Heatmap: Cluster_311 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1005_g230180.1 (Contig3320.g26056)
0.0 0.05 0.02 0.02 0.03 0.38 0.0 0.0 0.09 0.35 0.28 0.64 0.08 0.3 0.16 0.09 1.0 0.0 0.01 0.12 0.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.37 0.15
Sro1010_g230950.1 (Contig4560.g34060)
0.22 0.13 0.16 0.16 0.14 0.24 0.19 0.12 0.29 0.46 0.33 0.51 0.7 0.25 0.27 0.04 0.41 0.25 0.67 1.0 0.45 0.43 0.17 0.18 0.39 0.45 0.23
Sro1080_g239010.1 (Contig43.g300)
0.02 0.64 1.0 0.47 0.46 0.23 0.33 0.34 0.42 0.7 0.46 0.96 0.38 0.96 0.43 0.52 0.43 0.39 0.57 0.89 0.79 0.59 0.59 0.46 0.49 0.78 0.5
Sro1083_g239410.1 (Contig4146.g31664)
0.05 0.19 0.14 0.05 0.05 0.25 0.1 0.1 0.07 0.43 0.51 0.72 0.41 0.2 0.36 0.35 0.36 0.19 0.13 0.33 0.92 0.05 0.05 0.51 1.0 0.42 0.34
Sro10_g007850.1 (Contig1.g9)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.0 0.33 0.25 0.52 0.08 0.06 0.16 0.06 1.0 0.04 0.02 0.13 0.81 0.01 0.01 0.0 0.0 0.25 0.17
Sro1128_g244300.1 (Contig1354.g12495)
0.06 0.68 1.0 0.68 0.56 0.37 0.45 0.37 0.43 0.56 0.36 0.79 0.35 0.32 0.34 0.37 0.41 0.42 0.5 0.67 0.75 0.61 0.57 0.5 0.47 0.6 0.39
Sro1186_g250290.1 (Contig3178.g25115)
0.05 0.22 0.09 0.26 0.32 0.37 0.37 0.1 0.1 0.7 0.51 0.79 0.29 0.68 0.36 0.35 0.34 0.09 0.22 0.43 1.0 0.12 0.06 0.54 0.72 0.66 0.51
Sro1206_g252340.1 (Contig178.g2090)
1.0 0.74 0.89 0.62 0.79 0.48 0.64 0.78 0.85 0.58 0.26 0.64 0.42 0.47 0.5 0.17 0.36 0.17 0.26 0.31 0.57 0.38 0.59 0.81 0.29 0.22 0.29
Sro1227_g254290.1 (Contig334.g4441)
0.28 0.21 0.66 0.28 0.15 0.04 0.26 0.12 0.53 0.61 0.19 0.91 0.19 0.15 0.17 0.32 0.4 0.07 0.04 0.24 1.0 0.22 0.18 0.43 0.9 0.31 0.14
Sro1312_g261850.1 (Contig2711.g21814)
0.1 0.54 0.58 0.33 0.32 0.56 0.34 0.27 0.34 0.58 0.47 0.55 0.35 0.37 0.42 0.33 0.59 0.52 0.89 0.71 0.65 0.47 0.37 0.7 0.85 1.0 0.44
Sro1346_g264830.1 (Contig1723.g15410)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.14 0.41 0.0 1.0 0.25 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.0 0.09 0.18 0.0 0.67 0.02
Sro1385_g268210.1 (Contig774.g8719)
0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.42 0.57 1.0 0.27 0.0 0.24 0.0 0.14 0.21 0.04 0.07 0.0 0.0 0.01 0.36 0.53 0.21 0.09 0.02 0.04 0.07
Sro1419_g271040.1 (Contig2543.g20724)
0.02 0.77 0.93 0.77 0.74 0.39 0.73 0.44 0.64 0.8 0.58 0.8 0.76 0.64 0.57 0.56 0.61 0.34 0.5 0.75 1.0 0.66 0.57 0.5 0.83 0.64 0.51
Sro149_g068380.1 (Contig259.g3206)
0.1 0.11 0.2 0.33 0.24 0.5 0.18 0.12 0.34 0.58 0.23 0.91 0.13 0.4 0.2 0.06 0.33 0.13 0.31 0.25 1.0 0.29 0.24 0.4 0.59 0.58 0.29
Sro14_g010490.1 (Contig1128.g10798)
0.02 0.67 0.5 0.54 0.74 0.13 0.53 0.26 0.4 0.75 0.57 0.94 0.8 0.79 0.57 0.47 0.55 0.35 0.36 0.98 1.0 0.49 0.51 0.41 0.78 0.65 0.44
Sro1508_g278440.1 (Contig142.g1575)
0.01 0.44 0.45 0.51 0.63 0.39 0.39 0.31 0.31 0.55 0.48 0.9 0.89 1.0 0.45 0.36 0.37 0.53 0.65 0.41 0.41 0.27 0.43 0.31 0.18 0.37 0.34
Sro159_g071860.1 (Contig500.g6726)
0.06 0.24 0.4 0.17 0.29 0.22 0.26 0.08 0.06 0.67 0.16 0.84 0.13 0.53 0.2 0.13 0.08 0.1 0.62 0.65 1.0 0.4 0.22 0.64 0.61 0.56 0.33
Sro15_g011420.1 (Contig791.g8868)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.02 0.05 0.58 0.08 1.0 0.24 0.98 0.19 0.06 0.25 0.17 0.3 0.44 0.55 0.1 0.02 0.01 0.0 0.28 0.08
Sro1671_g290030.1 (Contig3050.g24255)
0.45 0.2 0.19 0.21 0.18 0.35 0.55 0.45 0.58 0.64 0.71 0.71 0.76 0.49 0.64 0.42 0.61 0.5 0.67 1.0 0.89 0.61 0.41 0.55 0.93 0.65 0.51
Sro1699_g292060.1 (Contig1765.g15629)
0.01 0.14 0.37 0.28 0.13 0.14 0.39 0.2 0.23 0.52 0.31 0.65 0.0 0.41 0.32 0.54 0.58 0.0 0.0 0.0 0.99 0.48 0.29 0.41 0.94 1.0 0.51
Sro1819_g299640.1 (Contig1484.g13563)
0.01 1.0 0.98 0.96 0.71 0.62 0.35 0.18 0.22 0.73 0.42 0.94 0.42 0.72 0.43 0.35 0.41 0.24 0.41 0.55 0.86 0.38 0.23 0.33 0.69 0.34 0.42
Sro188_g081160.1 (Contig1383.g12717)
0.01 0.75 0.81 0.44 0.5 0.26 0.55 0.37 0.55 0.7 0.65 0.85 0.59 0.74 0.57 0.52 0.72 0.44 0.57 0.69 1.0 0.65 0.56 0.65 0.76 0.85 0.57
Sro1891_g303800.1 (Contig3442.g26777)
0.38 0.55 1.0 0.17 0.24 0.55 0.39 0.36 0.34 0.38 0.32 0.39 0.31 0.24 0.44 0.13 0.29 0.18 0.38 0.37 0.28 0.35 0.38 0.58 0.47 0.29 0.27
Sro1903_g304530.1 (Contig4361.g32860)
0.07 0.21 0.22 0.23 0.22 0.32 0.53 0.42 0.4 0.69 0.76 1.0 0.52 0.62 0.63 0.46 0.76 0.4 0.52 0.55 0.75 0.4 0.45 0.7 0.78 0.78 0.58
Sro19_g013250.1 (Contig446.g5989)
0.04 0.23 0.36 0.34 0.27 0.19 0.14 0.06 0.19 0.6 0.44 1.0 0.18 0.45 0.42 0.41 0.43 0.22 0.53 0.47 0.52 0.14 0.15 0.24 0.12 0.4 0.43
Sro20_g013810.1 (Contig2954.g23411)
0.03 0.05 0.03 0.02 0.03 0.24 0.42 0.17 0.12 0.71 0.73 0.84 0.74 0.65 0.75 0.88 0.48 0.31 0.5 0.99 0.89 0.32 0.09 0.85 1.0 0.76 0.52
0.05 0.03 0.04 0.04 0.05 0.07 0.4 0.36 0.31 0.45 0.15 0.65 0.2 0.18 0.21 0.05 0.06 0.3 0.4 0.34 0.76 0.14 0.14 0.76 1.0 0.69 0.16
Sro2124_g315600.1 (Contig3835.g29496)
0.06 0.61 0.53 0.48 0.55 0.38 0.28 0.73 0.56 0.71 0.57 0.86 0.25 0.48 0.31 0.03 0.25 0.15 0.95 0.41 1.0 0.61 0.35 0.65 0.39 0.42 0.49
Sro2145_g316360.1 (Contig2950.g23390)
0.05 0.87 0.43 0.57 0.59 0.68 0.37 0.33 0.49 0.66 0.42 1.0 0.42 0.68 0.36 0.35 0.39 0.14 0.44 0.56 0.5 0.57 0.28 0.61 0.34 0.44 0.35
Sro2153_g316770.1 (Contig3156.g25016)
0.02 0.45 1.0 0.17 0.23 0.09 0.17 0.1 0.06 0.44 0.32 0.68 0.18 0.85 0.25 0.23 0.19 0.14 0.26 0.32 0.71 0.03 0.09 0.36 0.23 0.3 0.24
Sro223_g091440.1 (Contig370.g5013)
0.58 0.53 0.78 0.33 0.37 0.22 0.52 0.36 0.31 0.72 0.57 0.86 0.57 0.72 0.43 0.29 0.67 0.29 0.62 0.78 1.0 0.49 0.23 0.51 0.66 0.6 0.32
Sro223_g091480.1 (Contig370.g5017)
0.0 0.32 0.51 0.21 0.17 0.26 0.17 0.05 0.02 0.43 0.48 0.66 0.85 0.29 0.35 0.32 0.2 0.22 0.46 1.0 0.67 0.05 0.01 0.29 0.27 0.25 0.29
Sro2250_g320820.1 (Contig354.g4798)
0.01 0.11 0.17 0.23 0.09 0.18 0.36 0.19 0.27 0.51 0.25 0.62 0.9 0.47 0.37 0.3 0.38 0.34 0.79 1.0 0.62 0.22 0.23 0.68 0.42 0.51 0.25
Sro23_g015980.1 (Contig2259.g18748)
0.02 0.35 0.93 0.27 0.24 0.3 0.69 0.4 0.7 0.7 0.66 1.0 0.28 0.99 0.59 0.53 0.65 0.15 0.26 0.43 0.54 0.63 0.77 0.27 0.3 0.72 0.59
Sro2635_g333300.1 (Contig4367.g32897)
0.11 0.13 1.0 0.09 0.05 0.11 0.18 0.09 0.03 0.45 0.34 0.49 0.65 0.41 0.36 0.42 0.36 0.18 0.43 0.82 0.62 0.01 0.04 0.36 0.21 0.52 0.54
Sro279_g106850.1 (Contig3140.g24924)
1.0 0.31 0.38 0.1 0.15 0.02 0.09 0.24 0.33 0.38 0.11 0.53 0.07 0.14 0.08 0.17 0.07 0.05 0.01 0.11 0.51 0.08 0.15 0.2 0.17 0.09 0.07
Sro279_g106860.1 (Contig3140.g24925)
0.74 0.13 0.07 0.37 0.22 0.01 0.24 0.28 0.49 0.62 0.0 1.0 0.02 0.22 0.07 0.2 0.03 0.01 0.05 0.25 0.75 0.07 0.18 0.14 0.08 0.09 0.06
Sro2889_g339510.1 (Contig4534.g33916)
0.06 0.33 0.39 0.26 0.28 0.09 0.16 0.17 0.12 0.54 0.32 1.0 0.66 0.49 0.33 0.31 0.29 0.35 0.48 0.56 0.66 0.09 0.04 0.33 0.37 0.34 0.28
Sro3297_g346350.1 (Contig3020.g24087)
0.02 0.14 0.11 0.19 0.19 0.14 0.22 0.08 0.03 0.58 0.38 1.0 0.02 0.23 0.09 0.02 0.26 0.01 0.15 0.12 0.55 0.0 0.05 0.36 0.67 0.78 0.45
Sro3410_g347750.1 (Contig2195.g18303)
0.02 0.61 0.49 0.62 0.72 0.23 0.69 0.49 0.58 0.78 0.71 0.98 0.19 1.0 0.61 0.55 0.79 0.16 0.17 0.3 0.74 0.64 0.69 0.38 0.53 0.61 0.61
Sro3_g002060.1 (Contig3832.g29391)
0.01 0.08 0.06 0.5 0.26 0.14 0.13 0.27 0.15 0.55 0.34 1.0 0.01 0.18 0.31 0.37 0.36 0.03 0.03 0.02 0.96 0.09 0.09 0.04 0.0 0.32 0.48
Sro400_g135110.1 (Contig1256.g11754)
0.01 0.14 0.18 0.1 0.25 0.15 0.16 0.25 0.09 0.59 0.48 1.0 0.26 0.27 0.37 0.49 0.26 0.28 0.31 0.23 0.95 0.12 0.03 0.21 0.31 0.58 0.42
Sro448_g145180.1 (Contig3664.g28293)
0.65 0.15 0.07 0.1 0.15 0.01 0.05 0.88 1.0 0.38 0.02 0.52 0.03 0.1 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.11 0.69 0.3 0.3 0.17 0.11 0.01 0.01
Sro475_g150360.1 (Contig3232.g25562)
0.05 0.6 0.75 0.41 0.45 0.06 0.38 1.0 0.94 0.36 0.28 0.23 0.06 0.22 0.4 0.29 0.13 0.09 0.07 0.08 0.49 0.1 0.29 0.53 0.36 0.26 0.28
Sro484_g152280.1 (Contig2684.g21699)
0.01 0.18 0.48 0.35 0.22 0.38 0.58 0.54 0.68 0.67 0.8 0.75 0.62 0.33 0.62 0.57 0.94 0.86 0.7 1.0 0.67 0.6 0.51 0.29 0.28 0.61 0.68
Sro48_g028180.1 (Contig1255.g11713)
0.19 0.28 0.14 0.27 0.19 0.17 0.38 0.34 0.28 0.64 0.47 0.8 0.44 0.56 0.45 0.55 0.35 0.53 0.78 0.59 1.0 0.45 0.3 0.35 0.26 0.37 0.47
Sro505_g156230.1 (Contig1779.g15763)
0.02 0.31 0.14 0.17 0.14 0.28 0.19 0.12 0.15 0.65 0.61 0.87 0.04 0.93 0.56 0.61 0.87 0.11 0.15 0.03 1.0 0.05 0.07 0.29 0.39 0.83 0.55
Sro519_g159020.1 (Contig1321.g12219)
0.33 0.01 0.01 0.0 0.01 0.21 0.41 0.19 0.1 0.6 0.51 0.72 0.21 0.63 0.33 0.22 0.38 0.14 0.28 0.36 0.92 0.09 0.1 0.62 1.0 1.0 0.48
Sro547_g164230.1 (Contig2126.g17951)
0.0 0.06 0.07 0.08 0.04 0.08 0.21 0.37 0.17 0.28 0.25 0.36 0.13 0.45 0.21 0.06 0.2 0.15 0.17 0.17 0.35 0.16 0.19 0.5 1.0 0.64 0.25
Sro556_g165950.1 (Contig1584.g14386)
0.12 0.71 1.0 0.62 0.52 0.71 0.43 0.88 0.4 0.37 0.23 0.27 0.15 0.13 0.35 0.27 0.38 0.11 0.07 0.11 0.53 0.39 0.3 0.73 0.57 0.34 0.26
Sro59_g034450.1 (Contig571.g7291)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.36 0.14 0.05 0.47 0.18 0.59 0.54 0.29 0.25 0.17 0.2 0.3 0.38 0.49 1.0 0.0 0.03 0.36 0.77 0.55 0.25
Sro621_g176650.1 (Contig1511.g13782)
0.15 0.59 0.75 0.37 0.34 0.05 0.3 0.22 0.3 0.7 0.23 1.0 0.81 0.62 0.31 0.15 0.35 0.56 0.52 0.88 0.58 0.3 0.26 0.36 0.95 0.32 0.13
Sro638_g179630.1 (Contig628.g7626)
0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.37 0.4 1.0 0.69 0.5 0.52 0.46 0.31 0.54 0.46 0.39 0.72 0.42 0.43 0.68 0.54 0.88 0.69 0.12 0.13 0.42 0.47
Sro643_g180270.1 (Contig2037.g17505)
0.19 0.49 0.36 0.33 0.28 0.09 0.28 0.21 0.2 0.64 0.49 1.0 0.17 0.49 0.41 0.38 0.39 0.1 0.15 0.21 0.8 0.25 0.16 0.38 0.62 0.3 0.29
Sro643_g180280.1 (Contig2037.g17506)
0.24 0.27 0.33 0.2 0.21 0.33 0.54 0.31 0.36 0.67 0.69 1.0 0.54 0.38 0.58 0.82 0.6 0.37 0.43 0.5 0.91 0.36 0.27 0.76 0.87 0.68 0.4
Sro67_g037760.1 (Contig495.g6692)
0.02 0.0 0.05 0.04 0.0 0.06 0.09 0.08 0.09 0.49 0.13 0.74 0.26 0.11 0.3 0.78 0.27 0.68 1.0 0.2 0.96 0.03 0.0 0.09 0.0 0.02 0.26
Sro6_g005030.1 (Contig175.g2008)
0.39 0.24 0.28 0.7 0.52 0.15 0.17 0.1 0.21 0.34 0.37 0.27 0.1 0.14 0.2 0.13 0.27 0.37 0.32 0.23 0.55 0.12 0.19 0.66 1.0 0.73 0.19
Sro735_g194860.1 (Contig2764.g22258)
0.14 0.25 0.16 0.15 0.18 0.3 0.38 0.46 0.45 0.62 1.0 0.95 0.4 0.39 0.62 0.52 0.59 0.59 0.82 0.74 0.97 0.57 0.26 0.7 0.99 0.49 0.53
Sro736_g194990.1 (Contig1047.g10321)
0.19 0.24 0.44 0.37 0.4 0.69 0.35 0.35 0.68 0.48 0.28 0.5 0.8 0.39 0.4 0.28 0.35 0.2 0.47 0.45 1.0 0.3 0.42 0.73 0.4 0.36 0.23
Sro793_g203270.1 (Contig534.g6935)
0.0 0.07 0.05 0.08 0.09 0.44 0.45 0.18 0.09 0.69 0.69 0.9 0.21 0.65 0.63 0.08 0.74 0.51 0.77 0.54 1.0 0.02 0.1 0.74 0.8 0.91 0.53
0.01 0.18 0.06 0.02 0.17 0.04 0.38 0.19 0.1 0.48 0.15 1.0 0.06 0.4 0.14 0.02 0.01 0.08 0.1 0.17 0.69 0.02 0.14 0.25 0.15 0.29 0.03
Sro856_g211630.1 (Contig4173.g31834)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.16 0.01 0.04 0.32 0.05 0.31 0.79 0.35 0.06 0.09 0.48 0.47 0.54 1.0 0.92 0.0 0.07 0.27 0.4 0.2 0.3
Sro862_g212460.1 (Contig833.g9203)
0.02 0.06 0.12 0.05 0.09 0.16 0.25 0.09 0.26 0.49 0.5 0.55 0.06 0.77 0.56 0.76 0.67 0.04 0.47 0.29 0.68 0.5 0.24 0.29 0.57 1.0 0.48
Sro918_g219990.1 (Contig3322.g26083)
0.01 0.16 0.09 0.08 0.09 0.3 0.01 0.0 0.38 0.35 0.25 0.51 0.36 0.27 0.19 0.07 1.0 0.07 0.08 0.78 0.2 0.14 0.03 0.01 0.03 0.34 0.13
Sro963_g225300.1 (Contig3377.g26431)
0.02 0.25 1.0 0.27 0.13 0.48 0.13 0.11 0.17 0.45 0.11 0.41 0.13 0.43 0.16 0.09 0.12 0.03 0.11 0.12 0.63 0.24 0.15 0.16 0.21 0.56 0.26
Sro963_g225310.1 (Contig3377.g26432)
0.18 0.43 0.78 0.32 0.33 0.33 0.27 0.23 0.39 0.65 0.21 0.9 0.39 0.58 0.2 0.28 0.21 0.11 0.5 0.38 1.0 0.26 0.28 0.43 0.41 0.38 0.32
Sro975_g226830.1 (Contig3918.g30029)
0.07 0.9 1.0 0.31 0.44 0.19 0.32 0.2 0.38 0.32 0.09 0.47 0.04 0.21 0.1 0.02 0.06 0.1 0.51 0.17 0.24 0.27 0.41 0.51 0.25 0.13 0.09
Sro976_g226940.1 (Contig4239.g32117)
0.02 0.65 0.65 0.45 0.59 0.24 0.57 0.82 0.58 0.81 0.97 1.0 0.32 0.62 0.61 0.51 0.67 0.86 0.99 0.67 0.77 0.43 0.53 0.31 0.31 0.54 0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)