 0.37
Sro506_g156290.1 (Contig3494.g27106)
 0.01 0.31 0.12 0.16 0.14 0.26 0.44 0.19 0.17 0.34 0.15 0.37 0.41 1.0 0.23 0.06 0.15 0.53 0.58 0.53 0.49 0.78 0.35 0.34 0.5 0.47 0.17
Sro560_g166590.1 (Contig2779.g22374)
 0.13 0.18 0.35 0.58 0.33 0.59 0.74 0.61 0.39 0.5 0.38 0.73 0.3 0.38 0.43 0.61 0.31 0.32 0.19 0.2 0.83 0.39 0.27 0.91 0.95 1.0 0.42
Sro566_g167730.1 (Contig3739.g28668)
 0.01 0.26 0.19 0.13 0.11 0.13 0.2 0.11 0.02 0.19 0.07 0.13 0.14 0.73 0.11 0.0 0.04 0.17 1.0 0.22 0.34 0.85 0.16 0.36 0.34 0.24 0.06
Sro588_g171460.1 (Contig4679.g34788)
 0.06 0.27 0.24 0.22 0.25 0.23 0.33 0.17 0.17 0.68 0.41 1.0 0.46 0.92 0.35 0.21 0.48 0.59 0.78 0.7 0.63 0.42 0.31 0.28 0.33 0.74 0.34
Sro621_g176760.1 (Contig1511.g13793)
 0.01 0.16 0.14 0.06 0.05 0.66 0.39 0.19 0.03 0.4 0.1 0.54 0.06 1.0 0.32 0.0 0.12 0.67 0.28 0.29 0.6 0.4 0.1 0.63 0.85 0.67 0.18
Sro625_g177620.1 (Contig691.g8100)
 0.01 0.68 0.94 0.65 0.51 0.25 0.29 0.12 0.04 0.68 0.49 1.0 0.3 0.64 0.37 0.47 0.41 0.44 0.74 0.59 0.97 0.55 0.12 0.55 0.55 0.49 0.54
Sro684_g186720.1 (Contig2085.g17776)
 0.05 0.58 0.57 0.65 0.38 0.26 0.66 0.55 0.48 0.49 0.51 0.45 0.24 0.64 0.44 0.47 0.34 0.64 0.31 0.37 0.5 1.0 0.29 0.45 0.44 0.37 0.4
Sro753_g197310.1 (Contig4403.g33074)
 0.02 0.27 0.22 0.26 0.28 0.52 0.32 0.2 0.26 0.34 0.36 0.44 0.25 0.78 0.4 0.04 0.5 0.38 0.74 0.4 0.29 1.0 0.46 0.4 0.47 0.58 0.21
Sro790_g202880.1 (Contig4757.g459)
 0.02 0.33 0.32 0.28 0.24 0.47 0.72 0.39 0.39 0.54 0.56 0.74 0.32 1.0 0.54 0.11 0.5 0.56 0.47 0.56 0.66 0.58 0.33 0.79 0.59 0.59 0.48
Sro802_g204570.1 (Contig712.g8224)
 0.0 0.07 0.06 0.03 0.09 0.18 0.25 0.21 0.1 0.51 0.56 0.45 0.23 0.7 0.51 0.7 0.48 0.38 0.42 0.4 0.59 1.0 0.22 0.35 0.69 0.56 0.52
Sro83_g044360.1 (Contig4450.g33410)
 0.08 0.26 0.24 0.38 0.4 1.0 0.58 0.4 0.23 0.53 0.5 0.55 0.09 0.56 0.51 0.08 0.35 0.15 0.17 0.15 0.43 0.28 0.27 0.8 0.29 0.55 0.45
Sro850_g210660.1 (Contig2035.g17488)
 0.03 0.12 0.07 0.06 0.14 0.19 0.57 0.35 0.21 0.82 0.36 0.91 0.16 0.48 0.35 0.47 0.43 0.46 0.58 0.66 0.92 1.0 0.32 1.0 0.74 0.79 0.55
Sro93_g048730.1 (Contig3841.g29561)
 0.0 0.1 0.07 0.07 0.08 0.54 0.47 0.24 0.15 0.39 0.35 0.39 0.43 0.97 0.53 0.23 0.47 0.47 0.64 0.49 0.52 0.82 0.25 0.57 1.0 0.59 0.21
Sro98_g050390.1 (Contig3362.g26331)
 0.04 0.13 0.05 0.03 0.05 0.19 0.44 0.45 0.21 0.44 0.28 0.45 0.6 0.9 0.42 0.29 0.29 0.74 0.39 0.69 0.83 0.87 0.27 0.51 1.0 0.39 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)