Heatmap: Cluster_169 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1029_g233290.1 (Contig460.g6202)
0.0 0.57 1.0 0.26 0.33 0.06 0.1 0.5 0.24 0.19 0.46 0.08 0.16 0.03 0.54 0.43 0.1 0.28 0.08 0.09 0.07 0.17 0.3 0.19 0.13 0.11 0.44
Sro1059_g236570.1 (Contig822.g9133)
0.01 0.96 1.0 0.94 0.81 0.12 0.31 0.41 0.35 0.42 0.42 0.42 0.51 0.26 0.33 0.28 0.36 0.69 0.57 0.59 0.41 0.38 0.25 0.37 0.34 0.29 0.33
Sro1088_g239930.1 (Contig3790.g29088)
0.03 0.6 0.98 1.0 0.68 0.12 0.53 0.79 0.75 0.36 0.53 0.25 0.39 0.08 0.46 0.54 0.2 0.34 0.33 0.43 0.38 0.53 0.54 0.4 0.53 0.4 0.5
Sro1131_g244720.1 (Contig1944.g16716)
0.05 0.44 0.52 0.76 0.68 0.02 0.11 0.31 0.16 0.19 0.19 0.17 1.0 0.2 0.14 0.06 0.18 0.36 0.46 0.64 0.06 0.28 0.24 0.02 0.01 0.09 0.1
Sro1152_g246860.1 (Contig333.g4426)
0.3 0.44 1.0 0.73 0.69 0.17 0.24 0.63 0.47 0.25 0.54 0.17 0.34 0.14 0.3 0.34 0.17 0.5 0.26 0.19 0.22 0.37 0.28 0.26 0.36 0.32 0.36
Sro1221_g253730.1 (Contig1854.g16197)
0.01 0.41 0.55 0.53 0.6 0.12 0.1 0.17 0.21 0.18 0.24 0.18 1.0 0.17 0.14 0.13 0.24 0.27 0.39 0.74 0.12 0.22 0.19 0.08 0.07 0.09 0.12
Sro125_g060390.1 (Contig2833.g22750)
0.04 0.81 0.77 0.44 0.47 0.28 0.2 0.2 0.26 0.26 0.37 0.17 1.0 0.03 0.38 0.3 0.43 0.23 0.21 0.85 0.34 0.17 0.25 0.12 0.14 0.1 0.27
Sro1262_g257160.1 (Contig187.g2173)
0.0 0.48 0.56 0.23 0.33 0.0 0.0 0.07 0.02 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.33 0.86 0.0 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro127_g060680.1 (Contig98.g1155)
0.1 0.11 0.1 0.04 0.05 0.0 0.11 0.04 0.09 0.11 0.01 0.03 0.94 0.11 0.05 0.0 0.01 0.17 0.25 1.0 0.03 0.07 0.11 0.13 0.01 0.01 0.01
Sro1463_g274840.1 (Contig87.g919)
0.0 0.49 0.43 0.12 0.4 0.02 0.01 0.19 0.0 0.16 0.1 0.03 0.89 0.03 0.11 0.09 0.02 0.16 0.45 1.0 0.08 0.29 0.07 0.01 0.0 0.04 0.07
Sro1472_g275490.1 (Contig2029.g17421)
0.01 0.67 0.83 1.0 0.92 0.16 0.17 0.5 0.61 0.28 0.26 0.28 0.4 0.14 0.21 0.21 0.22 0.51 0.45 0.53 0.21 0.38 0.36 0.13 0.19 0.14 0.21
Sro1644_g288180.1 (Contig3810.g29187)
0.0 0.37 0.91 1.0 0.82 0.05 0.22 0.46 0.31 0.13 0.08 0.04 0.23 0.01 0.12 0.15 0.06 0.39 0.12 0.13 0.08 0.44 0.41 0.22 0.19 0.19 0.1
Sro186_g080750.1 (Contig266.g3356)
0.04 0.58 0.8 0.89 0.85 0.26 0.39 0.38 0.46 0.41 0.41 0.33 0.46 0.21 0.35 0.33 0.29 0.61 1.0 0.53 0.33 0.55 0.5 0.26 0.29 0.3 0.3
Sro1885_g303560.1 (Contig262.g3249)
0.02 0.66 0.57 0.62 0.63 0.03 0.1 0.2 0.35 0.16 0.05 0.04 1.0 0.02 0.07 0.03 0.07 0.14 0.19 0.64 0.03 0.27 0.3 0.34 0.28 0.21 0.03
Sro1902_g304400.1 (Contig632.g7666)
0.02 0.5 1.0 0.44 0.65 0.0 0.05 0.11 0.17 0.19 0.03 0.11 0.85 0.07 0.03 0.04 0.05 0.17 0.3 0.6 0.18 0.21 0.09 0.03 0.06 0.02 0.01
Sro1999_g310180.1 (Contig925.g9702)
0.0 0.72 0.44 0.06 0.7 0.03 0.1 0.15 0.54 0.13 0.04 0.15 1.0 0.17 0.08 0.09 0.03 0.21 0.92 0.39 0.13 0.41 0.02 0.0 0.0 0.07 0.07
0.0 0.13 0.25 0.08 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.14 0.0 0.02 0.67 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.11 1.0 0.22 0.01 0.02 0.11 0.08 0.0 0.04
Sro2190_g318320.1 (Contig3010.g24035)
0.0 0.42 0.26 0.37 0.28 0.38 0.25 0.25 0.27 0.37 0.32 0.4 0.79 0.27 0.31 0.32 0.39 0.49 0.67 1.0 0.36 0.47 0.21 0.2 0.44 0.26 0.28
Sro220_g090690.1 (Contig3599.g27831)
0.0 0.62 1.0 0.84 0.67 0.18 0.24 0.57 0.31 0.25 0.4 0.1 0.4 0.09 0.33 0.46 0.38 0.73 0.53 0.24 0.23 0.29 0.29 0.25 0.19 0.28 0.39
0.02 0.36 1.0 0.79 0.53 0.01 0.09 0.16 0.19 0.08 0.14 0.05 0.16 0.03 0.11 0.18 0.06 0.06 0.05 0.12 0.1 0.09 0.27 0.16 0.02 0.03 0.17
Sro232_g093930.1 (Contig4063.g31158)
0.03 0.64 0.57 0.49 0.54 0.08 0.21 0.22 0.25 0.21 0.23 0.33 1.0 0.14 0.13 0.14 0.22 0.21 0.24 0.61 0.12 0.14 0.28 0.17 0.12 0.11 0.19
Sro2333_g323740.1 (Contig2357.g19373)
0.0 0.86 0.65 0.53 0.33 0.0 0.04 0.16 0.14 0.12 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.34 0.37 0.95 0.04 0.33 0.02 0.0 0.04 0.22 0.02
Sro234_g094450.1 (Contig3223.g25492)
0.0 0.74 1.0 0.49 0.47 0.04 0.2 0.16 0.19 0.3 0.18 0.27 0.51 0.22 0.21 0.19 0.11 0.2 0.23 0.45 0.35 0.28 0.13 0.19 0.16 0.13 0.15
Sro2382_g325590.1 (Contig4090.g31271)
0.0 0.5 0.97 0.52 0.62 0.05 0.41 0.02 0.43 0.19 0.0 0.05 0.09 0.04 0.03 0.0 0.0 0.21 0.73 1.0 0.06 0.23 0.38 0.03 0.0 0.0 0.04
Sro27_g018270.1 (Contig3926.g30088)
0.0 1.0 0.72 0.62 0.38 0.03 0.14 0.29 0.17 0.25 0.26 0.02 0.89 0.01 0.34 0.35 0.12 0.72 0.48 0.51 0.07 0.12 0.23 0.21 0.46 0.21 0.38
Sro310_g113940.1 (Contig2751.g22154)
0.0 1.0 0.58 0.31 0.52 0.07 0.23 0.3 0.78 0.15 0.0 0.04 0.45 0.06 0.01 0.04 0.02 0.25 0.46 0.35 0.11 0.41 0.41 0.01 0.0 0.0 0.04
Sro310_g114070.1 (Contig2751.g22167)
0.01 0.91 0.79 0.9 0.75 0.28 0.43 0.4 0.55 0.37 0.48 0.24 1.0 0.31 0.41 0.6 0.51 0.5 0.39 0.95 0.26 0.7 0.52 0.51 0.53 0.31 0.28
Sro314_g115030.1 (Contig2448.g20029)
0.0 0.16 0.09 0.36 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro316_g115630.1 (Contig2414.g19769)
0.0 0.96 1.0 0.65 0.78 0.09 0.19 0.41 0.49 0.38 0.3 0.33 0.8 0.45 0.31 0.31 0.27 0.17 0.28 0.74 0.35 0.63 0.28 0.22 0.38 0.25 0.28
Sro322_g117170.1 (Contig1229.g11555)
0.01 0.45 0.66 0.61 0.5 0.03 0.08 0.02 0.14 0.33 0.34 0.27 0.77 0.21 0.2 0.21 0.19 0.56 0.83 1.0 0.27 0.42 0.22 0.04 0.16 0.29 0.2
Sro3619_g349750.1 (Contig1179.g11218)
0.0 0.93 1.0 0.39 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.32 0.64 0.0 0.62 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3763_g350880.1 (Contig2382.g19553)
0.0 0.27 0.45 0.27 0.23 0.01 0.22 0.26 0.51 0.14 0.09 0.09 1.0 0.06 0.07 0.13 0.04 0.3 0.47 0.86 0.04 0.27 0.2 0.06 0.1 0.01 0.02
Sro3798_g351130.1 (Contig3474.g26925)
0.0 0.19 0.62 0.45 0.29 0.01 0.07 0.23 0.23 0.27 0.19 0.23 0.29 0.16 0.15 0.2 0.25 0.19 0.3 1.0 0.35 0.26 0.32 0.14 0.21 0.22 0.11
Sro384_g131570.1 (Contig425.g5730)
0.01 0.46 1.0 0.72 0.7 0.05 0.08 0.57 0.2 0.1 0.08 0.06 0.28 0.06 0.1 0.08 0.08 0.22 0.16 0.13 0.04 0.38 0.25 0.04 0.04 0.05 0.06
Sro3930_g351910.1 (Contig3674.g28387)
0.0 0.38 0.52 0.35 0.31 0.04 0.16 0.19 0.42 0.26 0.19 0.18 0.91 0.15 0.21 0.09 0.19 0.43 0.61 1.0 0.22 0.44 0.39 0.08 0.12 0.09 0.16
Sro3_g002690.1 (Contig3832.g29454)
0.0 0.66 0.87 1.0 0.88 0.42 0.42 0.77 0.5 0.53 0.81 0.44 0.83 0.62 0.7 0.63 0.74 0.77 0.72 0.64 0.57 0.48 0.52 0.43 0.38 0.4 0.71
Sro430_g141290.1 (Contig4379.g32923)
0.0 0.81 0.8 0.84 0.69 0.07 0.13 0.14 0.38 0.33 0.28 0.27 0.93 0.18 0.26 0.33 0.24 0.64 1.0 0.93 0.18 0.28 0.29 0.22 0.24 0.23 0.2
Sro449_g145340.1 (Contig3482.g27004)
0.0 0.91 0.86 1.0 0.64 0.0 0.0 0.17 0.01 0.09 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.25 0.18 0.0 0.24 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro44_g026540.1 (Contig358.g4823)
0.0 0.89 0.49 0.32 0.36 0.0 0.11 0.11 0.12 0.1 0.02 0.02 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.52 0.89 0.69 0.01 0.11 0.19 0.01 0.01 0.01 0.02
Sro457_g146960.1 (Contig1832.g16125)
0.0 0.5 1.0 0.9 0.79 0.09 0.18 0.43 0.53 0.27 0.33 0.1 0.4 0.06 0.29 0.4 0.24 0.64 0.44 0.43 0.18 0.54 0.27 0.22 0.14 0.21 0.36
Sro467_g148960.1 (Contig2066.g17709)
0.07 0.56 1.0 0.72 0.61 0.05 0.19 0.16 0.34 0.12 0.28 0.08 0.43 0.03 0.18 0.16 0.2 0.11 0.09 0.19 0.08 0.2 0.4 0.41 0.3 0.14 0.11
Sro47_g027840.1 (Contig1172.g11177)
0.01 0.53 1.0 0.89 0.75 0.17 0.18 0.57 0.4 0.19 0.32 0.11 0.2 0.11 0.23 0.22 0.25 0.59 0.42 0.19 0.07 0.57 0.23 0.23 0.32 0.28 0.27
Sro487_g152940.1 (Contig367.g4970)
0.01 0.65 0.84 0.89 1.0 0.18 0.21 0.43 0.54 0.31 0.34 0.18 0.6 0.14 0.38 0.42 0.25 0.66 0.47 0.55 0.25 0.37 0.23 0.35 0.45 0.27 0.37
Sro568_g168150.1 (Contig267.g3366)
0.16 0.68 1.0 0.86 0.89 0.3 0.42 0.63 0.75 0.34 0.55 0.31 0.55 0.21 0.43 0.47 0.46 1.0 0.56 0.55 0.25 0.57 0.46 0.29 0.3 0.36 0.41
Sro598_g173040.1 (Contig1655.g14930)
0.0 0.79 1.0 0.88 0.86 0.04 0.13 0.47 0.48 0.27 0.11 0.18 0.69 0.12 0.18 0.18 0.14 0.2 0.41 0.71 0.13 0.33 0.35 0.14 0.1 0.14 0.11
Sro609_g174960.1 (Contig285.g3728)
0.0 0.76 1.0 0.54 0.51 0.3 0.25 0.79 0.52 0.27 0.34 0.16 0.39 0.12 0.33 0.37 0.35 0.65 0.35 0.31 0.26 0.61 0.33 0.21 0.21 0.2 0.36
Sro610_g175110.1 (Contig255.g3137)
0.0 1.0 0.92 0.54 0.63 0.02 0.14 0.1 0.42 0.23 0.11 0.28 0.36 0.19 0.08 0.12 0.05 0.14 0.21 0.37 0.29 0.39 0.25 0.19 0.31 0.22 0.05
Sro636_g179240.1 (Contig84.g901)
0.05 0.83 0.81 0.33 0.32 0.13 0.25 0.4 0.31 0.34 0.19 0.28 0.86 0.26 0.32 0.41 0.2 0.66 0.61 1.0 0.34 0.2 0.31 0.12 0.02 0.06 0.28
Sro661_g183170.1 (Contig401.g5417)
0.07 0.43 1.0 0.65 0.59 0.12 0.16 0.5 0.26 0.17 0.2 0.1 0.21 0.11 0.21 0.35 0.16 0.19 0.1 0.12 0.16 0.21 0.22 0.19 0.19 0.19 0.21
Sro67_g037480.1 (Contig495.g6664)
0.0 0.34 0.61 0.4 1.0 0.02 0.01 0.14 0.53 0.14 0.01 0.05 0.04 0.01 0.04 0.0 0.03 0.07 0.18 0.01 0.0 0.31 0.12 0.77 0.98 0.27 0.02
Sro683_g186600.1 (Contig860.g9398)
0.11 0.59 0.91 1.0 0.97 0.16 0.17 0.49 0.8 0.27 0.52 0.2 0.49 0.17 0.53 0.28 0.69 0.72 0.43 0.39 0.24 0.22 0.29 0.33 0.34 0.28 0.34
Sro724_g193150.1 (Contig824.g9145)
0.0 0.53 0.87 0.47 0.58 0.04 0.33 0.28 0.22 0.22 0.18 0.15 0.47 0.05 0.11 0.18 0.01 0.59 0.61 1.0 0.28 0.28 0.15 0.15 0.32 0.1 0.13
0.0 0.34 0.39 0.25 0.18 0.01 0.05 0.09 0.12 0.11 0.06 0.09 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.13 0.11 0.98 0.22 0.16 0.07 0.06 0.13 0.13 0.03
Sro796_g203660.1 (Contig2034.g17464)
0.0 0.41 1.0 0.88 0.77 0.14 0.25 0.54 0.5 0.35 0.27 0.25 0.29 0.21 0.23 0.28 0.2 0.18 0.2 0.44 0.32 0.41 0.21 0.35 0.42 0.21 0.22
Sro865_g212800.1 (Contig3005.g23903)
0.0 0.5 0.32 0.39 0.33 0.03 0.16 0.1 0.15 0.18 0.19 0.06 1.0 0.18 0.11 0.12 0.26 0.13 0.25 0.88 0.14 0.21 0.14 0.31 0.3 0.18 0.1
0.25 0.32 0.58 0.36 0.27 0.05 0.08 0.15 0.28 0.17 0.1 0.1 0.63 0.09 0.08 0.15 0.03 0.48 0.57 1.0 0.13 0.1 0.07 0.09 0.09 0.0 0.05
Sro901_g217990.1 (Contig2989.g23743)
0.2 0.62 0.97 1.0 0.81 0.09 0.46 0.75 0.66 0.29 0.45 0.22 0.18 0.06 0.4 0.56 0.21 0.32 0.28 0.33 0.31 0.23 0.37 0.35 0.21 0.11 0.49
Sro90_g047410.1 (Contig124.g1403)
0.0 0.48 0.65 0.64 0.57 0.35 0.23 1.0 0.46 0.24 0.44 0.19 0.29 0.13 0.45 0.49 0.44 0.64 0.3 0.21 0.3 0.58 0.29 0.41 0.8 0.54 0.43
Sro96_g049600.1 (Contig3763.g28886)
0.49 1.0 0.63 0.77 0.55 0.05 0.07 0.12 0.48 0.3 0.37 0.22 0.11 0.1 0.1 0.14 0.14 0.17 0.37 0.63 0.15 0.16 0.33 0.05 0.05 0.11 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)