1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_172 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1051_g235730.1 (Contig3964.g30410)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.19 0.39 0.14 0.06 0.15 0.03 0.08 0.07 0.19 0.09 0.01 0.02 0.1 0.13 0.12 0.22 0.08 0.07 1.0 0.41 0.41 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.12 0.0 0.19 0.0 0.36 0.09 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.26 0.42 0.0 0.0 0.78 0.0
Sro1105_g241930.1 (Contig2574.g20912)
 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.09 0.04 0.71 0.03 0.14 0.05 0.14 0.01 0.07 0.26 0.18 0.18 0.13 0.04 0.01 0.46 0.02 0.05 1.0 0.84 0.31 0.12
Sro1290_g259730.1 (Contig199.g2312)
 0.55 0.13 0.46 0.62 0.64 0.06 0.2 0.35 0.17 0.18 0.35 0.12 0.09 0.12 0.34 0.2 0.17 0.13 0.16 0.1 0.13 0.49 0.4 0.96 1.0 0.4 0.23
Sro1309_g261550.1 (Contig3914.g29998)
 0.04 0.08 0.03 0.1 0.04 0.61 0.19 0.31 0.11 0.47 0.31 0.42 0.01 0.09 0.16 0.09 0.19 0.04 0.17 0.03 0.52 0.08 0.13 1.0 0.39 0.21 0.18
Sro1309_g261570.1 (Contig3914.g30000)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.15 0.27 0.03 0.14 0.22 0.18 0.0 0.24 0.16 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.3 0.08 0.02 1.0 0.52 0.16 0.08
Sro1326_g263020.1 (Contig231.g2777)
 0.14 0.07 0.13 0.12 0.16 0.05 0.09 0.39 0.41 0.25 0.15 0.39 0.03 0.03 0.16 0.03 0.19 0.17 0.19 0.16 0.2 0.15 0.12 1.0 0.54 0.23 0.12
Sro1326_g263040.1 (Contig231.g2779)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1381_g267900.1 (Contig151.g1714)
 0.0 0.27 0.32 0.04 0.02 0.0 0.31 0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 1.0 0.32 0.27 0.0
Sro1449_g273650.1 (Contig2836.g22755)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1461_g274700.1 (Contig2979.g23677)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
Sro1472_g275520.1 (Contig2029.g17424)
 0.03 0.22 0.17 0.2 0.14 0.14 0.3 0.44 0.3 0.26 0.39 0.23 0.12 0.05 0.36 0.92 0.35 0.17 0.1 0.22 0.14 0.15 0.16 1.0 0.21 0.07 0.21
Sro149_g068710.1 (Contig259.g3239)
 0.01 0.28 0.26 0.27 0.51 0.16 0.18 0.39 0.19 0.26 0.32 0.16 0.28 0.31 0.35 0.37 0.3 0.4 0.18 0.27 0.31 0.2 0.16 1.0 0.31 0.14 0.29
Sro14_g010650.1 (Contig1128.g10814)
 0.0 0.06 0.05 0.01 0.02 0.02 0.13 0.14 0.15 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.24 0.27 1.0 0.36 0.28 0.01
Sro160_g072310.1 (Contig2985.g23727)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.81 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro190_g082020.1 (Contig3488.g27077)
 0.0 0.77 0.62 0.54 0.59 0.05 0.45 0.68 0.43 0.33 0.13 0.41 0.19 0.42 0.19 0.09 0.1 0.14 0.21 0.21 0.46 0.81 0.46 1.0 0.89 0.9 0.2
Sro1940_g306660.1 (Contig1706.g15278)
 0.0 0.22 0.4 0.38 0.34 0.09 0.12 0.07 0.3 0.09 0.14 0.09 0.0 0.03 0.13 0.18 0.08 0.04 0.1 0.04 0.01 0.11 0.24 1.0 0.95 0.58 0.14
Sro2066_g313250.1 (Contig4436.g33288)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.82 0.33 0.17 0.56 0.27 0.6 0.22 0.15 0.29 0.14 0.0 0.39 0.18 0.83 0.93 1.0 0.17 0.15 0.45 1.0 0.15
Sro214_g088860.1 (Contig282.g3671)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.2 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.23 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Sro2166_g317290.1 (Contig1985.g16989)
 0.33 0.1 0.12 0.18 0.11 0.03 0.29 0.16 0.15 0.07 0.06 0.14 0.02 0.02 0.06 0.08 0.05 0.02 0.01 0.02 0.07 0.15 0.31 1.0 0.75 0.45 0.07
Sro2251_g320840.1 (Contig398.g5372)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro226_g092080.1 (Contig565.g7180)
 0.48 0.14 0.33 0.12 0.16 0.11 0.19 0.38 0.38 0.23 0.32 0.2 0.04 0.04 0.18 0.21 0.19 0.18 0.11 0.1 0.28 0.14 0.24 1.0 0.43 0.19 0.17
Sro2455_g328190.1 (Contig2474.g20234)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2461_g328320.1 (Contig2671.g21640)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2510_g329820.1 (Contig2511.g20546)
 1.0 0.2 0.11 0.1 0.12 0.07 0.11 0.15 0.23 0.09 0.11 0.04 0.09 0.08 0.11 0.16 0.07 0.01 0.08 0.01 0.03 0.2 0.25 0.97 0.51 0.06 0.07
0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.46 0.58 0.15 0.64 0.55 0.01
Sro2614_g332650.1 (Contig1086.g10532)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.33 0.05 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0
Sro28_g018590.1 (Contig404.g5468)
 0.0 0.15 0.11 0.01 0.03 0.0 0.16 0.17 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 1.0 0.48 0.28 0.0
Sro28_g018610.1 (Contig404.g5470)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 0.28 0.15 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.1 1.0 0.63 0.43 0.01
Sro296_g110750.1 (Contig440.g5914)
 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.45 0.21 0.16 0.0 0.18 0.14 0.12 0.15 0.06 0.0 0.0 0.14 0.06 0.08 1.0 0.19 0.08 0.0 0.0 0.05
Sro301_g111950.1 (Contig455.g6143)
 0.0 0.8 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 1.0 0.31 0.38 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3052_g342840.1 (Contig883.g9446)
 0.41 0.06 0.13 0.06 0.06 0.06 0.23 0.38 0.27 0.1 0.34 0.07 0.13 0.04 0.25 0.32 0.32 0.1 0.14 0.17 0.19 0.34 0.41 0.88 1.0 0.4 0.18
Sro3206_g345230.1 (Contig3460.g26848)
 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.14 0.13 0.18 0.08 0.3 0.01 0.71 0.01 0.22 0.26 0.06 0.39 0.48 0.53 0.05 0.09 0.13 1.0 0.63 0.07 0.15
Sro3360_g347210.1 (Contig1493.g13636)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro356_g125300.1 (Contig3618.g27966)
 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.07 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07 0.05 0.07 0.08 0.65 0.13 0.08 0.01
Sro35_g022360.1 (Contig3323.g26113)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro35_g022370.1 (Contig3323.g26114)
 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.02 0.05 0.0 0.07 0.02 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.21 0.0 0.02 0.33 1.0 0.14 0.0
Sro388_g132230.1 (Contig4393.g32997)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.04 0.24 0.04 0.01 0.04 0.11 0.04 0.02 0.08 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.12 0.05 1.0 0.37 0.0 0.03
Sro406_g136460.1 (Contig2793.g22487)
 0.01 0.65 0.62 0.2 0.29 0.0 0.44 0.14 0.02 0.07 0.09 0.04 0.02 0.0 0.05 0.02 0.01 0.09 0.3 0.07 0.33 0.01 0.04 0.77 1.0 0.25 0.02
Sro4183_g353290.1 (Contig152.g1715)
 0.0 0.39 0.3 0.03 0.0 0.0 0.54 0.05 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 1.0 0.42 0.22 0.0
Sro419_g139190.1 (Contig4415.g33180)
 0.12 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.06 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14 0.03 0.01 0.0 1.0 0.18 0.0 0.01
Sro419_g139200.1 (Contig4415.g33181)
 0.14 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.08 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.06 0.03 0.01 1.0 0.22 0.0 0.0
Sro465_g148670.1 (Contig3955.g30312)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04 0.0 0.08 0.19 0.0 1.0 0.11 0.22 0.0
Sro485_g152500.1 (Contig1932.g16650)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro506_g156400.1 (Contig3494.g27117)
 0.1 0.08 0.22 0.4 0.27 0.11 0.28 0.47 0.18 0.15 0.17 0.28 0.08 0.11 0.18 0.29 0.08 0.07 0.03 0.07 0.22 0.04 0.19 1.0 0.47 0.24 0.13
Sro551_g164910.1 (Contig4706.g35012)
 0.26 0.18 0.41 0.26 0.14 0.17 0.2 0.49 0.29 0.31 0.59 0.27 0.11 0.08 0.33 0.57 0.48 0.22 0.14 0.18 0.42 0.17 0.14 1.0 0.48 0.42 0.4
Sro556_g166040.1 (Contig1584.g14395)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.24 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 1.0 0.57 0.34 0.0
Sro57_g033320.1 (Contig284.g3700)
 0.01 0.11 0.09 0.05 0.07 0.08 0.7 0.38 0.08 0.22 0.13 0.16 0.25 0.04 0.23 0.05 0.38 0.12 0.22 0.19 0.24 0.12 0.14 1.0 0.8 0.41 0.25
Sro595_g172600.1 (Contig4483.g33678)
 0.1 0.28 0.36 0.82 0.62 0.1 0.48 1.0 0.62 0.34 0.41 0.38 0.13 0.18 0.28 0.32 0.19 0.25 0.24 0.17 0.54 0.15 0.6 0.58 0.58 0.52 0.22
0.0 0.47 0.22 0.27 0.09 0.05 0.51 0.12 0.22 0.19 0.36 0.25 0.11 0.08 0.13 0.15 0.57 0.05 0.18 0.09 0.18 1.0 0.4 0.12 0.03 0.04 0.06
Sro608_g174740.1 (Contig3978.g30557)
 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.14 0.16 0.25 0.05 0.13 0.02 0.1 0.03 0.04 0.04 0.06 0.21 0.13 0.08 0.05 0.12 0.43 0.87 1.0 1.0 0.1
Sro629_g178160.1 (Contig2563.g20825)
 0.29 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.13 0.01 0.05 0.03 0.04 0.0 0.09 0.07 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.04 1.0 0.27 0.09 0.02
Sro658_g182700.1 (Contig1438.g13220)
 0.0 0.32 0.12 0.13 0.15 0.04 0.24 0.23 0.17 0.09 0.03 0.03 0.1 0.01 0.06 0.0 0.07 0.03 0.06 0.11 0.06 0.21 0.41 0.9 1.0 0.71 0.05
0.0 0.68 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.42 0.24 0.0 0.31 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
Sro668_g184400.1 (Contig3161.g25045)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.45 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77
Sro684_g186700.1 (Contig2085.g17774)
 0.09 0.23 0.36 0.4 0.31 0.18 0.28 0.35 0.3 0.25 0.29 0.25 0.24 0.22 0.26 0.24 0.16 0.47 0.16 0.26 0.43 0.2 0.25 1.0 0.82 0.53 0.24
Sro68_g038160.1 (Contig2027.g17397)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro705_g190290.1 (Contig346.g4663)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.31 0.22 0.15 0.05 0.0 0.13 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.03 0.01 0.1 0.06 0.19 0.83 0.94 1.0 0.01
Sro720_g192580.1 (Contig2421.g19819)
 0.09 0.26 1.0 0.38 0.41 0.35 0.14 0.15 0.13 0.35 0.6 0.28 0.21 0.09 0.36 0.51 0.59 0.11 0.17 0.3 0.47 0.1 0.04 0.88 0.61 0.49 0.41
Sro74_g040710.1 (Contig4700.g34933)
 0.05 0.22 0.49 0.12 0.14 0.0 0.41 0.28 0.24 0.04 0.02 0.01 0.1 0.02 0.06 0.09 0.0 0.06 0.26 0.01 0.02 0.09 0.25 1.0 0.06 0.0 0.07
Sro774_g200730.1 (Contig845.g9317)
 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.11 0.18 0.08 0.07 0.09 0.27 0.05 0.01 0.2 0.29 0.14 0.21 0.03 0.05 0.0 0.08 0.15 0.05 1.0 0.67 0.55 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.27 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.52 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro82_g043680.1 (Contig4032.g30959)
 0.54 0.07 0.09 0.07 0.03 0.0 0.18 0.47 0.38 0.13 0.02 0.15 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 0.03 0.05 0.03 0.31 1.0 0.26 0.11 0.01
Sro86_g045560.1 (Contig2999.g23834)
 0.01 0.06 0.06 0.05 0.03 0.02 0.08 0.18 0.09 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.03 0.04 1.0 0.76 0.21 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.2 0.17 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.7 1.0 0.04 0.0
Sro921_g220410.1 (Contig435.g5873)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.18 0.08 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.74 1.0 0.92 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)