Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1024_g232610.1 (Contig4464.g33540)
0.0 0.04 0.07 0.07 0.14 0.07 0.11 0.04 0.08 0.12 0.04 0.16 0.17 0.03 0.09 0.01 0.1 0.04 0.37 0.2 0.38 0.1 0.04 0.53 1.0 0.19 0.05
Sro1034_g233830.1 (Contig2522.g20584)
0.66 0.07 0.14 0.18 0.13 0.25 0.28 0.38 0.25 0.28 0.99 0.34 0.03 0.04 0.51 0.52 0.57 0.08 0.17 0.11 0.27 0.09 0.12 0.54 1.0 0.39 0.48
Sro1082_g239180.1 (Contig1844.g16163)
0.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.22 0.39 0.19 0.24 0.42 0.62 0.74 0.34 0.11 0.27 0.17 0.41 0.52 0.33 0.61 0.53 0.21 0.21 0.57 1.0 0.97 0.49
Sro1156_g247250.1 (Contig4160.g31772)
0.01 0.03 0.23 0.24 0.33 0.26 0.13 0.17 0.12 0.19 0.36 0.23 0.13 0.21 0.32 0.26 0.3 0.16 0.19 0.13 0.15 0.07 0.17 0.37 1.0 0.61 0.27
Sro118_g057800.1 (Contig2714.g21850)
0.02 0.18 0.1 0.29 0.19 0.2 0.47 0.33 0.35 0.58 0.44 0.87 0.48 0.45 0.47 0.6 0.29 0.33 0.47 0.76 0.72 0.2 0.2 0.57 1.0 0.51 0.46
Sro122_g059140.1 (Contig71.g733)
0.04 0.06 0.06 0.09 0.1 0.13 0.27 0.36 0.13 0.27 0.68 0.3 0.08 0.04 0.42 0.69 0.5 0.27 0.2 0.11 0.3 0.07 0.11 0.56 1.0 0.33 0.31
Sro1252_g256290.1 (Contig3295.g25880)
0.29 0.01 0.2 0.08 0.06 0.13 0.14 0.05 0.08 0.14 0.59 0.09 0.17 0.02 0.3 0.56 0.61 0.02 0.02 0.17 0.17 0.04 0.04 0.21 1.0 0.27 0.51
Sro1255_g256480.1 (Contig3638.g28082)
0.0 0.03 0.04 0.03 0.04 0.34 0.21 0.2 0.12 0.31 1.0 0.25 0.14 0.1 0.46 0.67 1.0 0.29 0.3 0.18 0.36 0.28 0.14 0.26 0.57 0.28 0.45
Sro1402_g269550.1 (Contig3746.g28709)
0.07 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.11 0.1 0.14 0.13 0.29 0.14 0.2 0.21 0.1 0.09 0.09 0.17 0.47 0.32 0.06 0.05 0.08 0.39 1.0 0.59 0.12
Sro1560_g282560.1 (Contig3879.g29831)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.07 0.12 0.02 0.0 0.14 0.54 0.11 0.07 0.01 0.28 0.22 0.22 0.05 0.36 0.09 0.35 0.08 0.0 0.22 1.0 0.28 0.17
Sro1688_g291220.1 (Contig1668.g15022)
0.16 0.08 0.14 0.05 0.03 0.4 0.16 0.11 0.22 0.45 0.25 1.0 0.1 0.55 0.4 0.59 0.28 0.29 0.89 0.31 0.61 0.3 0.22 0.34 0.85 0.57 0.42
Sro16_g011800.1 (Contig916.g9617)
0.08 0.07 0.19 1.0 0.54 0.18 0.24 0.13 0.17 0.2 0.11 0.44 0.14 0.06 0.12 0.22 0.1 0.38 0.22 0.32 0.22 0.44 0.27 0.45 0.61 0.78 0.24
Sro175_g077150.1 (Contig1856.g16231)
0.0 0.05 0.06 0.05 0.05 0.09 0.41 0.42 0.18 0.21 0.39 0.73 0.05 0.02 0.22 0.21 0.18 0.2 0.17 0.12 0.12 0.04 0.1 1.0 0.69 0.55 0.33
Sro1823_g299930.1 (Contig3221.g25458)
0.02 0.16 0.14 0.09 0.08 0.03 0.15 0.3 0.13 0.15 0.75 0.09 0.01 0.0 0.23 0.63 0.25 0.08 0.33 0.03 0.13 0.01 0.03 0.73 1.0 0.19 0.6
Sro188_g081140.1 (Contig1383.g12715)
0.0 0.01 0.02 0.07 0.1 0.06 0.07 0.06 0.05 0.06 0.22 0.03 0.07 0.02 0.16 0.21 0.16 0.09 0.18 0.08 0.04 0.02 0.1 0.31 1.0 0.45 0.14
Sro1933_g306240.1 (Contig3642.g28144)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.03 0.01 0.0 0.1 0.27 0.12 0.12 0.04 0.18 0.11 0.2 0.1 0.14 0.14 0.09 0.01 0.0 0.29 1.0 0.4 0.18
Sro1968_g308390.1 (Contig2992.g23783)
0.02 0.2 0.39 0.24 0.3 0.06 0.18 0.13 0.08 0.18 0.14 0.15 0.11 0.16 0.27 0.53 0.07 0.28 0.38 0.14 0.15 0.09 0.09 0.46 1.0 0.27 0.15
Sro199_g084520.1 (Contig257.g3190)
0.22 0.25 0.52 0.21 0.18 0.1 0.18 0.17 0.22 0.27 1.0 0.24 0.33 0.03 0.49 0.89 0.74 0.44 0.34 0.52 0.18 0.07 0.13 0.27 0.65 0.39 0.39
Sro2005_g310500.1 (Contig1905.g16498)
0.01 0.1 0.11 0.14 0.1 0.26 0.36 0.47 0.24 0.4 1.0 0.46 0.18 0.28 0.52 0.8 0.78 0.29 0.29 0.24 0.48 0.34 0.18 0.25 0.34 0.23 0.47
Sro2077_g313620.1 (Contig1970.g16847)
0.06 0.13 0.02 0.0 0.05 0.28 0.61 0.2 0.52 0.24 0.13 0.56 0.61 0.13 0.38 0.43 0.28 0.05 0.12 0.4 0.16 0.67 0.46 1.0 0.67 0.7 0.45
Sro2152_g316760.1 (Contig1736.g15482)
0.03 0.09 0.23 0.12 0.23 0.15 0.26 0.11 0.27 0.2 0.78 0.1 0.13 0.01 0.31 0.81 1.0 0.06 0.24 0.27 0.35 0.04 0.07 0.06 0.04 0.02 0.4
Sro2631_g333180.1 (Contig2273.g18837)
0.0 0.01 0.05 0.12 0.16 0.38 0.02 0.09 0.05 0.16 0.57 0.06 0.24 0.07 0.39 0.26 0.27 0.66 0.37 0.23 0.02 0.02 0.07 0.21 1.0 0.36 0.28
Sro2631_g333200.1 (Contig2273.g18839)
0.23 0.05 0.04 0.02 0.02 0.24 0.51 0.22 0.09 0.3 0.51 0.64 0.37 0.08 0.36 0.44 0.41 0.06 0.15 0.46 0.13 0.17 0.32 0.97 1.0 0.67 0.45
Sro276_g106090.1 (Contig2556.g20789)
0.03 0.09 0.18 0.2 0.23 0.33 0.2 0.23 0.27 0.39 0.9 0.44 0.12 0.5 0.5 0.81 0.81 0.41 0.63 0.19 0.23 0.42 0.37 0.32 1.0 0.5 0.56
Sro3010_g342090.1 (Contig2152.g18112)
0.01 0.03 0.08 0.09 0.02 0.27 0.13 0.04 0.16 0.23 0.21 0.2 0.14 0.08 0.33 0.29 0.16 0.04 0.15 0.08 0.1 0.07 0.1 0.68 1.0 0.46 0.49
Sro3022_g342260.1 (Contig2390.g19591)
0.06 0.06 0.04 0.02 0.03 0.65 0.31 0.4 0.34 0.52 0.45 1.0 0.24 0.58 0.4 0.13 0.35 0.27 0.51 0.31 0.59 0.43 0.44 0.32 0.68 0.74 0.48
Sro304_g112620.1 (Contig465.g6236)
0.02 0.4 0.48 0.11 0.13 0.07 0.19 0.3 0.19 0.27 0.8 0.17 0.17 0.06 0.59 1.0 0.82 0.23 0.45 0.34 0.28 0.16 0.28 0.38 0.49 0.3 0.4
Sro30_g019870.1 (Contig3962.g30387)
0.35 0.29 0.18 1.0 0.41 0.55 0.26 0.3 0.46 0.28 0.2 0.46 0.08 0.05 0.22 0.2 0.17 0.22 0.18 0.19 0.21 0.39 0.2 0.54 0.53 0.62 0.22
Sro30_g019880.1 (Contig3962.g30388)
0.43 0.24 0.17 1.0 0.41 0.65 0.36 0.42 0.39 0.47 0.36 0.85 0.1 0.11 0.3 0.31 0.25 0.34 0.32 0.31 0.39 0.43 0.2 0.67 0.91 0.85 0.3
Sro321_g116640.1 (Contig56.g420)
0.12 0.28 0.32 0.56 0.45 0.2 0.61 0.36 0.45 0.38 0.62 1.0 0.11 0.04 0.27 0.26 0.33 0.21 0.73 0.27 0.47 0.15 0.29 0.8 0.9 0.23 0.41
Sro321_g116710.1 (Contig56.g427)
0.08 0.04 0.01 0.01 0.01 0.2 0.18 0.04 0.1 0.18 0.86 0.09 0.16 0.04 0.48 1.0 0.91 0.11 0.19 0.1 0.07 0.06 0.04 0.38 0.1 0.03 0.52
Sro32_g021080.1 (Contig3715.g28581)
0.01 0.17 0.18 0.01 0.01 0.37 0.45 0.16 0.06 0.3 0.17 0.73 0.08 0.09 0.26 0.02 0.16 0.05 0.27 0.23 0.1 0.06 0.1 0.79 1.0 0.92 0.38
Sro340_g121230.1 (Contig1886.g16442)
0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.21 0.06 0.18 0.31 0.15 1.0 0.11 0.12 0.03 0.5 0.68 0.82 0.28 0.22 0.12 0.06 0.12 0.17 0.11 0.34 0.54 0.5
Sro3622_g349790.1 (Contig2420.g19806)
0.02 0.49 0.53 0.5 0.49 0.43 0.37 0.43 0.31 0.38 1.0 0.34 0.36 0.23 0.62 0.55 0.51 0.35 0.42 0.4 0.3 0.25 0.32 0.52 1.0 0.63 0.5
Sro3742_g350780.1 (Contig3195.g25267)
0.0 0.04 0.05 0.09 0.1 0.06 0.07 0.27 0.11 0.07 0.21 0.05 0.1 0.17 0.11 0.06 0.09 0.17 0.16 0.13 0.02 0.03 0.08 0.38 1.0 0.53 0.15
Sro398_g134670.1 (Contig371.g5028)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.3 0.19 0.19 0.48 0.03 0.29 0.48 0.29 0.2 0.12 0.14 0.3 0.2 0.02 0.03 0.04 0.47 1.0 0.92 0.32
Sro399_g134880.1 (Contig279.g3615)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3_g002230.1 (Contig3832.g29408)
0.11 0.05 0.08 0.11 0.09 0.16 0.19 0.21 0.13 0.24 1.0 0.24 0.08 0.14 0.48 0.53 0.52 0.27 0.28 0.27 0.15 0.06 0.08 0.72 0.98 0.33 0.43
Sro3_g002680.1 (Contig3832.g29453)
0.06 0.07 0.06 0.07 0.08 0.06 0.23 0.13 0.34 0.42 0.95 1.0 0.11 0.06 0.36 0.34 0.63 0.05 0.16 0.27 0.45 0.14 0.27 0.21 0.43 0.24 0.53
Sro447_g144930.1 (Contig3064.g24415)
0.0 0.1 0.15 0.34 0.35 0.29 0.23 0.28 0.17 0.26 0.58 0.19 0.14 0.18 0.42 0.56 0.41 0.36 0.3 0.19 0.24 0.07 0.16 0.54 1.0 0.65 0.44
Sro475_g150330.1 (Contig3232.g25559)
0.02 0.01 0.03 0.08 0.07 0.18 0.2 0.12 0.12 0.24 0.61 0.24 0.26 0.09 0.48 0.51 0.39 0.37 0.5 0.33 0.2 0.07 0.15 0.38 1.0 0.42 0.36
Sro490_g153430.1 (Contig328.g4363)
0.06 0.14 0.51 0.3 0.22 0.03 0.21 0.58 0.1 0.38 0.99 0.17 0.12 0.05 0.58 1.0 0.48 0.22 0.54 0.45 0.22 0.15 0.06 0.65 0.99 0.3 0.95
Sro498_g154960.1 (Contig3753.g28750)
0.03 0.06 0.1 0.09 0.19 0.05 0.19 0.13 0.05 0.18 0.2 0.16 0.08 0.19 0.37 1.0 0.13 0.37 0.36 0.1 0.17 0.05 0.06 0.35 0.85 0.43 0.17
Sro522_g159640.1 (Contig3319.g26050)
0.38 0.09 0.09 0.26 0.29 0.1 0.12 0.12 0.07 0.12 0.58 0.03 0.01 0.01 0.22 0.68 0.45 0.04 0.04 0.02 0.09 0.02 0.04 0.56 1.0 0.31 0.41
Sro555_g165620.1 (Contig677.g7910)
0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.28 0.1 0.15 0.17 0.12 0.24 0.18 0.02 0.03 0.11 0.07 0.24 0.13 0.2 0.08 0.11 0.11 0.16 0.35 1.0 0.5 0.24
Sro57_g033230.1 (Contig284.g3691)
0.0 0.04 0.05 0.09 0.1 0.06 0.07 0.27 0.11 0.07 0.21 0.05 0.1 0.17 0.11 0.06 0.09 0.17 0.16 0.13 0.02 0.03 0.08 0.38 1.0 0.53 0.15
Sro628_g177990.1 (Contig4318.g32572)
0.2 0.02 0.03 0.01 0.01 0.07 0.06 0.04 0.01 0.26 0.39 0.5 0.18 0.07 0.22 0.25 0.21 0.15 0.46 0.52 0.19 0.0 0.01 0.58 1.0 0.28 0.33
Sro631_g178530.1 (Contig3194.g25258)
0.04 0.1 0.08 0.11 0.11 0.11 0.22 0.15 0.07 0.2 0.4 0.2 0.25 0.2 0.33 0.41 0.25 0.25 0.22 0.24 0.16 0.05 0.09 0.64 1.0 0.58 0.27
Sro633_g178760.1 (Contig1591.g14448)
0.0 0.2 0.34 1.0 0.54 0.29 0.34 0.22 0.31 0.26 0.15 0.37 0.15 0.11 0.16 0.18 0.14 0.18 0.16 0.18 0.4 0.22 0.18 0.39 0.44 0.36 0.21
Sro633_g178870.1 (Contig1591.g14459)
0.14 0.16 0.11 0.09 0.04 0.17 0.22 0.24 0.24 0.34 0.49 0.76 0.48 0.06 0.33 0.37 0.64 0.13 0.67 0.7 0.28 0.15 0.23 0.43 1.0 0.27 0.47
Sro670_g184700.1 (Contig318.g4222)
0.08 0.11 0.25 0.19 0.2 0.23 0.24 0.13 0.15 0.28 0.44 0.53 0.2 0.04 0.29 0.45 0.37 0.33 1.0 0.32 0.23 0.22 0.18 0.28 0.98 0.35 0.34
Sro682_g186510.1 (Contig1406.g12886)
0.01 0.0 0.01 0.06 0.06 0.18 0.03 0.11 0.09 0.08 0.25 0.06 0.04 0.04 0.19 0.13 0.12 0.12 0.19 0.05 0.02 0.03 0.13 0.36 1.0 0.43 0.14
Sro682_g186520.1 (Contig1406.g12887)
0.0 0.01 0.02 0.05 0.05 0.31 0.04 0.13 0.11 0.15 0.33 0.11 0.09 0.08 0.29 0.2 0.15 0.26 0.47 0.12 0.03 0.03 0.16 0.49 1.0 0.77 0.24
Sro7_g006150.1 (Contig389.g5268)
0.27 0.18 0.15 0.1 0.0 0.06 0.3 0.12 0.47 0.46 1.0 0.59 0.14 0.1 0.4 0.55 0.86 0.06 0.04 0.21 0.42 0.16 0.31 0.56 0.89 0.22 0.55
Sro809_g205550.1 (Contig3027.g24118)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro82_g043920.1 (Contig4032.g30983)
0.07 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.33 0.03 0.04 0.22 0.39 0.34 0.06 0.16 0.23 0.29 0.28 0.11 0.66 0.19 0.38 0.01 0.07 0.28 1.0 0.26 0.27
Sro837_g209170.1 (Contig405.g5510)
0.01 0.02 0.07 0.03 0.04 0.38 0.14 0.16 0.17 0.17 0.79 0.07 0.07 0.05 0.52 1.0 0.95 0.06 0.08 0.11 0.14 0.08 0.08 0.21 0.52 0.1 0.47
Sro855_g211480.1 (Contig1132.g10862)
0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.23 0.14 0.42 0.14 0.23 0.59 0.24 0.08 0.09 0.48 0.52 0.44 0.1 0.13 0.14 0.06 0.15 0.1 0.41 1.0 0.8 0.45
Sro866_g212960.1 (Contig709.g8206)
0.01 0.13 0.16 0.29 0.29 0.66 0.15 0.22 0.15 0.43 0.53 0.58 0.44 0.18 0.49 0.52 0.3 1.0 0.9 0.57 0.06 0.07 0.27 0.27 0.22 0.34 0.7
Sro912_g219300.1 (Contig4041.g31028)
0.0 0.0 0.15 0.0 0.13 0.19 0.28 0.12 0.05 0.13 0.35 0.08 0.05 0.47 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.04 0.12 1.0 0.15 0.07
Sro992_g228870.1 (Contig4505.g33790)
0.26 0.19 0.54 0.49 0.43 0.26 0.27 0.34 0.39 0.25 1.0 0.2 0.07 0.04 0.5 0.72 0.65 0.18 0.17 0.09 0.18 0.06 0.18 0.42 0.85 0.39 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)