Heatmap: Cluster_442 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1485_g276580.1 (Contig4245.g32139)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.07 0.01 0.08 0.02 0.06 0.09 0.03 0.12 0.04 0.14 0.03 0.05 0.07 0.08 0.02 0.04 0.07 0.08 0.1 0.01 0.04 0.06 0.09 0.03 0.06
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1646_g288320.1 (Contig464.g6223)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.04 0.08 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.02 0.04 0.05 0.02 0.13 0.0 0.02 0.07 0.01
Sro1651_g288760.1 (Contig2974.g23648)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro1901_g304390.1 (Contig2664.g21559)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.06 0.01 0.05 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro193_g082580.1 (Contig826.g9157)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
Sro2020_g311370.1 (Contig280.g3626)
1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
Sro2095_g314240.1 (Contig4570.g34136)
1.0 0.05 0.06 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro212_g088100.1 (Contig3756.g28793)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01
Sro2473_g328690.1 (Contig3538.g27371)
1.0 0.22 0.13 0.16 0.18 0.04 0.07 0.12 0.1 0.09 0.07 0.05 0.09 0.03 0.05 0.04 0.11 0.11 0.1 0.1 0.04 0.07 0.1 0.03 0.06 0.05 0.03
Sro2842_g338280.1 (Contig3207.g25371)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
Sro293_g110040.1 (Contig3203.g25325)
1.0 0.03 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.03 0.08 0.05 0.05 0.06 0.02 0.04 0.05 0.06 0.04 0.05 0.06 0.06 0.03 0.02 0.04 0.04 0.02 0.04
Sro3287_g346220.1 (Contig3043.g24240)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro342_g121680.1 (Contig3070.g24468)
1.0 0.03 0.04 0.02 0.05 0.01 0.05 0.14 0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.06 0.05 0.04 0.02 0.02
Sro35_g022580.1 (Contig3323.g26135)
1.0 0.03 0.07 0.05 0.05 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.08 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0
Sro37_g023250.1 (Contig1425.g13141)
1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
Sro4_g003310.1 (Contig3815.g29249)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro578_g169810.1 (Contig83.g890)
1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0
Sro705_g190380.1 (Contig346.g4672)
1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.05 0.04 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.12 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)