Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1064_g237210.1 (Contig2708.g21801)
4.53 5.37 12.02 6.94 5.95 3.14 6.1 4.05 3.71 6.96 9.85 12.72 8.89 7.31 7.7 7.74 8.93 6.09 7.79 9.27 9.92 7.13 3.81 11.46 4.26 4.54 5.54
Sro1108_g242140.1 (Contig1956.g16795)
0.63 9.46 5.97 3.11 3.17 2.81 15.47 12.59 9.75 8.54 6.16 20.52 7.44 3.78 7.02 6.14 3.62 10.52 5.31 9.28 12.99 2.09 3.55 16.49 14.21 7.57 4.43
Sro1180_g249730.1 (Contig2637.g21365)
0.37 5.85 7.82 4.85 5.52 4.47 4.59 3.04 4.07 8.5 8.21 10.43 7.44 6.22 6.06 9.04 5.32 13.57 12.54 10.34 12.29 7.93 3.53 5.78 8.23 9.49 9.32
Sro1261_g257030.1 (Contig24.g173)
0.0 0.08 0.35 0.07 0.09 0.36 1.03 0.59 0.39 1.96 1.69 4.59 0.54 0.67 2.02 2.36 1.75 0.67 1.07 1.1 2.75 0.05 0.25 2.25 1.63 1.97 1.39
Sro126_g060560.1 (Contig82.g873)
0.0 0.84 1.39 0.87 0.9 0.86 1.37 0.37 0.47 1.35 1.43 1.34 2.99 1.54 1.71 1.69 1.69 1.48 2.07 3.42 1.7 1.8 0.48 1.09 1.46 1.55 1.32
Sro129_g061510.1 (Contig1945.g16725)
1.25 6.8 6.89 8.63 7.7 2.27 8.29 4.89 4.28 6.6 5.92 14.05 15.76 4.42 7.87 9.08 3.97 12.3 6.8 14.03 7.41 6.75 3.75 10.3 15.22 6.99 5.83
Sro1407_g269980.1 (Contig1773.g15691)
0.03 0.23 0.56 0.12 0.23 0.75 3.33 1.36 1.99 2.93 3.67 4.79 1.95 0.73 3.09 5.31 3.04 3.47 2.28 2.39 3.99 1.33 0.64 3.27 4.07 2.7 3.24
Sro143_g066490.1 (Contig3754.g28755)
18.17 5.93 6.41 2.96 3.93 3.7 15.16 10.26 14.49 17.55 8.46 24.53 11.71 12.18 12.54 13.27 8.1 17.23 19.8 22.5 28.21 11.81 11.77 10.42 15.44 9.83 10.95
Sro159_g071870.1 (Contig500.g6727)
64.5 110.6 173.11 187.85 180.53 106.43 97.2 92.92 116.98 132.04 157.64 179.47 189.44 121.93 151.59 213.69 177.66 95.42 105.61 142.93 133.25 71.09 80.96 138.75 150.22 95.33 124.7
Sro160_g072190.1 (Contig2985.g23715)
0.38 13.45 20.3 13.28 16.39 2.32 4.69 4.12 8.23 8.66 2.68 9.71 9.68 6.55 5.25 8.9 2.8 9.03 7.96 6.77 6.21 6.28 4.01 4.13 7.95 2.28 5.06
Sro1693_g291680.1 (Contig4594.g34335)
24.63 30.28 33.97 23.23 23.11 10.0 28.23 12.51 12.75 25.03 28.72 46.31 33.94 26.51 29.56 34.17 15.52 16.33 14.6 30.16 26.44 8.1 11.79 31.63 53.84 32.19 14.66
Sro16_g011910.1 (Contig916.g9628)
7.45 16.77 58.08 44.56 41.51 2.11 9.06 28.0 21.82 15.43 20.26 15.76 9.41 3.57 7.91 34.28 8.76 23.42 17.39 11.5 25.71 10.07 5.55 18.4 22.42 11.24 26.98
Sro1753_g295410.1 (Contig4414.g33154)
0.05 0.29 0.26 0.1 0.0 0.17 0.83 1.35 0.98 1.24 1.7 2.11 0.42 0.31 0.83 2.11 1.55 0.4 0.97 0.99 1.17 0.4 0.82 1.14 2.06 0.62 1.75
Sro1771_g296600.1 (Contig3831.g29374)
1.23 28.55 32.05 32.06 18.84 12.31 32.28 17.12 15.06 20.64 21.99 39.66 20.74 12.7 27.5 29.18 17.47 29.02 16.6 23.01 23.79 6.57 16.01 29.04 20.27 22.8 26.98
Sro1784_g297290.1 (Contig4744.g35150)
8.25 13.06 19.65 25.14 25.24 10.84 8.56 14.47 17.59 20.2 32.26 24.88 34.88 7.74 19.93 38.81 17.18 26.28 29.89 29.77 13.6 12.22 22.06 6.59 9.46 14.59 30.08
Sro1829_g300220.1 (Contig2354.g19342)
1.11 12.22 13.98 13.44 13.35 4.67 14.53 8.04 8.47 12.22 15.21 20.73 6.86 4.26 13.79 21.18 14.31 12.04 9.75 13.38 12.59 5.82 13.27 17.91 11.94 11.46 14.32
Sro1908_g304720.1 (Contig1938.g16672)
13.66 61.09 97.23 98.08 86.24 55.32 53.49 135.7 127.95 70.19 115.86 62.76 98.62 37.41 82.1 121.75 81.63 97.11 45.57 75.91 144.89 91.9 49.04 33.26 48.02 43.77 85.91
Sro1982_g309200.1 (Contig2941.g23372)
2.76 18.36 35.71 33.58 32.1 28.12 63.43 42.99 26.56 44.48 63.66 66.1 53.65 34.86 59.56 63.86 44.44 68.05 41.82 57.31 53.9 16.12 36.47 70.29 84.5 59.56 46.97
Sro2131_g315860.1 (Contig2224.g18462)
0.24 1.04 1.68 0.61 0.36 4.31 13.82 9.22 5.22 11.33 12.46 27.01 5.75 3.35 13.75 20.81 8.57 5.53 2.93 8.73 16.64 4.61 3.24 13.17 20.52 15.58 11.2
Sro2338_g323920.1 (Contig557.g7098)
0.25 6.93 11.64 5.65 4.34 3.26 6.85 6.99 5.28 5.26 6.53 9.34 6.0 1.48 6.3 11.12 4.49 4.84 5.23 5.22 5.76 3.38 2.92 10.42 5.22 5.04 6.8
1.0 1.64 1.58 1.87 0.44 2.37 4.68 5.79 5.38 9.51 13.76 15.84 4.03 1.44 9.09 12.07 7.33 4.94 3.74 5.78 14.36 2.03 4.38 5.56 11.54 6.04 5.0
Sro23_g016010.1 (Contig2259.g18751)
2.01 47.1 64.6 70.59 60.72 31.04 55.21 111.86 82.95 51.15 78.0 53.69 76.96 48.48 75.81 111.36 67.16 26.46 34.82 57.11 56.48 70.78 55.06 27.01 40.22 40.85 76.51
Sro2413_g326740.1 (Contig2828.g22665)
0.77 5.86 22.72 9.85 9.42 8.73 9.72 23.8 15.21 22.15 20.1 36.98 8.11 10.97 15.88 37.08 12.0 32.75 29.0 17.47 39.94 17.28 10.54 12.29 19.84 11.07 17.49
Sro2436_g327610.1 (Contig915.g9580)
1.3 8.23 21.96 12.61 12.59 11.4 17.49 16.83 10.05 18.92 15.27 29.1 28.13 15.05 17.53 24.56 14.58 42.71 26.18 36.45 30.06 10.37 8.96 18.1 38.8 19.38 15.62
Sro2441_g327750.1 (Contig4619.g34460)
0.08 0.75 3.35 2.36 2.94 16.39 5.38 7.71 4.8 17.51 23.57 15.1 12.37 16.52 16.4 24.04 25.22 28.23 26.95 26.11 38.01 14.54 5.25 5.28 6.71 10.2 17.69
Sro246_g097800.1 (Contig171.g1964)
8.56 27.27 39.68 42.56 35.93 27.2 30.46 32.85 22.16 27.86 23.64 65.49 23.26 13.12 15.47 8.72 16.02 9.67 17.67 17.13 25.13 11.97 13.8 46.0 37.14 28.07 18.23
Sro2528_g330330.1 (Contig3353.g26268)
0.02 1.22 4.8 2.96 2.32 1.67 2.43 2.85 2.33 3.06 1.94 5.14 2.95 1.21 2.74 5.24 2.91 2.62 2.12 3.2 4.21 2.35 1.0 1.61 2.79 2.37 1.76
Sro2940_g340660.1 (Contig1872.g16360)
0.28 0.06 1.1 0.95 0.87 8.3 2.48 3.76 1.3 8.07 9.14 8.13 3.93 7.41 6.45 10.68 9.63 12.29 11.65 10.81 19.64 4.39 1.48 2.77 3.46 6.12 9.12
Sro2_g001350.1 (Contig467.g6293)
2.79 24.93 38.25 31.95 30.77 16.32 31.56 35.66 33.49 24.64 29.21 28.28 36.31 19.76 31.2 45.26 25.63 38.33 33.33 36.4 29.41 29.44 27.76 15.04 17.27 17.39 27.12
Sro322_g117070.1 (Contig1229.g11545)
0.0 0.78 0.6 0.68 0.6 0.78 6.8 2.87 4.27 3.14 3.06 7.43 6.56 3.17 3.97 3.58 2.82 3.45 5.03 4.9 5.44 1.69 1.88 6.83 5.94 3.44 2.72
Sro32_g021110.1 (Contig3715.g28584)
0.13 0.51 0.85 0.34 0.17 4.67 5.04 2.1 1.75 4.85 5.11 8.84 5.91 2.38 5.88 4.41 2.75 1.52 2.51 5.07 7.45 0.66 0.88 8.63 8.44 3.98 4.33
Sro3301_g346420.1 (Contig4241.g32124)
0.02 0.28 0.31 0.58 0.21 0.36 1.48 1.48 0.84 2.29 2.22 5.21 2.33 1.48 1.56 2.2 1.06 1.31 2.39 2.81 3.44 0.57 0.68 2.21 1.36 1.19 1.56
Sro361_g126620.1 (Contig1094.g10587)
0.04 1.23 3.85 0.71 1.06 0.35 1.86 0.62 0.67 2.65 1.05 3.61 1.56 3.23 3.28 9.04 1.38 2.35 2.63 2.01 4.11 3.39 4.01 2.25 1.08 1.74 1.49
Sro379_g130500.1 (Contig3398.g26567)
0.78 18.67 23.69 15.22 12.06 8.87 12.9 7.07 12.45 19.0 15.72 38.87 33.01 36.64 12.87 16.47 11.22 14.71 21.81 30.75 20.14 15.0 10.65 13.76 5.17 14.33 11.37
Sro395_g133960.1 (Contig4272.g32315)
0.69 0.29 0.78 0.43 0.17 0.36 2.4 1.27 2.29 2.13 1.59 2.73 5.7 0.85 2.3 2.78 1.18 1.33 2.31 4.3 3.04 2.13 0.85 1.83 2.28 1.33 1.17
Sro395_g134030.1 (Contig4272.g32322)
2.18 80.08 182.96 114.65 88.23 36.78 70.37 47.35 55.91 49.38 55.68 96.08 43.81 3.7 46.44 68.67 32.61 53.9 46.23 52.12 53.87 7.45 21.76 71.12 120.01 59.91 47.22
Sro395_g134160.1 (Contig4272.g32335)
13.2 65.49 53.19 58.1 68.26 26.88 42.66 48.63 83.38 41.22 72.64 61.11 30.69 45.41 47.32 49.65 54.23 34.91 36.25 36.05 27.6 44.96 70.66 29.79 21.56 27.72 46.8
Sro3_g002800.1 (Contig3832.g29465)
6.12 1.55 5.33 2.17 1.42 2.81 2.56 3.19 1.75 9.65 5.03 18.78 2.94 9.08 2.88 7.26 7.5 10.83 12.13 7.54 20.53 9.45 1.97 3.17 7.45 7.69 7.14
Sro40_g024840.1 (Contig335.g4491)
0.06 7.24 18.98 11.08 7.55 10.9 9.06 8.89 12.39 9.13 7.3 18.18 11.16 5.21 7.85 18.87 13.06 8.8 8.29 10.33 10.14 7.63 6.22 8.92 14.19 9.4 6.25
Sro437_g142750.1 (Contig994.g10041)
0.08 0.08 0.06 0.0 0.0 0.14 0.77 0.6 0.29 0.92 0.43 1.57 1.41 0.35 0.71 1.5 0.74 0.48 0.25 1.06 1.44 0.26 0.25 0.61 1.55 1.19 0.42
Sro450_g145500.1 (Contig271.g3475)
3.3 33.44 28.12 33.86 43.94 16.85 36.39 41.08 23.59 34.04 22.41 44.6 15.26 36.52 18.72 20.06 16.91 20.68 23.23 22.52 51.54 12.98 20.68 32.6 53.28 36.32 25.74
Sro463_g148230.1 (Contig3968.g30432)
4.89 7.73 21.31 16.74 12.94 3.4 10.06 23.46 20.94 12.63 17.76 15.6 14.9 6.97 11.21 18.4 21.41 20.25 16.2 20.86 14.46 13.05 9.53 12.22 12.19 8.91 17.02
Sro466_g148790.1 (Contig1164.g11098)
1.46 23.94 25.32 21.08 21.62 7.37 14.73 13.59 27.45 14.04 8.28 24.25 11.79 9.22 9.33 14.7 8.75 20.31 19.03 12.6 12.19 11.56 19.93 14.43 16.36 12.48 9.91
Sro472_g150040.1 (Contig4323.g32619)
5.1 18.32 16.22 32.02 27.53 28.27 36.85 46.93 36.15 31.19 38.69 31.97 44.42 16.94 35.12 26.65 31.37 17.64 17.88 33.94 45.58 15.44 21.19 26.66 50.0 36.12 29.52
Sro490_g153450.1 (Contig328.g4365)
0.24 6.53 7.85 8.67 7.87 1.82 7.27 8.0 4.53 7.37 6.2 7.6 14.31 4.82 7.12 8.43 3.68 6.63 9.82 17.56 9.25 7.48 2.45 9.3 14.33 9.26 5.24
Sro510_g157240.1 (Contig2749.g22139)
0.11 3.59 2.67 2.55 1.76 0.99 2.81 3.46 2.79 3.02 3.7 3.29 6.09 1.86 3.08 3.31 1.56 2.93 4.54 6.41 3.58 2.51 1.13 2.49 2.97 2.57 1.97
Sro537_g162410.1 (Contig1194.g11293)
0.78 5.37 13.83 11.06 7.41 3.63 8.81 3.69 3.06 6.54 4.91 9.56 5.22 4.67 6.29 10.33 3.36 4.96 5.12 5.89 8.69 1.82 5.45 5.16 9.98 8.48 5.78
0.16 0.74 2.8 2.3 0.96 0.39 1.18 1.14 0.81 2.45 2.9 3.92 0.84 1.95 2.49 2.78 0.59 1.81 3.6 2.37 3.23 1.23 1.87 2.6 0.62 1.5 3.23
Sro55_g032310.1 (Contig4458.g33505)
0.09 0.34 0.24 0.37 0.15 0.84 2.69 2.22 0.84 2.79 3.08 4.85 2.42 2.08 2.89 4.14 2.32 1.99 1.3 2.85 4.77 0.87 0.79 3.7 3.92 3.66 2.61
Sro611_g175360.1 (Contig1882.g16417)
0.89 3.2 5.83 1.85 1.95 2.9 11.78 9.48 7.53 20.14 17.63 21.58 15.29 20.89 14.07 21.38 13.02 27.78 25.51 36.58 34.48 11.65 6.24 17.27 28.32 12.97 14.26
Sro62_g035370.1 (Contig2718.g21918)
15.17 18.78 29.73 32.84 34.7 19.43 25.75 24.52 25.36 24.06 47.66 34.27 3.9 10.99 25.33 40.83 44.91 9.99 6.24 6.67 21.86 9.35 14.23 26.83 41.37 31.07 24.77
Sro62_g035480.1 (Contig2718.g21929)
0.08 7.17 9.91 9.1 7.83 6.16 14.36 7.09 4.26 7.79 9.78 15.82 4.38 4.06 7.72 17.46 9.55 15.78 6.77 5.49 9.95 2.88 5.03 17.36 13.99 12.04 10.09
Sro633_g178860.1 (Contig1591.g14458)
0.96 9.57 11.91 8.23 10.11 2.46 9.43 6.89 11.7 5.99 4.83 11.83 7.45 0.72 7.38 7.52 3.06 7.65 4.56 11.21 6.63 6.4 4.04 10.41 10.26 5.21 3.4
Sro696_g188910.1 (Contig116.g1331)
0.31 9.77 11.4 6.35 5.6 4.91 12.5 4.89 9.83 18.1 22.33 33.49 18.84 16.31 20.37 21.79 10.91 13.72 18.27 21.37 15.8 10.23 9.73 12.68 21.76 9.07 12.23
Sro702_g189970.1 (Contig1416.g13000)
4.71 47.31 71.47 60.41 63.22 15.3 19.65 16.88 34.0 28.59 20.55 35.07 69.16 21.79 32.33 52.97 18.46 33.92 35.94 38.53 20.08 24.46 39.8 16.47 7.89 10.04 32.67
Sro716_g191830.1 (Contig2471.g20207)
5.55 41.42 50.03 41.69 35.0 13.35 46.83 26.76 25.37 31.41 35.77 43.58 37.25 29.84 38.77 50.54 36.21 23.46 17.03 38.23 26.04 27.95 41.06 41.62 39.71 25.37 26.67
Sro740_g195620.1 (Contig168.g1901)
0.21 1.43 0.81 1.92 1.22 1.31 2.04 2.88 1.92 4.0 4.97 5.91 5.34 1.88 3.52 2.73 5.16 2.28 2.32 10.39 5.41 2.58 2.2 2.89 2.54 2.61 2.99
Sro740_g195630.1 (Contig168.g1902)
0.04 2.34 1.19 1.88 2.4 0.45 1.26 1.25 0.86 1.91 1.49 1.76 3.27 0.64 1.27 0.48 1.27 2.96 1.74 6.07 1.82 0.71 0.51 1.13 0.56 0.63 1.01
Sro78_g042520.1 (Contig1698.g15228)
0.59 27.22 34.11 22.6 19.85 9.78 21.8 18.31 13.05 17.27 12.52 30.05 12.33 11.67 13.36 15.89 11.54 6.59 6.94 11.85 17.66 8.33 9.54 31.94 22.15 19.73 11.27
Sro796_g203690.1 (Contig2034.g17467)
2.3 34.39 46.52 49.97 31.77 25.04 45.67 47.87 55.41 41.48 59.57 43.1 82.67 44.3 49.64 52.63 51.87 83.06 68.78 77.67 37.76 37.53 41.21 31.24 26.75 27.7 50.07
Sro807_g205300.1 (Contig531.g6916)
2.19 2.43 1.8 1.63 2.26 4.05 7.24 7.34 7.11 15.21 7.93 18.31 9.07 13.32 9.33 11.39 6.95 18.52 28.43 18.18 27.92 12.18 7.21 6.55 8.81 9.82 8.09
Sro819_g207100.1 (Contig8.g96)
0.0 2.74 5.78 2.33 1.62 1.52 3.77 2.04 2.33 3.73 3.71 5.45 10.38 2.58 5.14 6.56 3.06 5.98 5.23 10.81 4.05 5.2 1.76 3.26 5.5 3.98 2.88
Sro858_g211810.1 (Contig4009.g30827)
0.16 4.54 6.87 3.04 3.56 1.07 2.3 2.06 2.89 3.27 2.13 4.1 6.94 3.69 3.43 7.97 3.98 1.69 2.17 4.87 3.62 4.22 4.06 2.51 1.99 1.85 1.91
Sro870_g213730.1 (Contig1807.g15943)
0.0 3.38 3.93 2.01 1.48 1.37 3.4 2.48 3.13 4.89 2.2 6.26 12.45 4.03 5.33 4.53 0.58 5.25 7.28 13.57 5.38 4.76 1.41 6.0 8.44 6.1 2.14
Sro870_g213740.1 (Contig1807.g15944)
0.07 0.53 1.73 0.52 0.47 0.47 2.4 1.09 0.97 2.1 1.5 2.36 3.66 1.78 2.53 2.4 1.34 1.29 1.99 4.3 2.74 0.93 0.48 2.9 4.99 2.51 1.41
Sro895_g217230.1 (Contig1937.g16665)
0.76 1.73 1.73 1.19 1.72 1.05 0.99 7.45 2.84 2.55 9.53 2.01 4.68 3.46 5.5 5.64 7.27 6.81 1.57 2.9 4.3 5.69 1.44 3.75 5.28 2.82 5.08
Sro901_g218070.1 (Contig2989.g23751)
0.03 17.91 20.13 7.93 6.86 3.55 10.02 7.04 13.87 6.99 4.7 18.18 8.26 2.78 5.14 5.64 3.13 7.6 5.84 5.81 11.02 4.24 12.78 8.87 15.7 10.04 4.98
Sro913_g219480.1 (Contig577.g7329)
0.11 7.2 14.82 5.12 4.53 4.15 9.27 3.64 7.72 9.7 6.18 16.21 21.81 21.91 8.95 9.26 7.49 9.1 6.02 19.92 13.62 8.21 7.53 8.75 6.93 12.03 7.23
Sro926_g221040.1 (Contig4614.g34429)
16.59 11.07 25.96 20.85 10.9 22.13 9.4 14.99 11.67 13.16 19.18 24.55 8.94 4.58 11.22 2.65 13.4 5.44 6.55 9.28 14.74 10.97 12.15 21.7 29.26 20.54 10.28
Sro975_g226840.1 (Contig3918.g30030)
0.0 3.24 2.47 2.48 1.81 0.25 3.44 1.89 1.93 2.95 2.84 5.48 5.34 2.88 3.04 2.83 2.8 3.97 2.92 5.45 4.58 2.92 1.26 4.26 5.66 3.39 2.79
Sro9_g007120.1 (Contig4120.g31480)
8.3 1.39 1.72 1.14 0.98 2.82 4.45 3.02 2.95 6.95 4.25 8.33 6.86 3.14 3.35 1.61 2.73 5.8 10.17 11.13 10.02 5.42 2.99 8.75 3.74 3.46 3.23
Sro9_g007140.1 (Contig4120.g31482)
5.86 1.92 1.05 1.21 0.59 3.79 3.92 1.77 3.24 8.53 3.89 7.14 13.23 3.0 4.41 2.38 2.58 11.01 21.68 18.9 11.45 1.54 1.99 8.81 7.17 4.97 3.72
Sro9_g007230.1 (Contig4120.g31491)
1.09 4.14 10.89 9.34 7.64 2.25 8.46 9.75 9.58 8.76 5.41 16.89 13.97 8.7 8.81 21.98 4.19 6.08 8.4 8.97 11.38 7.03 8.07 9.81 10.16 8.89 9.54

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)