Heatmap: Cluster_210 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1009_g230770.1 (Contig1546.g14042)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.22 0.2 0.43 0.41 0.4 0.46 0.47 0.63 0.32 0.49 0.41 0.19 0.41 0.21 0.39 0.0 0.41 0.46 1.0 0.18 0.36
Sro1043_g234840.1 (Contig3084.g24575)
0.03 0.52 0.65 0.36 0.38 0.3 0.79 0.48 0.93 0.55 0.51 0.59 0.63 0.41 0.59 0.53 0.44 0.82 1.0 0.81 0.6 0.41 0.75 0.65 0.52 0.62 0.52
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.55 0.36 0.53 0.29 0.51 0.34 0.0 0.21 0.41 0.53 0.46 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.52 0.52 0.46 0.33 0.39
Sro1264_g257300.1 (Contig827.g9165)
0.0 0.0 0.08 0.06 0.09 0.17 0.41 0.55 0.02 0.38 1.0 0.35 0.0 0.27 0.96 0.9 0.95 0.0 0.0 0.0 0.75 0.06 0.02 0.77 0.76 0.49 0.59
Sro1285_g259330.1 (Contig851.g9361)
0.67 0.01 0.03 0.05 0.03 0.15 0.11 0.04 0.07 0.58 0.99 1.0 0.03 0.39 0.72 0.75 0.72 0.02 0.04 0.02 0.32 0.0 0.11 0.05 0.0 0.22 0.72
Sro1285_g259340.1 (Contig851.g9362)
0.41 0.01 0.02 0.01 0.01 0.27 0.05 0.03 0.04 0.44 1.0 0.63 0.01 0.37 0.62 0.76 0.82 0.01 0.01 0.01 0.28 0.0 0.06 0.05 0.03 0.18 0.69
Sro1285_g259350.1 (Contig851.g9363)
0.43 0.01 0.01 0.01 0.01 0.27 0.06 0.03 0.05 0.45 1.0 0.6 0.01 0.36 0.66 0.77 0.85 0.01 0.01 0.01 0.29 0.0 0.06 0.06 0.02 0.16 0.71
Sro13_g009810.1 (Contig337.g4522)
0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.32 1.0 0.72 0.68 0.37 0.6 0.47 0.7 0.51 0.58 0.53 0.57 0.31 0.41 0.58 0.46 0.25 0.8 0.43 0.64 0.47 0.48
Sro1423_g271380.1 (Contig94.g1083)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.5 0.24 0.87 0.34 0.28 0.69 0.0 0.5 0.37 0.31 0.41 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 1.0 0.31 0.3 0.17 0.26
0.31 0.56 0.48 0.1 0.05 0.14 0.35 0.13 0.26 0.35 0.59 0.34 0.04 0.56 0.53 1.0 0.14 0.03 0.02 0.09 0.43 0.0 0.3 0.37 0.46 0.16 0.42
0.31 0.56 0.48 0.1 0.05 0.14 0.35 0.13 0.26 0.35 0.59 0.34 0.04 0.56 0.53 1.0 0.14 0.03 0.02 0.09 0.43 0.0 0.3 0.37 0.46 0.16 0.42
0.31 0.56 0.48 0.1 0.05 0.14 0.35 0.13 0.26 0.35 0.59 0.34 0.04 0.56 0.53 1.0 0.14 0.03 0.02 0.09 0.43 0.0 0.3 0.37 0.46 0.16 0.42
0.0 0.29 0.49 0.19 0.11 0.38 0.5 0.26 0.32 0.5 0.39 0.78 0.13 0.43 0.71 1.0 0.69 0.12 0.07 0.07 0.76 0.01 0.4 0.59 0.37 0.37 0.5
Sro1508_g278430.1 (Contig142.g1574)
0.05 0.57 0.56 0.45 0.4 0.2 0.31 0.4 0.42 0.27 0.33 0.29 0.9 0.58 0.34 0.27 0.37 0.52 1.0 0.48 0.19 0.41 0.48 0.49 0.1 0.13 0.26
Sro155_g070460.1 (Contig395.g5353)
0.07 0.14 0.07 0.05 0.04 0.25 1.0 0.72 0.69 0.38 0.48 0.44 0.0 0.29 0.47 0.52 0.44 0.0 0.0 0.0 0.71 0.1 0.51 0.36 0.18 0.18 0.32
Sro1570_g283200.1 (Contig4602.g34357)
0.01 0.56 0.73 0.34 0.42 0.17 1.0 0.41 0.72 0.56 0.71 0.59 0.18 0.55 0.76 0.51 0.85 0.21 0.21 0.21 0.61 0.39 0.78 0.69 0.9 0.76 0.69
Sro1573_g283490.1 (Contig1464.g13446)
0.0 1.0 0.87 0.46 0.41 0.05 0.14 0.24 0.15 0.21 0.2 0.18 0.53 0.38 0.17 0.15 0.48 0.24 0.45 0.36 0.07 0.13 0.21 0.2 0.0 0.02 0.2
Sro1604_g285400.1 (Contig23.g167)
1.0 0.03 0.1 0.06 0.04 0.06 0.14 0.24 0.17 0.18 0.07 0.13 0.11 0.09 0.09 0.15 0.11 0.16 0.14 0.11 0.35 0.03 0.29 0.17 0.11 0.17 0.11
Sro161_g072660.1 (Contig3982.g30607)
0.06 0.74 1.0 0.41 0.35 0.08 0.37 0.33 0.37 0.27 0.25 0.24 0.31 0.19 0.33 0.35 0.2 0.42 0.44 0.39 0.34 0.21 0.49 0.35 0.13 0.13 0.29
Sro1697_g291870.1 (Contig3875.g29816)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.94 0.38 0.64 0.44 1.0 0.58 0.0 0.27 0.7 0.86 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.98 0.21 0.55 0.44 0.89
Sro1708_g292690.1 (Contig3919.g30037)
0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.6 0.27 0.17 0.28 0.64 1.0 0.75 0.02 0.68 0.82 0.67 0.62 0.01 0.01 0.04 0.18 0.03 0.29 0.04 0.0 0.32 0.66
Sro1742_g294720.1 (Contig636.g7701)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.0 0.0 0.1 0.43 0.0 0.0 0.2 0.46 0.44 1.0 0.0 0.0 0.08 0.53 0.08 0.21 0.07 0.07 0.09 0.1
Sro1742_g294730.1 (Contig636.g7702)
0.09 0.0 0.18 0.06 0.24 0.07 0.1 0.13 0.21 0.13 0.43 0.12 0.03 0.0 0.36 0.85 1.0 0.02 0.0 0.19 0.35 0.0 0.19 0.2 0.0 0.04 0.2
Sro1775_g296880.1 (Contig695.g8118)
1.0 0.18 0.27 0.15 0.09 0.36 0.22 0.47 0.17 0.66 0.84 0.79 0.42 0.27 0.46 0.26 0.19 0.17 0.35 0.82 0.64 0.12 0.11 0.56 0.61 0.36 0.71
Sro1823_g299870.1 (Contig3221.g25452)
1.0 0.16 0.23 0.38 0.28 0.04 0.41 0.21 0.35 0.3 0.14 0.37 0.07 0.11 0.18 0.15 0.15 0.06 0.05 0.23 0.29 0.09 0.28 0.2 0.21 0.17 0.13
Sro186_g080600.1 (Contig266.g3341)
0.86 0.27 0.17 0.1 0.2 0.16 0.82 0.57 0.5 0.52 0.66 0.6 0.3 0.25 0.58 0.71 0.59 1.0 0.6 0.61 0.47 0.2 0.5 0.47 0.2 0.27 0.53
Sro1973_g308640.1 (Contig2822.g22607)
0.41 0.09 0.17 0.12 0.14 0.45 0.09 0.43 0.25 0.63 0.41 1.0 0.25 0.29 0.27 0.27 0.27 0.18 0.68 0.47 0.68 0.12 0.13 0.25 0.25 0.19 0.56
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54 0.26 0.28 0.46 0.49 0.54 0.0 0.54 0.77 1.0 0.67 0.03 0.0 0.02 0.58 0.01 0.39 0.56 0.46 0.28 0.53
0.0 0.48 0.35 0.14 0.15 0.0 0.33 0.51 0.91 0.25 1.0 0.4 0.13 0.1 0.31 0.94 0.11 0.1 0.11 0.3 0.33 0.04 0.83 0.14 0.25 0.08 0.51
Sro209_g087450.1 (Contig4070.g31216)
0.06 0.47 0.3 0.19 0.33 0.19 0.63 0.36 0.34 0.62 0.74 0.74 0.2 0.65 0.74 0.85 0.77 0.08 0.12 0.25 0.96 0.39 0.38 0.62 1.0 0.65 0.61
0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.84 0.38 0.74 0.57 1.0 0.66 0.01 0.5 0.84 0.64 0.63 0.01 0.01 0.04 0.05 0.02 0.82 0.0 0.0 0.31 0.72
0.38 0.0 0.01 0.0 0.0 0.27 0.96 0.41 0.86 0.45 0.72 0.49 0.02 0.39 0.62 0.47 0.56 0.0 0.01 0.02 0.12 0.01 1.0 0.02 0.0 0.19 0.47
Sro218_g089950.1 (Contig1136.g10896)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.81 0.49 0.53 0.39 0.62 0.72 0.0 0.05 0.75 0.65 0.95 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 1.0 0.19 0.03 0.14 0.49
Sro218_g089960.1 (Contig1136.g10897)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.61 0.17 0.58 0.32 0.09 0.2 0.15 0.05 0.62 1.0 0.08 0.08 0.08 0.0 0.29 0.08 0.69 0.28 0.0 0.21 0.36
0.0 0.0 0.87 0.48 0.06 0.0 0.38 0.17 0.12 0.26 1.0 0.29 0.09 0.0 0.61 0.44 0.25 0.0 0.02 0.12 0.27 0.0 0.04 0.06 0.32 0.27 0.43
Sro224_g091570.1 (Contig758.g8611)
0.06 0.1 1.0 0.41 0.37 0.4 0.33 0.45 0.37 0.26 0.55 0.15 0.16 0.12 0.6 0.39 0.91 0.45 0.14 0.05 0.32 0.1 0.42 0.49 0.24 0.37 0.5
Sro2282_g321820.1 (Contig3485.g27026)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.49 0.31 0.0 0.47 0.83 0.71 0.03 0.19 0.51 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.28 0.56 0.48 0.7
Sro2282_g321830.1 (Contig3485.g27027)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.37 0.0 0.0 0.52 1.0 0.96 0.0 0.15 0.89 0.85 0.68 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.7 0.44 0.22 0.61
Sro2288_g322060.1 (Contig4716.g35057)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.3 0.21 0.34 0.1 0.6 0.04 0.43 0.05 0.31 0.25 0.33 0.69 0.51 0.23 0.0 0.0 0.35 1.0 0.7 0.3 0.23
Sro2853_g338660.1 (Contig1140.g10943)
0.1 0.09 0.18 0.15 0.1 0.44 0.2 0.06 0.12 0.56 1.0 0.75 0.23 0.34 0.51 0.39 0.6 0.08 0.32 0.41 0.57 0.12 0.03 0.51 0.51 0.35 0.65
Sro291_g109490.1 (Contig4055.g31095)
0.0 0.82 0.55 0.4 0.38 0.15 0.52 0.32 0.51 0.22 0.33 0.16 0.73 0.47 0.46 0.22 0.55 0.52 1.0 0.5 0.06 0.23 0.57 0.47 0.06 0.13 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.22 0.04 0.03 0.21 1.0 0.44 0.03 0.09 0.17 0.1 0.07 0.03 0.05 0.05 0.16 0.0 0.08 0.82 0.69 0.35 0.2
Sro294_g110100.1 (Contig215.g2558)
0.55 0.02 0.01 0.01 0.01 0.63 0.36 0.13 0.31 0.61 1.0 0.6 0.03 0.6 0.85 0.62 0.62 0.0 0.01 0.03 0.16 0.01 0.38 0.03 0.0 0.26 0.81
Sro3048_g342830.1 (Contig2470.g20206)
0.08 0.77 1.0 0.62 0.6 0.1 0.62 0.42 0.85 0.5 0.6 0.45 0.63 0.3 0.46 0.33 0.53 0.47 0.52 0.66 0.51 0.4 0.78 0.84 0.9 0.76 0.26
Sro309_g113680.1 (Contig3477.g26958)
0.01 0.8 0.54 0.63 0.55 0.42 0.6 0.32 0.47 0.67 0.9 0.87 0.6 1.0 0.66 0.85 0.77 0.41 0.65 0.87 0.64 0.65 0.47 0.55 0.7 0.71 0.67
Sro321_g116760.1 (Contig56.g432)
0.01 0.37 0.84 0.43 0.36 0.19 0.54 0.45 1.0 0.35 0.56 0.43 0.27 0.32 0.4 0.48 0.55 0.26 0.43 0.45 0.39 0.43 0.67 0.39 0.56 0.53 0.46
Sro3247_g345830.1 (Contig3708.g28517)
0.06 0.02 0.09 0.07 0.06 0.12 0.51 0.74 1.0 0.29 0.73 0.39 0.31 0.06 0.25 0.27 0.32 0.44 0.28 0.32 0.4 0.03 0.81 0.36 0.5 0.32 0.23
Sro333_g119680.1 (Contig3012.g24064)
0.01 0.66 0.71 0.54 0.5 0.45 0.6 0.38 1.0 0.56 0.52 0.78 0.33 0.76 0.54 0.65 0.64 0.17 0.35 0.37 0.64 0.58 0.79 0.38 0.31 0.41 0.37
Sro342_g121780.1 (Contig3070.g24478)
0.01 0.41 1.0 0.37 0.34 0.46 0.25 0.6 0.12 0.37 0.69 0.3 0.54 0.1 0.38 0.24 0.33 0.32 0.53 0.52 0.33 0.1 0.07 0.41 0.34 0.53 0.44
Sro3687_g350290.1 (Contig1784.g15799)
0.51 0.15 0.21 0.12 0.07 0.65 0.65 0.35 0.62 0.68 1.0 0.86 0.02 0.79 0.85 0.7 0.79 0.01 0.02 0.04 0.32 0.03 0.73 0.09 0.01 0.31 0.71
Sro374_g129350.1 (Contig347.g4696)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.24 0.11 0.0 0.41 0.75 0.34 0.0 0.32 0.89 1.0 0.75 0.0 0.01 0.01 0.52 0.0 0.02 0.59 0.64 0.65 0.71
Sro4255_g353540.1 (Contig2877.g22997)
0.09 0.24 0.26 0.0 0.17 0.0 0.9 0.6 0.57 0.15 0.0 0.0 0.6 0.0 0.36 0.68 0.08 0.08 0.0 0.51 0.07 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.12
Sro551_g164800.1 (Contig4706.g35001)
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.12 0.27 1.0 0.41 0.32 0.49 0.42 0.38 0.3 0.41 0.54 0.47 0.4 0.38 0.51 0.52 0.45 0.27 0.22 0.1 0.24 0.42
Sro551_g164810.1 (Contig4706.g35002)
0.03 0.04 0.04 0.02 0.02 0.31 0.79 0.95 0.84 0.54 0.97 0.54 0.61 0.56 0.81 1.0 0.88 0.67 0.59 0.76 0.76 0.73 0.64 0.61 0.21 0.47 0.93
Sro551_g164820.1 (Contig4706.g35003)
0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.34 0.91 1.0 0.92 0.43 0.77 0.29 0.39 0.49 0.69 0.81 0.72 0.57 0.38 0.49 0.72 0.71 0.65 0.55 0.25 0.38 0.77
0.0 0.53 0.43 0.28 0.16 0.04 1.0 0.89 0.44 0.36 0.5 0.42 0.11 0.13 0.52 0.3 0.29 0.32 0.57 0.39 0.5 0.89 0.76 0.28 0.29 0.23 0.3
Sro609_g174920.1 (Contig285.g3724)
0.18 0.33 0.3 0.19 0.2 0.25 0.83 0.8 1.0 0.36 0.56 0.41 0.68 0.23 0.5 0.45 0.55 0.43 0.37 0.49 0.35 0.13 0.79 0.24 0.34 0.31 0.43
Sro621_g176870.1 (Contig1511.g13804)
0.0 0.42 0.95 0.53 0.37 0.47 0.41 1.0 0.41 0.54 0.91 0.44 0.62 0.74 0.66 0.61 0.73 0.32 0.47 0.72 0.53 0.51 0.43 0.6 0.51 0.47 0.73
Sro631_g178410.1 (Contig3194.g25246)
0.1 0.87 0.93 0.47 0.53 0.16 0.81 0.78 0.72 0.48 0.54 0.51 0.31 0.49 0.36 0.1 0.31 0.37 0.43 0.5 0.5 0.16 1.0 0.44 0.49 0.7 0.44
0.02 0.5 0.38 0.13 0.25 0.82 0.86 0.39 0.64 0.5 0.54 0.54 0.0 0.76 0.81 1.0 0.32 0.0 0.0 0.01 0.71 0.1 0.85 0.61 0.64 0.54 0.47
Sro65_g036700.1 (Contig155.g1740)
0.43 0.03 0.07 0.09 0.07 0.23 0.06 0.04 0.05 0.48 1.0 0.68 0.01 0.39 0.69 0.74 0.89 0.0 0.01 0.01 0.36 0.0 0.1 0.04 0.03 0.15 0.71
Sro72_g039700.1 (Contig1459.g13369)
0.01 0.08 0.08 0.06 0.05 0.71 0.57 0.47 0.48 0.46 0.9 0.8 0.28 0.58 0.52 0.26 1.0 0.14 0.22 0.46 0.42 0.14 0.59 0.48 0.64 0.67 0.58
Sro744_g196200.1 (Contig393.g5319)
0.02 0.6 0.71 0.31 0.45 0.21 0.78 0.43 0.62 0.5 0.72 0.42 0.17 0.37 0.62 0.59 0.91 0.26 0.21 0.34 0.45 0.2 0.54 0.6 1.0 0.72 0.52
Sro765_g199220.1 (Contig2703.g21781)
0.02 0.49 0.25 0.27 0.55 0.04 0.47 1.0 0.53 0.32 0.47 0.27 0.18 0.17 0.44 0.32 0.21 0.64 0.32 0.34 0.44 0.87 0.32 0.25 0.3 0.32 0.48
Sro780_g201430.1 (Contig2838.g22777)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.13 0.03 0.0 0.41 1.0 0.49 0.0 0.32 0.63 0.67 0.83 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.24 0.27 0.31 0.52
Sro780_g201440.1 (Contig2838.g22778)
0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.45 0.21 0.06 0.0 0.43 1.0 0.43 0.0 0.41 0.66 0.63 0.73 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.43 0.52 0.45 0.62
Sro85_g045380.1 (Contig4580.g34215)
0.4 0.55 0.7 1.0 0.74 0.57 0.5 0.44 0.36 0.48 0.67 0.38 0.43 0.32 0.49 0.25 0.52 0.35 0.37 0.4 0.6 0.19 0.4 0.65 0.59 0.65 0.34
Sro896_g217360.1 (Contig3311.g25947)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.01 0.0 0.17 0.51 0.35 0.08 0.3 0.39 1.0 0.41 0.02 0.09 0.06 0.22 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.15
Sro899_g217770.1 (Contig130.g1464)
0.41 0.02 0.01 0.01 0.01 0.39 0.05 0.03 0.04 0.45 1.0 0.69 0.01 0.38 0.65 0.7 0.91 0.01 0.01 0.01 0.27 0.0 0.06 0.05 0.02 0.18 0.73
Sro931_g221450.1 (Contig2300.g19028)
0.02 0.25 0.5 0.13 0.17 0.14 0.45 0.39 0.61 0.21 0.29 0.23 0.17 0.07 0.2 0.41 0.1 0.06 0.22 0.14 0.29 0.13 0.56 1.0 0.73 0.77 0.28
0.0 1.0 0.92 0.13 0.57 0.0 0.37 0.4 0.65 0.31 0.32 0.52 0.02 0.07 0.33 0.08 0.51 0.03 0.01 0.28 0.17 0.25 0.46 0.09 0.13 0.01 0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)