Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1021_g232230.1 (Contig686.g7985)
0.0 0.06 0.1 0.07 0.05 0.08 0.24 0.11 0.1 0.44 0.25 0.5 0.76 0.62 0.35 0.5 0.31 0.36 0.32 1.0 0.76 0.11 0.1 0.2 0.29 0.38 0.3
Sro103_g052290.1 (Contig308.g4026)
0.02 0.06 0.1 0.07 0.08 0.12 0.3 0.19 0.08 0.58 0.48 0.8 0.68 0.64 0.4 0.5 0.58 0.35 0.35 0.93 1.0 0.14 0.13 0.31 0.35 0.33 0.43
Sro103_g052400.1 (Contig308.g4037)
0.0 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.24 0.18 0.05 0.5 0.18 0.6 0.3 0.43 0.28 0.37 0.2 0.44 0.23 1.0 0.87 0.09 0.03 0.31 0.38 0.28 0.15
Sro1048_g235240.1 (Contig3784.g29048)
0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.06 0.28 0.14 0.04 0.54 0.3 0.6 0.34 0.81 0.4 0.46 0.34 0.48 0.45 1.0 0.91 0.26 0.07 0.3 0.3 0.38 0.27
Sro107_g054020.1 (Contig1548.g14077)
0.01 0.09 0.13 0.03 0.03 0.07 0.29 0.22 0.14 0.51 0.31 0.67 0.41 0.42 0.28 0.37 0.38 0.51 0.5 1.0 0.79 0.16 0.11 0.19 0.36 0.39 0.33
0.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04 0.13 0.09 0.12 0.47 0.39 0.49 0.46 0.7 0.31 0.44 0.36 0.31 0.51 1.0 0.58 0.17 0.14 0.16 0.2 0.4 0.4
Sro1229_g254490.1 (Contig3654.g28213)
0.01 0.07 0.19 0.12 0.11 0.14 0.14 0.11 0.13 0.49 0.35 0.59 0.85 0.46 0.36 0.6 0.25 0.34 0.52 1.0 0.88 0.24 0.07 0.25 0.25 0.3 0.3
Sro1339_g264340.1 (Contig2212.g18359)
0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.04 0.14 0.13 0.06 0.45 0.24 0.55 0.5 0.11 0.26 0.28 0.27 0.32 0.49 1.0 0.75 0.03 0.04 0.16 0.36 0.39 0.22
Sro137_g064410.1 (Contig3969.g30456)
0.02 0.19 0.27 0.16 0.13 0.16 0.28 0.22 0.21 0.63 0.47 0.81 1.0 0.55 0.45 0.7 0.36 0.26 0.48 0.89 0.96 0.28 0.2 0.16 0.24 0.25 0.4
Sro139_g065070.1 (Contig4334.g32683)
0.01 0.01 0.06 0.01 0.01 0.07 0.17 0.07 0.05 0.42 0.19 0.66 0.49 0.2 0.24 0.24 0.18 0.31 0.31 1.0 0.8 0.13 0.04 0.2 0.46 0.37 0.19
Sro1415_g270730.1 (Contig16.g134)
0.1 0.07 0.09 0.05 0.04 0.25 0.35 0.19 0.29 0.53 0.43 0.59 0.7 0.58 0.46 0.7 0.47 0.54 0.59 1.0 0.76 0.33 0.3 0.38 0.35 0.46 0.38
Sro143_g066660.1 (Contig3754.g28772)
0.05 0.04 0.07 0.03 0.02 0.13 0.23 0.15 0.15 0.64 0.46 0.72 0.48 0.92 0.52 0.67 0.51 0.38 0.4 1.0 0.74 0.25 0.11 0.27 0.33 0.41 0.44
Sro1474_g275690.1 (Contig1848.g16174)
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.08 0.19 0.07 0.1 0.41 0.2 0.52 0.58 0.63 0.31 0.27 0.18 0.23 0.41 1.0 0.63 0.19 0.05 0.21 0.14 0.18 0.19
Sro1493_g277320.1 (Contig1998.g17101)
0.01 0.06 0.42 0.03 0.03 0.02 0.18 0.12 0.11 0.48 0.23 0.53 0.3 0.51 0.29 0.48 0.26 0.34 0.34 1.0 0.97 0.24 0.12 0.22 0.35 0.42 0.29
Sro1495_g277390.1 (Contig2585.g20988)
0.01 0.04 0.02 0.07 0.07 0.09 0.37 0.07 0.03 0.48 0.28 0.5 0.35 0.1 0.48 0.73 0.55 0.68 0.6 0.67 1.0 0.22 0.02 0.24 0.28 0.25 0.28
Sro1601_g285140.1 (Contig4269.g32298)
0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.1 0.16 0.08 0.05 0.5 0.27 0.54 0.67 0.65 0.32 0.33 0.23 0.22 0.38 1.0 0.72 0.12 0.07 0.17 0.36 0.26 0.24
Sro1649_g288620.1 (Contig3529.g27272)
0.04 0.02 0.17 0.05 0.03 0.2 0.21 0.1 0.16 0.51 0.31 0.69 0.8 0.43 0.36 0.4 0.27 0.3 0.41 1.0 0.83 0.34 0.16 0.3 0.39 0.36 0.3
Sro174_g076540.1 (Contig4298.g32438)
0.01 0.04 0.03 0.1 0.08 0.19 0.23 0.2 0.05 0.58 0.25 0.82 0.78 0.57 0.43 0.67 0.23 0.34 0.53 1.0 0.85 0.09 0.04 0.26 0.25 0.51 0.37
Sro174_g076550.1 (Contig4298.g32439)
0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.09 0.34 0.13 0.21 0.57 0.46 0.54 0.41 0.59 0.46 0.54 0.35 0.5 0.46 0.99 1.0 0.29 0.21 0.26 0.26 0.38 0.4
Sro176_g077230.1 (Contig203.g2410)
0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.06 0.17 0.08 0.06 0.52 0.29 0.65 0.61 0.83 0.39 0.67 0.35 0.34 0.52 1.0 0.66 0.18 0.08 0.19 0.38 0.43 0.38
Sro178_g078240.1 (Contig275.g3549)
0.02 0.02 0.01 0.04 0.02 0.1 0.37 0.17 0.09 0.58 0.39 0.68 0.56 0.48 0.48 0.55 0.43 0.62 0.59 1.0 0.87 0.24 0.08 0.27 0.25 0.25 0.53
Sro1792_g297880.1 (Contig126.g1433)
0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.07 0.54 0.17 0.14 0.57 0.37 0.73 0.44 0.11 0.51 0.42 0.18 0.54 0.3 0.75 1.0 0.22 0.08 0.23 0.41 0.24 0.36
Sro180_g078670.1 (Contig350.g4746)
0.0 0.12 0.29 0.15 0.04 0.06 0.17 0.18 0.03 0.52 0.48 0.69 0.37 0.38 0.41 0.45 0.34 0.26 0.29 0.92 1.0 0.14 0.09 0.27 0.26 0.33 0.3
Sro189_g081610.1 (Contig744.g8525)
0.02 0.04 0.13 0.04 0.06 0.06 0.26 0.19 0.17 0.59 0.39 0.8 0.33 0.62 0.43 0.5 0.26 0.27 0.45 1.0 0.83 0.27 0.08 0.26 0.35 0.22 0.36
Sro1902_g304450.1 (Contig632.g7671)
0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.09 0.24 0.12 0.15 0.52 0.43 0.67 0.58 0.56 0.41 0.64 0.31 0.45 0.45 1.0 0.9 0.09 0.12 0.33 0.27 0.29 0.23
Sro1925_g305790.1 (Contig1431.g13199)
0.25 0.02 0.03 0.04 0.04 0.06 0.22 0.07 0.03 0.52 0.29 0.54 0.41 0.39 0.3 0.27 0.17 0.74 0.7 1.0 0.67 0.03 0.02 0.29 0.34 0.45 0.38
Sro1947_g307140.1 (Contig4111.g31365)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.13 0.22 0.15 0.11 0.5 0.27 0.59 0.64 0.18 0.28 0.35 0.25 0.1 0.19 1.0 0.93 0.08 0.06 0.29 0.42 0.37 0.26
Sro194_g082700.1 (Contig237.g2865)
0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.09 0.16 0.06 0.02 0.43 0.21 0.58 0.66 0.44 0.3 0.36 0.28 0.33 0.3 1.0 0.75 0.12 0.04 0.14 0.37 0.24 0.18
Sro1959_g307950.1 (Contig1986.g16996)
0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.31 0.37 0.23 0.07 0.62 0.54 0.71 0.33 0.35 0.56 0.56 0.36 0.7 0.67 1.0 0.94 0.19 0.08 0.48 0.48 0.61 0.63
Sro208_g087160.1 (Contig351.g4787)
0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.04 0.25 0.05 0.06 0.48 0.15 0.62 0.27 0.29 0.2 0.26 0.3 0.15 0.23 0.7 1.0 0.06 0.02 0.17 0.27 0.36 0.21
Sro2113_g315080.1 (Contig664.g7843)
0.01 0.08 0.03 0.06 0.06 0.06 0.22 0.12 0.05 0.59 0.49 0.69 0.89 0.59 0.51 0.67 0.38 0.46 0.6 1.0 0.94 0.22 0.07 0.23 0.26 0.35 0.45
Sro2121_g315460.1 (Contig4568.g34123)
0.0 0.03 0.04 0.03 0.03 0.21 0.29 0.14 0.19 0.5 0.41 0.54 0.81 0.6 0.45 0.81 0.48 0.57 0.76 1.0 0.65 0.31 0.21 0.22 0.22 0.39 0.34
Sro2148_g316540.1 (Contig3130.g24840)
0.01 0.02 0.03 0.03 0.0 0.05 0.22 0.08 0.01 0.54 0.41 0.56 0.79 0.43 0.35 0.51 0.28 0.35 0.37 0.87 1.0 0.1 0.02 0.41 0.57 0.54 0.31
Sro2292_g322230.1 (Contig4369.g32900)
0.01 0.05 0.16 0.04 0.02 0.07 0.26 0.16 0.12 0.51 0.31 0.67 0.57 0.48 0.35 0.43 0.37 0.34 0.32 1.0 0.92 0.25 0.1 0.28 0.42 0.44 0.33
0.03 0.11 0.17 0.12 0.15 0.15 0.3 0.14 0.2 0.59 0.39 0.77 0.72 1.0 0.4 0.72 0.31 0.31 0.5 0.92 0.64 0.24 0.17 0.21 0.35 0.38 0.36
Sro253_g099860.1 (Contig3900.g29904)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.26 0.35 0.02 0.47 0.2 0.58 0.17 0.29 0.28 0.46 0.29 0.4 0.44 0.94 1.0 0.08 0.02 0.25 0.25 0.62 0.41
0.0 0.01 0.06 0.01 0.01 0.02 0.1 0.11 0.07 0.44 0.14 0.63 0.43 0.38 0.21 0.26 0.22 0.19 0.14 1.0 0.75 0.09 0.06 0.16 0.28 0.2 0.18
Sro322_g116910.1 (Contig1229.g11529)
0.03 0.06 0.06 0.06 0.06 0.18 0.31 0.23 0.18 0.69 0.56 0.96 0.8 0.96 0.52 0.66 0.55 0.45 0.59 1.0 0.92 0.3 0.2 0.49 0.63 0.53 0.48
Sro372_g128830.1 (Contig2891.g23063)
0.01 0.05 0.01 0.03 0.06 0.04 0.23 0.07 0.18 0.39 0.19 0.44 1.0 0.45 0.19 0.24 0.1 0.26 0.49 0.93 0.72 0.07 0.09 0.23 0.4 0.17 0.22
Sro392_g133410.1 (Contig4514.g33847)
0.01 0.04 0.11 0.09 0.09 0.15 0.22 0.17 0.13 0.52 0.33 0.59 0.9 0.31 0.31 0.41 0.25 0.3 0.43 1.0 0.9 0.16 0.16 0.26 0.38 0.28 0.27
Sro4_g003160.1 (Contig3815.g29234)
0.0 0.05 0.05 0.03 0.09 0.15 0.28 0.08 0.1 0.49 0.26 0.49 0.5 0.23 0.36 0.31 0.21 0.41 0.71 1.0 0.65 0.1 0.06 0.37 0.48 0.44 0.32
Sro4_g003170.1 (Contig3815.g29235)
0.01 0.09 0.08 0.04 0.12 0.12 0.41 0.22 0.1 0.58 0.35 0.58 0.84 0.28 0.52 0.49 0.21 0.65 0.72 1.0 0.92 0.19 0.07 0.46 0.49 0.42 0.4
Sro4_g003180.1 (Contig3815.g29236)
0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.16 0.04 0.03 0.32 0.1 0.35 0.54 0.2 0.2 0.26 0.08 0.28 0.39 1.0 0.6 0.1 0.04 0.13 0.28 0.17 0.12
Sro561_g166870.1 (Contig575.g7314)
0.0 0.16 0.0 0.03 0.03 0.28 0.49 0.19 0.12 0.59 0.23 0.61 0.37 0.12 0.5 0.97 0.21 0.83 0.46 0.68 1.0 0.0 0.05 0.71 0.42 0.56 0.57
Sro64_g036360.1 (Contig2497.g20470)
0.02 0.15 0.18 0.06 0.12 0.08 0.2 0.23 0.07 0.6 0.4 0.64 0.86 0.45 0.41 0.26 0.25 0.27 0.48 1.0 0.94 0.16 0.06 0.31 0.68 0.4 0.32
Sro69_g038700.1 (Contig4677.g34779)
0.03 0.13 0.08 0.05 0.05 0.38 0.41 0.3 0.07 0.58 0.41 0.43 0.26 0.44 0.59 0.64 0.35 0.67 0.69 0.57 1.0 0.28 0.15 0.39 0.56 0.53 0.65
Sro72_g039710.1 (Contig1459.g13370)
0.01 0.15 0.15 0.11 0.07 0.05 0.24 0.1 0.08 0.42 0.28 0.45 0.54 0.32 0.27 0.29 0.28 0.32 0.26 1.0 0.63 0.13 0.09 0.19 0.43 0.32 0.27
Sro767_g199550.1 (Contig2377.g19543)
0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.04 0.17 0.06 0.06 0.43 0.19 0.44 0.42 0.28 0.28 0.3 0.16 0.35 0.25 1.0 0.92 0.1 0.06 0.18 0.39 0.27 0.22
Sro83_g044530.1 (Contig4450.g33427)
0.02 0.04 0.02 0.02 0.01 0.05 0.1 0.12 0.07 0.43 0.16 0.49 0.42 0.43 0.27 0.2 0.16 0.27 0.23 1.0 0.56 0.1 0.05 0.12 0.28 0.21 0.21
Sro84_g044910.1 (Contig220.g2624)
0.0 0.05 0.1 0.1 0.05 0.05 0.22 0.21 0.07 0.56 0.38 0.63 0.78 0.94 0.44 0.65 0.29 0.3 0.39 1.0 0.85 0.18 0.1 0.25 0.39 0.39 0.4
Sro84_g045030.1 (Contig220.g2636)
0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.07 0.35 0.12 0.19 0.57 0.28 0.64 0.7 0.53 0.35 0.4 0.23 0.44 0.42 1.0 0.75 0.2 0.2 0.2 0.45 0.34 0.24
Sro926_g220980.1 (Contig4614.g34423)
0.03 0.03 0.09 0.04 0.02 0.1 0.17 0.09 0.12 0.47 0.33 0.58 0.72 0.59 0.34 0.35 0.34 0.43 0.37 1.0 0.56 0.21 0.11 0.15 0.18 0.31 0.27
Sro945_g223100.1 (Contig53.g391)
0.05 0.03 0.03 0.01 0.0 0.07 0.23 0.08 0.06 0.47 0.36 0.56 0.52 0.83 0.44 0.39 0.23 0.36 0.41 1.0 0.47 0.16 0.05 0.2 0.17 0.33 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)