Heatmap: Cluster_206 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051710.1 (Contig348.g4724)
0.14 0.22 0.19 0.09 0.17 0.24 1.07 0.87 1.01 3.41 2.79 3.57 4.1 5.36 2.8 4.78 2.72 5.06 2.14 7.29 3.71 2.23 0.75 1.81 1.92 1.64 1.45
Sro1073_g238230.1 (Contig2105.g17887)
1.99 3.08 0.83 1.4 2.81 3.69 7.59 8.32 3.2 21.59 17.04 26.31 12.25 32.68 18.69 17.68 22.26 14.93 16.54 27.2 28.49 12.37 6.76 9.55 4.09 15.13 12.56
Sro108_g054070.1 (Contig2294.g18987)
0.53 1.66 0.75 1.93 1.36 7.3 6.04 2.91 3.07 14.84 21.97 14.58 8.41 29.82 19.93 35.13 24.8 7.42 8.34 10.87 17.65 7.72 2.87 6.64 6.33 12.2 10.48
Sro110_g055030.1 (Contig1501.g13726)
5.45 22.6 21.7 17.4 18.3 20.79 36.83 24.33 40.25 69.18 74.11 81.69 81.03 145.2 76.17 88.3 129.99 76.82 70.71 109.28 67.84 65.5 51.54 31.4 19.02 66.31 48.4
Sro1175_g249160.1 (Contig1328.g12263)
0.72 1.16 0.23 0.88 1.39 9.8 9.53 6.39 1.82 21.81 16.56 25.52 6.64 43.14 18.18 30.77 25.21 19.57 24.68 13.82 28.86 17.34 6.02 6.31 9.27 22.88 16.89
Sro1225_g254060.1 (Contig1995.g17082)
0.54 1.27 0.41 1.13 1.5 4.63 10.43 5.45 2.96 18.58 10.51 25.47 20.08 23.18 12.56 25.97 12.38 11.23 8.23 19.79 25.74 8.03 4.47 8.82 6.67 9.92 11.93
Sro1226_g254200.1 (Contig1389.g12811)
3.78 4.24 29.0 6.06 4.15 1.83 6.74 10.59 21.19 35.85 18.18 31.89 16.95 63.23 24.83 38.07 22.59 16.18 19.21 54.07 82.76 55.1 24.28 11.92 13.64 41.8 29.75
Sro1277_g258650.1 (Contig3253.g25670)
2.48 5.6 43.87 7.07 5.55 1.64 2.93 2.61 25.33 22.06 5.98 17.23 6.14 55.57 12.22 14.79 18.5 3.19 12.56 28.23 53.95 32.37 20.5 4.02 5.54 26.28 16.53
Sro1324_g262810.1 (Contig3409.g26610)
1.9 22.11 10.41 17.9 19.49 39.28 46.01 32.04 16.35 64.98 61.54 86.36 40.24 73.14 62.91 41.99 48.8 42.73 35.09 43.09 61.9 33.69 18.52 58.91 44.6 39.16 41.59
Sro1425_g271610.1 (Contig1471.g13489)
0.08 0.19 0.08 0.08 0.54 1.56 2.21 1.56 0.58 5.88 5.2 8.81 2.74 8.04 5.06 9.93 4.16 3.56 2.63 3.69 8.46 2.3 0.68 1.7 1.28 2.02 3.88
Sro143_g066650.1 (Contig3754.g28771)
0.99 18.87 15.43 18.15 21.33 33.29 45.0 35.29 27.37 80.74 90.3 102.74 92.43 158.23 91.8 112.43 98.54 68.24 75.63 103.52 94.55 53.52 39.59 50.78 24.95 74.27 72.07
Sro151_g069130.1 (Contig294.g3839)
22.94 51.57 40.16 34.96 45.79 21.92 36.63 30.55 31.98 103.9 81.43 138.41 32.27 186.99 74.16 79.08 86.48 29.69 38.68 57.72 103.7 69.46 42.92 41.63 30.32 65.27 56.87
Sro151_g069300.1 (Contig294.g3856)
1.72 3.93 6.48 3.69 4.76 7.39 19.28 13.29 8.6 57.91 51.23 60.11 46.38 103.52 57.18 110.9 68.41 54.37 51.84 68.35 76.24 43.81 19.3 24.55 22.3 52.42 50.73
Sro1718_g293350.1 (Contig3856.g29683)
27.25 137.94 69.56 86.84 103.72 84.28 220.13 144.73 162.27 213.94 214.31 191.06 255.35 297.17 271.76 496.07 258.03 267.39 252.07 236.55 280.59 225.01 200.93 105.62 86.92 127.96 170.9
Sro178_g078180.1 (Contig275.g3543)
0.51 1.93 0.93 6.41 4.62 8.01 9.88 8.78 8.67 24.49 17.66 28.19 26.66 32.17 24.85 42.19 31.91 18.59 15.64 30.15 19.99 7.35 4.24 9.12 11.52 12.88 18.71
Sro188_g081120.1 (Contig1383.g12713)
4.68 4.81 18.33 12.87 16.93 5.77 23.48 14.21 17.74 80.64 58.92 107.89 41.1 155.88 65.82 107.9 81.41 48.05 69.47 79.91 85.09 74.15 34.37 27.39 17.24 106.74 63.88
Sro1917_g305290.1 (Contig4179.g31877)
0.57 1.26 0.7 1.49 3.69 3.55 5.63 3.88 1.46 19.99 7.22 29.48 10.79 46.51 11.47 21.89 13.04 5.04 6.6 9.29 26.67 11.04 3.79 4.78 4.42 13.05 9.83
Sro1926_g305870.1 (Contig1976.g16899)
0.46 0.7 1.01 0.4 0.7 1.47 1.53 1.82 0.93 8.66 6.49 10.37 5.73 10.34 6.02 11.5 6.93 7.17 6.86 9.12 12.91 6.09 1.94 3.07 2.51 8.18 6.76
Sro196_g083600.1 (Contig3206.g25356)
1.55 3.28 2.49 2.28 4.16 3.27 8.32 5.71 4.15 16.75 10.61 21.57 10.12 32.42 11.54 16.43 10.47 8.84 12.15 15.96 20.84 13.75 7.04 7.23 9.96 16.66 10.92
Sro210_g087690.1 (Contig2488.g20386)
0.08 0.75 0.41 0.93 0.41 1.53 1.67 2.19 1.15 6.07 6.2 6.95 8.25 12.67 6.6 16.85 3.65 5.46 5.03 9.42 5.8 2.57 0.96 2.44 1.16 3.18 2.54
Sro2193_g318460.1 (Contig1101.g10667)
0.02 0.45 0.91 0.11 0.15 0.6 1.42 0.73 1.3 4.1 1.87 4.04 3.25 6.54 3.49 6.79 3.49 3.0 2.94 6.38 11.46 5.27 1.69 1.26 3.53 7.12 2.92
Sro21_g014720.1 (Contig813.g9062)
3.87 4.93 1.31 5.09 5.01 8.88 18.27 18.24 13.89 58.0 41.49 79.05 43.07 107.71 44.65 91.86 79.05 24.29 38.87 47.28 80.74 22.18 14.18 23.52 40.33 19.17 36.95
Sro221_g090890.1 (Contig91.g1012)
0.04 0.18 0.0 0.16 0.89 0.77 1.28 0.46 0.09 4.54 3.94 6.3 1.57 20.48 4.84 7.35 5.23 1.39 1.37 1.68 2.0 1.27 0.17 0.42 0.38 0.92 2.54
Sro2246_g320570.1 (Contig1042.g10302)
1.25 1.33 11.88 1.83 2.06 6.46 15.72 11.33 6.74 20.41 25.33 30.43 13.99 19.64 23.78 41.8 42.06 26.52 12.41 19.69 36.77 11.23 9.9 22.35 17.38 30.49 13.01
Sro2276_g321650.1 (Contig3282.g25809)
0.04 0.24 0.59 0.13 0.12 0.14 0.31 0.21 0.13 2.92 1.42 3.52 0.42 5.44 2.05 3.17 1.97 1.58 0.98 1.48 6.46 2.3 0.82 0.33 0.24 5.2 1.83
Sro2330_g323550.1 (Contig817.g9101)
0.47 1.91 0.77 1.84 4.82 2.87 5.45 4.3 2.28 15.55 10.55 16.21 1.9 25.85 15.72 49.61 17.81 10.87 9.59 6.89 18.54 3.33 1.99 2.5 2.24 11.59 13.42
Sro2469_g328600.1 (Contig4329.g32648)
0.81 1.5 0.48 0.81 1.12 3.49 6.19 4.09 1.2 10.89 9.6 19.44 2.23 19.09 11.96 13.87 9.08 3.29 1.71 3.02 15.1 6.02 2.3 11.26 8.41 7.92 4.76
Sro2542_g330700.1 (Contig739.g8470)
17.38 178.74 134.43 193.08 249.0 433.77 266.19 199.15 93.8 388.37 458.04 381.32 105.43 525.5 483.84 526.78 528.59 492.14 278.49 101.79 297.82 48.17 127.51 184.59 45.56 136.15 336.24
Sro256_g100600.1 (Contig3587.g27705)
1.94 1.79 0.37 2.53 4.16 3.64 4.63 4.23 2.71 18.45 9.49 23.27 2.35 31.71 11.95 16.99 17.08 3.96 9.97 6.96 19.94 14.75 4.52 3.18 2.53 17.37 10.98
Sro259_g101350.1 (Contig240.g2925)
0.26 3.82 4.46 2.03 2.06 2.08 7.35 5.69 5.65 7.12 7.88 8.24 7.27 8.03 6.32 7.55 5.23 5.49 6.38 9.22 11.6 6.71 4.87 4.58 3.73 5.05 5.64
Sro263_g102210.1 (Contig612.g7543)
0.61 3.27 1.06 3.0 5.58 2.16 4.39 4.31 1.38 16.75 14.82 20.79 7.02 26.11 15.21 35.91 18.84 12.8 11.53 9.93 15.61 4.53 2.12 3.23 2.14 11.35 13.04
Sro289_g109020.1 (Contig4471.g33586)
0.52 1.96 0.88 2.14 1.66 2.24 3.75 2.87 1.78 11.52 4.6 16.06 7.01 18.38 6.2 7.37 7.92 7.44 9.09 11.38 18.54 7.71 2.53 4.69 6.97 7.32 5.22
Sro299_g111440.1 (Contig1218.g11446)
12.39 30.07 9.34 19.48 13.68 14.37 16.81 13.11 6.08 31.02 33.19 32.01 12.72 45.53 31.69 43.23 26.5 12.59 18.49 14.26 21.11 22.01 14.44 20.19 14.38 19.24 29.2
Sro29_g019080.1 (Contig1384.g12751)
0.19 0.5 9.54 1.59 1.19 0.24 0.32 1.7 19.2 10.42 2.3 12.68 1.48 10.55 1.43 2.64 1.81 3.22 22.92 27.13 27.02 36.73 22.09 1.36 3.93 16.81 8.48
Sro3401_g347600.1 (Contig3245.g25640)
0.39 5.49 6.9 7.2 4.18 9.39 11.0 6.02 7.01 24.94 34.14 35.1 23.89 41.27 31.52 40.24 48.02 15.32 13.59 21.18 34.38 6.11 6.01 21.6 5.39 18.81 21.45
Sro346_g122790.1 (Contig4731.g35106)
10.49 52.67 30.2 20.73 31.97 51.08 91.11 53.71 36.37 117.86 142.56 146.6 111.33 200.77 163.56 142.51 154.79 149.43 113.43 143.29 179.93 114.08 69.76 125.33 112.48 142.65 80.87
Sro347_g122810.1 (Contig477.g6449)
0.54 2.28 0.96 1.73 4.47 6.55 11.31 9.23 1.97 25.93 19.8 30.4 8.01 50.18 28.84 37.69 28.01 25.71 14.98 21.6 22.13 8.39 3.35 18.02 7.07 18.44 22.05
Sro348_g123290.1 (Contig2346.g19295)
20.58 50.97 24.08 28.67 57.07 78.58 106.93 64.33 33.35 108.72 129.22 110.92 80.8 136.9 151.13 186.89 156.52 177.13 131.16 90.44 122.1 19.68 48.71 109.03 63.4 53.77 87.88
Sro3521_g348890.1 (Contig4377.g32917)
0.66 0.12 0.58 0.18 0.09 6.07 3.16 2.71 1.17 6.77 8.1 10.12 8.1 7.74 6.57 11.91 13.46 14.84 8.01 12.43 10.99 1.16 2.14 5.26 2.13 8.13 3.59
Sro362_g126700.1 (Contig50.g352)
0.84 8.88 46.61 5.73 4.96 7.32 22.03 20.37 14.76 30.83 23.13 36.2 22.95 47.68 24.22 29.55 26.11 23.82 29.66 43.04 53.55 35.12 21.23 17.85 13.17 25.01 23.24
Sro381_g130780.1 (Contig161.g1811)
7.63 43.93 22.21 37.6 47.97 48.97 91.94 65.67 46.95 131.76 146.91 140.49 119.45 209.18 152.44 232.32 149.08 123.67 115.99 130.83 161.26 90.73 74.31 83.13 77.81 94.09 109.75
Sro383_g131260.1 (Contig132.g1491)
15.37 94.06 125.48 105.47 101.6 38.13 76.14 52.74 53.27 185.24 181.95 234.29 335.56 357.12 197.72 147.39 254.3 297.67 215.24 236.28 206.85 191.91 117.62 91.48 86.14 229.33 137.62
Sro387_g132160.1 (Contig424.g5701)
0.07 1.93 1.49 0.72 0.38 0.46 2.15 1.68 2.99 2.81 2.33 3.65 4.59 2.45 1.79 1.97 1.62 1.72 2.52 5.42 5.46 3.78 1.59 1.7 1.64 2.33 2.36
Sro43_g026390.1 (Contig2453.g20105)
2.46 12.1 6.45 13.24 17.59 54.47 51.17 35.8 18.51 64.35 58.74 81.72 18.78 126.27 83.11 87.98 60.51 70.53 28.89 28.8 62.91 15.99 31.03 38.06 15.61 16.33 36.48
Sro453_g146040.1 (Contig1693.g15161)
6.66 154.82 131.94 126.21 131.67 63.21 87.26 47.96 46.68 116.47 105.37 126.8 162.7 226.52 144.56 92.95 100.98 142.5 112.62 182.89 147.41 109.08 81.12 88.1 102.41 170.94 86.11
Sro468_g149070.1 (Contig3973.g30501)
1.17 6.0 2.14 3.32 3.45 7.84 15.89 10.78 4.35 13.61 17.12 16.84 20.89 22.98 14.4 14.33 17.15 16.85 5.81 11.49 12.55 1.45 6.45 15.57 2.69 4.56 6.56
Sro478_g151100.1 (Contig272.g3508)
0.76 1.19 0.0 0.0 0.0 2.48 1.66 1.43 0.07 25.43 9.44 14.24 1.62 15.68 25.44 105.58 17.51 3.79 2.37 1.91 49.33 1.56 0.24 0.82 0.11 9.41 29.89
Sro487_g152950.1 (Contig367.g4971)
0.24 3.92 2.94 1.93 2.33 1.72 3.37 0.97 0.36 7.38 2.46 7.94 5.11 7.31 6.04 8.04 2.91 7.53 3.3 11.55 11.94 2.96 0.75 2.13 7.41 7.09 4.38
Sro492_g153910.1 (Contig2481.g20317)
0.49 0.24 0.08 0.05 0.2 7.08 8.25 4.39 2.02 4.05 4.24 2.13 1.32 2.63 5.44 4.51 3.33 7.06 4.64 0.83 5.52 0.09 2.62 3.81 2.12 1.87 3.0
0.94 0.25 0.17 0.05 0.19 14.37 11.18 8.12 6.36 9.51 10.92 13.52 5.09 9.22 13.98 5.45 14.34 18.06 8.15 1.66 8.78 0.06 3.89 8.13 1.58 1.49 7.48
Sro49_g028520.1 (Contig2054.g17602)
6.53 9.0 44.37 12.39 19.7 4.53 32.96 19.54 104.57 117.39 82.38 122.98 34.7 122.36 70.3 137.88 96.67 60.5 88.83 121.15 260.06 239.55 111.42 47.43 89.83 144.56 111.2
Sro49_g028670.1 (Contig2054.g17617)
0.06 0.34 2.06 0.37 0.33 0.36 2.07 2.8 2.05 8.8 6.83 8.42 13.33 11.6 8.75 18.72 6.22 10.44 7.48 23.41 12.8 5.59 2.47 4.14 8.04 7.03 7.37
Sro510_g157170.1 (Contig2749.g22132)
1.97 23.98 21.98 26.52 40.75 117.47 103.56 60.62 45.43 60.74 106.84 58.47 87.2 83.45 132.31 159.47 119.38 138.68 40.14 35.52 44.16 12.76 51.03 64.24 20.74 37.07 46.47
Sro562_g167130.1 (Contig149.g1665)
12.12 9.76 14.72 28.1 36.2 32.38 93.3 58.71 70.06 109.88 119.57 162.0 137.36 147.19 149.94 334.11 156.08 221.99 156.21 175.84 154.25 126.18 96.29 59.23 40.05 41.99 47.96
Sro589_g171830.1 (Contig2898.g23120)
0.87 5.68 5.84 4.87 3.99 6.49 10.24 9.17 5.06 29.39 21.52 35.6 30.25 48.75 24.41 32.69 26.05 21.64 21.78 49.85 28.39 21.1 8.48 11.83 11.52 21.27 22.74
Sro59_g034380.1 (Contig571.g7284)
0.21 0.18 0.22 0.23 0.32 0.66 1.91 1.02 0.13 6.37 2.82 8.18 2.59 16.08 4.35 4.51 4.32 3.43 1.91 8.58 8.44 2.28 0.45 1.37 2.65 3.26 2.6
Sro5_g004800.1 (Contig4001.g30795)
21.93 51.07 55.96 53.74 58.67 49.9 77.59 66.72 85.31 144.21 129.49 223.04 96.71 171.57 115.4 142.59 144.91 95.92 110.95 131.77 187.75 77.43 89.62 58.79 39.58 84.76 91.27
Sro601_g173560.1 (Contig3429.g26714)
2.02 1.58 24.78 2.49 1.25 0.67 3.53 4.49 12.63 26.85 14.29 34.14 12.32 29.93 16.12 19.44 19.06 22.23 21.16 41.52 77.07 39.67 25.46 9.22 18.61 40.42 23.43
Sro673_g185190.1 (Contig1386.g12784)
1.55 1.37 0.4 0.64 2.46 7.74 23.12 17.16 5.65 33.28 15.79 36.47 16.53 109.03 37.13 34.55 25.02 29.5 22.69 36.43 42.26 8.74 13.31 17.84 27.9 43.92 20.36
Sro68_g038220.1 (Contig2027.g17403)
1.78 12.02 18.36 6.27 21.3 16.5 30.91 31.04 16.89 97.93 41.5 129.44 24.82 206.29 56.39 95.45 75.58 37.95 67.83 101.84 119.65 110.27 35.47 18.14 21.38 108.64 63.42
Sro694_g188510.1 (Contig4437.g33304)
0.4 2.62 7.98 3.89 4.41 3.48 6.47 4.58 13.22 14.46 19.97 14.88 10.35 12.0 13.3 16.13 24.18 5.83 4.14 9.15 26.12 20.11 11.29 10.51 18.96 12.59 12.13
Sro70_g039080.1 (Contig3352.g26255)
4.27 3.16 3.05 40.51 8.85 3.91 10.28 6.72 5.22 18.63 13.66 24.21 12.85 18.57 16.06 38.22 14.06 6.89 10.3 14.2 22.42 6.25 3.96 22.71 19.26 10.22 12.99
Sro713_g191500.1 (Contig2997.g23817)
2.25 3.07 1.67 3.63 6.04 7.93 15.52 14.52 13.08 46.32 36.66 69.67 43.29 88.36 41.29 54.37 46.19 44.01 36.53 62.06 58.53 35.59 20.33 18.35 18.67 37.03 28.48
Sro715_g191810.1 (Contig4130.g31593)
0.29 1.68 8.04 1.58 2.14 1.41 8.09 6.49 3.38 19.25 28.28 19.83 11.57 35.95 20.57 22.76 33.51 17.42 13.13 17.01 32.64 16.78 6.65 10.24 4.62 14.66 15.29
Sro719_g192320.1 (Contig661.g7818)
1.3 18.57 5.39 18.45 28.54 10.48 18.42 15.32 4.64 51.21 57.4 51.18 13.09 99.11 59.46 95.4 91.11 60.32 60.72 32.48 34.01 19.83 10.96 22.09 13.3 48.91 42.84
Sro719_g192340.1 (Contig661.g7820)
1.4 3.87 1.54 6.85 8.49 9.85 6.34 6.09 3.73 20.39 29.29 17.47 6.27 31.61 22.19 54.57 29.68 21.12 13.22 9.45 11.89 9.59 4.11 5.14 1.0 4.63 17.86
Sro719_g192370.1 (Contig661.g7823)
1.02 16.11 9.85 9.85 10.22 10.38 18.32 12.53 9.37 35.4 34.75 35.02 38.49 80.49 45.29 60.24 28.83 44.28 52.35 57.37 36.26 27.81 18.45 25.18 19.26 49.33 31.67
Sro799_g204070.1 (Contig974.g9937)
0.32 2.72 2.07 0.91 0.94 2.15 5.13 3.28 3.42 6.05 7.45 6.94 7.5 6.82 5.98 7.64 4.61 8.39 9.36 9.21 8.57 6.6 3.79 4.31 2.43 3.2 5.41
Sro80_g043280.1 (Contig92.g1072)
0.42 16.86 8.43 15.04 11.03 8.71 9.85 7.17 5.89 26.35 17.25 23.01 27.27 44.06 19.5 38.84 17.37 30.18 31.32 33.34 29.9 15.11 8.83 5.66 4.01 12.64 19.56
Sro83_g044310.1 (Contig4450.g33405)
0.05 0.37 0.09 0.99 1.29 1.31 4.16 1.66 0.59 7.54 4.94 10.7 5.12 24.21 7.16 12.36 6.57 3.06 2.85 5.98 10.68 3.1 0.78 2.97 4.1 2.36 4.07
Sro965_g225650.1 (Contig945.g9794)
13.12 321.34 215.59 306.5 264.57 216.59 190.95 143.48 127.59 234.55 200.65 238.98 225.0 366.94 209.24 229.34 196.12 286.37 309.65 233.59 194.14 254.23 182.14 118.42 104.95 184.54 191.83
Sro971_g226420.1 (Contig3611.g27891)
76.5 93.58 96.15 117.58 155.29 104.78 226.6 184.49 190.87 514.63 472.52 649.81 301.41 844.36 395.63 587.9 525.98 254.33 368.03 459.81 645.15 397.77 331.45 257.18 218.38 520.93 465.64
Sro9_g007070.1 (Contig4120.g31475)
0.51 3.73 1.22 4.83 8.67 16.34 9.1 10.18 1.77 31.22 11.08 35.9 14.8 74.85 27.22 43.66 32.03 32.92 15.68 18.09 19.83 3.68 5.26 9.72 4.59 14.41 17.95

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)